单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 11101 - 11120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11101 | 2025-10-07 |
Single-cell pseudotime and intercellular communication analysis reveals heterogeneity and immune microenvironment in oral cancer
2025-Feb-10, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01918-4
PMID:39928204
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序、拟时序分析和细胞间通讯分析揭示口腔癌的异质性和免疫微环境特征 | 首次在口腔癌中整合单细胞RNA测序、拟时序分析和细胞间通讯网络分析，提供了关于肿瘤异质性的新视角 | NA | 研究口腔癌发展过程中的细胞亚型、状态转换和细胞间相互作用及其在肿瘤进展和免疫应答中的作用 | 口腔癌肿瘤微环境中的细胞 | 单细胞分析 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序, 拟时序分析, 细胞间通讯分析, PCA, UMAP, t-SNE, GSEA | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11102 | 2025-10-07 |
The expression and functional role of proline-rich 15 in non-small cell lung cancer
2025-Feb-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07373-x
PMID:39929816
|
研究论文 | 本研究探讨脯氨酸丰富蛋白15在非小细胞肺癌中的表达模式、功能作用及分子机制 | 首次系统揭示PRR15在非小细胞肺癌中的致癌功能及其通过Akt-mTOR信号通路的作用机制 | 主要基于细胞系和异种移植模型，缺乏直接临床干预验证 | 探索PRR15在非小细胞肺癌发生发展中的生物学功能 | 非小细胞肺癌组织样本、原代及已建系NSCLC细胞、异种移植模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、shRNA干扰、CRISPR/Cas9基因敲除、慢病毒过表达 | NA | 基因表达数据、蛋白质印迹数据、细胞功能实验数据 | NSCLC组织样本与正常肺组织对比、多种NSCLC细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11103 | 2025-10-07 |
Genome-wide characterization of circular RNAs in three rat models of pulmonary hypertension reveals distinct pathological patterns
2025-Feb-10, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11239-z
PMID:39930385
|
研究论文 | 通过高通量RNA测序分析三种肺动脉高压大鼠模型中环状RNA的全基因组表达模式 | 首次在三种肺动脉高压大鼠模型中全面揭示circRNA调控网络，发现不同模型特异的circRNA分布模式 | 研究仅限于大鼠模型，人类样本验证不足 | 探索环状RNA在肺动脉高压发病机制中的作用 | 三种肺动脉高压大鼠模型的肺动脉组织 | 生物信息学 | 肺动脉高压 | 高通量RNA测序, 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络 | RNA测序数据 | 三种大鼠模型（缺氧、缺氧/Sugen5416、野百合碱诱导） | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11104 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals the alteration of immune cell profile in peripheral blood of Henoch-Schonlein purpura
2025-Feb-07, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2025.110443
PMID:39924084
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示过敏性紫癜患者外周血免疫细胞谱的变化 | 首次结合单细胞RNA测序和多参数流式细胞术全面分析HSP患者外周血单个核细胞，发现不同临床亚型HSP的特异性免疫细胞特征 | 样本量相对有限，未涉及疾病不同阶段的动态追踪 | 探究过敏性紫癜患者外周血免疫细胞组成和状态的变化 | 健康供者和过敏性紫癜患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 过敏性紫癜 | 单细胞RNA测序，多参数流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 健康供者和HSP患者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11105 | 2025-10-07 |
Integrative Multi-omics Analysis and Mendelian Randomization Reveal Potential Therapeutic Targets and their Stratification in Lung Squamous Cell Carcinoma
2025-Feb-06, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 通过整合多组学分析和孟德尔随机化方法识别肺鳞状细胞癌的潜在治疗靶点及其分层 | 结合bulk RNA测序、单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法，首次对LUSC治疗靶点进行三级分层 | NA | 识别肺鳞状细胞癌的新型治疗靶点以改善治疗策略 | 肺鳞状细胞癌(LUSC) | 生物信息学 | 肺癌 | bulk RNA测序,单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,生存分析,孟德尔随机化,LASSO回归,蛋白质-蛋白质相互作用网络分析,免疫浸润评估,通路富集分析,伪时序分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 11106 | 2025-10-07 |
Single Cell RNA-Seq Identifies Cell Subpopulations Contributing to Idiopathic Pulmonary Fibrosis in Humans
2025-Feb, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70402
PMID:39928535
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了特发性肺纤维化患者肺部细胞亚群的比例变化及其在疾病发生发展中的作用 | 首次在人类IPF肺部中系统鉴定出多种细胞亚群的比例变化，并发现成纤维细胞向肌成纤维细胞分化、肺泡巨噬细胞向macrophage_SPP1亚群转化的轨迹 | 研究未深入探讨细胞亚群比例变化的具体分子机制和功能验证 | 阐明特发性肺纤维化发病机制中的细胞群体变化 | 特发性肺纤维化患者的肺部组织细胞 | 单细胞生物学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 特发性肺纤维化患者肺部组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11107 | 2025-10-07 |
Dynamic Activation of NADPH Oxidases in Immune Responses Modulates Differentiation, Function, and Lifespan of Plasma Cells
2025-Feb, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350975
PMID:39931760
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了NADPH氧化酶在B细胞动态表达及其对浆细胞分化、功能和寿命的调控机制 | 首次结合单细胞转录组学和单细胞NOX活性检测，系统揭示了NOX1和NOX2在B细胞亚群中的动态表达模式及其与代谢、功能和寿命的关联 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；未完全阐明ROS与细胞存活之间的具体分子机制 | 探究NADPH氧化酶活性在B细胞免疫应答中对细胞分化、功能能力和存活的影响 | 小鼠B细胞（二次免疫后的B细胞应答） | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学，单细胞NOX活性检测 | NA | 单细胞基因表达数据，酶活性数据 | 未明确样本数量的小鼠B细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11108 | 2025-10-07 |
Hunger Games: A Modern Battle Between Stress and Appetite
2025-Feb, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.70006
PMID:39936619
|
综述 | 探讨压力与食欲的相互作用机制及其在进食障碍发病过程中的神经生物学基础 | 强调海马-外侧隔区-下丘脑轴在整合压力与摄食信号中的新机制，并提出肠道微生物组等新兴研究方向 | 存在未解科学问题，如个体对压力易感性差异的机制尚未明确 | 阐明压力通过神经环路影响进食行为的机制，为进食障碍提供新的治疗靶点 | 进食障碍的神经生物学机制 | 神经科学 | 进食障碍 | 单细胞测序、先进人类成像技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11109 | 2025-10-07 |
A Bi-Specific T Cell-Engaging Antibody Shows Potent Activity, Specificity, and Tumor Microenvironment Remodeling in Experimental Syngeneic and Genetically Engineered Models of GBM
2025-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.18.628714
PMID:39763755
|
研究论文 | 本研究开发了一种靶向IL13Rα2的双特异性T细胞衔接抗体，并在免疫健全的胶质母细胞瘤小鼠模型中评估其治疗效果和机制 | 首次在免疫系统完整的小鼠模型中系统研究双特异性T细胞衔接抗体的作用机制，包括对肿瘤微环境的重塑作用 | 研究仅限于临床前动物模型，尚未在人体中进行验证 | 探究双特异性T细胞衔接抗体在胶质母细胞瘤治疗中的作用机制和疗效 | 胶质母细胞瘤小鼠模型和肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 多色流式细胞术、单细胞RNA测序、多重免疫荧光、多参数磁共振成像 | NA | 基因表达数据、影像数据、细胞表型数据 | 多个临床前胶质母细胞瘤模型的小鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11110 | 2025-10-07 |
TGFBR2 High mesenchymal glioma stem cells phenocopy regulatory T cells to suppress CD4+ and CD8+ T cell function
2025-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.07.631757
PMID:39829747
|
研究论文 | 本研究鉴定出一种表达免疫抑制效应分子模拟调节性T细胞的胶质瘤干细胞亚群，该亚群通过TGFBR2驱动抑制CD4+和CD8+ T细胞功能 | 首次发现间充质胶质瘤干细胞通过TGFBR2（而非TGFBR1）驱动免疫抑制性Treg样表型，并鉴定出6基因特征标志物 | 研究主要基于患者来源细胞和临床样本，需要进一步体内验证 | 阐明胶质母细胞瘤免疫抑制微环境中胶质瘤干细胞的免疫调节机制 | 患者来源的胶质瘤干细胞、临床胶质母细胞瘤标本、CD4+和CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序、生物信息学分析、分子操作、药理学干预 | NA | 测序数据、基因表达数据、临床数据 | 患者来源细胞和临床标本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 11111 | 2025-10-07 |
Differentiation signals induce APOBEC3A expression via GRHL3 in squamous epithelia and squamous cell carcinoma
2025-Jan, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00298-9
PMID:39548236
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了APOBEC3A在鳞状上皮和鳞状细胞癌中通过GRHL3转录因子表达的分化信号机制 | 首次发现APOBEC3A表达受GRHL3调控并局限于终末分化细胞，而在鳞癌中该表达扩展至增殖细胞 | 研究主要聚焦于鳞状上皮和鳞癌，其他类型癌症中的机制尚需进一步验证 | 探究APOBEC脱氨酶在正常组织和癌症中的表达调控机制及其在肿瘤发生中的作用 | 健康黏膜上皮和恶性黏膜上皮组织 | 单细胞生物学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,空间转录组学,功能实验 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,组织切片图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 11112 | 2025-10-07 |
Bronchoalveolar lavage single-cell transcriptomics reveals immune dysregulations driving COVID-19 severity
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0309880
PMID:39928675
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示COVID-19重症患者支气管肺泡灌洗液中免疫细胞失调机制 | 首次在单细胞水平系统揭示COVID-19重症患者中性粒细胞、巨噬细胞、树突状细胞、NK细胞和T细胞的协同失调机制 | 基于二次数据分析，缺乏实验验证；样本量未明确说明 | 探索COVID-19疾病严重程度的免疫学机制 | COVID-19患者和健康对照的支气管肺泡灌洗液样本 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11113 | 2025-10-07 |
Detection of hepatitis B virus mRNA from single cell RNA sequencing data without prior knowledge
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0314060
PMID:39932940
|
研究论文 | 本研究开发了一种无需先验知识即可从单细胞RNA测序数据中检测乙型肝炎病毒mRNA的方法 | 无需16S rRNA扩增或先验知识即可直接从scRNA-seq数据中检测病毒mRNA | 仅验证了乙型肝炎病毒，且依赖病毒mRNA具有poly-A尾的特征 | 开发从单细胞RNA测序数据中检测病毒mRNA的新方法 | 慢性乙型肝炎病毒感染患者的肝脏样本 | 单细胞测序分析 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 慢性HBV感染患者肝脏样本（包括有和无HBsAg消失的患者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11114 | 2025-10-07 |
Integrative multi-omics analysis for identifying novel therapeutic targets and predicting immunotherapy efficacy in lung adenocarcinoma
2025, Cancer drug resistance (Alhambra, Calif.)
DOI:10.20517/cdr.2024.91
PMID:39935429
|
研究论文 | 通过整合多组学分析识别肺腺癌的新型治疗靶点并预测免疫治疗疗效 | 识别了11个不同的细胞亚群和两种分子亚型，开发了多组学驱动的机器学习特征，发现RRM1作为化疗反应的关键生物标志物 | NA | 阐明肺腺癌的细胞亚群和分子亚型，识别关键生物标志物，探索潜在治疗靶点 | 肺腺癌患者队列 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组分析, 全基因组关联研究 | 贝叶斯反卷积, 机器学习算法 | 基因组数据, 转录组数据 | 多个肺腺癌患者队列 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 11115 | 2025-10-07 |
Identification of WDR74 and TNFRSF12A as biomarkers for early osteoarthritis using machine learning and immunohistochemistry
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1517646
PMID:39935469
|
研究论文 | 通过机器学习和免疫组化技术鉴定WDR74和TNFRSF12A作为早期骨关节炎的生物标志物 | 首次整合泛素化相关基因表达数据与机器学习方法识别早期骨关节炎生物标志物 | 研究样本来源单一（GEO数据库），需要更多临床样本验证 | 改善早期骨关节炎的诊断和预后 | 骨关节炎患者的软骨细胞 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，免疫组化 | XGBoost | 基因表达数据，图像数据 | 来自GEO数据库的单细胞RNA测序数据集和人膝关节标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11116 | 2025-10-07 |
Exploring Core Genes Associated with Sepsis and Systemic Inflammatory Response Syndrome Using Single-Cell Sequencing Technology
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S448900
PMID:39935525
|
研究论文 | 利用单细胞测序技术探索脓毒症和全身炎症反应综合征的核心基因 | 首次通过单细胞转录组分析揭示脓毒症死亡组和SIRS患者血液样本中免疫细胞亚群的差异表达基因 | 样本量有限，缺乏独立验证队列 | 识别脓毒症和SIRS的独特生物标志物和免疫应答模式 | 脓毒症死亡患者和全身炎症反应综合征患者的血液样本 | 生物信息学 | 脓毒症，全身炎症反应综合征 | 单细胞RNA测序 | UMAP细胞聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 脓毒症死亡组和SIRS患者血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11117 | 2025-10-07 |
Deconvolution of spatial transcriptomics data via graph contrastive learning and partial least square regression
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf052
PMID:39924717
|
研究论文 | 提出一种基于图对比学习和偏最小二乘回归的空间转录组数据反卷积方法CLPLS | 首次将图对比学习与偏最小二乘回归结合用于空间转录组反卷积，并能整合单细胞多组学数据探索空间表观基因组异质性 | NA | 开发空间转录组数据反卷积方法以解析组织内细胞空间架构 | 空间转录组数据和单细胞多组学数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组测序，单细胞多组学测序 | 图对比学习，偏最小二乘回归 | 基因表达数据，染色质可及性数据 | 模拟数据集和来自不同平台的真实数据集 | NA | 空间转录组学，单细胞多组学 | NA | NA |
| 11118 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomic revealed intratumor heterogeneity and cancer stem cell enrichment in colorectal cancer metastasis
2024-Oct-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217181
PMID:39159882
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组技术揭示结直肠癌原发灶和肝转移灶的瘤内异质性及癌症干细胞富集机制 | 首次利用空间转录组技术系统揭示结直肠癌转移过程中的瘤内异质性特征，发现FOXD1作为新型转移性癌症干细胞标志物 | 仅分析两对原发灶与匹配转移灶样本，样本量有限 | 探索结直肠癌转移的细胞机制和癌症干细胞作用 | 结直肠癌患者的原发肿瘤组织及匹配的肝转移组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | 轨迹分析、伪时间分析、CellphoneDB互作分析 | 空间RNA转录组数据 | 2例原发结直肠癌组织及其匹配的肝转移组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 空间转录组技术 |
| 11119 | 2025-10-07 |
Inferring pattern-driving intercellular flows from single-cell and spatial transcriptomics
2024-Oct, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02380-w
PMID:39187683
|
研究论文 | 提出FlowSig方法，从单细胞和空间转录组数据推断细胞间通讯驱动的信息流 | 首次结合图形因果建模和条件独立性分析，揭示细胞间通讯与细胞内基因模块之间的耦合关系 | 方法依赖于因果推断假设，需要实验验证其生物学意义 | 开发从单细胞和空间转录组数据推断细胞间信息流的方法 | 皮质类器官、胰腺胰岛、COVID-19患者样本、小鼠胚胎 | 生物信息学 | COVID-19, 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 图形因果模型 | 基因表达数据 | 多种实验数据集和合成数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 11120 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals placental response under environmental stress
2024-Aug-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50914-9
PMID:39095385
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究环境应激下胎盘的反应机制 | 首次在单细胞水平揭示砷暴露下胎盘细胞类型特异性反应，发现PRAP1基因在26种胎盘细胞类型中显著上调并具有性别偏好性 | 研究主要基于小鼠模型，人类细胞验证有限 | 探究环境应激下胎盘的分子响应机制 | 小鼠胎盘细胞和人类滋养层细胞 | 单细胞生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序，体外实验，离体实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种胎盘细胞类型（包括多种滋养层细胞） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |