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当前共找到 39398 篇文献，本页显示第 1081 - 1100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1081 | 2026-05-03 |
Mouse cortical cellular diversification through lineage progression of radial glia
2025-11-03, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.352826.125
PMID:40774817
|
研究论文 | 通过时间序列单细胞RNA测序和单核ATAC测序，研究小鼠皮层放射状胶质细胞谱系进程驱动的细胞多样化 | 首次结合时间序列scRNA-seq和snATAC-seq，系统揭示了放射状胶质细胞从早期到晚期转变过程中，通过限制广泛表达的转录因子到特定阶段和细胞类型，驱动皮层细胞多样化的染色质可及性机制 | 未提及 | 研究小鼠皮层放射状胶质细胞内在程序如何驱动皮层细胞多样化 | 纯化的小鼠皮层祖细胞（放射状胶质细胞、中间神经元祖细胞、中间胶质祖细胞） | 单细胞组学 | NA | scRNA-seq, snATAC-seq | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 多个胚胎和出生后阶段的小鼠皮层祖细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序 | NA | NA |
| 1082 | 2026-05-03 |
Highly accurate reference and method selection for universal cross-data set cell type annotation with CAMUS
2025-Nov-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280821.125
PMID:41034048
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研究论文 | 提出了一种名为CAMUS的跨数据集细胞类型注释方法，通过通用参考数据和方法选择策略实现高准确率和高效率的注释 | 首次提出一种通用的参考数据和方法选择策略，用于跨数据集细胞类型注释，显著提升注释准确率 | 未明确提及局限性，但可能依赖于参考数据集的多样性和覆盖度 | 开发一种能够自动选择最佳参考数据和方法的高准确率细胞类型注释方法 | 跨物种单细胞RNA测序、单细胞空间转录组和单细胞ATAC测序数据集 | 机器学学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组, 单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达矩阵 | 672对跨物种单细胞RNA测序数据集、80个单细胞空间转录组数据集和5个单细胞ATAC测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 1083 | 2026-05-03 |
Single-cell RNA profiling of blood CD4+ T cells identifies distinct helper and dysfunctional regulatory clusters in children with SLE
2025-Nov, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02297-2
PMID:41120754
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析儿童系统性红斑狼疮（SLE）患者血液中CD4+ T细胞的异质性，发现辅助性和功能失调的调节性T细胞亚群 | 首次在儿童SLE患者中通过单细胞RNA测序详细描绘CD4+ T细胞的复杂亚群，特别是发现功能失调的调节性T细胞亚群与狼疮肾炎相关，并揭示TLR5和FCRL3在SLE初始T细胞中的上调可能关联粘膜微生物失调 | 未提供具体局限性信息 | 阐明系统性红斑狼疮（SLE）中CD4+ T细胞的复杂性和亚群特征，以理解其对疾病活动性和免疫失调的影响 | 儿童SLE患者和健康供体的血液CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自儿科患者和健康供体的血液CD4+ T细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用分选后的血液CD4+ T细胞进行单细胞RNA测序 |
| 1084 | 2026-05-03 |
Integrated 'omics analysis reveals human milk oligosaccharide biosynthesis programs in human lactocytes
2025-Sep-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113269
PMID:40894860
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据和HMO浓度测量，揭示哺乳期乳腺细胞中母乳低聚糖的生物合成程序 | 首次通过单细胞转录组学与HMO浓度测量相结合的方法，鉴定出上皮细胞亚群中HMO合成基因的差异表达模式，并发现多个候选基因和可能调控HMO生物合成的转录因子 | 未明确说明局限性 | 探究哺乳期乳腺中母乳低聚糖的复杂生物合成通路 | 人类乳腺细胞（lactocytes）中的上皮细胞亚群 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1085 | 2026-05-03 |
Roadmap for spatial transcriptomics of HIV in tissues
2025-Sep-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000961
PMID:40626838
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在组织中HIV研究中的应用，包括平台选择、质量控制和分析流程 | 提出了针对HIV感染组织空间转录组分析的工作流程，包括质量控制、合理性检查和生物信息学分析 | 未提及具体局限性，但指出靶向捕获中靶标数量增加会降低灵敏度 | 探讨空间转录组学在揭示组织中HIV持续存在机制中的潜力和方法 | HIV感染组织及微环境 | 数字病理学 | HIV/AIDS | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | NA | 基于poly-A的mRNA捕获和靶向RNA捕获 |
| 1086 | 2026-05-03 |
scSpatialSIM: a simulator of spatial single-cell molecular data
2025-Sep, SoftwareX
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.softx.2025.102223
PMID:41908069
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研究论文 | 开发了scSpatialSIM软件包，用于模拟具有生物学真实性的空间单细胞分子数据，以支持空间统计方法的基准测试 | 无需参考数据集即可高效模拟单细胞空间模式，支持细胞聚类、共定位、组织分区和空洞等特征，并兼容分类与连续数据 | 仅模拟细胞聚类和共定位，无法模拟更广泛的组织水平子域 | 为空间单细胞分子数据分析提供灵活的模拟框架，推动空间统计方法的比较评估和新方法开发 | 空间单细胞分子数据 | 机器学习 | NA | 多重免疫荧光、空间转录组学 | NA | 图像、文本 | NA | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium FFPE, Illumina NovaSeq 6000 |
| 1087 | 2026-05-03 |
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.657506
PMID:40766395
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研究论文 | 利用单细胞转录组学技术分析化学物质诱导的肝细胞应激状态 | 首次系统性利用单细胞转录组学解码化学物质诱导的细胞应激状态，揭示不同应激反应通路在单细胞层面的异质性 | NA | 利用单细胞转录组学解码毒理学中的细胞应激状态 | HepaRG细胞暴露于依托泊苷、布雷菲德菌素A、放线菌酮、鱼藤酮、tBHQ、曲格列酮和衣霉素等化学物质 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞转录组测序（SCTr） | NA | 单细胞转录组数据 | 约40,000个HepaRG细胞 | BioSpyder | 单细胞RNA-seq | TempO-LINC | TempO-LINC平台进行单细胞转录组分析 |
| 1088 | 2026-05-03 |
Stromal heterogeneity in the adult lung delineated by single-cell genomics
2025-Jun-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00285.2025
PMID:40353369
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综述 | 通过单细胞基因组学描绘成年肺间质细胞的异质性 | 系统总结了单细胞RNA测序研究揭示的肺间质细胞异质性及其功能特征和空间位置 | 未提及具体局限性 | 综述肺间质细胞异质性的单细胞基因组学研究进展 | 肺间质细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1089 | 2026-05-03 |
IL-32-mediated caspase-43 induction: Shaping macrophage differentiation & immunomodulation in glioblastoma multiforme
2025-06, The Indian journal of medical research
DOI:10.25259/IJMR_382_2024
PMID:40878339
|
研究论文 | 研究IL-32在胶质母细胞瘤（GBM）中通过诱导caspase-43表达来调控单核细胞分化、巨噬细胞极化的免疫调节作用 | 首次揭示IL-32通过caspase-43介导单核细胞分化为巨噬细胞，并通过激活NF-κB通路诱导M1向M2表型转换，以及发现IL-32与RNA修饰基因（METTL3、TET2）的表观遗传调控关联 | 未提及具体局限性 | 探究IL-32在GBM中的免疫调节功能，特别是对单核细胞分化和巨噬细胞极化的影响 | 胶质母细胞瘤（GBM）组织和细胞系，以及单核细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组分析、qPCR、蛋白质印迹、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据（基因表达）、单细胞RNA测序数据 | TCGA-GBM和GEO-GSE156902数据集，具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA |
| 1090 | 2026-05-03 |
A STT3A-dependent PD-L1 glycosylation modification mediated by GMPS drives tumor immune evasion in hepatocellular carcinoma
2025-May, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01432-0
PMID:39690246
|
研究论文 | 通过蛋白质组学和单细胞RNA测序分析，发现GMPS介导的STT3A依赖性PD-L1糖基化修饰驱动肝细胞癌的免疫逃逸 | 首次揭示GMPS作为补充模块连接Sec61通道复合物和STT3A，增强PD-L1糖基化修饰，从而促进HCC免疫逃逸的新机制 | 主要基于体外细胞实验和小鼠模型，尚需更多临床样本验证；仅关注GMPS对PD-L1的作用，可能忽略其他免疫逃逸相关分子 | 探索肝细胞癌快速进展和免疫逃逸的分子机制 | 肝细胞癌组织及CD8+ T细胞 | 计算机视觉 | 肝细胞癌 | 蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | 晚期HCC组织样本（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1091 | 2026-05-03 |
Impact of mechanotransduction on gene expression changes in periodontal ligament during orthodontic tooth movement
2025-May, Journal of bone and mineral metabolism
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s00774-025-01581-3
PMID:39893595
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术揭示机械力传导对大鼠牙周膜在正畸牙移动过程中基因表达变化的影响，并探讨Mkx转录因子的作用 | 首次通过单细胞RNA测序描绘了正畸牙移动过程中大鼠牙周膜的细胞图谱，明确了Mkx和Scx在不同细胞群中的表达模式，揭示了Mkx在机械刺激下的保护性作用 | 文章未明确提及研究局限性，例如样本量较小、仅使用了动物模型而未验证人体组织等 | 阐明机械力传导对牙周膜在正畸牙移动过程中基因表达变化的影响，以及Mkx转录因子在该过程中的功能 | 大鼠牙周膜细胞和人类牙周膜细胞 | 单细胞组学 | 口腔疾病（正畸相关） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），RT-qPCR | NA | 测序数据，基因表达数据 | 大鼠牙周膜样本（0天、1周、2周时间点） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1092 | 2026-05-03 |
Spatial transcriptomics of Glomerulo-centric antibody mediated rejection in renal transplants
2025-May, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2025.110460
PMID:39993695
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研究论文 | 通过数字空间分析技术研究肾移植中急性抗体介导排斥反应的肾小球中心空间转录组 | 首次在单患者系列活检中利用数字空间分析技术以空间分辨率定位肾小球内与抗体介导排斥反应相关的先天免疫细胞分子特征，并揭示足细胞损伤与持续肾小球炎的关系 | 基于单一患者的系列活检样本，样本量小，可能限制结果的普适性 | 揭示肾移植中急性抗体介导排斥反应期间肾小球的空间转录组变化 | 一名肾移植患者的连续四次活检组织（排斥反应前后及治疗期间） | 数字病理学 | 肾移植排斥反应 | 数字空间分析（DSP） | NA | 转录组数据 | 4份活检样本来自一名患者 | NA | 空间转录组学 | Digital Spatial Profiling | 数字空间分析（DSP）技术用于定位肾小球内转录本 |
| 1093 | 2026-05-03 |
Murine Aortic Valve Cell Heterogeneity at Birth
2025-May, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322280
PMID:40079140
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析新生小鼠主动脉瓣的细胞异质性，揭示新的内皮细胞亚群和间质细胞亚群及其在出生后成熟过程中的时空轨迹 | 首次在出生后第1天小鼠主动脉瓣中鉴定出一个新的瓣膜内皮细胞亚群和三个先前未描述的瓣膜间质细胞亚群（原始型、重塑型和生物活性型） | 机制方面对瓣膜结构-功能关系建立的理解仍不充分，结论主要基于小鼠模型 | 阐明瓣膜出生后成熟过程中细胞异质性与结构功能关系建立的机制 | 新生小鼠主动脉瓣结构 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 出生后第1天小鼠主动脉瓣样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3‘端测序平台 |
| 1094 | 2026-05-03 |
Chemokine (C-C Motif) Ligand 2 Expressing Adventitial Fibroblast Expansion During Loeys-Dietz Syndrome Aortic Aneurysm Formation
2025-May, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322069
PMID:40109260
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示Loeys-Dietz综合征主动脉瘤形成中外膜成纤维细胞中趋化因子（C-C基序）配体2的表达与扩增 | 首次发现LDS主动脉瘤中转录组变化主要发生在外膜成纤维细胞而非血管平滑肌细胞，并表明LDS与马凡综合征在细胞和分子机制上存在显著差异 | NA | 研究LDS主动脉瘤发病机制中细胞状态转变的作用，特别是外膜成纤维细胞的病理角色 | 小鼠LDS模型（Tgfbr2G357W/+）和人类LDS手术标本的主动脉根/升主动脉组织 | 数字病理学 | Loeys-Dietz综合征 | 单细胞RNA测序，RNA原位杂交，免疫荧光，免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠LDS模型在8周和24周龄时取样，人类LDS手术标本（n=5 LDS）和供体对照（n=2），共超过30000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1095 | 2026-05-03 |
Human skeletal development and regeneration are shaped by functional diversity of stem cells across skeletal sites
2025-May-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.02.013
PMID:40118065
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研究论文 | 通过整合来自十个人体骨骼部位的骨骼干细胞分离、功能实验和单细胞RNA测序分析，揭示了骨骼干细胞在发育和再生中的功能多样性 | 首次系统描绘了来自10个不同骨骼位点的人类骨骼干细胞亚型组成及其克隆动态，并发现年龄相关的骨形成障碍源于干细胞的病理成纤维化转变 | 未明确提及研究局限性 | 探索人类骨骼干细胞在不同骨骼位点的功能多样性及其在骨骼发育和再生中的作用 | 来自十个人体骨骼部位的人类骨骼干细胞 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序 | 布尔算法模型 | 单细胞测序数据 | 10个人体骨骼部位的样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 1096 | 2026-05-03 |
Pooled tagging and hydrophobic targeting of endogenous proteins for unbiased mapping of unfolded protein responses
2025-May-01, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2025.04.002
PMID:40273915
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研究论文 | 开发了一种对内源蛋白进行池式标记和疏水靶向的方法，用于无偏映射未折叠蛋白响应 | 首次实现高通量可视化与扰动结合的内源蛋白池式标记系统，揭示不同细胞区室对蛋白错误折叠的互斥而非协作响应 | 未明确说明局限性，但可能依赖HaloTag标记效率及细胞系特异性 | 系统解析蛋白质组组织、调节和功能，特别是蛋白质质量控制响应机制 | 内源蛋白（HaloTag标记的蛋白质）及未折叠蛋白响应相关基因 | 机器学习和组学分析结合 | NA | 池式成像、原位条形码测序、单细胞RNA测序、配体诱导蛋白错误折叠 | NA | 图像、转录组测序数据 | 复杂细胞池（具体数量未在摘要中给出） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1097 | 2026-05-03 |
Inactivation of GSK3β by Ser389 phosphorylation prevents thymocyte necroptosis and impacts Tcr repertoire diversity
2025-May, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01441-z
PMID:39779909
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研究论文 | 通过高分辨率单细胞RNA测序分析发现GSK3β的Ser389磷酸化失活阻止胸腺细胞坏死，影响T细胞受体库多样性 | 首次揭示GSK3β通过坏死而非凋亡促进胸腺细胞死亡，以及其失活对TCR库多样性的调控作用 | 未提供 | 阐明胸腺细胞在V(D)J重组过程中细胞周期检查点和生存通路的机制 | 小鼠DN3和DN4胸腺细胞 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 单个分选的小鼠DN3和DN4胸腺细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 高分辨率单细胞RNA测序 |
| 1098 | 2026-05-03 |
A Robust Kernel-Based Workflow for Niche Trajectory Analysis
2025-05, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401199
PMID:40411819
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研究论文 | 提出一种基于核的稳健工作流，用于生态位轨迹分析，无需细胞类型注释即可建模组织微环境的空间连续变化 | 通过将生态位结构组成建模为基因表达空间中的连续函数，避免了传统方法对细胞类型注释的需求，并结合细胞类型去卷积分析扩展至任意空间分辨率的数据集 | 未明确说明，但可能包括对高分辨率空间转录组数据的依赖以及连续函数建模的计算复杂性 | 开发一种无需细胞类型注释的稳健生态位轨迹分析方法，以提升空间转录组数据分析的准确性和鲁棒性 | 空间转录组数据集中的组织微环境生态位结构 | 机器学习 | 损伤或疾病相关组织微环境变化 | 空间转录组学 | 基于核的连续函数模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1099 | 2026-05-03 |
scDILT: A Model-Based and Constrained Deep Learning Framework for Single-Cell Data Integration, Label Transferring, and Clustering
2025 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3553068
PMID:40811359
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研究论文 | 提出一种名为scDILT的新工具，利用条件自编码器和深度嵌入聚类来整合单细胞RNA测序数据，同时保留参考数据集的细胞类型模式 | 提出scDILT框架，通过同质约束保持参考数据集中的细胞类型/聚类模式，同时利用异质约束将新数据集中的细胞映射到已注释的细胞簇，实现数据整合、标签转移和聚类的一体化 | 未明确说明局限性 | 开发一种能够同时实现单细胞数据整合、标签转移和聚类的工具，确保整合新数据时不会改变旧/参考数据集中的细胞簇定义 | 单细胞RNA测序数据，包括模拟和真实数据集，以及多组学单细胞数据集 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 条件自编码器、深度嵌入聚类 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1100 | 2026-05-03 |
DNTT-mediated DNA damage response drives inotuzumab ozogamicin resistance in B-cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Mar-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024026085
PMID:39791601
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研究论文 | 通过全基因组CRISPR筛选发现DNTT缺失是B细胞急性淋巴细胞白血病对Inotuzumab ozogamicin耐药的主要驱动因素 | 首次揭示DNTT通过调控DNA损伤反应介导InO耐药机制，并利用单细胞RNA测序验证了白血病内异质性 | 未在更大临床样本中验证DNTT作为生物标志物的预测效能，且未探讨其他潜在耐药机制 | 阐明B细胞急性淋巴细胞白血病对Inotuzumab ozogamicin耐药的遗传基础 | B细胞急性淋巴细胞白血病细胞系、患者样本及异种移植模型 | 机器学习 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | CRISPR筛选 | NA | 基因表达数据 | 儿童肿瘤组AALL1621试验中的B-ALL患者样本及患者来源异种移植模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |