单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 11121 - 11140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11121 | 2024-08-05 |
Identification of New Chemoresistance-Associated Genes in Triple-Negative Breast Cancer by Single-Cell Transcriptomic Analysis
2024-Jun-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25136853
PMID:38999963
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析识别了与三阴性乳腺癌化学耐药相关的新基因 | 首次揭示了三阴性乳腺癌细胞中转录异质性的显著性，并通过scRNA-seq识别了稀有的抗药性相关细胞亚群 | 未能明确所有机制，特别是在其他亚群中的耐药基因的作用 | 揭示三阴性乳腺癌中化疗耐药的转录特征 | 三阴性乳腺癌细胞 | 数字病理 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用了多种三阴性乳腺癌细胞样本，具体样本数量未说明 |
| 11122 | 2024-08-05 |
Reshaping the Tumor Microenvironment of KRASG12D Pancreatic Ductal Adenocarcinoma with Combined SOS1 and MEK Inhibition for Improved Immunotherapy Response
2024-Jun-21, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0172
PMID:38727236
|
研究论文 | 本研究探讨了KRAS靶向疗法对肿瘤微环境的影响。 | 提出将SOS1和MEK抑制联合用于改善免疫疗法反应的新策略。 | 缺乏持久反应，且肿瘤微环境仍然高度免疫抑制。 | 研究KRAS抑制如何影响肿瘤微环境以增强抗肿瘤效果。 | 使用KrasG12D、p53突变的鼠源性胰腺导管腺癌细胞系进行研究。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞系 | 使用多种KPCY细胞系进行实验 |
| 11123 | 2024-08-05 |
Destabilization of mRNAs enhances competence to initiate meiosis in mouse spermatogenic cells
2024-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.20.557439
PMID:37781613
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研究论文 | 这篇文章探讨了MEIOC如何在小鼠生殖细胞中分子地支持早期减数分裂。 | 该研究首次揭示了MEIOC在减数分裂启动前如何介导转录组变化，并早于之前的认识。 | 本研究主要集中在小鼠模型，结果的普遍适用性可能有限。 | 研究MEIOC如何影响小鼠生殖细胞中的减数分裂启动。 | 小鼠的生殖细胞，特别是有能力启动减数分裂的 spermatogenic cells。 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq 和 bulk RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 11124 | 2024-08-04 |
EHMT2 Inactivation in Pancreatic Epithelial Cells Shapes the Transcriptional Landscape and Inflammation Response of the Whole Pancreas
2024-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.14.584700
PMID:38529489
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研究论文 | 本研究阐明了EHMT2在维持胰腺转录组和炎症反应中的关键作用 | 揭示了EHMT2失活如何重塑局部环境并影响胰腺的炎症反应 | 未提及具体样本数量和研究范围的局限性 | 探讨EHMT2在胰腺炎症中的功能影响 | 采用条件性敲除小鼠模型研究胰腺外分泌细胞中的EHMT2 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA-seq、数字细胞学解卷积、空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | 条件性敲除动物的胰腺组织样本 |
| 11125 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals granzyme K-expressing cytotoxic Tfh cells in tertiary lymphoid structures in IgG4-RD
2024-02, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.08.019
PMID:37652139
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研究论文 | 本研究揭示了在IgG4相关疾病患者的三级淋巴结构中表达颗粒酶K的细胞毒性Tfh细胞。 | 发现了一种新的HLA+GZMK+细胞毒性Tfh细胞亚群，并提出浸润的Tfr细胞可能抑制这些细胞的功能。 | 研究主要集中在IgG4相关疾病患者的特定组织，可能限制了结果的广泛适用性。 | 通过单细胞转录组学识别IgG4-RD患者三级淋巴结构中的GC-Tfh细胞亚群。 | 来自IgG4相关疾病患者的组织浸润T细胞。 | 数字病理 | IgG4相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 已分析的样本来自IgG4相关疾病患者的受累病灶中的CD3+ T细胞 |
| 11126 | 2024-08-05 |
Genome-wide meta-analysis implicates variation affecting mast cell biology in urticaria
2024-02, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.08.033
PMID:37690594
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研究论文 | 本研究通过全基因组关联研究确定了影响荨麻疹易感性的基因组位点 | 识别了6个基因组位点与荨麻疹相关的常见遗传变异，这些位点涉及肥大细胞生物学中的特定基因 | 缺乏对其他种族或地区的研究结果，这可能限制了结果的普遍性 | 旨在确定影响荨麻疹易感性的基因组位点 | 研究对象为来自三个欧洲队列的荨麻疹病例和对照组 | 数字病理学 | 荨麻疹 | 全基因组关联研究 | NA | 遗传数据 | 14,306个荨麻疹病例和650,664个对照 |
| 11127 | 2024-08-05 |
Unravelling the heterogeneity of oral squamous cell carcinoma by integrative analysis of single-cell and bulk transcriptome data
2024-02, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18108
PMID:38279519
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研究论文 | 本研究通过单细胞和整体转录组数据的综合分析揭示了口腔鳞状细胞癌的异质性 | 识别出四种主要的肿瘤细胞亚群及其独特的分子特征和功能特性，并探讨其与肿瘤微环境的相互作用 | 研究可能没有涵盖所有潜在的亚群和与其相关的临床特征 | 探讨口腔鳞状细胞癌组织中肿瘤细胞的异质性及其与肿瘤微环境的相互作用 | 口腔鳞状细胞癌组织中的肿瘤细胞亚群及其功能特征 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 11128 | 2024-08-05 |
Expansion of highly interferon-responsive T cells in early-onset Alzheimer's disease
2024-Jan-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.26.559634
PMID:37823036
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研究论文 | 这篇论文研究了早发性阿尔茨海默病中高度干扰素反应性T细胞的扩展 | 发现早发性阿尔茨海默病中抗病毒样ISAGhi T细胞显著扩展 | 该研究主要基于单细胞RNA测序和公共数据，可能缺乏临床样本的多样性 | 探讨早发性阿尔茨海默病中的免疫反应及相关的T细胞特征 | 早发性阿尔茨海默病患者及临床正常对照的外周血单核细胞 | 免疫学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）及滴液数字PCR（ddPCR） | NA | 细胞数据 | 分析了约182,000个PBMC样本 |
| 11129 | 2024-08-04 |
Ehmt2 inactivation in pancreatic epithelial cells shapes the transcriptional landscape and inflammation response of the whole pancreas
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1412767
PMID:38948355
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研究论文 | 本研究探讨了Ehmt2在胰腺细胞中的失活如何影响整个胰腺的转录谱和炎症反应 | 揭示了Ehmt2在维护器官免受炎症影响中的重要作用，并展示了其对胰腺癌起始和炎症相关疾病的调控机制 | 未具体说明样本数量和特定实验条件的限制 | 研究Ehmt2在胰腺细胞中的作用及其对转录和炎症反应的影响 | 条件性缺失的胰腺外分泌上皮细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 来自条件性缺失动物的正常和年轻成人胰腺组织的比较研究 |
| 11130 | 2024-08-05 |
Deciphering the Underlying Mechanisms of Sanleng-Ezhu for the Treatment of Idiopathic Pulmonary Fibrosis Based on Network Pharmacology and Single-cell RNA Sequencing Data
2024, Current computer-aided drug design
IF:1.5Q3
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研究论文 | 本文揭示了三棱-莪术对特发性肺纤维化的治疗机制 | 首次利用网络药理学和单细胞RNA测序数据探索了三棱-莪术的作用机制，并确定了其影响的细胞类型和信号通路 | 未进行长期临床试验以验证三棱-莪术的疗效和安全性 | 探究三棱-莪术在特发性肺纤维化治疗中的潜在机制 | 特发性肺纤维化相关基因及生物活性成分 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | LC-MS/MS和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | GSE53845数据集中有1907个差异表达基因 |
| 11131 | 2024-08-04 |
Artificial intelligence-based pathology as a biomarker of sensitivity to atezolizumab-bevacizumab in patients with hepatocellular carcinoma: a multicentre retrospective study
2023-12, The Lancet. Oncology
DOI:10.1016/S1470-2045(23)00468-0
PMID:37951222
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研究论文 | 本研究开发了一种人工智能模型，以直接从组织切片中估计ABRS表达，并评估其与无进展生存期的相关性。 | 采用人工智能技术分析肝细胞癌数字切片作为无进展生存期的生物标志物，提供了新的治疗策略。 | 本研究为回顾性研究，可能会受到样本选择偏差的影响。 | 研究旨在开发一种人工智能模型来估计肝细胞癌患者对治疗的反应。 | 研究对象为接受了手术切除及活检的肝细胞癌患者。 | 数字病理学 | 肝癌 | 分子生物学分析，空间转录组学 | 聚类约束的注意力多实例学习模型（CLAM） | 组织切片图像 | 840名患者 |
| 11132 | 2024-08-05 |
Inflammatory Activity of Epithelial Stem Cell Variants from Cystic Fibrosis Lungs Is Not Resolved by CFTR Modulators
2023-11-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202305-0818OC
PMID:37695863
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研究论文 | 这篇文章探讨了囊性纤维化(CF)肺部上皮干细胞变体的炎症活性，并评估了CFTR调节剂的影响 | 首次识别了CF肺部的三种促炎干细胞变体，并证明CFTR调节剂未能抑制其促炎功能 | 研究仅限于终末期CF患者的样本，结果可能不适用于早期CF患者 | 确定CF肺部是否存在与正常肺干细胞不同的促病干细胞变体 | 研究CF患者的终末期肺部干细胞，重点关注促炎性变体 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序、RNA测序、异种移植 | NA | 组织样本 | 四名接受治疗的囊性纤维化患者 |
| 11133 | 2024-08-04 |
N4-acetylcytidine of Nop2 mRNA is required for the transition of morula-to-blastocyst
2023-Sep-28, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-04955-w
PMID:37768430
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研究论文 | 本研究探讨了Nop2 mRNA的N4-乙酰胞苷修饰在小鼠早期胚胎发育中的作用 | 首次揭示了NAT10介导的N4-乙酰胞苷修饰在小鼠前植入期胚胎中对mRNA稳定性和翻译效率的重要性 | 研究主要集中在小鼠胚胎中，结果可能无法直接推广到其他哺乳动物 | 旨在了解N4-乙酰胞苷修饰在小鼠早期胚胎发育中的功能 | 小鼠早期胚胎，包括缺乏NAT10的小鼠胚胎 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序, RNA-seq, 乙酰化RNA免疫沉淀结合PCR(acRIP-PCR) | NA | NA | NA |
| 11134 | 2024-08-05 |
Stem cell antigen-1+cell-derived fibroblasts are crucial for cardiac fibrosis during heart failure
2023-Sep-23, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-04957-8
PMID:37740736
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研究论文 | 本研究探讨了干细胞抗原-1+细胞来源的成纤维细胞在心力衰竭中的关键作用 | 揭示了非骨髓来源的Sca1+细胞通过Wnt4-PDGFRα通路转化为成纤维细胞并促进心脏纤维化的机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能在应用到人类时存在差异 | 探讨干细胞在心力衰竭中的作用及机制 | 小鼠和人类心脏中的干细胞抗原-1+细胞及其转化的成纤维细胞 | 数字病理学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 小鼠的非心肌细胞和人类心力衰竭患者的样本 |
| 11135 | 2024-08-05 |
CNS Repopulation by Hematopoietic-Derived Microglia-Like Cells Corrects Progranulin deficiency
2023-Sep-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3263412/v1
PMID:37790525
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研究论文 | 这篇文章探讨了通过造血干细胞移植来纠正Progranulin缺乏症的方法 | 提出了一种基于Busulfan和 PLX3397的高效条件处理方案，以增强微胶质细胞的再生 | 尚未提及该方法在临床应用中的具体限制 | 研究造血干细胞移植在CNS中替代微胶质细胞的能力 | 主要研究对象为骨髓来源的微胶质细胞及其在小鼠模型中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和高维CyTOF质谱细胞计数 | NA | 细胞 | 小鼠模型，具体样本大小未详细说明 |
| 11136 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveal a hyperacute cytokine and immune checkpoint axis after cardiac arrest in patients with poor neurological outcome
2023-Jul-14, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.05.003
PMID:37257452
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研究论文 | 本文探讨了心脏骤停后患者的单细胞转录组特征及其与神经预后不良的联系 | 首次在单细胞水平上揭示心脏骤停后超急性细胞因子和免疫检查点轴 | 样本量可能有限，可能影响研究结果的广泛适用性 | 研究心脏骤停后系统性炎症反应与神经损伤之间的关系 | 心脏骤停患者的单细胞免疫网络 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 血液样本 | 心脏骤停患者的外周血细胞 |
| 11137 | 2024-08-05 |
The meningeal transcriptional response to traumatic brain injury and aging
2023-01-03, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.81154
PMID:36594818
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研究论文 | 本研究利用高通量RNA测序技术探讨了脑膜对创伤性脑损伤和衰老的转录反应 | 该研究揭示了年轻和衰老小鼠在轻微脑损伤后的脑膜转录组动态变化 | 研究对脑膜生物学的基本认识仍然不足 | 探讨脑膜对创伤性脑损伤和衰老的转录反应 | 研究对象为年轻和衰老小鼠的脑膜 | 数字病理学 | 神经疾病 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 年轻小鼠和衰老小鼠 |
| 11138 | 2024-08-05 |
TSEE: an elastic embedding method to visualize the dynamic gene expression patterns of time series single-cell RNA sequencing data
2019-Apr-04, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-019-5477-8
PMID:30967106
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研究论文 | 提出了一种利用弹性嵌入方法可视化时间序列单细胞RNA测序数据的算法 | 开发了时间序列弹性嵌入(TSEE)算法，通过整合实验时间信息来增强对时间序列scRNA-seq数据的可视化 | NA | 旨在开发一种算法以可视化时间序列单细胞RNA测序数据 | 时间序列单细胞RNA测序数据，主要用于人类和斑马鱼的发育过程 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 弹性嵌入(EE) | 时间序列数据 | NA |
| 11139 | 2024-08-05 |
Cerebral organoids at the air-liquid interface generate diverse nerve tracts with functional output
2019-04, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-019-0350-2
PMID:30886407
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研究论文 | 本文探讨了大脑类器官在气液界面培养条件下的神经轨迹形成及其功能输出 | 通过气液界面培养，显著提高了神经元存活率和轴突生长，显示出不同的神经轨迹形态及功能 | 研究未提及样本数量的限制或长期功能观察 | 旨在改善对人脑发育和神经疾病的理解 | 研究对象为大脑类器官及其形成的神经网络 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 组织样本 | NA |
| 11140 | 2024-08-05 |
A diffusion-based microfluidic device for single-cell RNA-seq
2019-03-27, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/c8lc00967h
PMID:30815639
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研究论文 | 本文介绍了一种基于扩散的微流体设备，用于单细胞RNA测序 | 提出的MID-RNA-seq设备通过扩散试剂交换方案简化了单细胞RNA测序的执行 | NA | 开发一个低输入、高效率的单细胞RNA测序平台 | 单细胞样本的转录组研究 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | NA | NA |