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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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11041 | 2025-10-07 |
Characterisation of choroid plexus-infiltrating T cells reveals novel therapeutic targets in murine neuropsychiatric lupus
2024-Jul-15, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224689
PMID:38531610
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了神经精神性狼疮小鼠模型中脉络丛浸润T细胞的特征及其在疾病进展中的作用 | 首次在神经精神性狼疮小鼠模型中系统表征脉络丛浸润T细胞,发现特异性T细胞克隆并验证VCAM/VLA-4信号通路作为潜在治疗靶点 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 探究神经精神性狼疮疾病进展中脉络丛浸润免疫细胞的作用机制 | MRL/lpr小鼠(神经精神性狼疮模型)的脉络丛组织 | 单细胞组学 | 神经精神性狼疮 | 单细胞RNA测序,T细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据 | MRL/lpr小鼠在疾病早期和晚期的脉络丛组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 液滴式单细胞转录组分析平台 |
11042 | 2025-10-07 |
Defining the Regulatory Logic of Breast Cancer Using Single-Cell Epigenetic and Transcriptome Profiling
2024-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598858
PMID:38948758
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研究论文 | 通过单细胞表观遗传和转录组分析揭示乳腺癌的调控逻辑 | 开发了使用线性混合效应模型系统量化染色质可及性区域与基因表达关联的新方法,并发现正常细胞中基因表达沉默子转变为癌细胞中增强子的调控元件 | 研究样本仅限于手术切除后立即处理的人类乳腺肿瘤和健康乳腺组织 | 解析乳腺癌细胞的转录失调调控机制 | 人类乳腺肿瘤、健康乳腺组织和乳腺癌细胞系 | 单细胞多组学 | 乳腺癌 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | 线性混合效应模型 | 表观遗传数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
11043 | 2025-10-07 |
Unveiling inflammatory and prehypertrophic cell populations as key contributors to knee cartilage degeneration in osteoarthritis using multi-omics data integration
2024-Jun-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224420
PMID:38325908
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学整合分析揭示膝关节骨关节炎中炎症和前肥大细胞群对软骨退变的关键作用 | 发现两个新的软骨细胞群体(preInfC和InfC),揭示MIF-CD74信号通路激活,并确定preHTC和HTC为OA关键细胞群 | 样本量相对有限(8例OA供体和3例非OA对照),需要更大规模研究验证 | 解析人类膝关节软骨细胞异质性并识别骨关节炎关键细胞群体 | 人类膝关节软骨组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学染色, 实时定量PCR | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据, 全基因组关联研究数据 | 11名供体(8例OA,3例对照)共19个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
11044 | 2025-10-07 |
Disease activity drives divergent epigenetic and transcriptomic reprogramming of monocyte subpopulations in systemic lupus erythematosus
2024-Jun-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-225433
PMID:38413168
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研究论文 | 本研究探讨系统性红斑狼疮中疾病活动度对单核细胞亚群表观遗传和转录组重编程的影响 | 首次整合DNA甲基化组、转录组和单细胞转录组学数据,揭示SLE疾病活动度驱动单核细胞亚群特异性表观遗传和转录组重编程 | 样本量相对有限,仅包含SLE患者和健康供体的单核细胞分析 | 研究系统性红斑狼疮中单核细胞亚群的表观遗传和转录组特征与疾病活动度和进展的关系 | 系统性红斑狼疮患者和健康供体的经典、中间和非经典单核细胞亚群 | 表观遗传学 | 系统性红斑狼疮 | DNA甲基化组测序,转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 表观遗传数据,转录组数据,单细胞转录组数据 | SLE患者(首次和随访访视)和健康供体的单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,DNA甲基化测序 | NA | NA |
11045 | 2025-10-07 |
Proinflammatory phenotype of B10 and B10pro cells elicited by TNF-α in rheumatoid arthritis
2024-Apr-11, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224878
PMID:38302261
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研究论文 | 本研究揭示了TNF-α通过干扰SHIP-1诱发B10和B10pro细胞促炎表型在类风湿关节炎中的机制 | 首次发现TNF-α能够改变B10和B10pro细胞的免疫表型,使其从抑炎转为促炎,并阐明了SHIP-1在这一过程中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型,在人类患者中的直接证据仍需进一步验证 | 探究TNF-α对B10和B10pro细胞表型和功能的调控机制及其在类风湿关节炎发病中的作用 | B10和B10pro细胞、类风湿关节炎患者、健康个体、基因敲除小鼠模型 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、转录组测序、基因敲除模型 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、细胞频率数据 | 健康个体和RA患者的外周血样本、TNF-α-/-和SHIP-1-/-小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11046 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analyses reveal disturbed decidual homoeostasis in obstetric antiphospholipid syndrome
2024-Apr-11, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224930
PMID:38331588
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示产科抗磷脂综合征中蜕膜稳态失衡的细胞组成和分子特征 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘OAPS患者蜕膜细胞的异常微环境,发现巨噬细胞/dNK细胞比例失衡、血管内皮细胞收缩及代谢通路改变等新特征 | 样本量有限(5例患者+5例对照),需更大队列验证;主要聚焦早孕期蜕膜组织 | 揭示产科抗磷脂综合征的发病机制 | 早孕期蜕膜组织细胞 | 单细胞组学 | 产科抗磷脂综合征 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组化,免疫荧光,ELISA | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 5例OAPS患者和5例健康对照的蜕膜组织(初验证扩大队列) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11047 | 2025-10-07 |
p53 accelerates endothelial cell senescence in diabetic retinopathy by enhancing FoxO3a ubiquitylation and degradation via UBE2L6
2024-Apr, Experimental gerontology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.exger.2024.112391
PMID:38437929
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研究论文 | 本研究揭示了p53通过增强UBE2L6介导的FoxO3a泛素化降解加速糖尿病视网膜病变中内皮细胞衰老的机制 | 首次发现p53通过上调UBE2L6表达促进FoxO3a泛素化降解,从而加速内皮细胞衰老的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,尚未在人体临床试验中验证 | 阐明糖尿病视网膜病变中内皮细胞衰老的具体分子机制 | db/db糖尿病小鼠视网膜组织和人视网膜微血管内皮细胞(HRMECs) | 分子生物学 | 糖尿病视网膜病变 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | db/db小鼠视网膜组织 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
11048 | 2025-10-07 |
[Analysis of the types and functions of CD34+ cells in full-thickness skin defect wounds of normal mice and diabetic mice by single-cell RNA sequencing]
2024-Mar-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析正常小鼠和糖尿病小鼠全层皮肤缺损创面中CD34+细胞的类型和功能 | 首次使用CD34细胞谱系示踪小鼠结合单细胞RNA测序技术,系统比较了正常和糖尿病小鼠创面愈合过程中CD34+细胞的异质性和功能差异 | 样本量较小(对照组3只,糖尿病组2只),仅观察了伤后第4天的时间点 | 探究CD34+细胞在正常和糖尿病小鼠皮肤创面愈合过程中的细胞类型和功能差异 | CD34细胞谱系示踪小鼠(正常组和糖尿病模型组) | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,荧光激活细胞分选 | Seurat 4.0.2 | 单细胞RNA测序数据 | 6只CD34细胞谱系示踪小鼠(3只对照组,2只糖尿病组用于单细胞测序) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11049 | 2025-10-07 |
CD7 activation regulates cytotoxicity-driven pathology in systemic sclerosis, yielding a target for selective cell depletion
2024-Mar-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224827
PMID:38123919
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学等技术发现CD7激活调控系统性硬化症中细胞毒性驱动的病理过程,并验证了靶向CD7的选择性细胞清除策略 | 首次揭示CD7在系统性硬化症中作为共刺激分子调控细胞毒性T细胞和NK细胞的致病作用,并证明靶向CD7的选择性细胞清除可改善疾病表现 | 样本量相对有限(165例患者),临床验证仅基于单个同情用药案例 | 探究系统性硬化症中细胞毒性细胞的调控机制及潜在治疗靶点 | 系统性硬化症患者和健康对照者的皮肤和血液样本 | 免疫学 | 系统性硬化症 | 单细胞转录组学, 流式细胞术, 多重免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据, 图像数据 | 165例系统性硬化症患者和80例健康个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11050 | 2025-10-07 |
CD_99 G1 neutrophils modulate osteogenic differentiation of mesenchymal stem cells in the pathological process of ankylosing spondylitis
2024-Feb-15, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224107
PMID:37977819
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了强直性脊柱炎患者脊柱附着点中细胞亚群的异质性及其在骨生成过程中的相互作用机制 | 发现新型早期中性粒细胞亚群CD99_G1在AS中升高,并揭示间充质干细胞通过CAR细胞亚群向成骨分化的两条分化路径 | 样本量较小(5例患者和3例健康对照),需要在更大队列中验证发现 | 探究强直性脊柱炎脊柱附着点中细胞类型异质性及骨生成机制 | 强直性脊柱炎患者和健康个体的脊柱附着点组织 | 单细胞生物学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序,实时定量PCR,免疫荧光,流式细胞术,成骨诱导,茜素红染色,免疫组化,shRNA | 伪时间分析,配体-受体对分析 | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 5例强直性脊柱炎患者和3例健康个体,共40,065个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11051 | 2025-10-07 |
RNA-seq analysis reveals prenatal alcohol exposure is associated with placental inflammatory cells and gene expression
2024-Feb-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2023.147951
PMID:37918548
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现产前酒精暴露与胎盘炎症细胞比例和基因表达改变相关 | 首次利用单细胞RNA测序数据进行细胞类型反卷积分析,研究产前酒精暴露对胎盘细胞组成和炎症基因表达的影响 | 样本量相对较小(68例),需要未来研究进一步验证和功能分析 | 探究产前酒精暴露对胎盘细胞类型组成和炎症基因表达的影响 | 南非开普敦前瞻性出生队列中的35名重度饮酒孕妇和33名对照孕妇的胎盘样本 | 生物信息学 | 胎儿酒精谱系障碍 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,细胞类型反卷积分析 | 线性回归模型 | RNA测序数据 | 68例胎盘样本(35例酒精暴露,33例对照) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
11052 | 2025-10-07 |
Multiplex Immunohistochemistry Staining for Paraffin-embedded Lung Cancer Tissue
2023-11-21, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65850
PMID:38078595
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研究论文 | 本文开发了用于石蜡包埋肺癌组织的多重免疫组化染色实验方案 | 通过优化实验方案解决了肺组织自发荧光和通道串扰问题,实现了标记靶细胞和蛋白的多重免疫组化染色 | NA | 开发有效的多重免疫组化染色方法以解析肺癌肿瘤微环境中细胞间关系 | 临床来源的肺鳞状细胞癌石蜡包埋组织切片 | 数字病理学 | 肺癌 | 多重免疫组化,酪胺信号放大技术 | NA | 图像 | NA | NA | 多重免疫组化染色 | NA | 基于酪胺信号放大技术的多重免疫组化染色方法 |
11053 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis profiles cellular and molecular alterations in submandibular gland and blood in IgG4-related disease
2023-10, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2023-224363
PMID:37474274
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了IgG4相关疾病中颌下腺和血液的细胞与分子改变 | 发现了三种新型组织驻留免疫细胞亚群,揭示了TOP2A_B细胞和TOP2A_T细胞的分化轨迹,以及ICOS_PD-1_B细胞在B细胞向IgG4+浆细胞分化中的中间状态 | 样本量有限,需要在更大队列中验证发现 | 解析IgG4相关疾病的细胞种群和免疫细胞与非免疫细胞间的相互作用 | IgG4相关疾病患者和匹配对照的颌下腺组织和外周血单个核细胞 | 单细胞生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多重免疫荧光染色 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据, 免疫组库数据, 图像数据 | IgG4相关疾病患者和匹配对照的颌下腺和PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
11054 | 2025-10-07 |
The covariance environment defines cellular niches for spatial inference
2023-Apr-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.18.537375
PMID:37131616
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研究论文 | 开发了一种名为COVET的细胞生态位表示方法和ENVI空间推断算法,用于整合空间转录组和单细胞RNA-seq数据 | 提出协方差环境(COVET)表示法捕捉细胞生态位的连续多变量性质,并开发基于最优传输的距离度量和环境变分推断(ENVI)算法 | NA | 解决多路空间分析技术中的计算挑战,开发细胞生态位的合适表示方法 | 细胞生态位和空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 条件变分自编码器 | 空间转录组数据,单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
11055 | 2025-10-07 |
[Research advances on the role and mechanism of epidermal stem cells in skin wound repair]
2022-Sep-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi
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综述 | 本文综述了表皮干细胞在皮肤伤口修复中的作用机制及应用进展 | 结合单细胞测序和基因敲除等新技术揭示了表皮干细胞在表皮自我更新和伤口修复中的新机制 | NA | 探讨表皮干细胞在皮肤伤口修复中的作用机制 | 表皮干细胞 | NA | 皮肤创伤 | 单细胞测序, 基因敲除 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
11056 | 2025-10-07 |
Low-ratio somatic NLRC4 mutation causes late-onset autoinflammatory disease
2022-08, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-221708
PMID:35428651
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研究论文 | 本文报道一例由NLRC4体细胞突变引起的晚发性自身炎症性疾病,并通过单细胞技术揭示了其发病机制 | 首次在单细胞转录组水平系统分析NLRC4体细胞突变导致的自身炎症性疾病,并发现靶向gasdermin D可有效抑制炎症因子产生 | 仅基于单个病例研究,样本量有限 | 探究晚发性自身炎症性疾病的遗传基础和致病机制 | NLRC4体细胞突变患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 自身炎症性疾病 | 全外显子/基因组测序,数字液滴PCR,单细胞RNA测序,细胞内细胞因子染色,定量PCR,免疫组织化学,western blotting | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA测序,全外显子测序,全基因组测序 | NA | NA |
11057 | 2025-10-07 |
[Investigation on the growth factor regulatory network of dermal fibroblasts in mouse full-thickness skin defect wounds based on single-cell RNA sequencing]
2022-Jul-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序技术研究小鼠全层皮肤缺损创面中真皮成纤维细胞的异质性及生长因子调控网络 | 首次在单细胞水平系统揭示小鼠皮肤创面愈合过程中真皮成纤维细胞的异质性及其在生长因子信号网络中的核心作用 | 研究仅针对小鼠模型,样本量较小(正常组和创面组各5只),且仅观察了伤后第7天的时间点 | 探索小鼠全层皮肤缺损创面中真皮成纤维细胞的异质性及其在生长因子调控网络中的作用 | 8周龄雄性C57BL/6小鼠的正常皮肤组织和伤后第7天的全层皮肤缺损创面组织 | 单细胞生物学 | 皮肤创伤 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光染色 | Seurat 3.0, CellChat 1.1.3 | 单细胞基因表达数据,免疫荧光图像数据 | 10只小鼠(5只正常,5只创面),另加2只用于验证实验 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Genomics平台, Illumina Novaseq6000 | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
11058 | 2025-10-07 |
Rheumatoid arthritis, systemic lupus erythematosus and primary Sjögren's syndrome shared megakaryocyte expansion in peripheral blood
2022-03, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220066
PMID:34462261
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研究论文 | 本研究通过分析类风湿关节炎、系统性红斑狼疮和原发性干燥综合征患者的外周血转录组数据,发现这些自身免疫疾病共同存在巨核细胞扩增现象 | 首次在多种自身免疫疾病中发现共同的巨核细胞扩增特征,并鉴定出相关的转录因子调控网络 | 样本量相对有限(119例患者),且仅分析了外周血单个核细胞 | 识别自身免疫疾病中共同的转录特征和免疫细胞组成 | 类风湿关节炎、系统性红斑狼疮、原发性干燥综合征和多重自身免疫患者的外周血单个核细胞 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | RNA-seq, scRNA-seq, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 119例初治患者(41例RA、38例pSS、28例SLE、12例多重自身免疫)和20例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
11059 | 2025-10-07 |
[Re-understanding the physiological and pathophysiological roles of neutrophils]
2022-Feb-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi
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综述 | 本文综述了中性粒细胞的生物学行为及其在多种疾病中的作用,重新评估其生理和病理生理功能 | 重新评估中性粒细胞的异质性及其与其他免疫细胞的相互作用机制,挑战传统认为中性粒细胞是短寿命同质细胞的观点 | NA | 重新理解中性粒细胞的生理和病理生理作用 | 中性粒细胞 | 免疫学 | 多种疾病 | 单细胞测序技术、空间转录组测序技术、多组学联合测序技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学测序 | NA | NA |
11060 | 2025-10-07 |
Ex vivo mass cytometry analysis reveals a profound myeloid proinflammatory signature in psoriatic arthritis synovial fluid
2021-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220280
PMID:34226188
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研究论文 | 本研究通过质谱流式细胞术和多组学分析揭示了银屑病关节炎滑液中髓系细胞的显著促炎特征 | 首次在无体外刺激条件下发现银屑病关节炎滑液中的经典单核细胞、中间单核细胞和巨噬细胞自发产生高水平骨桥蛋白和CCL2等促炎介质 | 研究样本量有限,且主要关注髓系细胞而T细胞自发细胞因子产生较少 | 识别银屑病关节炎滑液和血液中淋巴细胞和髓系细胞在无刺激条件下的细胞因子产生情况 | 银屑病关节炎患者的滑液和配对血液白细胞 | 免疫学 | 银屑病关节炎 | 质谱流式细胞术, 转录组分析, 单细胞RNA测序, ELISA, LEGENDplex分析 | NA | 细胞表型数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | 银屑病关节炎患者的滑液和配对血液样本 | NA | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序, 基因芯片, 蛋白质检测 | NA | NA |