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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1081 | 2026-05-09 |
Deconvolving cell-type-specific gene expression profiles from bulk RNA-seq samples
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014101
PMID:41886524
|
研究论文 | 开发基于U-Net的深度学习算法BLUE,从bulk RNA-seq样本中解卷积出细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达谱 | 提出U-Net架构的深度学习算法BLUE,能同时预测细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达谱,显著优于现有解卷积算法 | NA | 整合bulk RNA-seq和scRNA-seq的优势,从bulk RNA-seq数据中推断细胞类型特异性基因表达信息 | bulk RNA-seq样本和scRNA-seq数据集 | 机器学习 | 癌症 | RNA-seq | U-Net | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1082 | 2026-05-09 |
IL4I1+ macrophages drive hepatocellular carcinoma progression by responding to biomechanical cues
2026-Feb-11, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101782
PMID:42096911
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学,鉴定出IL4I1+巨噬细胞能感知肿瘤微环境中的生物力学信号并驱动肝细胞癌进展 | 首次从生物力学角度鉴定出IL4I1+巨噬细胞作为力学敏感性亚群,揭示其将力学信号转化为免疫抑制和促肿瘤信号的新机制 | 未明确IL4I1+巨噬细胞感知力学信号的具体分子机制,且仅基于临床前模型验证治疗靶点 | 探究肝细胞癌微环境中生物力学信号对巨噬细胞亚群的调控作用及其在肿瘤进展中的功能 | IL4I1+巨噬细胞在肝细胞癌肿瘤微环境中的空间分布、表型可塑性和力学响应行为 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 原子力显微镜 | NA | 基因表达数据, 空间转录数据, 力学数据 | 临床前模型包括肿瘤细胞增殖(n=3)、迁移能力(n=3)、干细胞特性(n=6)及SB505124治疗组(n=5) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 1083 | 2026-05-09 |
Histotripsy-initiated immune response synergizes with chemotherapy in a neuroblastoma murine model
2026-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.30.702878
PMID:41676730
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研究论文 | 探究组织碎化术与化疗联合治疗神经母细胞瘤小鼠模型的免疫协同效应 | 首次揭示组织碎化术通过机械性气泡云消融肿瘤后,能诱发系统性抗肿瘤免疫反应,增强化疗对转移性神经母细胞瘤的疗效,并在未靶向的远端肿瘤中也观察到生长延迟 | 该研究基于小鼠模型,其结果向人类临床转化的有效性尚需验证;未提供长期随访数据或作用机制的完整分子通路 | 研究组织碎化术诱导的肿瘤微环境变化能否改善转移性神经母细胞瘤对化疗的应答 | 雌性A/J小鼠双侧接种Neuro-2a神经母细胞瘤细胞,一侧肿瘤接受组织碎化术治疗,对侧肿瘤作为非靶向转移模型 | 生物医学 | 神经母细胞瘤 | 组织碎化术, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 细胞计数数据 | NA(未明确样本量,涉及多组小鼠) | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | NA |
| 1084 | 2026-05-09 |
Tumor and Immune Dynamics Following Sequential CDK4/6 and PD-1 Inhibition: Results from a Phase 2 Study in Dedifferentiated Liposarcoma
2026-Feb-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0334
PMID:41325133
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研究论文 | 一项第二阶段临床试验,评估CDK4/6抑制剂palbociclib和PD-1抑制剂retifanlimab联合治疗去分化脂肪肉瘤的效果,分析了肿瘤和免疫细胞的动态变化 | 首次在去分化脂肪肉瘤中系统评估CDK4/6和PD-1抑制剂的联合治疗,结合单细胞RNA测序和流式细胞术深入分析肿瘤微环境和免疫变化 | 样本量小(仅12名患者),研究因42%的免疫相关毒性而提前终止,无对照组 | 评估palbociclib和retifanlimab联合治疗去分化脂肪肉瘤的安全性和有效性,并探究肿瘤和宿主动态变化 | 晚期去分化脂肪肉瘤患者 | 数字病理学 | 去分化脂肪肉瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,细胞免疫表型数据 | 12名患者接受治疗;9名患者有肿瘤活检分析(其中3名有配对样本);10名患者有配对血液样本 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | NA |
| 1085 | 2026-05-09 |
Distinct sympathetic projections to brown fat regulate thermogenesis and glucose tolerance
2026-Feb, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-025-01429-0
PMID:41559445
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研究论文 | 本研究揭示了星状神经节中两种不同的交感神经元亚群分别调控棕色脂肪组织的产热和葡萄糖耐受功能 | 首次通过化学遗传学和单细胞转录组学结合逆行示踪技术,识别出支配棕色脂肪组织实质和血管的不同交感神经元亚群,并证明它们分别控制产热-血流和葡萄糖代谢 | 研究仅在动物模型中进行,人类棕色脂肪组织神经支配的复杂性可能不同,且未探索长期刺激的影响 | 解析棕色脂肪组织中产热与葡萄糖代谢功能的神经调控机制 | 小鼠肩胛间棕色脂肪组织和星状神经节中的交感神经元 | 神经科学 | 代谢性疾病 | 化学遗传学、单细胞转录组学、逆行示踪技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型(具体样本量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1086 | 2026-05-09 |
NEXT-scASV: a Nextflow pipeline for allele-specific variant calling from single-cell RNA-seq data
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag042
PMID:41947412
|
研究论文 | 提出NEXT-scASV,一个用于从单细胞RNA测序数据中检测等位基因特异性变异的可扩展Nextflow流程 | 自动化整个等位基因特异性变异检测流程,无需预先基因分型即可进行从头检测,具有模块化设计支持大规模并行化处理 | 未明确提及局限性 | 开发一个可重复、易部署且高效处理大规模单细胞数据的等位基因特异性变异检测流程 | 来自57个供体的135,000个外周血单核细胞的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 135,000个外周血单核细胞,来自57个供体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 5'单细胞RNA测序 |
| 1087 | 2026-05-09 |
GEfetch2R: fetching single-cell/bulk RNA-seq data from public repositories to R and benchmarking the subsequent format conversion tools
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag039
PMID:41964930
|
研究论文 | GEfetch2R是一个R包,用于从多个公共数据库获取单细胞/批量RNA-seq数据,并基准测试后续格式转换工具 | 首个能够同时下载多种单细胞RNA-seq数据类型(原始数据、计数矩阵、处理对象)、流程化加载到R环境、进行对象格式转换并基准测试转换工具的综合工具 | 未明确指出局限性 | 开发一个整合数据下载、处理和格式转换功能的R包,方便研究人员访问和探索公共基因表达数据 | 单细胞RNA-seq和批量RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1088 | 2026-05-09 |
Advances in Adipose Tissue Biology
2026-Jan-13, Endocrine reviews
IF:22.0Q1
DOI:10.1210/endrev/bnaf032
PMID:41071598
|
综述 | 综述脂肪组织生物学的最新进展及其在健康与疾病中的关键作用 | 强调脂肪组织作为人体生理中心调节器的新认识,以及单细胞RNA测序等新技术在揭示脂肪库特异性机制中的应用潜力 | 未明确提及局限性,但综述本身可能受限于现有研究范围和发表时间 | 阐述脂肪组织在健康和疾病中的重要角色的科学进展 | 脂肪组织和脂肪细胞 | 计算生物学 | 肥胖相关疾病, 2型糖尿病, 心血管疾病, 肝脏疾病, 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1089 | 2026-05-09 |
Leveraging AI for cell biology discovery
2026-01-08, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253023
PMID:41502213
|
综述 | 探讨人工智能在细胞生物学中的应用,包括显微镜成像、药物发现和合成生物学等领域 | 系统总结了AI在单细胞分辨率细胞图像分析、复杂生物模式识别及细胞行为建模方面的最新进展 | 涉及数据质量要求、模型可解释性以及AI工具在生物领域普及化的挑战 | 概述AI在细胞生物学发现中的变革性作用,展望未来基础研究和治疗应用方向 | 细胞生物学中的AI应用场景,包括显微镜图像、转录组数据和蛋白质结构 | 机器学习 | NA | NA | 深度学习 | 图像, 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1090 | 2026-05-09 |
Microneedle Delivery of Small Extracellular Vesicles From Young Blood to Treat Endothelial Senescence
2026-Jan, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202418352
PMID:40765122
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研究论文 | 利用微针递送来自年轻血液的小细胞外囊泡治疗内皮的衰老 | 首次将微针递送技术与年轻血液来源的小细胞外囊泡结合,用于延缓内皮细胞衰老并减轻炎症,并通过单细胞RNA测序揭示其作用机制 | 未提及具体局限性 | 评估源自年轻血液的小细胞外囊泡在调节内皮细胞衰老中的作用,并探索其通过微针递送的可行性 | 脐带血浆中的小细胞外囊泡与老年人血浆中的小细胞外囊泡,以及老龄小鼠的内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 分离自脐带血浆(年轻)和老年人血浆(>70岁)的小细胞外囊泡,以及22-24个月大的老龄小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1091 | 2026-05-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune regulatory mechanisms and molecular therapeutic strategies in the microenvironment of multiple myeloma
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003306
PMID:40899849
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示多发性骨髓瘤微环境中的免疫调控机制和分子治疗策略 | 结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和分子对接分析,首次系统性揭示多发性骨髓瘤微环境中免疫相关信号通路及关键基因的因果作用 | 未提及具体样本来源和样本量,可能限制结论的普适性 | 探究多发性骨髓瘤微环境中的分子和细胞相互作用,发现新治疗靶点 | 多发性骨髓瘤微环境中的肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞 | 机器学习和数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、分子对接分析 | Seurat聚类分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1092 | 2026-05-09 |
Host biological sex directs immune control of the Plasmodium parasite liver stage in mice
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1734587
PMID:41846936
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研究论文 | 探究宿主生物性别和雄激素如何调控疟原虫肝脏期感染的免疫控制 | 首次揭示雄激素通过减少寄生虫感染肝细胞的清除来增加寄生虫存活率,并阐明性别差异在肝脏先天性免疫细胞组成和免疫反应中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,需在人类中验证性别差异的关联性;未深入探讨雄激素作用的具体分子机制 | 分析生物性别和雄激素对疟原虫肝脏期宿主-寄生虫相互作用的调节作用 | 雄性、雌性、去势及雄激素处理的BALB/cJ小鼠,感染伯氏疟原虫子孢子 | 机器学习 | 疟疾 | 空间转录组学 | NA | 图像、文本 | 雄性、雌性、去势及雄激素处理的小鼠样本,具体数量未说明 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于分析肝脏组织中的基因表达 |
| 1093 | 2026-05-09 |
GSK3β as a potential regulator in AML: A pan-cancer multi-omics analysis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0344994
PMID:41915675
|
研究论文 | 通过泛癌多组学分析揭示GSK3β在急性髓系白血病中的潜在调控作用 | 首次在31种癌症中系统比较GSK3α/β亚型的差异表达和功能,发现GSK3β在AML中具有独立的预后价值,并揭示了亚型特异性的免疫微环境调控机制 | 未涉及具体分子机制的深入验证,且THP-1细胞系的体外实验无法完全代表AML患者体内的复杂微环境 | 探究GSK3α/β亚型在多种癌症中的表达模式、预后价值和免疫调控作用 | 31种癌症的TCGA、GTEx和单细胞RNA-seq多组学数据,以及AML THP-1细胞系 | 机器学习和数字病理学 | 肺癌、前列腺癌、肝癌、急性髓系白血病等 | 多组学整合分析、单细胞RNA-seq、Cox回归、免疫浸润分析 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 31种癌症的泛癌样本,包含TCGA和GTEx数据库的多个队列 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 1094 | 2026-05-09 |
B cells in anti-tRNA synthetase syndrome patients show an activated, interferon-responsive signature
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1770291
PMID:42023216
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析抗tRNA合成酶综合征患者B细胞的激活及干扰素响应特征 | 首次在单细胞水平揭示抗tRNA合成酶综合征患者活化与记忆B细胞中干扰素和应激通路上调,并发现FKBP5和MYADM基因表达变化与细胞骨架重排、代谢及抗原呈递通路相关 | 发现需进一步验证,未来需探究其作为新靶点减少组织损伤的实用性 | 识别抗tRNA合成酶综合征中的失调通路作为新型治疗靶点 | 抗tRNA合成酶综合征患者与健康参与者的外周血单个核细胞中的CD19+B细胞 | 数字病理学 | 抗tRNA合成酶综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 抗tRNA合成酶综合征患者与健康参与者,样本量未具体说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 对流式分选的CD19+细胞进行单细胞RNA测序 |
| 1095 | 2026-05-09 |
Emodin Inhibitsg Hepatocellular Carcinoma Invasion and Migration by Regulating the HDAC4/NF-κB (p65)/CXCL12 Signaling Axis and Suppressing M2 Macrophage Polarization
2026, The American journal of Chinese medicine
DOI:10.1142/S0192415X26500369
PMID:42036631
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研究论文 | 研究大黄素通过调控HDAC4/NF-κB(p65)/CXCL12信号轴抑制肝细胞癌侵袭迁移及M2型巨噬细胞极化 | 首次揭示大黄素通过HDAC4/NF-κB/CXCL12通路调控巨噬细胞极化并抑制肝细胞癌进展的新机制 | NA | 探究大黄素如何通过HDAC4/NF-κB/CXCL12通路调控巨噬细胞极化并影响肝细胞癌进展 | HepG2肝癌细胞、巨噬细胞、肝细胞癌模型 | NA | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接、表面等离子体共振、Western blot | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1096 | 2026-05-09 |
Molecular regulation of spermatogenesis: Insights from spatial transcriptomics
2026, Current topics in developmental biology
DOI:10.1016/bs.ctdb.2026.01.004
PMID:42097820
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综述 | 通过空间转录组学揭示精子发生的分子调控机制 | 首次系统综述空间转录组学技术在睾丸细胞空间组织、不同生精细胞群和体细胞区室相互作用中的应用,提供了对精子发生过程中基因表达模式的新见解 | 主要聚焦于当前空间转录组学技术的应用,未深入讨论技术本身的局限性(如分辨率、通量等) | 探讨从原始生殖细胞发育到精原干细胞过程中的关键调控因子、体细胞与生殖细胞的相互作用,以及空间转录组技术在干细胞研究中的应用 | 睾丸生精细胞(包括精原细胞、精母细胞、精子细胞)和睾丸体细胞(如支持细胞、间质细胞等) | 数字病理学 | NA | 空间转录组学、单细胞转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1097 | 2026-05-09 |
Unraveling spermatogenesis: A single-cell genomics perspective
2026, Current topics in developmental biology
DOI:10.1016/bs.ctdb.2026.03.003
PMID:42097818
|
综述 | 本文从单细胞基因组学角度综述了精子发生过程的技术演变、关键生物学争议及未来研究方向 | 系统整合了单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和单细胞DNA甲基化等技术在精子发生研究中的应用,并提出了多组学与空间转录组学的未来前景 | 未提及具体实验验证或定量比较不同技术的性能差异 | 综述单细胞基因组学技术对雄性生殖细胞研究带来的变革,并展望临床转化潜力 | 精子发生过程,包括精原干细胞、生殖细胞分化及表观遗传调控 | 单细胞基因组学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞DNA甲基化, 多组学, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞DNA甲基化, 多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1098 | 2026-05-09 |
Integrating single-cell and bulk RNA sequencing data reveals RGS4 as a functional driver in a proliferative subgroup of SF-1 lineage PitNETs
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1815682
PMID:42099385
|
研究论文 | 整合单细胞和批量RNA测序数据揭示RGS4是SF-1谱系PitNETs增殖亚组的功能驱动因子 | 首次识别出一个高表达RGS4的SF-1谱系PitNETs亚组,并阐明RGS4通过促进p53泛素化降解驱动肿瘤增殖的机制 | 未提及具体局限性 | 探索SF-1谱系垂体神经内分泌肿瘤异质性和增殖行为的分子决定因素 | SF-1谱系垂体神经内分泌肿瘤 | 机器学习 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1099 | 2026-05-09 |
CD146+ CAFs mediate immunosuppression in gastric cancer via COL4A1: potential therapeutic targets
2025-Dec-21, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013577
PMID:41423274
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序鉴定胃癌中CD146+癌症相关成纤维细胞亚群,并揭示其通过COL4A1介导免疫抑制的机制,为靶向治疗提供新靶点 | 首次发现CD146+ CAFs亚群在胃癌中的免疫抑制作用,并阐明JAG1-NOTCH3/PI3K/AKT信号轴调控COL4A1分泌及M2型巨噬细胞极化的分子机制,提出CD146和COL4A1作为潜在治疗靶点 | 未提及具体限制 | 识别胃癌特异性癌症相关成纤维细胞亚群,阐明其免疫抑制作用的分子机制 | 胃癌组织中的癌症相关成纤维细胞和匹配的正常成纤维细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9对患者肿瘤及相邻正常组织样本,共8,322个高质量成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1100 | 2026-05-09 |
Epidermal Loss of PRMT5 Leads to the Emergence of an Atypical Basal Keratinocyte-Like Cell Population and Defective Epidermal Stratification
2025-Dec, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.008
PMID:40339790
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研究论文 | 本研究通过条件性敲除小鼠模型,发现PRMT5缺失导致基底角质细胞样异常细胞群出现和表皮分层缺陷 | 首次揭示PRMT5通过抑制Cdkn1a表达来阻止基底角质细胞衰老,为先天性皮肤病的表观遗传调控提供新见解 | NA | 探究PRMT5在体内维持角质细胞干细胞表型的作用及其机制 | 条件性敲除Prmt5的小鼠表皮 | 机器学习 | 先天性皮肤病 | 单细胞RNA测序、转座酶可及染色质高通量测序 | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 | 条件性敲除Prmt5小鼠及其对照 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | NA |