单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 11081 - 11100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11081 | 2024-08-04 |
Glutamine metabolism prognostic index predicts tumour microenvironment characteristics and therapeutic efficacy in ovarian cancer
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18198
PMID:38506093
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研究论文 | 本文探讨了谷氨酰胺代谢在卵巢癌肿瘤微环境特征和治疗效果中的预测作用 | 构建了谷氨酰胺代谢预测指数（GMPI），作为卵巢癌的独立预测因子 | 尚未全面阐明谷氨酰胺代谢在肿瘤微环境中的总体角色 | 研究谷氨酰胺代谢在卵巢癌中的作用及其预测患者预后的能力 | 患者的卵巢癌及其在肿瘤微环境中的特征 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | NA |
| 11082 | 2024-08-05 |
Combining bulk and scRNA-seq to explore the molecular mechanisms governing the distinct efferocytosis activities of a macrophage subpopulation in PDAC
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18266
PMID:38501838
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研究论文 | 本研究探讨了在胰腺导管腺癌（PDAC）中不同巨噬细胞亚群的吞噬活性所涉及的分子机制。 | 首次结合大样本和单细胞RNA测序数据，揭示了PDAC中巨噬细胞亚型在吞噬过程中的活性差异及其转录因子的作用。 | 样本量虽大，但只来自于基因表达公共数据库，缺乏临床数据的交叉验证。 | 分析巨噬细胞亚群在PDAC中的作用，以提高PDAC患者的预后。 | 涉及22,124个细胞的PDAC组织样本，分析其在吞噬过程中的活性及转录因子。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞类型数据 | 8个PDAC组织样本，分析了22,124个细胞 |
| 11083 | 2024-08-05 |
Exploring the current landscape of single-cell RNA sequencing applications in gastric cancer research
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18159
PMID:38494861
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综述 | 本文探讨了单细胞RNA测序在胃癌研究中的应用现状 | 研究单细胞RNA测序在揭示肿瘤异质性及识别潜在治疗靶点方面的重要性 | 肿瘤异质性和技术限制仍然是该领域面临的主要障碍 | 探讨单细胞RNA测序对胃癌研究的意义及其优缺点 | 胃癌的细胞群体、稀有细胞及动态转录变化 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 11084 | 2024-08-04 |
STRN3 promotes tumour growth in hepatocellular carcinoma by inhibiting the hippo pathway
2024-03, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18147
PMID:38429901
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研究论文 | 本研究发现STRN3通过抑制Hippo通路促进肝细胞癌的肿瘤生长 | 首次揭示了STRN3通过抑制Hippo通路来促进肝细胞癌肿瘤生长的机制 | 本研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据，可能存在数据来源的限制 | 旨在探究STRN3在肝细胞癌中的功能及其对肿瘤生长的影响 | 对371名肝癌患者及其肿瘤和正常组织进行了临床相关性分析 | 数字病理学 | 肝癌 | qRT-PCR, western blotting, CCK8实验, 转移实验, 流式细胞术, 单细胞测序, 免疫组化 | NA | 细胞组织样本和临床数据 | 371名肝癌患者及其组织样本 |
| 11085 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomic analysis in clear cell renal cell carcinoma: Deciphering the role of APP within the tumour microenvironment
2024-03, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18186
PMID:38445803
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研究论文 | 本研究探讨了淀粉样前体蛋白(APP)在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤微环境中的角色 | 首次运用单细胞转录组分析揭示了APP在ccRCC的肿瘤相关巨噬细胞中的表达及其与临床结果的相关性 | 需要进一步研究来验证这些发现并探讨APP的调控机制及治疗意义 | 了解淀粉样前体蛋白(APP)在ccRCC肿瘤微环境中的潜在预后生物标志物作用 | 聚焦于肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)中APP的表达及其与ccRCC患者预后的关系 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达谱 | NA |
| 11086 | 2024-08-04 |
Progress in single-cell multimodal sequencing and multi-omics data integration
2024-Feb, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-023-01092-3
PMID:38495443
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综述 | 本文总结了单细胞多模态组学数据的实验方法和多组学数据整合的计算方法 | 提出了将多种单细胞组学技术整合以获得更全面的细胞状态 | 可能没有深入探讨每种整合技术的具体应用和局限性 | 旨在探讨单细胞多模态组学及其数据整合在理解细胞状态和基因调控中的应用 | 单细胞多模态组学技术和数据整合方法 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 组学数据 | NA |
| 11087 | 2024-08-05 |
Increased blood CSF3R+ myeloid-derived suppressor cell is a predictor for breast cancer recurrence
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/MUKD2745
PMID:39005677
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研究论文 | 本研究探讨了CSF3R+骨髓来源抑制细胞（MDSCs）在乳腺癌复发中的潜在作用 | 首次确认CSF3R+ MDSCs作为预测乳腺癌复发的生物标志物 | 该研究样本量较小，仅包含35名乳腺癌患者 | 研究MDSCs在乳腺癌复发中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 乳腺癌患者中MDSCs的丰度及基因表达特征 | 数字病理学 | 乳腺癌 | NanoString分析 | 动物模型 | 血液标本 | 35名乳腺癌患者 |
| 11088 | 2024-08-05 |
Integrated pan-cancer genomic analysis reveals the role of SLC30A5 in the proliferation, metastasis, and prognosis of hepatocellular carcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.97214
PMID:39006068
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研究论文 | 本研究探讨了SLC30A5在肝细胞癌中的表达及其预后意义。 | 发现SLC30A5在多个肿瘤类型中表达上调，并与肝细胞癌的不良预后相关联。 | 研究主要集中于肝细胞癌，其他类型癌症的相关性尚需进一步验证。 | 探讨SLC30A家族基因在多种癌症中的表达及其预后影响，特别是在肝细胞癌中的作用。 | 主要研究对象为SLC30A5及其在肝细胞癌中的作用。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠异种移植模型 | 基因表达数据 | 涉及33种癌症类型的样本，Huh7细胞系用于功能实验 |
| 11089 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis Identifies Distinct Populations of Cytotoxic CD4+ T Cells Linked to the Therapeutic Efficacy of Immune Checkpoint Inhibitors in Metastatic Renal Cell Carcinoma
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S457570
PMID:39006494
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序分析了转移性肾细胞癌患者中的细胞毒性CD4+ T细胞亚群及其与免疫检查点抑制剂疗效之间的关系 | 首次揭示了转移性肾细胞癌中细胞毒性CD4+ T细胞的不同状态及其在抗肿瘤免疫中的关键作用 | 该研究的验证主要依赖于初步的多重免疫荧光染色，进一步验证需要更多的实验支持 | 探讨细胞毒性CD4+ T细胞在转移性肾细胞癌患者接受免疫检查点抑制剂治疗时的作用 | 转移性肾细胞癌患者的CD4+ T细胞亚群 | 免疫学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | 转移性肾细胞癌患者的相关数据集 |
| 11090 | 2024-08-05 |
Transcriptomic profiling of retinal cells reveals a subpopulation of microglia/macrophages expressing Rbpms marker of retinal ganglion cells (RGCs) that confound identification of RGCs
2023-07-15, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2023.148377
PMID:37121423
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了一种表达Rbpms标记的视网膜小胶质细胞/巨噬细胞亚群，并指出其可能会干扰视网膜神经节细胞（RGCs）的识别 | 首次发现Rbpms+视网膜小胶质细胞/巨噬细胞亚群可能导致对RGC的错误识别，并提供了避免此问题的解决方案 | 研究集中在特定条件下，可能无法完全代表所有视网膜细胞类型的复杂性 | 探讨RGCs的生物学和亚型，以及神经保护和轴突再生的机制 | 视网膜小胶质细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11091 | 2024-08-05 |
Transcriptomic profiling of retinal cells reveals a subpopulation of microglia/macrophages expressing Rbpms and Spp1 markers of retinal ganglion cells (RGCs) that confound identification of RGCs
2023-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.23.525216
PMID:36747805
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研究论文 | 本文分析了小鼠视网膜的微胶质细胞和巨噬细胞，发现其中特定亚群可能导致对视网膜神经节细胞的误识别 | 揭示了Rbpms+和Spp1+微胶质细胞/巨噬细胞在视网膜神经节细胞鉴定中的潜在混淆作用 | 仅分析了小鼠的视网膜细胞，无法推广到其他物种 | 研究视网膜神经节细胞的生物学及其亚型 | 视网膜微胶质细胞和巨噬细胞 | 数字病理 | NA | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 视网膜细胞亚群体 |
| 11092 | 2024-08-05 |
Celda: a Bayesian model to perform co-clustering of genes into modules and cells into subpopulations using single-cell RNA-seq data
2022-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqac066
PMID:36110899
|
研究论文 | 本文开发了一种名为Celda的新型贝叶斯模型，用于对单细胞RNA-seq数据中的基因和细胞进行共同聚类 | Celda能够量化每个基因对每个模块的概率贡献，并在其他常用流程中遗漏的细胞亚群中取得新的发现 | 未提及 | 揭示复杂组织的分子和细胞构建块，并表征转录程序及细胞异质性 | 使用单细胞RNA-seq数据进行基因和细胞的共同聚类分析 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | 贝叶斯层次模型 | 基因表达数据 | 外周血单核细胞数据集 |
| 11093 | 2024-08-05 |
A time-resolved, multi-symbol molecular recorder via sequential genome editing
2022-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04922-8
PMID:35794474
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研究论文 | 本文描述了DNA打字机的系统，作为一种体内分子记录的通用方法 | 提出了一种新的分子记录方法，克服了现有DNA记忆设备的限制，能够捕捉事件的顺序和同时记录多个符号 | 尚未提及具体的限制因素 | 实现体内分子记录，记录复杂事件历史和短文本信息 | 使用单细胞RNA测序重建3,257个细胞的单系谱 | 数字病理学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 3,257个细胞 |
| 11094 | 2024-08-05 |
A single-cell transcriptomic atlas of the developing chicken limb
2019-May-22, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-019-5802-2
PMID:31117954
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序构建了小鸡肢体发育的转录组图谱 | 首次在细胞分辨率下 catalog 了小鸡环肢的发育组织类型和转录组动态 | 目前的研究主要集中在小鸡肢体的发育阶段，可能不适用于其他物种 | 揭示转录细胞类型特异性程序与形态形成之间动态相互作用 | 研究小鸡发育过程中不同的组织类型及其转录组动态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞转录组数据 | 共测序了来自小鸡三个人肢发育阶段的17,628个细胞 |
| 11095 | 2024-08-05 |
Multiplexed, Sequential Secretion Analysis of the Same Single Cells Reveals Distinct Effector Response Dynamics Dependent on the Initial Basal State
2019-May-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.201801361
PMID:31065513
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研究论文 | 该文章展示了一种基于微芯片的多重、序列化的分泌分析方法，用于研究单个免疫细胞的效应器响应动态. | 文章创新性地提出了一种在同一单细胞上进行10重分泌测定的方法，揭示了基于初始基础状态的不同效应器响应动态 | 样本数量和时间点可能限制了对更广泛免疫反应的全面理解 | 研究不同激活模式下单个人类巨噬细胞对特定刺激物的响应动态 | 单个免疫细胞，尤其是人类巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 微芯片基础的分泌分析 | NA | 蛋白质分泌数据和单细胞RNA测序数据 | 大约5000个单细胞，在4个时间点同时测量 |
| 11096 | 2024-08-05 |
Endothelial-to-haematopoietic transition: an update on the process of making blood
2019-04-30, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20180320
PMID:30902922
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评论 | 本综述总结了血液生成中内皮细胞向造血细胞转变的最新发现 | 更新了内皮向造血细胞转变（EHT）过程的诸多细节与研究进展 | 未提及具体的实验数据或模型验证 | 总结内皮细胞转变为造血细胞的过程和最新发现 | 胚胎中内皮细胞及其转变过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 小鼠、鸡和斑马鱼胚胎 | NA | 多种模型系统，包括小鼠、鸡和斑马鱼胚胎 |
| 11097 | 2024-08-05 |
Learning mutational graphs of individual tumour evolution from single-cell and multi-region sequencing data
2019-Apr-25, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-019-2795-4
PMID:31023236
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研究论文 | 本文介绍了一种新的计算框架TRaIT，用于推断肿瘤进化的突变图 | TRaIT是首个支持单细胞和多区域测序数据的同一统计框架，能够捕获复杂的进化现象 | 文中未提及具体的局限性 | 研究旨在重建个体肿瘤的进化模型 | 研究对象为通过单细胞和多区域测序获取的癌症数据集 | 数字病理学 | 肿瘤 | 测序 | 突变图模型 | 基因组数据 | 涉及多区域和单细胞测序的数据集，具体样本量未说明 |
| 11098 | 2024-08-05 |
Ex vivo Dynamics of Human Glioblastoma Cells in a Microvasculature-on-a-Chip System Correlates with Tumor Heterogeneity and Subtypes
2019-Apr-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.201801531
PMID:31016107
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研究论文 | 这篇文章评估了来自十名胶质母细胞瘤患者的BTSCs在微血管芯片系统中的动态 | 建立了微血管芯片系统作为PVN模型，揭示了泰BTSCs的运动特征与肿瘤异质性和亚型之间的关系 | 样本数量较小，仅涵盖十名患者，可能限制了研究结果的普适性 | 研究人类胶质母细胞瘤细胞在微血管环境中的动态与肿瘤异质性之间的关系 | 十名胶质母细胞瘤患者的脑肿瘤干细胞(BTSCs) | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞 | 10名患者，合计21,750个单细胞 |
| 11099 | 2024-08-05 |
SAFE-clustering: Single-cell Aggregated (from Ensemble) clustering for single-cell RNA-seq data
2019-04-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty793
PMID:30202935
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SAFE-clustering的单细胞RNA-seq数据聚类方法 | SAFE-clustering是一种灵活、准确且稳健的聚类方法，通过集成多种聚类方法的结果构建共识解 | NA | 提高单细胞RNA-seq数据的细胞类型聚类的准确性 | 多个单细胞RNA-seq数据集 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | 聚类算法 | 数据集 | 12个数据集，单细胞数量从49到32,695不等 |
| 11100 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling of the Ciona larval brain
2019-04-15, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2018.09.023
PMID:30392840
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研究论文 | 该文章描述了使用单细胞RNA测序对Ciona幼虫大脑的转录组进行了分析 | 首次利用单细胞RNA测序技术对Ciona幼虫大脑的转录组进行全面剖析 | 仅关注特定类型的大脑细胞，可能无法全面代表整个大脑的基因表达特征 | 探索脊椎动物中枢神经系统的发育与连接 | Ciona robusta幼虫的单个脑细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从整个Ciona幼虫大脑中分离的单个细胞 |