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当前共找到 41090 篇文献，本页显示第 1081 - 1100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1081 | 2026-06-18 |
Single-cell reveals age-dependent epithelial reprogramming and EMT vulnerability in THCA
2026-06-01, Endocrine-related cancer
IF:4.1Q2
DOI:10.1530/ERC-26-0021
PMID:42171146
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示甲状腺癌中年龄依赖的上皮重编程和上皮-间充质转化易感性 | 首次通过单细胞RNA测序系统揭示甲状腺癌中年龄相关的上皮细胞重编程和EMT特征，并鉴定PHTF2和SNAI1为关键调控因子 | 研究样本量有限（20例），主要依赖体外功能验证，缺乏体内实验和临床结局数据 | 探究甲状腺癌中上皮-间充质转化和肿瘤微环境重塑的机制 | 92,849个细胞，来自20例未成年和成年患者的甲状腺组织样本 | 单细胞转录组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 20例甲状腺组织样本（来自未成年和成年患者），共92,849个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1082 | 2026-06-18 |
Spatially resolved single-cell analyses of human meningioma identify novel cell states influencing tumor microenvironment and progression
2026-Jun, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-026-02615-w
PMID:42265312
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研究论文 | 利用单细胞分辨率的空间转录组学和单核RNA测序，分析人类脑膜瘤的细胞状态异质性及其对肿瘤微环境和进展的影响 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘脑膜瘤的细胞状态图谱，包括髓系细胞状态的差异及其与分子分型、微环境塑造和预后预测的关联 | 未在标题和摘要中明确提及局限性 | 探讨脑膜瘤肿瘤内在异质性的单细胞特征，以指导潜在治疗途径 | 人类脑膜瘤组织样本 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单核RNA测序, 高分辨率空间转录组学, 批量DNA甲基化测序, 批量RNA测序, 批量蛋白质组学, 血浆甲基化检测 | NA | 测序数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 甲基化数据 | 712例批量DNA甲基化和RNA测序样本, 88例批量蛋白质组样本, 59例血浆甲基化样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1083 | 2026-06-18 |
Accurate, scalable and cross-platform cell identification for high-resolution spatial transcriptomics
2026-Jun, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-026-02610-1
PMID:42162410
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research paper | 提出 Cellist 多模态方法，结合图像和表达信息实现高分辨率空间转录组学数据的精确、可扩展、跨平台细胞分割 | Cellist 方法结合图像和表达信息，实现跨多种空间转录组学平台（如 Stereo-seq、Seq-Scope、seqFISH+、STARmap 和 10x Xenium）的细胞分割，具有高计算效率和鲁棒性 | 未明确提及，但可能依赖高质量图像数据和表达信息融合；对极端低分辨率或噪声数据性能可能受限 | 开发一种准确、可扩展、跨平台的细胞分割方法，以解决高分辨率空间转录组学中的细胞分割挑战 | 小鼠脑组织和非小细胞肺癌样本 | digital pathology | non-small cell lung cancer | spatial transcriptomics | CNN | image | 未提供具体样本数量，但包括小鼠脑组织和非小细胞肺癌样本 | 10x Genomics | spatial transcriptomics | 10x Xenium | NA |
| 1084 | 2026-06-18 |
Research progress on immune microenvironment and biomarkers of small cell lung cancer
2026-May-31, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2026-1-0320
PMID:42306740
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综述 | 系统总结了小细胞肺癌不同阶段和亚型的免疫微环境特征及关键生物标志物 | 整合基因组测序、单细胞测序和空间转录组学等多方法数据，首次系统回顾不同分期和亚型小细胞肺癌的免疫微环境特征 | 缺乏该领域的系统性综述，且免疫联合治疗在SCLC患者中的疗效仍有限 | 为改善免疫治疗疗效和发现新治疗靶点提供新视角 | 小细胞肺癌的免疫微环境和生物标志物 | 医学研究 | 小细胞肺癌 | 基因组测序, 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1085 | 2026-06-18 |
Identifying and validating of prognostic genes associated with myeloid cell differentiation in cervical cancer: development of a risk model based on single-cell RNA sequencing combined with bulk RNA sequencing data
2026-May-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-1-0174
PMID:42305465
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序与批量RNA测序数据，开发了与骨髓细胞分化相关的宫颈癌预后基因风险模型 | 首次整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建了基于骨髓细胞分化的宫颈癌预后风险模型，并揭示了相关免疫微环境特征和药物敏感性差异 | 未提供具体的样本量信息和外部验证队列，潜在的地域或人群偏倚未被讨论 | 识别与骨髓细胞分化相关的宫颈癌预后基因，并建立风险模型以改善预后预测 | 宫颈癌患者样本中的骨髓细胞（包括MDSCs和TAMs）及相关基因表达数据 | machine learning | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR | LASSO回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1086 | 2026-06-18 |
Single-cell analysis identifies a tumor-specific T-cell metabolic signature: prognostic model and association with immunosuppressive microenvironment in ovarian cancer
2026-May-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-1-0211
PMID:42305453
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析卵巢癌中肿瘤特异性T细胞的代谢特征，构建预后模型并评估其与免疫抑制微环境的关联 | 首次从单细胞分辨率识别出肿瘤特异性T细胞亚群（CA-T细胞）的线粒体代谢重编程特征，并建立了一个包含8个基因的预后风险评分模型，揭示代谢异质性与免疫抑制微环境及免疫检查点抑制剂疗效之间的关联 | 模型主要基于公共数据库（GSE184880和TCGA-OV），验证队列较为有限，且未在独立前瞻性队列或临床试验中进行外部验证 | 构建基于肿瘤特异性T细胞代谢特征的预后模型，分析其与免疫抑制微环境及免疫治疗疗效的关系 | 卵巢癌组织中的肿瘤特异性T细胞亚群（CA-T细胞） | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO回归、随机生存森林 | 单细胞转录组数据、多组学数据 | GSE184880单细胞数据集和TCGA-OV队列的多组学数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1087 | 2026-06-18 |
Integrating innovative multiomics and machine learning strategies for prognostic biomarker discovery in hepatocellular carcinoma: guiding personalized treatment strategies with single-cell analysis
2026-May-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1-2870
PMID:42305483
|
研究论文 | 整合多组学数据和机器学习策略，结合单细胞分析，为肝细胞癌发现预后生物标志物并指导个性化治疗 | 创新性地开发了包含13种机器学习组合的框架来构建共识CS1相关特征，并整合单细胞RNA测序与多组学分析，提供了肝细胞癌风险分层和个性化治疗的全面视角 | 研究未提及具体限制，但可能包括数据来源的偏差、机器模型的外部验证范围有限以及临床应用的潜在挑战 | 利用多组学数据、机器学习和单细胞分析发现肝细胞癌预后生物标志物，指导个性化治疗策略 | 肝细胞癌患者的多组学数据（包括mRNA、长链非编码RNA、microRNA表达谱、基因组突变和DNA甲基化数据） | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 甲基化测序, 单细胞RNA测序 | CNN, LSTM, GAN（根据机器学习的13种组合，可能包含多种模型） | 表达数据, 突变数据, 甲基化数据, 单细胞转录组数据 | 来自癌症基因组图谱数据集的多组学样本，具体数量未明确，但包含训练集和验证集 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 甲基化测序 | Illumina NovaSeq（可能用于测序平台，但原文未明确） | NA（由于抽象中未提供具体平台配置细节） |
| 1088 | 2026-06-18 |
Comprehensive analysis to develop a stromal senescence-associated gene signature for predicting hepatocellular carcinoma
2026-May-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1-2894
PMID:42305498
|
研究论文 | 基于基质衰老相关基因特征构建肝细胞癌预后预测模型并进行多组学验证 | 首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法构建基质衰老相关的六基因预后特征，并整合空间转录组学和虚拟筛选进行多维度验证 | 未提及 | 开发并验证一个稳健的预后预测模型，以准确评估肝细胞癌患者的预后风险并促进个性化精准治疗 | 肝细胞癌患者肿瘤组织和相关基质细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学、虚拟筛选、分子对接和分子动力学模拟 | Cox回归和LASSO分析 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质组数据、空间转录组数据 | 未明确样本量，涉及GEO、TCGA和CPTAC数据库数据 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1089 | 2026-06-18 |
WT1-AS acts as a tumor suppressor in cervical cancer via OSR2-mediated transcriptional activation
2026-May-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1-2842
PMID:42305506
|
研究论文 | 探究WT1-AS在宫颈癌中通过OSR2介导的转录激活发挥抑癌作用 | 首次发现WT1-AS在宫颈癌中作为抑癌因子，并揭示OSR2作为其直接上游转录调控因子，阐明了WT1-AS/OSR2轴促进凋亡的机制 | 临床适用性仍需进一步验证 | 研究WT1-AS在宫颈癌中的表达模式、预后意义、生物学功能及其上游转录调控机制 | WT1-AS在宫颈癌中的作用及OSR2对其的转录调控 | 数字病理 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、转录因子预测、共表达分析、荧光素酶报告实验、Western blotting、流式细胞术、异种移植小鼠模型 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA泛癌和宫颈癌数据集，以及异种移植小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1090 | 2026-06-18 |
Circadian-immune-related gene signature for lung squamous cell carcinoma: machine learning and multi-omics analysis
2026-May-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-1-0302
PMID:42305521
|
研究论文 | 开发基于昼夜节律-免疫相关基因的预后标志物，用于肺鳞癌风险分层和治疗指导 | 通过整合多组学数据和十种机器学习算法，首次构建了昼夜节律-免疫相关基因预后标志物（CIGPS），揭示了肺鳞癌中免疫微环境异质性与昼夜节律紊乱的关联 | 样本量有限（n=494+69），外部验证数据集规模较小；单细胞RNA-seq数据未进行独立队列验证；CIGPS的临床实用性需进一步前瞻性研究验证 | 构建预后标志物以改善肺鳞癌风险分层和治疗指导，并探索昼夜节律紊乱对肿瘤免疫微环境的影响 | 肺鳞癌（LUSC）患者，公共数据库数据（TCGA和GEO） | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）, StepCox + GBM等十种机器学习算法 | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 临床数据 | 494例（TCGA）+ 69例（GSE73403）+ 单细胞RNA-seq数据（GSE148071） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1091 | 2026-06-18 |
Leveraging Lineage Barcodes as Natural Augmentations for Contrastive Learning of Cell Fate in scRNA-seq Data
2026-May-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.28.620670
PMID:42239199
|
研究论文 | 介绍一种名为谱系感知对比学习（LCL）的框架，利用可遗传谱系条形码作为数据增强方法，从单细胞RNA测序数据中分离细胞命运决定信号 | 将谱系条形码视为自然数据增强手段，通过半监督架构将谱系结构转移到无条形码的临床数据集，实现了从横截面数据预测纵向命运承诺 | 未提及具体的局限性 | 开发可扩展的对比学习范式，以理解并潜在操纵细胞分化过程 | 造血系统和成纤维细胞系统中的细胞分化与命运决定 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、谱系追踪 | 对比学习模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1092 | 2026-06-18 |
Transcriptomic Meta-Analysis as a Framework for Robust Cross-Study Biological Inference
2026-May-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27114674
PMID:42278205
|
综述 | 该综述概述了转录组荟萃分析的关键方法学步骤及其在跨研究生物学推断中的应用 | 强调异质性不仅被视为噪声来源，而是定义了跨研究分析的可重复性和解释边界 | 文中未明确说明具体局限性，但可能包括数据整合中异质性的挑战尚未完全解决 | 提供转录组荟萃分析的方法论框架，支持更稳健的生物学推断 | 转录组数据集及其跨研究整合 | 机器学习 | NA | RNA-seq, 单细胞转录组, 空间转录组 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1093 | 2026-06-18 |
EPHB2 drives EMT-linked vasculogenic mimicry and cervical cancer progression via an ERK-ETV4 transcriptional program
2026-May-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08300-0
PMID:42143313
|
research paper | 本研究揭示了EPHB2通过ERK-ETV4转录程序驱动宫颈癌中EMT相关的血管生成拟态和肿瘤进展 | 首次发现EPHB2作为上游调控因子，通过ERK-ETV4转录程序协调EMT和血管生成拟态，促进宫颈癌侵袭和耐药 | 机制验证主要基于体外细胞实验和异种移植模型，缺乏临床样本的大规模队列验证和更深入的信号网络解析 | 阐明EPHB2在宫颈癌血管生成拟态相关可塑性中的功能角色和分子机制 | 宫颈癌细胞系HeLa和SiHa，以及宫颈癌组织样本 | machine learning | 宫颈癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组化, qRT-PCR, Western blot | NA | 转录组数据, 单细胞数据 | 多个公共数据集包括GSE168244、GSE138080、TCGA-CESC、GTEx，以及一个机构的免疫组化队列 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 公共转录组数据集和单细胞RNA-seq数据 |
| 1094 | 2026-06-18 |
Lineage and organ signals sequentially build organ intrinsic nervous systems
2026-May-13, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10490-y
PMID:42129551
|
研究论文 | 通过系统级跨器官分析，揭示器官固有神经系统由谱系和器官信号依次构建的发育逻辑 | 首次提出器官固有神经系统发育的双重逻辑：谱系程序预置空间框架，而器官特异性信号指导最终分子身份和结构精度 | 未提及具体局限性 | 探究器官固有神经系统如何从共同的神经嵴细胞起源发育为不同神经结构 | 小鼠心脏、胰腺、肠道和肺的器官固有神经系统 | 机器学习 | NA | 谱系追踪、3D成像、单细胞转录组学、遗传扰动 | NA | 图像、转录组数据 | 涉及多个器官的小鼠样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 1095 | 2026-06-18 |
Novel Approaches for Investigating Host Responses to HIV Infection in Ex Vivo Human Genital Tissues
2026-05, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.70240
PMID:42053961
|
综述 | 综述利用离体人类生殖组织研究HIV感染宿主反应的新方法 | 聚焦空间转录组学与多重成像技术在生殖组织免疫微环境分析中的创新应用，开发定制化计算流程以整合转录组与成像数据 | 现有空间转录组学与生物成像平台仍存在分辨率限制和高成本等问题 | 揭示生殖黏膜免疫反应与结构完整性对HIV性传播易感性和慢性感染的作用机制 | 离体人类生殖组织 | 数字病理学 | 艾滋病 | 空间转录组学，多重成像 | NA | 图像， 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1096 | 2026-06-18 |
Single-Cell Characterization of Terminal States and State-Specific Transcriptional Regulatory Networks in Hepatocellular Carcinoma
2026-05, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71214
PMID:42186138
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据揭示肝细胞癌的终端细胞状态及其特异性转录调控网络 | 首次构建连接细胞命运动态与转录调控网络的整合框架，识别出肝细胞癌的三种终端细胞状态（免疫激活型、代谢型和增殖型），并发现每种状态由特定核心调控因子（IRF3、PPARA和JUN）调控 | 基于公开数据且主要依赖计算预测，缺乏体外或体内实验验证 | 阐明肝细胞癌肿瘤细胞沿命运轨迹状态的涌现及其转录调控机制 | 肝细胞癌中的恶性细胞及其细胞状态和转录调控网络 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | CellRank、SCENIC | 单细胞转录组数据 | 公开可用的单细胞RNA测序数据（具体样本量未在标题和摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1097 | 2026-06-18 |
RUNX2 drives adenoma-to-carcinoma transition in colon cancer
2026-Apr-29, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08801-2
PMID:42056097
|
研究论文 | 揭示RUNX2在结肠癌腺瘤-癌转变中的驱动作用及其分子机制 | 通过单细胞RNA测序首次发现CD8耗竭T细胞通过TNF-α/TNFRSF1A通路激活恶性上皮细胞中的RUNX2，驱动腺瘤向癌转变，并鉴定RUNX2抑制剂CADD522可阻断该过程 | 研究主要基于体外细胞实验和AOM/DSS小鼠模型，缺乏大规模临床队列验证及RUNX2抑制剂在体内的长期安全性评估 | 阐明结肠腺瘤向腺癌转变的分子机制，寻找早期干预靶点 | 结肠腺瘤组织和癌组织中的CD8耗竭T细胞、恶性上皮细胞，以及HCT116和HCT15细胞系 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序、qRT-PCR、多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据、细胞图像 | 包含结肠腺瘤、癌及癌旁正常组织的患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'试剂盒 |
| 1098 | 2026-06-18 |
Therapeutic effects of mesenchymal stem cell-derived extracellular vesicles from different tissue sources on diminished ovarian reserve and the related mechanisms
2026-Apr-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04403-4
PMID:42057118
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研究论文 | 比较脂肪来源和脐带来源间充质干细胞胞外囊泡对卵巢储备功能减退小鼠的治疗效果及机制 | 首次系统比较不同组织来源间充质干细胞胞外囊泡在卵巢储备功能减退模型中的疗效差异，并揭示脐带来源囊泡具有更广泛的调控作用和更持久的生殖益处 | 未提及具体局限性 | 比较脂肪和脐带来源间充质干细胞胞外囊泡对卵巢储备功能减退的治疗效果及机制，为临床选择最优囊泡来源提供实验证据 | 环磷酰胺诱导的卵巢储备功能减退小鼠模型 | 数字病理学 | 卵巢储备功能减退 | 蛋白质组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据，单细胞转录组数据 | 环磷酰胺诱导的卵巢储备功能减退小鼠，未明确样本数 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1099 | 2026-06-18 |
Spatial transcriptomic atlas of murine neurotoxocariasis reveals region-specific host responses and dysfunction in the brain
2026-Apr-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72114-3
PMID:41997914
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研究论文 | 结合空间转录组学、单核RNA测序、脂质组学和行为学分析，在小鼠模型中绘制犬弓首蛔虫幼虫引起神经弓首蛔虫病的宿主-寄生虫界面图谱，揭示区域特异性脑损伤和功能障碍机制 | 首次使用空间转录组学技术系统解析神经弓首蛔虫病中脑区域特异性宿主反应和寄生虫转录程序，结合多组学和行为学分析揭示运动学习和记忆障碍的分子机制 | NA | 阐明神经弓首蛔虫病的病理机制，特别是脑区域特异性神经损伤、免疫反应和功能障碍的分子机制 | 感染犬弓首蛔虫的小鼠模型脑组织 | 数字病理学 | 神经弓首蛔虫病 | 空间转录组学、单核RNA测序、脂质组学 | NA | 转录组数据、脂质组数据、行为学数据 | 小鼠模型（具体样本量未在摘要中提及） | NA | 空间转录组学、单核RNA测序 | NA | NA |
| 1100 | 2026-06-18 |
Tumor cell-derived IFN spatially reprograms osteopontin-enriched macrophage niches to promote PARP inhibitor resistance
2026-04-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199035
PMID:41734034
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研究论文 | 该研究整合空间转录组学与单细胞RNA测序，揭示了肿瘤细胞衍生的IFN通过SPP1通路重塑巨噬细胞微环境导致PARP抑制剂耐药的新机制 | 首次发现肿瘤细胞来源的IFN通过STAT信号诱导TAM中骨桥蛋白（SPP1）表达形成免疫抑制生态位，并验证SPP1阻断可恢复PARP抑制剂敏感性 | 未明确说明样本量及长期随访数据 | 阐明PARP抑制剂耐药的空间免疫微环境机制并探索新治疗靶点 | 高级别浆液性卵巢癌患者肿瘤标本及HRD小鼠模型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | PhenoCycler-Fusion空间分析, 单细胞RNA测序, 多重免疫组化 | NA | 图像, 转录组数据 | 前瞻性新辅助尼拉帕利单药治疗试验的肿瘤标本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | PhenoCycler-Fusion | PhenoCycler-Fusion空间分析平台配合10x单细胞RNA测序 |