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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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10981 | 2025-10-07 |
TIMD4hiMHCⅡhi Macrophages Preserve Heart Function Through Retnla
2025-Jan, JACC. Basic to translational science
DOI:10.1016/j.jacbts.2024.08.009
PMID:39906591
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研究论文 | 研究发现TIMD4hiMHCⅡhi巨噬细胞通过Retnla基因保护心脏功能 | 首次确认TIMD4hiMHCⅡhi巨噬细胞亚群的存在及其通过Retnla/RELMα保护心脏功能的新机制 | NA | 探究TIMD4hiMHCⅡhi巨噬细胞在心脏功能保护中的作用机制 | 心脏组织巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序,遗传命运图谱 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10982 | 2025-10-07 |
CBX1 is involved in hepatocellular carcinoma progression and resistance to sorafenib and lenvatinib via IGF-1R/AKT/SNAIL signaling pathway
2024-Oct, Hepatology international
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12072-024-10696-0
PMID:38769286
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研究论文 | 本研究探讨CBX1在肝细胞癌进展及对索拉非尼和乐伐替尼耐药性中的作用机制 | 首次揭示CBX1通过IGF-1R/AKT/SNAIL信号通路促进肝细胞癌进展和酪氨酸激酶抑制剂耐药性的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型,需要进一步临床验证 | 探究CBX1在泛癌及肝细胞癌中的表达特征、功能作用及其分子机制 | 肝细胞癌组织、癌细胞系、裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序、RT-PCR、Western Blotting、免疫组化、组织芯片、CCK-8、集落形成、Transwell侵袭、划痕实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、临床病理数据 | 肝细胞癌组织及癌旁组织、多种癌细胞系、裸鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10983 | 2025-10-07 |
Spatial Transcriptomic Analysis Identifies Epithelium-Macrophage Crosstalk in Endometriotic Lesions
2024-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.23.586434
PMID:38798560
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研究论文 | 本研究通过空间转录组分析揭示了子宫内膜异位病变中上皮细胞与巨噬细胞之间的相互作用机制 | 首次发现浅表腹膜子宫内膜异位病变上皮细胞通过补体3驱动炎症信号并促进巨噬细胞向促修复表型转化 | 仅分析了浅表腹膜病变,未涉及其他类型子宫内膜异位病变 | 阐明子宫内膜异位病变中细胞类型特异性基因表达变化及细胞间通讯机制 | 子宫内膜异位病变组织和患者匹配的在位子宫内膜组织 | 空间转录组学 | 子宫内膜异位症 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | 患者匹配的病变组织和正常组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
10984 | 2025-10-07 |
Transcriptomic landscape of endothelial cells: Key tumor microenvironment components indicating variable clinical outcomes in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.23881
PMID:37449672
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了胰腺导管腺癌中内皮细胞的异质性及其对临床预后的影响 | 首次在胰腺导管腺癌中系统鉴定出7个不同的内皮细胞亚群,并阐明其与肿瘤恶性进展和患者预后的关联 | 样本量相对有限(24个肿瘤和11个正常胰腺),需要更大规模的研究验证 | 阐明胰腺导管腺癌肿瘤微环境中内皮细胞的异质性及其对临床结局的影响 | 胰腺导管腺癌患者肿瘤组织和正常胰腺组织中的内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,拟时序分析 | NA | 单细胞转录组数据,批量转录组数据 | 24个PDAC肿瘤样本和11个正常胰腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10985 | 2025-10-07 |
Interferon-γ signaling in eosinophilic esophagitis has implications for epithelial barrier function and programmed cell death
2024-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.26.577407
PMID:38352458
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体外器官模型探讨了干扰素-γ信号在嗜酸性粒细胞性食管炎中对上皮屏障功能和程序性细胞死亡的影响 | 首次在单细胞水平揭示EoE患者食管上皮细胞中干扰素反应特征基因上调,并通过器官模型证实IFN-γ可破坏上皮分化和屏障完整性并诱导细胞凋亡 | 研究样本量有限,主要依赖体外模型验证,需要进一步在体实验确认 | 阐明嗜酸性粒细胞性食管炎中免疫细胞与上皮细胞间的相互作用机制 | 嗜酸性粒细胞性食管炎患者的食管上皮细胞和免疫细胞 | 单细胞基因组学 | 嗜酸性粒细胞性食管炎 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 器官模型培养 | NA | 基因表达数据 | 嗜酸性粒细胞性食管炎患者食管活检组织 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
10986 | 2025-10-07 |
Inhibiting ceramide synthase 5 expression in microglia decreases neuroinflammation after spinal cord injury
2025-Oct-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-23-01933
PMID:39610106
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研究论文 | 本研究通过抑制小胶质细胞中神经酰胺合酶5的表达,有效减轻脊髓损伤后的神经炎症反应 | 首次发现MG1亚群在脊髓损伤急性/亚急性期出现,并揭示神经酰胺合酶5通过NLRP3信号通路介导细胞焦亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞共培养系统,人类临床应用的转化价值仍需进一步验证 | 探究小胶质细胞在脊髓损伤后神经炎症反应中的分子调控机制 | 小鼠脊髓损伤模型、PC12-BV2细胞共培养系统、小胶质细胞亚群 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序、siRNA鞘内注射、分子抑制剂、细胞共培养 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10987 | 2025-10-07 |
Multi-omics profiles reveal immune microenvironment alterations associated with PD-L1 checkpoint in acute pancreatitis in the early phase
2025-Mar-05, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151451
PMID:39922059
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研究论文 | 通过多组学分析揭示急性胰腺炎早期免疫微环境变化与PD-L1检查点的关联 | 首次整合单细胞RNA测序、数字空间分析和质谱流式细胞术系统研究急性胰腺炎早期免疫微环境变化 | 样本来源包括小鼠模型和人类患者,可能存在物种差异 | 探究急性胰腺炎早期免疫检查点PD-1/PD-L1在免疫调节中的作用机制 | 雨蛙素诱导的急性胰腺炎小鼠模型和急性胰腺炎患者 | 多组学分析 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序, 数字空间分析, 质谱流式细胞术, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | 小鼠胰腺和血液样本,急性胰腺炎患者血液样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 质谱流式细胞术, 批量RNA测序 | NA | NA |
10988 | 2025-10-07 |
Deconvolution and inference of spatial communication through optimization algorithm for spatial transcriptomics
2025-Feb-14, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07625-8
PMID:39948133
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研究论文 | 提出一种结合单细胞RNA测序和空间信息的空间转录组解卷积方法NODE | 开发了同时整合细胞类型特异性信息和细胞间通讯的空间解卷积算法 | NA | 改进空间转录组数据的细胞类型解卷积和空间通讯推断 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 非负最小二乘法, 优化搜索算法 | 基因表达数据, 空间位置数据 | 四个数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
10989 | 2025-10-07 |
Cryoablation-induced modulation of Treg cells and the TGF-β pathway in lung adenocarcinoma: implications for increased antitumor immunity
2025-Feb-14, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-03926-1
PMID:39948553
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研究论文 | 本研究探讨了冷冻消融通过调节Treg细胞和TGF-β通路增强肺腺癌抗肿瘤免疫的机制 | 首次通过单细胞测序和动物模型系统揭示冷冻消融通过TGF-β通路抑制Treg细胞增强抗肿瘤免疫的新机制 | 研究样本量有限,临床观察时间较短,需要更大规模临床试验验证 | 探索冷冻消融对肺腺癌局部免疫微环境的影响及其抗肿瘤免疫机制 | 肺腺癌患者组织样本、小鼠肿瘤模型、体外细胞培养 | 肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 细胞冷冻消融, 小鼠皮下肿瘤移植模型 | 动物模型, 细胞模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 未明确具体样本数量,包括患者组织、外周血样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
10990 | 2025-10-07 |
Interpretable AI for inference of causal molecular relationships from omics data
2025-Feb-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk0837
PMID:39951525
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研究论文 | 提出一种可解释AI方法CIMLA,用于从组学数据中推断因果分子关系 | 证明了在特定假设下,流行的特征归因模型能够估计反映变量间直接影响的因果量平均值,并基于此提出了基因调控关系的精确定义 | 需要特定假设条件才能保证因果推断的有效性 | 从高维组学数据中发现因果分子关系,识别不同生物条件下基因调控网络的差异 | 基因调控网络,阿尔茨海默病相关基因调控关系 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 特征归因模型 | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10991 | 2025-10-07 |
Chronic exposure to glucocorticoids amplifies inhibitory neuron cell fate during human neurodevelopment in organoids
2025-Feb-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn8631
PMID:39951527
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研究论文 | 本研究利用单细胞技术探究糖皮质激素暴露对人类神经类器官发育过程中基因调控和谱系分化的影响 | 首次在人类神经类器官模型中揭示慢性糖皮质激素暴露通过特定转录因子促进抑制性神经元谱系分化的分子机制 | 研究基于非指导性神经类器官模型,可能无法完全模拟体内复杂的神经发育环境 | 探究环境因素(糖皮质激素)对人类神经发育过程中谱系分化的影响机制 | 人类神经类器官 | 发育神经生物学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组测序, 染色质可及性分析 | 人类神经类器官模型 | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10992 | 2025-10-07 |
Dissecting the role of CAR signaling architectures on T cell activation and persistence using pooled screens and single-cell sequencing
2025-Feb-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp4008
PMID:39951542
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研究论文 | 通过组合CAR信号域库、重复抗原刺激实验和单细胞测序,系统研究CAR信号架构对T细胞活化和持久性的影响 | 设计组合CAR信号域文库,结合体外筛选与临床结果关联,建立临床信息指导的筛选方法 | NA | 研究CAR信号架构如何影响T细胞功能和持久性 | CAR-T细胞 | 单细胞生物学 | 癌症 | 单细胞测序, 组合文库筛选, 重复抗原刺激实验 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
10993 | 2025-02-17 |
Comprehensive analysis of cytokine and chemokine gene expression in IgG4-related disease by spatial transcriptomics
2025-Feb-14, Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.alit.2024.12.010
PMID:39952877
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
10994 | 2025-10-07 |
Analysis of microarray and single-cell RNA-seq identifies gene co-expression, cell-cell communication, and tumor environment associated with metabolite interconversion enzyme in prostate cancer
2025-Feb-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01926-4
PMID:39946051
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研究论文 | 通过微阵列和单细胞RNA测序分析前列腺癌中代谢物互变酶相关的基因共表达、细胞间通讯和肿瘤微环境 | 首次结合基因表达微阵列数据、单细胞RNA测序、癌基因和抑癌基因分析前列腺癌中代谢物互变酶相关差异表达基因的互作网络 | NA | 探索前列腺癌中分子特性和通路,发现在前列腺癌发生发展中起关键作用的潜在生物标志物 | 前列腺癌患者 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 微阵列, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 基因表达微阵列 | NA | NA |
10995 | 2025-10-07 |
Mitochondrial carrier homolog 2 is important for mitochondrial functionality and non-small cell lung cancer cell growth
2025-Feb-13, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07419-0
PMID:39948081
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研究论文 | 本研究探讨线粒体载体同源物2(MTCH2)在非小细胞肺癌中的表达及其通过调控线粒体功能促进肿瘤生长的作用机制 | 首次系统揭示MTCH2在非小细胞肺癌中的过表达现象及其通过维持线粒体超功能促进肿瘤生长的分子机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型,尚未在临床患者中进行验证 | 探索MTCH2作为非小细胞肺癌新型治疗靶点的潜力 | 非小细胞肺癌细胞系、原代NSCLC细胞、裸鼠皮下移植瘤模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 生物信息学分析、单细胞测序、CRISPR/Cas9基因敲除、shRNA沉默、腺相关病毒载体 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、蛋白质印迹数据 | 多种原代/已建立的NSCLC细胞系及裸鼠移植瘤模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
10996 | 2025-10-07 |
LMNA R482L mutation causes impairments in C2C12 myoblasts subpopulations, alterations in metabolic reprogramming during differentiation, and oxidative stress
2025-Feb-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88219-6
PMID:39948343
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序技术,探讨了LMNA-R482L突变对C2C12成肌细胞亚群、分化过程中的代谢重编程及氧化应激的影响 | 首次在单细胞水平揭示LMNA-R482L突变对成肌细胞亚群组成的改变,并发现该突变通过抗氧化谷胱甘肽系统调控ROS产生和清除机制 | 研究仅限于体外培养的C2C12细胞系,未涉及动物模型或人类样本验证 | 探究LMNA突变如何影响骨骼肌功能特性 | 转基因小鼠C2C12成肌细胞系 | 单细胞生物学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C2C12细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
10997 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic atlas of the chicken cecum reveals cellular responses and state shifts during Eimeria tenella infection
2025-Feb-13, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11302-9
PMID:39948469
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序构建鸡盲肠细胞图谱,揭示艾美耳球虫感染期间的细胞响应和状态变化 | 首次构建鸡盲肠单细胞转录组图谱,揭示艾美耳球虫感染导致的APOB肠细胞减少和T细胞增殖等细胞组成变化 | 未明确说明样本数量和研究设计的局限性 | 研究艾美耳球虫感染对鸡盲肠细胞组成和功能的影响 | 鸡盲肠细胞 | 单细胞组学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7,394个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
10998 | 2025-10-07 |
Unveiling the crucial role of glycosylation modification in lung adenocarcinoma metastasis through artificial neural network-based spatial multi-omics single-cell analysis and Mendelian randomization
2025-Feb-13, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-13650-x
PMID:39948531
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法揭示了糖基化修饰在肺腺癌转移中的关键作用 | 首次结合人工神经网络、空间多组学单细胞分析和孟德尔随机化方法系统研究肺腺癌中糖基化修饰的功能 | NA | 阐明糖基化修饰在肺腺癌中的作用并识别潜在生物靶点 | 肺腺癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 人工神经网络, 孟德尔随机化 | 人工神经网络 | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
10999 | 2025-10-07 |
Integrative machine learning model of RNA modifications predict prognosis and treatment response in patients with breast cancer
2025-Feb-13, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03651-y
PMID:39948551
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研究论文 | 开发基于RNA修饰的机器学习模型预测乳腺癌患者预后和治疗反应 | 整合九种RNA修饰类型构建综合机器学习特征(CMRS),首次系统评估RNA修饰在乳腺癌预后和治疗反应中的作用 | 回顾性研究设计,需要前瞻性验证;样本来源为多个独立队列,可能存在批次效应 | 探索RNA修饰在乳腺癌预后和治疗反应中的作用,开发预测模型 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,多组学分析 | 机器学习模型 | RNA测序数据,单细胞数据,临床数据 | 15个独立乳腺癌队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
11000 | 2025-10-07 |
Long Non-Coding RNAs in Ovarian Cancer: Mechanistic Insights and Clinical Applications
2025-Jan-30, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17030472
PMID:39941838
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综述 | 本文探讨长链非编码RNA在卵巢癌中的分子机制及其临床转化潜力 | 系统阐述lncRNAs在卵巢癌中作为癌基因和抑癌基因的双重调控作用,并评估单细胞测序等新兴技术对肿瘤异质性的解析能力 | NA | 分析lncRNAs在卵巢癌发病机制中的作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 卵巢癌相关长链非编码RNA(如HOTAIR、GAS5) | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、组学分析、生物信息学 | NA | 文献数据、组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |