单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27924 篇文献，本页显示第 11081 - 11100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11081 | 2024-08-04 |
Tissue gene expression profiles and communication networks inform candidate blood biomarker identification in psoriasis and atopic dermatitis
2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110283
PMID:38880200
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学识别了银屑病和特应性皮炎患者的转录特征。 | 本研究首次通过空间转录组学结合体外预测探索了潜在的血液生物标志物，为其他炎症性疾病的研究提供了新方法。 | 研究可能存在样本规模限制，且对某些转录本的验证仅限于外周血T细胞。 | 本研究旨在识别银屑病和特应性皮炎的潜在生物标志物。 | 研究对象为银屑病和特应性皮炎患者的角质形成细胞和特定CD4/CD8 T淋巴细胞。 | 数字病理学 | 银屑病, 特应性皮炎 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11082 | 2024-08-05 |
Integrated multi-omics analysis and machine learning developed diagnostic markers and prognostic model based on Efferocytosis-associated signatures for septic cardiomyopathy
2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110301
PMID:38944364
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研究论文 | 这篇文章通过整合多组学分析，揭示了与凋亡细胞吞噬相关的关键基因及其在脓毒症心肌病中的作用 | 识别了一个新的与凋亡细胞吞噬相关的脓毒症心肌病亚型及诊断生物标志物 | NA | 探讨凋亡细胞吞噬在脓毒症心肌病中的临床和遗传作用 | 脓毒症患者的外周血单核细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 脓毒症心肌病 | scRNA-seq | NA | 基因数据 | 感染脓毒症患者的外周血单核细胞 |
| 11083 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing of facial adipose tissue unveils FKBP5 as a therapeutic target for facial infiltrating lipomatosis
2024-Jul-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03835-9
PMID:39020442
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研究论文 | 本研究揭示了FKBP5作为面部浸润性脂肪瘤的治疗靶点。 | 首次通过单细胞转录组测序确定了FKBP5在面部浸润性脂肪瘤中的显著过表达。 | 尚未完全理解PIK3CA变异的具体机制。 | 探讨面部浸润性脂肪瘤的发病机制及其潜在治疗靶点。 | 面部浸润性脂肪瘤患者和非患者的面部脂肪组织。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 组织样本 | 面部脂肪组织样本来源于FIL患者和非FIL个体 |
| 11084 | 2024-08-05 |
Perimenopausal and Menopausal Mammary Glands In A 4-Vinylcyclohexene Diepoxide Mouse Model
2024-Jul-17, Journal of mammary gland biology and neoplasia
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10911-024-09569-x
PMID:39017946
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研究论文 | 该论文描述了一种新的小鼠模型，能够表征围绝经期和绝经期乳腺腺体。 | 创新点在于开发了4-乙烯基环己烯二醇小鼠模型，该模型能够精准模拟女性的围绝经期和绝经期状态。 | 该研究未明确提及对模型的其他潜在限制。 | 研究围绝经期和绝经期对乳腺癌的影响。 | 对4-乙烯基环己烯二醇处理的小鼠乳腺进行表征与分析。 | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | VCD小鼠模型 | 生物样本 | 实验中使用了处理的小鼠，但具体样本数量未提及 |
| 11085 | 2024-08-05 |
The thalamic reticular nucleus orchestrates social memory
2024-Jul-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.04.013
PMID:38701789
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研究论文 | 本文研究了感觉丘脑网状核中介导社会记忆的parvalbumin阳性神经元 | 揭示了sTRN神经元通过调节新的皮层-丘脑回路协调社会记忆的机制 | 研究中可能未涵盖所有影响社会记忆的神经元类型或回路 | 探讨sTRN神经元在社会记忆中的作用 | 老鼠的parvalbumin阳性神经元及其在社会记忆中的功能 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 生物化学数据 | NA |
| 11086 | 2024-08-04 |
Integrative multi-omics analysis reveals cellular and molecular insights into primary Sjögren's syndrome
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33433
PMID:39027515
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研究论文 | 本研究综合分析了基因组、转录组、蛋白质组和单细胞测序数据，以揭示原发性舍格伦综合征的分子基础 | 通过整合多组学数据，发现CTSS和GSTO1是潜在的生物标志物和治疗靶点 | 需要进一步研究以阐明潜在机制并开发针对这种复杂自身免疫疾病的靶向疗法 | 研究原发性舍格伦综合征的分子基础及探索潜在的治疗靶点 | 研究原发性舍格伦综合征患者的不同血细胞类型的差异表达基因 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组、转录组和蛋白质组数据 | NA |
| 11087 | 2024-08-04 |
NDC80/HEC1 promotes macrophage polarization and predicts glioma prognosis via single-cell RNA-seq and in vitro experiment
2024-Jul, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14850
PMID:39021287
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研究论文 | 该研究探讨了HEC1在胶质瘤中的功能及其对预后的影响 | 首次揭示了HEC1的过表达与胶质瘤预后不良和肿瘤微环境中的免疫抑制相关 | 研究主要集中在细胞实验和RNA-seq分析，临床应用尚需进一步验证 | 探讨HEC1在胶质瘤中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 胶质瘤及其细胞系 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 人类胶质瘤组织和细胞系 |
| 11088 | 2024-08-04 |
Opening the Black Box: Spatial Transcriptomics and the Relevance of Artificial Intelligence-Detected Prognostic Regions in High-Grade Serous Carcinoma
2024-Jul, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2024.100508
PMID:38704029
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研究论文 | 本研究探讨了空间转录组学与人工智能识别的与预后相关区域在高等级浆液性癌中的相关性 | 该研究展示了AI引导的空间转录组分析改善了与患者预后相关的生物特征的识别 | 对肿瘤的异质性理解有限，且样本量相对较小 | 提高对高等级浆液性癌患者预后相关生物特征的理解 | 研究对象为16名接受初次减瘤手术和铂类化疗的高等级浆液性癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学 | 深度学习模型 | 组织样本 | 16名患者，分别为8名短期和长期化疗反应组 |
| 11089 | 2024-08-05 |
Integrative profiling of untreated primary membranous nephropathy at the single-cell transcriptome level
2024-Jul, Clinical kidney journal
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/ckj/sfae168
PMID:39027416
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研究论文 | 本研究在单细胞转录组水平上综合剖析了未治疗的原发性膜性肾病 | 首次利用单细胞RNA测序全面分析原发性膜性肾病患者的血液、肾脏和尿液样本，揭示了细胞成分和细胞间通信的变化 | 样本数量较少，仅包含五名患者，可能限制了结果的普遍性 | 探讨原发性膜性肾病的发病机制与潜在的干预策略 | 五名经活检证实的原发性膜性肾病患者 | 数字病理学 | 原发性膜性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液、肾脏和尿液样本 | 五名患者的血液、肾脏和尿液样本 |
| 11090 | 2024-08-05 |
Selectively T cell phosphorylation activation of azvudine in the thymus tissue with immune protection effect
2024-Jul, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2024.03.032
PMID:39027259
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研究论文 | 本研究探讨了药物Azvudine在胸腺组织中选择性激活T细胞磷酸化的作用及其免疫保护效果 | 研究表明胸腺的免疫细胞对氟呱韦(FNC)表现出较强的代谢能力，并强调了磷酸化激酶在NA药物性质评估中的重要性 | 本研究主要在大鼠和树猕猴模型中进行，可能缺乏对人类患者的直接适用性 | 探讨Azvudine在处理COVID-19患者时的免疫保护机制 | 该研究的对象为大鼠和SARS-CoV-2树猕猴的胸腺组织 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组学，蛋白质组学，平行反应监测（PRM） | NA | RNA，蛋白质 | NA |
| 11091 | 2024-08-05 |
scBoolSeq: Linking scRNA-seq statistics and Boolean dynamics
2024-Jul, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011620
PMID:38976751
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研究论文 | 提出了一种名为scBoolSeq的方法，旨在将scRNA-seq数据与基因的布尔激活状态双向链接。 | scBoolSeq能够通过计算统计标准和适应基因相关参数的概率模型，成功实现对scRNA-seq数据的二值化和从布尔模型生成合成数据。 | 将scRNA-seq数据特征与布尔状态链接是一项具有挑战性的任务。 | 研究目的在于实现scRNA-seq数据与布尔动力学之间的连接，以促进数据驱动的模型构建和验证。 | 研究对象包括基因及转录因子的激活状态以及scRNA-seq数据集。 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用参考的scRNA-seq数据集进行案例研究，具体样本量未明确说明 |
| 11092 | 2024-08-05 |
Foundation models in molecular biology
2024-Jun-30, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2024.240006
PMID:39027316
|
研究论文 | 本文总结了基于分子生物学中各种数据的基础模型。 | 介绍了在分子生物学中发展的基础模型，并探讨了其潜在的研究方向。 | 未提及具体的局限性 | 探索和总结分子生物学中基础模型的发展情况。 | 聚焦于RNA序列、DNA序列、蛋白质序列、单细胞转录组和空间转录组数据。 | 自然语言处理 | NA | 大型语言模型 | 基础模型 | RNA序列数据、DNA序列数据、蛋白质序列数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA |
| 11093 | 2024-08-05 |
Synergistic immunochemotherapy targeted SAMD4B-APOA2-PD-L1 axis potentiates antitumor immunity in hepatocellular carcinoma
2024-Jun-17, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06699-2
PMID:38886351
|
研究论文 | 本研究提出了一种针对肝细胞癌的协同免疫化疗策略，显著提高了患者的抗肿瘤免疫反应 | 首次提出聚焦于SAMD4B-APOA2-PD-L1轴的协同免疫化疗，组合了三种常见抗肿瘤药物以提高肝细胞癌患者的三年生存率 | 缺乏更大规模临床试验的验证以及长期效果的数据 | 提高晚期肝细胞癌患者的预后和生存率 | 晚期肝细胞癌患者和PDX小鼠模型 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、2'-O-甲基化修饰、多重免疫荧光染色 | NA | 文本 | 包括临床实践中的晚期肝细胞癌患者和PDX小鼠模型 |
| 11094 | 2024-08-05 |
Comprehensive pan-cancer analysis of mitochondrial outer membrane permeabilisation activity reveals positive immunomodulation and assists in identifying potential therapeutic targets for immunotherapy resistance
2024-Jun, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1735
PMID:38899748
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研究论文 | 本研究深入探讨了肿瘤线粒体外膜通透性活动对免疫的影响 | 创新性地开发了MOMP特征（MOMP.Sig）以准确反映肿瘤MOMP活动，并使用机器学习模型展示了其临床预测价值 | NA | 明确肿瘤MOMP对免疫及免疫疗法效果的影响，指导更有效的免疫治疗策略 | 分析了包括30种癌症类型转录组和免疫疗法转录组在内的综合数据集 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤和三阴性乳腺癌 | scRNA-seq | 机器学习模型 | 转录组数据 | 涉及30种癌症类型的转录组和20个免疫治疗转录组以及3个免疫治疗scRNA-seq数据集 |
| 11095 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics of gastric cancer brain metastasis reveals atypical vasculature strategies with supportive immune profiles
2024, Gastroenterology report
IF:3.8Q2
DOI:10.1093/gastro/goae067
PMID:39027914
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研究论文 | 本研究揭示了胃癌脑转移中不典型血管化策略和支持性免疫特征的空间转录组学。 | 本研究展示了肿瘤与免疫成分之间的空间互动，特别是不同的血管招募策略，提供了对GCBM的新的分子见解。 | 该研究的样本数量有限，仅研究了三例GCBM患者，可能影响结果的广泛适用性。 | 研究胃癌脑转移患者中不同细胞成分之间的空间相互作用，尤其是血管系统与脑微环境的关系。 | 研究对象为三名胃癌脑转移患者的肿瘤、免疫和脑组织区域。 | 数字病理学 | 胃癌 | 数字空间分析 | NA | 转录组数据 | 三名胃癌脑转移患者的140个区域 |
| 11096 | 2024-08-05 |
scVIC: deep generative modeling of heterogeneity for scRNA-seq data
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae086
PMID:39027640
|
研究论文 | 本文介绍了scVIC，一种用于单细胞RNA测序数据的深度生成建模算法 | scVIC创新性地同时处理生物异质性和批次效应，解决了传统方法的局限性 | 本文未提及具体的限制性因素 | 该研究旨在开发一种有效的方法以准确分析单细胞层面的异质性 | 研究对象为模拟和生物单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 变分推断 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用了模拟和生物scRNA-seq数据集 |
| 11097 | 2024-08-05 |
Network-based pharmacology and UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS reveal Jinhua Qinggan granule's mechanism in reducing cellular inflammation in COVID-19
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1382524
PMID:39026676
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研究论文 | 本研究探讨了金华清感颗粒在治疗COVID-19中减少细胞炎症的机制 | 首次利用网络药理学和UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS识别金华清感颗粒的成分及其在COVID-19中的作用机制 | 该研究未提供金华清感颗粒在临床应用中的长期效果数据 | 研究金华清感颗粒在COVID-19中的功效及其机制 | 主要研究金华清感颗粒对外周血单核细胞中免疫细胞的影响 | 数字病理学 | COVID-19 | UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS，单细胞RNA测序 | NA | 化学成分，免疫细胞的RNA数据 | 分析了73种化合物和外周血单核细胞 |
| 11098 | 2024-08-05 |
Advancing immunotherapy for melanoma: the critical role of single-cell analysis in identifying predictive biomarkers
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1435187
PMID:39026661
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研究论文 | 该文章探讨了单细胞分析在黑色素瘤免疫治疗中的关键作用 | 首次强调了单细胞分析技术在预测黑色素瘤患者治疗反应的潜力 | 存在RNA-蛋白表达不一致和肿瘤异质性等挑战 | 研究黑色素瘤的免疫微环境及其对治疗反应的影响 | 探索黑色素瘤细胞及其与免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 11099 | 2024-08-04 |
BayesTME: An end-to-end method for multiscale spatial transcriptional profiling of the tissue microenvironment
2023-07-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.06.003
PMID:37473731
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研究论文 | BayesTME是一种用于分析空间转录组数据的端到端贝叶斯方法 | BayesTME将多个以前独立的分析目标统一在一个整体的生成模型下，避免了对配对的单细胞RNA-seq的需求 | NA | 本研究的目的是分析肿瘤微环境中的空间转录组数据 | 人类和斑马鱼黑色素瘤组织 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | 贝叶斯生成模型 | 组织样本 | 人类和斑马鱼的黑色素瘤组织 |
| 11100 | 2024-08-05 |
SiftCell: A robust framework to detect and isolate cell-containing droplets from single-cell RNA sequence reads
2023-07-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.06.002
PMID:37473732
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研究论文 | 本研究提出了SiftCell，一个用于检测和隔离含细胞液滴的鲁棒框架 | SiftCell通过随机化和分类方法提供了一种全面且准确的细胞液滴质量控制新方式 | 文章未提及具体的限制 | 旨在提高单细胞RNA测序数据中细胞液滴的质量控制 | 研究对象为各类单细胞平台获得的数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 多个单细胞平台获得的数据集 |