单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27924 篇文献，本页显示第 11021 - 11040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11021 | 2024-08-05 |
CTCF mutation at R567 causes developmental disorders via 3D genome rearrangement and abnormal neurodevelopment
2024-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49684-1
PMID:38951485
|
研究论文 | 本文探讨了CTCF R567W突变对发育紊乱的影响及其机制 | 研究首次揭示了CTCF突变如何通过3D基因组重构影响神经发育 | 仅探索了特定突变的影响，缺乏对其他CTCF突变的广泛分析 | 阐明CTCF突变对人类神经发育障碍的影响及其潜在机制 | 小鼠模型和人类胚胎干细胞衍生的皮层类器官模型 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠及其胚胎干细胞衍生的皮层类器官 |
| 11022 | 2024-08-05 |
[Analysis of correlation between high expression of nucleoporin 85 (NUP85) and immune cell infiltration in hepatocellular carcinoma]
2024-Jun, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:38952090
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研究论文 | 该研究探讨了核孔蛋白85（NUP85）在肝细胞癌中的表达及其与免疫反应的相关性 | 首次系统分析了NUP85在HCC中高表达与免疫细胞浸润的相关性，并提出其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | 本研究的局限性在于使用的数据库和分析方法可能存在的数据偏差 | 研究NUP85在肝细胞癌中的意义及其与免疫反应的关系 | 肝细胞癌（HCC）样本中的NUP85表达及其相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序，基因表达分析 | NA | mRNA和蛋白数据 | 涉及HCC样本的突变率为19% |
| 11023 | 2024-08-05 |
Cell type evolution reconstruction across species through cell phylogenies of single-cell RNA sequencing data
2024-Feb, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-023-02281-9
PMID:38182680
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研究论文 | 该论文探讨了细胞类型的起源和进化，利用单细胞RNA测序数据重建细胞谱系 | 首次通过显式的谱系学方法应用于单细胞数据，使用主成分作为谱系特征以构建细胞谱系 | 谱系构建依赖于现有的数据，可能受限于样本的多样性和数量 | 研究细胞类型的进化及其在不同物种之间的比较 | 来自五种远缘相关哺乳动物的眼细胞的比较单细胞数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 主成分分析 | 基因表达数据 | 五种哺乳动物的眼细胞数据集 |
| 11024 | 2024-08-05 |
O-GlcNAc transferase regulates collagen deposition and fibrosis resolution in idiopathic pulmonary fibrosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1387197
PMID:38665916
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研究论文 | 本研究探讨了O-GlcNAc转移酶在特发性肺纤维化中的作用。 | 这项研究首次揭示了OGT在特发性肺纤维化中的调节作用及其在胶原沉积和纤维化消退中的关键角色。 | 尚未在临床试验中验证OGT抑制对纤维化分辨率的影响。 | 研究OGT在特发性肺纤维化中的作用及其对胶原沉积和纤维化消退的影响。 | 本研究的对象包括来自特发性肺纤维化及非特发性肺纤维化捐赠者的人肺组织和孤立成纤维细胞。 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 实验模型 | 组织样本和细胞样本 | 未提供具体样本量 |
| 11025 | 2024-08-05 |
Machine learning and single-cell sequencing reveal the potential regulatory factors of mitochondrial autophagy in the progression of gastric cancer
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05287-9
PMID:37648811
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序全面分析线粒体自噬相关基因在胃癌进展中的作用 | 通过机器学习算法识别出关键基因和特定的转录因子，为线粒体自噬在胃癌中的机制提供新见解 | 本研究的局限性在于样本数量和多样性可能影响结果的适用性 | 旨在分析线粒体自噬相关基因在胃癌进展中的作用 | 研究对象为与胃癌相关的线粒体自噬基因及相关细胞类型 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 支持向量机递归特征消除, 随机森林算法 | 基因表达数据 | 13个胃癌样本中的28,836个细胞 |
| 11026 | 2024-08-05 |
Selenium metabolism heterogeneity in pan-cancer: insights from bulk and single-cell RNA sequencing
2023-Nov, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05333-6
PMID:37648807
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研究论文 | 本研究探讨了硒代谢在肿瘤发生和免疫反应中的异质性 | 首次系统性探讨了硒代谢的预后意义及其与免疫反应的关系 | 研究主要依赖于公共数据库，可能存在样本选择偏倚 | 探究硒代谢对免疫反应和癌症生物学的影响 | 关注不同癌症类型中硒代谢的异质性及其相关的免疫调节模式 | 数字病理学 | 癌症 | RNA-seq | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 基于86个基因的分析，涉及多个癌症类型的数据 |
| 11027 | 2024-08-05 |
Single-cell multiomic analysis identifies a HOX-PBX gene network regulating the survival of lymphangioleiomyomatosis cells
2023-05-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf8549
PMID:37163604
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研究论文 | 本文通过单细胞多组学分析，识别了一种HOX-PBX基因网络，调控淋巴管平滑肌瘤细胞的生存。 | 研究揭示了HOX-PBX转录程序在肺淋巴管平滑肌瘤细胞中的激活及其对细胞生存的调控机制。 | 需要进行长期的药物管理以维持疗效，且部分患者无法耐受治疗或对疗法反应不佳 | 探索淋巴管平滑肌瘤细胞的致病机制以及潜在的治疗靶点。 | 淋巴管平滑肌瘤（LAM）细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序和单核ATAC-seq | NA | RNA数据 | NA |
| 11028 | 2024-08-05 |
Single-Cell Profiles of Retinal Ganglion Cells Differing in Resilience to Injury Reveal Neuroprotective Genes
2019-12-18, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2019.11.006
PMID:31784286
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序对小鼠视网膜神经节细胞的选择性抗损伤能力进行了分析 | 该研究首次建立了一套系统框架，以解析不同类型的细胞对损伤的反应，并揭示了用于干预的分子靶标 | 研究主要聚焦于小鼠模型，可能无法完全代表其他物种的情况 | 探讨视网膜神经节细胞对损伤的抗性及相关基因 | 小鼠视网膜神经节细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 46种视网膜神经节细胞类型的样本 |
| 11029 | 2024-08-05 |
scPred: accurate supervised method for cell-type classification from single-cell RNA-seq data
2019-12-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1862-5
PMID:31829268
|
研究论文 | 本文介绍了scPred，一种从单细胞RNA测序数据中进行细胞类型分类的准确监督方法 | scPred通过无偏特征选择与机器学习概率预测方法的结合，提供了高度准确的单细胞分类 | NA | 研究单细胞的转录特征，以便进行细胞类型分类 | 单细胞RNA测序数据，涉及胰腺组织、单核细胞、结肠肿瘤活检和循环树突状细胞 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 机器学习 | 基因表达数据 | NA |
| 11030 | 2024-08-05 |
High-throughput dense reconstruction of cell lineages
2019-12, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.190229
PMID:31822210
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评论 | 本文汇编了关于高通量细胞谱系重建会议的共识，讨论了新技术的挑战及解决方案 | 探讨了结合单细胞RNA测序的新工具，允许在单细胞分辨率下重建复杂模型生物的谱系 | 会议内容仅为共识，并未提供具体实验数据和结果 | 研究新工具在重建细胞谱系中的应用及其技术挑战 | 高通量细胞谱系重建的新工具和策略 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 11031 | 2024-08-05 |
Single-cell connectomic analysis of adult mammalian lungs
2019-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aaw3851
PMID:31840053
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了成年哺乳动物肺部细胞间相互作用 | 揭示了肺泡细胞群体之间的信号传递系统，并确定了各细胞类型在远端肺部的功能角色 | 研究主要集中于成年哺乳动物，未涉及其他发展阶段或物种的肺部细胞交互 | 阐明影响组织稳态的细胞间相互作用机制 | 成年小鼠、大鼠、猪和人类的肺组织 | 数字病理学 | 慢性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 未明确说明具体样本数量 |
| 11032 | 2024-08-05 |
Genetic Identification of Vagal Sensory Neurons That Control Feeding
2019-11-14, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.10.031
PMID:31730854
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研究论文 | 本文揭示了控制进食的迷走神经感觉神经元的遗传特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术明确识别出影响食物摄入的特定迷走神经元及其信号 | 推测其功能的实验主要依赖于外周操作与中央记录，尚需进一步验证 | 探讨迷走神经在调节食物摄入中的具体作用 | 迷走神经相关的感觉神经元及其对进食的影响 | 生物医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 11033 | 2024-08-05 |
Integrative Transcriptomics Reveals Sexually Dimorphic Control of the Cholinergic/Neurokine Interface in Schizophrenia and Bipolar Disorder
2019-10-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.09.017
PMID:31618642
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研究论文 | 本研究揭示了在精神分裂症和双相情感障碍中，胆碱能/神经激素界面的性别差异控制 | 提出了一种结合大规模转录组元分析与单细胞测序数据的整合方法 | RNA测序分析通常限于识别最低p值的转录本，未能解决多基因现象 | 旨在探讨精神分裂症和双相情感障碍中性别差异的转录组特征 | 分析精神分裂症和双相情感障碍患者的皮层转录本 | 数字病理学 | 精神分裂症, 双相情感障碍 | RNA测序, 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 来自精神分裂症和双相情感障碍患者的脑组织样本 |
| 11034 | 2024-08-05 |
Benchmark and Parameter Sensitivity Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Clustering Methods
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.01253
PMID:31921297
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研究论文 | 本文提供了对单细胞RNA测序聚类方法的基准测试和参数敏感性分析 | 探讨了用户选择的参数设置对模型性能的显著影响，并提供了不同使用模式和数据集特点下方法的评估 | 尚未进行大规模研究以调查不同实验背景下选择的参数对结果的影响 | 旨在提供有关单细胞RNA测序聚类方法优缺点的新见解 | 研究不同聚类方法在多种使用模式和参数设置下的表现 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类算法 | 真实和模拟数据集 | 多个数据集，具体样本量不详 |
| 11035 | 2024-08-05 |
LACC1 deficiency leading to juvenile arthritis and anemia
2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110290
PMID:38944365
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研究论文 | 该研究描述了由LACC1缺失引起的青少年关节炎和贫血的病例 | 首次识别了两种新的LACC1基因变体，并评估了其对患者炎症标志物的影响及治疗效果 | 仅基于单例患者的临床数据，样本量较小，需进一步研究验证 | 探讨LACC1突变对青少年关节炎和贫血的影响及其潜在治疗方案 | 一名因LACC1的复合杂合变异而出现多关节炎和贫血的患者 | 数字病理学 | 青少年关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据和血清细胞因子水平 | 1名患者和9名对照患者 |
| 11036 | 2024-08-05 |
NLRP12-associated autoinflammatory disease: A novel causal mutation and bioinformatics analyses
2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110278
PMID:38878806
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研究论文 | 本文报告了一例罕见的NLRP12相关自身炎症疾病及其新发现的突变 | 研究首次描述了A218V突变，并通过生物信息学分析提供了对NLRP12-AID机制的新见解 | 研究中病例数量有限，未进行更广泛的人群验证 | 探讨NLRP12相关自身炎症疾病的机制及其相关突变 | 一名患有NLRP12-AID的患者及其病理特征 | 数字病理学 | NA | 生物信息学分析，F-FDG PET/CT | NA | 单细胞转录组数据 | 1名患者 |
| 11037 | 2024-08-05 |
Determining cellular lineage directed networks in hematopoiesis using single-cell transcriptomic data and volatility-constrained correlation
2024-Aug, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105248
PMID:38871242
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研究论文 | 该研究利用单细胞转录组数据和波动约束相关性方法确定了造血过程中细胞谱系导向网络 | 创新点在于应用波动约束相关性方法预测造血过程中细胞类型之间的因果关系和方向性 | 研究主要基于小鼠骨髓细胞，可能限制其对人类造血过程的普遍适用性 | 旨在揭示造血过程中细胞谱系的网络结构及其因果关系 | 研究对象为小鼠骨髓细胞及其相关的造血细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 小鼠骨髓细胞样本 |
| 11038 | 2024-08-05 |
Integrated analysis reveals a novel 5-fluorouracil resistance-based prognostic signature with promising implications for predicting the efficacy of chemotherapy and immunotherapy in patients with colorectal cancer
2024-Aug, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01981-2
PMID:38824480
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研究论文 | 本文构建了一种新的5-FU耐药相关预后标志物，以预测结直肠癌患者的化疗和免疫治疗效果 | 建立并验证了5-FU耐药相关标志物5-FRSig模型，并与多个临床特征及治疗效果相关联 | 未提及具体的样本数量和相关数据的全面性 | 构建5-FU耐药相关标志物以预测结直肠癌患者的预后 | 结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序，定量实时聚合酶链反应（RT-qPCR） | 统计回归模型 | 基因组数据 | 多个结直肠癌队列 |
| 11039 | 2024-08-04 |
[Histone demethylase JMJD3 inhibits alveolar bone loss by regulating macrophage polarization in periodontitis]
2024-Jul-22, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去甲基化酶JMJD3在牙周炎中对巨噬细胞极化的调节作用及其对牙槽骨流失的影响 | 研究发现JMJD3在牙周炎组织中表达上调，并通过调节巨噬细胞极化在抑制牙槽骨损失中发挥保护作用 | 本研究缺乏长期观察数据，未能充分探讨JMJD3在不同阶段牙周炎中的功能 | 旨在研究JMJD3在牙周炎炎症组织中的表达及其调节机制 | 研究对象为健康人群和牙周炎患者的牙龈样本及小鼠牙周炎模型 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞测序、免疫组化染色、实时荧光定量PCR | 小鼠模型 | 生物样本数据 | 健康和炎症牙周患者各9个牙龈样本 |
| 11040 | 2024-08-05 |
[Deciphering the fate of granulation tissue in the human inflammatory alveolar microenvironment using single-cell RNA sequencing]
2024-Jul-22, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 本研究探讨了人类牙槽内颗粒组织的细胞组成及其异质性，通过单细胞转录组图谱阐明了炎症微环境中自然分解的潜在结果 | 本研究使用单细胞RNA测序构建了人类牙槽颗粒组织的单细胞图谱，揭示了炎症颗粒组织在不同微环境中的细胞序列变异及其时间空间分布模式 | 样本量相对较小，仅涉及12个牙槽颗粒组织，可能影响结果的普适性 | 研究炎症微环境中颗粒组织的自然分解过程及其细胞组成的变化 | 来自因牙周炎而拔除的牙齿的炎症颗粒组织 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞、基因表达数据 | 涉及12个牙槽颗粒组织样本 |