单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 11001 - 11020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11001 | 2025-10-07 |
Stem cell expression of CXCR4 regulates tissue composition in the vomeronasal organ
2025-Jan-01, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.263451
PMID:39639824
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术揭示了CXCR4在犁鼻器干细胞中的表达及其对组织组成的调控作用 | 首次发现CXCR4在犁鼻器增殖干细胞和基底神经元谱系中的表达，并证明其条件性敲除会改变干细胞数量和神经元成熟过程 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在其他物种验证；对87个转录因子的功能验证仍需进一步实验 | 探究CXCR4在犁鼻器干细胞分化和组织组成调控中的作用机制 | 小鼠犁鼻器组织及其干细胞和神经元谱系 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,谱系追踪,计算基因扰动分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11002 | 2025-10-07 |
A Foundation Model for Cell Segmentation
2024-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.17.567630
PMID:38045277
|
研究论文 | 提出了一种名为CellSAM的基础模型，用于实现跨多种细胞成像数据的通用细胞分割 | 基于Segment Anything Model开发了提示工程方法，结合自动细胞检测器CellFinder，实现了在哺乳动物细胞、酵母和细菌等多种成像模态下的通用细胞分割 | NA | 开发一个能够跨不同细胞成像领域通用的基础细胞分割模型 | 哺乳动物细胞（组织和细胞培养）、酵母和细菌的成像数据 | 计算机视觉 | NA | 深度学习，提示工程 | 基础模型，目标检测器，Segment Anything Model | 细胞成像数据 | NA | NA | 空间转录组学，细胞追踪 | NA | NA |
| 11003 | 2025-10-07 |
TIGIT expression in extrahepatic cholangiocarcinoma and its impact on CD8 + T cell exhaustion: implications for immunotherapy
2025-Feb-12, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07388-4
PMID:39939322
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肝外胆管癌中TIGIT表达对CD8+T细胞耗竭的影响 | 首次在肝外胆管癌中系统揭示TIGIT通过促进CD8+T细胞耗竭发挥免疫抑制作用 | 研究样本量有限，需要更大规模临床验证 | 探究TIGIT在肝外胆管癌免疫微环境中的作用机制 | 肝外胆管癌肿瘤浸润淋巴细胞 | 单细胞测序分析 | 肝外胆管癌 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫组织化学，患者来源异种移植模型 | 患者来源异种移植模型 | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据，免疫组化数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11004 | 2025-10-07 |
SpaCcLink: exploring downstream signaling regulations with graph attention network for systematic inference of spatial cell-cell communication
2025-Feb-12, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02141-x
PMID:39939849
|
研究论文 | 提出一种考虑细胞内下游信号调控的空间细胞通讯分析方法SpaCcLink | 首次将图注意力网络应用于系统推断空间细胞通讯中的下游信号调控网络 | 未明确说明方法在特定组织类型或疾病状态下的适用性限制 | 系统解析细胞间通讯的空间模式及下游信号网络 | 人类和小鼠的空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 图注意力网络(GAT) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 11005 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the dysregulated monocyte state associated with tuberculosis progression
2025-Feb-12, BMC infectious diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12879-025-10612-3
PMID:39939918
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结核病进展中单细胞亚群的失调状态 | 首次通过单细胞RNA测序结合生物信息学分析揭示单细胞从经典到中间再到非经典亚群的分化轨迹异常是结核病发病的关键机制 | 基于公共数据库SRP247583的二次分析，缺乏实验验证 | 研究单细胞亚群在结核病免疫应答中的作用机制 | 结核病患者单细胞 | 生物信息学 | 结核病 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | 伪时间分析，细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 公共数据库SRP247583中的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11006 | 2025-10-07 |
Integrating Hypoxia Signatures from scRNA-seq and Bulk Transcriptomes for Prognosis Prediction and Precision Therapy in Cervical Squamous Cell Carcinoma and Endocervical Adenocarcinoma
2025-Feb-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26031362
PMID:39941131
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据构建了宫颈鳞癌和腺癌特异性缺氧相关评分风险模型 | 首次识别了CESC特异性缺氧基因集，并构建了能够全面评估肿瘤微环境特征的CSHRS风险模型 | NA | 开发宫颈鳞癌和腺癌的预后预测模型和精准治疗方案 | 宫颈鳞状细胞癌和宫颈内膜腺癌(CESC) | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, WGCNA, LASSO回归, Cox回归分析 | CSHRS风险模型, 列线图模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | NA | NA |
| 11007 | 2025-10-07 |
H4K12 Lactylation Activated-Spp1 in Reprogrammed Microglia Improves Functional Recovery After Spinal Cord Injury
2025-Feb, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70232
PMID:39939834
|
研究论文 | 本研究揭示了H4K12乳酸化激活的Spp1在重编程小胶质细胞中通过促进神经元成熟和线粒体功能改善脊髓损伤后功能恢复的新机制 | 首次发现H4K12乳酸化通过激活Spp1转录在脊髓损伤后小胶质细胞重编程中的作用机制 | NA | 探索SPP1信号通路在脊髓损伤中的功能和调控机制，及其作为治疗靶点的潜力 | 小胶质细胞/巨噬细胞、神经元、脊髓损伤模型 | 单细胞生物学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序，假时序分析，DNA-pulldown | NA | 单细胞RNA测序数据，体外和体内实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11008 | 2025-10-07 |
Cannabidiol restores hematopoietic stem cell stemness in mouse through Atf2-Lrp6 axis after acute irradiation
2025-Feb, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70092
PMID:39949985
|
研究论文 | 本研究探讨了大麻二酚通过Atf2-Lrp6轴恢复急性辐射后小鼠造血干细胞干性的机制 | 首次揭示大麻二酚通过上调Atf2转录因子恢复辐射损伤的造血干细胞功能，并发现Atf2-Lrp6轴在其中的关键作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未进行临床验证 | 探索大麻二酚对急性辐射诱导的造血损伤的保护作用及分子机制 | 小鼠造血干细胞和祖细胞 | 干细胞生物学 | 辐射性造血损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11009 | 2025-10-07 |
Heterogeneity in Cancer
2025-Jan-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17030441
PMID:39941808
|
综述 | 本文探讨癌症异质性对肿瘤学的挑战及其临床意义 | 强调通过新兴分子诊断技术揭示癌症异质性的多维复杂性，并探索其在转移灶治疗耐药和复发中的作用 | NA | 讨论癌症异质性的临床意义，推动个性化治疗方法的开发 | 癌症患者、转移灶和个体病变 | 肿瘤学 | 癌症 | 下一代测序、单细胞转录组学、液体活检技术、人工智能 | NA | 分子数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11010 | 2025-10-07 |
The Cell States of Sea Urchin During Metamorphosis Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Jan-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26031059
PMID:39940825
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示海胆变态过程中的细胞状态变化 | 首次应用单细胞RNA测序技术系统描绘海胆变态过程中幼虫和幼体的细胞状态，揭示了六种主要细胞群体及其亚群的动态变化 | 未明确说明样本数量和技术重复情况，对分子机制的研究深度有限 | 探究海胆变态过程中的细胞状态变化和分子机制 | 海胆幼虫和幼体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11011 | 2025-10-07 |
Single-Cell Analysis Dissects the Effects of Vitamin D on Genetic Senescence Signatures Across Murine Tissues
2025-Jan-24, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu17030429
PMID:39940287
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析维生素D对小鼠多个组织中细胞衰老遗传特征的影响 | 首次在多个组织中系统评估维生素D对细胞衰老特征的影响，并揭示其通过调节炎症和代谢过程缓解衰老负担的机制 | 研究基于公共数据库的小鼠组织数据，缺乏人体验证 | 探究维生素D在细胞衰老过程中的作用机制及其在年龄相关疾病中的治疗潜力 | 小鼠的骨组织、前列腺和皮肤组织 | 单细胞生物学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 三个小鼠组织数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11012 | 2025-10-07 |
Spatial Transcriptomics in Human Cardiac Tissue
2025-Jan-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26030995
PMID:39940764
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在人类心脏组织中的应用现状、技术平台和研究进展 | 聚焦商业化的空间转录组学平台，为初学者提供实用指南，并强调其在心脏研究中的多领域应用潜力 | 存在技术挑战限制了其广泛应用和普及 | 探索空间转录组学在人类心脏研究中的应用价值 | 人类心脏组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 11013 | 2025-10-07 |
Deciphering the Role of Cancer Stem Cells: Drivers of Tumor Evolution, Therapeutic Resistance, and Precision Medicine Strategies
2025-Jan-24, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17030382
PMID:39941751
|
综述 | 全面分析癌症干细胞在肿瘤进展和治疗抵抗中的作用及其精准医疗策略 | 系统整合CSC生物学特性与新兴技术应用，提出多学科协同研究框架 | 作为综述文章未涉及原始实验数据验证 | 阐明癌症干细胞在肿瘤进化中的作用并探索精准医疗策略 | 癌症干细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas9，单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 11014 | 2025-10-07 |
Under pressure: integrated endothelial cell response to hydrostatic and shear stresses
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.30.596749
PMID:38854073
|
研究论文 | 本研究探讨静水压力与剪切应力对内皮细胞的协同作用机制 | 首次系统揭示压力在剪切应力诱导的内皮细胞反应中的剂量依赖性调节作用 | 体外模型可能无法完全模拟体内复杂的血流动力学环境 | 阐明不同类型血流动力学力对内皮细胞身份和功能的综合影响 | 人内皮细胞和早期小鼠胚胎血管发育 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | 体外细胞模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11015 | 2025-10-07 |
Interleukin-22 inhibits cardiac fibrosis by regulating fibroblast metabolic reprogramming in myocardial infarction
2024-Apr, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2024.155256
PMID:38492359
|
研究论文 | 本研究探讨白细胞介素-22通过调节成纤维细胞代谢重编程抑制心肌梗死后心脏纤维化的作用机制 | 首次揭示IL-22通过JNK/PKM2通路抑制有氧糖酵解从而减轻心脏纤维化的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，尚未在临床患者中验证 | 探究IL-22在心肌梗死后心肌纤维化中的作用及代谢机制 | 心肌梗死患者和小鼠模型的成纤维细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞测序，代谢分析，体外实验，体内实验 | NA | 单细胞测序数据，代谢数据，分子表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11016 | 2025-10-07 |
Dynamic Intestinal Stem Cell Plasticity and Lineage Remodeling by a Nutritional Environment Relevant to Human Risk for Tumorigenesis
2023-08-01, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-22-1000
PMID:37097719
|
研究论文 | 本研究通过新型西式饮食NWD1探究营养环境对肠道干细胞可塑性和谱系重塑的影响及其与肿瘤发生风险的关系 | 首次揭示营养环境通过表观遗传调控Ppargc1a表达，改变线粒体结构和功能，从而重编程Lgr5hi干细胞功能并动员替代干细胞 | 研究主要基于小鼠模型，人类肠道黏膜的实际响应机制需要进一步验证 | 阐明营养环境如何影响肠道干细胞可塑性和谱系重塑，及其在肿瘤发生中的作用机制 | 小鼠肠道干细胞和肠道组织 | 功能基因组学 | 肠道肿瘤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, scATAC-seq, 功能基因组学, 成像技术 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 11017 | 2025-10-07 |
Intestinal stem cell aging at single-cell resolution: Transcriptional perturbations alter cell developmental trajectory reversed by gerotherapeutics
2023-05, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13802
PMID:36864750
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究肠道干细胞衰老过程中的转录重编程及其对细胞发育轨迹的影响，并探索老年保护药物的逆转作用 | 首次在单细胞分辨率下揭示衰老导致的Lgr5肠道干细胞转录重编程如何改变细胞发育轨迹，并发现二甲双胍和雷帕霉素可逆转这些衰老效应 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探究衰老对肠道干细胞功能及其子代细胞成熟过程的影响，以及老年保护药物的干预效果 | 小鼠肠道Lgr5阳性肠道干细胞及其子代细胞 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肠道细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11018 | 2025-10-07 |
Isolation of Endothelial Cells from the Lumen of Mouse Carotid Arteries for Single-cell Multi-omics Experiments
2021-10-04, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/63128
PMID:34661575
|
研究论文 | 开发从小鼠颈动脉管腔分离内皮细胞的方法用于单细胞多组学研究 | 建立了通过管腔消化法富集动脉内皮细胞的新方法，解决了内皮细胞在动脉壁细胞中占比低的技术难题 | 方法中仍存在平滑肌细胞、成纤维细胞和免疫细胞等污染，且尚未在人类动脉样本中验证 | 研究血流动力学对内皮细胞转录组和表观基因组的影响 | 小鼠颈动脉内皮细胞 | 单细胞多组学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 小鼠部分颈动脉结扎模型，左颈动脉为实验组，右颈动脉为对照组 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Genomics微流体系统 |
| 11019 | 2025-02-15 |
A single approach, multiple insights: Harnessing spatial transcriptomics and proteomics to identify novel therapeutic targets of alcohol-associated hepatitis
2025-Feb-13, Alcohol, clinical & experimental research
DOI:10.1111/acer.70007
PMID:39948688
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11020 | 2025-10-07 |
Screening Co-Diagnostic Genes for Lung Adenocarcinoma and Myocardial Infarction and Analysis of the Molecular Functions and Drug Value of the Genes
2025-Feb-11, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
|
研究论文 | 通过生物信息学分析筛选肺腺癌和心肌梗死的共同诊断基因，并分析其分子功能和药物价值 | 首次发现MMP9作为肺腺癌和心肌梗死的共同诊断基因，并揭示其在炎症和免疫调节中的作用 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证 | 探索肺腺癌和心肌梗死的共同分子机制，为开发新的诊疗策略提供理论基础 | 肺腺癌和心肌梗死患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 肺腺癌,心肌梗死 | 生物信息学分析,差异表达分析,WGCNA,PPI网络,机器学习(LASSO,SVM-RFE),免疫浸润分析,分子对接,单细胞测序分析 | LASSO,SVM-RFE | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌和心肌梗死数据集 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |