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当前共找到 37326 篇文献，本页显示第 1081 - 1100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1081 | 2026-03-02 |
Negative binomial mixture model for identification of noise in antibody-antigen specificity predictions from single-cell data
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae170
PMID:39659592
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研究论文 | 本文提出了一种使用负二项混合模型对LIBRA-seq单细胞数据进行去噪的方法，以改进抗体-抗原特异性预测 | 通过负二项混合模型将抗原计数聚类为信号和噪声成分，为LIBRA-seq数据提供了一种数据驱动的去噪方法 | NA | 提高单细胞B细胞受体测序数据中抗原结合预测的准确性，以支持抗体发现和机器学习应用 | LIBRA-seq单细胞B细胞受体测序数据 | 机器学习 | NA | LIBRA-seq | 负二项混合模型 | 单细胞测序数据 | 来自九个供体的LIBRA-seq实验数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1082 | 2026-03-02 |
Semi-reference based cell type deconvolution with application to human metastatic cancers
2023-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad109
PMID:38143958
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SECRET的新型去卷积方法，利用单细胞RNA测序数据中的细胞类型特异性基因表达谱，从批量RNA测序数据中准确估计细胞类型比例 | SECRET方法能够适应批量数据中存在的细胞类型在参考数据中未表示的情况，从而提高了参考选择的灵活性 | NA | 开发一种去卷积方法以从批量RNA测序数据中估计细胞类型比例，应用于人类转移性癌症研究 | 人类转移性癌症 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 去卷积方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1083 | 2026-03-02 |
Increased spatial coupling of integrin and collagen IV in the immunoresistant clear cell renal cell carcinoma tumor microenvironment
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.16.567457
PMID:38014063
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，分析了免疫治疗（IO）敏感与耐药性透明细胞肾细胞癌（ccRCC）肿瘤微环境中整合素与胶原蛋白IV的空间耦合变化 | 首次在细胞分辨率水平上，通过空间转录组学揭示了IO耐药性ccRCC肿瘤微环境中COL4A1-ITGAV配体-受体对的空间自相关性增强 | 样本量相对较小（21例），且主要依赖相关性分析，需要进一步的功能性实验验证 | 探究透明细胞肾细胞癌对免疫治疗产生耐药性的肿瘤微环境机制 | 免疫治疗初治（IO naïve）与经治（IO exposed）的原发性透明细胞肾细胞癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 空间分子成像（SMI）、空间基因集富集分析（GSEA）、多重免疫荧光（mIF）、数据库分析（TCGA、CPTAC） | NA | 空间转录组数据、图像数据、批量RNA表达数据、蛋白质组数据 | 21例患者样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1084 | 2026-03-02 |
Immune profiling of murine cardiac leukocytes identifies triggering receptor expressed on myeloid cells 2 as a novel mediator of hypertensive heart failure
2023-10-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad093
PMID:37314125
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析小鼠心脏免疫细胞，发现TREM2在高血压性心力衰竭中具有心脏保护作用 | 首次使用CITE-seq技术绘制高血压性心力衰竭小鼠模型的心脏免疫细胞图谱，并揭示TREM2在心脏保护中的新功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限，且机制研究仍需深入 | 探究高血压性心力衰竭的免疫机制，寻找新的诊断和治疗靶点 | 小鼠心脏免疫细胞，特别是巨噬细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞测序，CITE-seq | NA | 单细胞转录组和表面蛋白数据 | 小鼠模型，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1085 | 2026-03-02 |
Immunophenotypic correlates of sustained MRD negativity in patients with multiple myeloma
2023-09-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40966-8
PMID:37660077
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术，分析了多发性骨髓瘤患者在接受来那度胺维持治疗前后的免疫微环境，以探索与长期治疗反应相关的免疫表型特征 | 首次结合单细胞RNA测序和T细胞受体β测序与质谱流式细胞术，纵向比较了达到持续微小残留病灶阴性与未达到或无法维持阴性的患者免疫微环境差异 | 样本量较小（仅23名患者），且研究主要关注来那度胺治疗，可能无法推广到其他治疗方案 | 探索多发性骨髓瘤患者免疫微环境在维持疾病缓解中的作用，并发现与长期治疗反应相关的免疫表型相关性 | 新诊断的多发性骨髓瘤患者，接受连续来那度胺维持治疗 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, T细胞受体β测序, 质谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 质谱流式细胞术数据 | 23名患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 1086 | 2026-03-02 |
Mammary duct luminal epithelium controls adipocyte thermogenic programme
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06361-5
PMID:37495690
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研究论文 | 本研究揭示了乳腺导管上皮细胞通过分泌因子调控雌性小鼠皮下白色脂肪组织中冷诱导的UCP1表达，从而影响脂肪细胞产热 | 首次发现乳腺导管上皮细胞分泌的“乳腺因子”在交感神经激活下限制脂肪细胞UCP1表达，揭示了性别特异性脂肪产热调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类中的相关性尚未验证；乳腺因子作用的具体分子通路需进一步阐明 | 探究乳腺导管上皮细胞在调控脂肪细胞产热程序中的作用机制 | 雌性小鼠的皮下白色脂肪组织及乳腺导管上皮细胞 | 细胞生物学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序，全组织免疫荧光3D可视化 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 雌性小鼠脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1087 | 2026-03-02 |
150 risk variants for diverticular disease of intestine prioritize cell types and enable polygenic prediction of disease susceptibility
2023-Jul-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100326
PMID:37492107
|
研究论文 | 本研究通过大规模基因组关联分析，识别了150个与肠道憩室病相关的风险变异，并利用单细胞RNA测序数据揭示了特定细胞类型在疾病发展中的作用 | 首次整合GWAS结果与人类肠道单细胞RNA测序数据，明确了肠道肌细胞、间皮细胞、基质细胞以及肠神经元和胶质细胞在憩室病发展中的关键作用，并构建了有效的多基因风险评分模型 | 研究主要基于欧洲人群数据，可能限制了结果在其他人群中的普适性；功能验证实验不足，机制研究仍需深入 | 通过基因组学方法揭示肠道憩室病的遗传基础、风险预测和发病机制 | 724,372名个体的基因组数据及人类肠道单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | 肠道憩室病 | 全基因组关联分析（GWAS）、单细胞RNA测序 | 多基因风险评分（PGS） | 基因组数据、单细胞RNA测序数据 | 724,372名个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1088 | 2026-03-02 |
p53 governs an AT1 differentiation programme in lung cancer suppression
2023-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06253-8
PMID:37468633
|
研究论文 | 本研究揭示了p53通过调控肺泡上皮细胞分化状态来抑制肺腺癌发展的新机制 | 首次发现p53通过促进肺泡I型细胞分化程序来抑制肺癌，并揭示其在组织损伤修复中的基础作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证有限 | 探究p53抑制肺腺癌发展的分子机制 | 表达致癌Kras和不同Trp53等位基因的小鼠模型中的肺腺癌细胞 | 癌症生物学 | 肺癌 | RNA测序, ATAC测序, 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 单细胞转录组数据 | 使用Trp53野生型、缺失型和超形态等位基因的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, bulk ATAC-seq | NA | NA |
| 1089 | 2026-03-02 |
CX3CR1+ Macrophage Facilitates the Resolution of Allergic Lung Inflammation via Interacting CCL26
2023-06-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202209-1670OC
PMID:36790376
|
研究论文 | 本研究揭示了CX3CR1+巨噬细胞通过与CCL26相互作用，在解决过敏性肺部嗜酸性粒细胞炎症中的关键作用 | 首次阐明了气道来源的CCL26通过激活CX3CR1+巨噬细胞分泌C1q，从而促进嗜酸性粒细胞清除的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究组织驻留巨噬细胞在嗜酸性过敏性肺部炎症消退过程中的细胞机制 | 人类和小鼠的肺泡巨噬细胞亚群、嗜酸性粒细胞、气道上皮细胞 | 免疫学 | 过敏性肺部疾病 | 质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、生物物理和免疫学分析 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 | 人类过敏原激发样本、小鼠过敏性肺部炎症模型、条件性CCL26敲除转基因小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1090 | 2026-03-02 |
Matrix stiffness enhances cancer-macrophage interactions and M2-like macrophage accumulation in the breast tumor microenvironment
2023-06, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2022.04.031
PMID:35483629
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探究了基质硬度对乳腺癌肿瘤微环境中细胞异质性和细胞间通讯的影响 | 首次在体内外结合单细胞RNA测序和生物材料平台，系统揭示了基质硬度通过调节CSF-1表达影响肿瘤相关巨噬细胞招募和M2表型极化的新机制 | 研究基于MMTV-PyMT小鼠模型，结论在人类乳腺癌中的普适性有待验证；未深入探究硬度影响CSF-1表达的具体信号通路 | 探究肿瘤基质硬度对肿瘤内异质性、细胞间通讯及巨噬细胞表型的影响 | MMTV-PyMT小鼠乳腺肿瘤模型、乳腺癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1091 | 2026-03-02 |
Massively parallel base editing to map variant effects in human hematopoiesis
2023-05-25, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.03.035
PMID:37137305
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研究论文 | 本文开发了一种大规模并行碱基编辑筛选方法，应用于人类造血干细胞和祖细胞，以系统性评估遗传变异在造血过程中的功能影响 | 首次在人类造血干细胞和祖细胞中实现大规模并行碱基编辑筛选，结合单细胞RNA测序和单细胞基因分型，实现跨造血分化状态的功能变异效应映射 | 方法主要针对造血系统，可能不适用于其他类型的原代细胞，且依赖于碱基编辑技术的特异性 | 系统性评估遗传变异对人类造血过程的影响，以研究疾病机制并开发治疗策略 | 人类造血干细胞和祖细胞 | 基因编辑与功能基因组学 | 血液疾病 | 碱基编辑，单细胞RNA测序，单细胞基因分型 | NA | 单细胞RNA测序数据，基因分型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1092 | 2026-03-02 |
Femtosecond laser microdissection for isolation of regenerating C. elegans neurons for single-cell RNA sequencing
2023-04, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01804-3
PMID:36928074
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研究论文 | 本文介绍了一种利用飞秒激光显微切割技术从活体组织中分离特定神经元的方法，用于单细胞RNA测序，以研究线虫神经再生的分子机制 | 开发了飞秒激光显微切割技术，首次实现了从活体线虫组织中精确分离具有特定再生表型的神经元，避免了组织解离引起的转录伪影 | 方法可能受限于激光切割的精度和效率，且在线虫以外的模型中的应用尚未验证 | 研究神经再生的分子机制，实现表型到基因型的映射 | 秀丽隐杆线虫的再生神经元 | 单细胞测序 | 神经再生 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1093 | 2026-03-02 |
Tumor Niche Network-Defined Subtypes Predict Immunotherapy Response of Esophageal Squamous Cell Cancer
2023-Feb-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.15.528539
PMID:36824935
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研究论文 | 本研究通过整合分析食管鳞状细胞癌（ESCC）患者肿瘤微环境的单细胞转录组数据，定义了基于T细胞耗竭、IFN a/b信号通路、TIGIT富集等特征的ESCC亚型，并预测了免疫检查点阻断（ICB）治疗的反应 | 利用单细胞转录组学数据，基于肿瘤微环境中T细胞、髓系细胞和成纤维细胞的细胞网络转录特征，首次定义了ESCC的亚型，并成功预测了ICB治疗反应，为精准免疫治疗提供了新策略 | 研究样本量相对较小（69例患者），且主要依赖转录组数据，缺乏蛋白质组或功能验证数据，可能限制了亚型定义的全面性和临床应用的普适性 | 旨在通过肿瘤微环境单细胞转录组分析，对ESCC进行亚型分类，并预测患者对免疫检查点阻断治疗的反应，以优化治疗选择 | 69例人类食管鳞状细胞癌（ESCC）患者的肿瘤微环境单细胞转录组数据集 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 69例ESCC患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1094 | 2026-03-02 |
Cross center single-cell RNA sequencing study of the immune microenvironment in rapid progressing multiple myeloma
2023-Jan-26, NPJ genomic medicine
IF:4.7Q1
DOI:10.1038/s41525-022-00340-x
PMID:36702834
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研究论文 | 本研究通过多中心单细胞RNA测序，揭示了快速进展型多发性骨髓瘤患者骨髓免疫微环境中耗竭性CD8 T细胞和M2耐受性巨噬细胞富集等特征 | 首次通过多中心单细胞RNA测序比较分析，验证了不同研究中心scRNA-seq数据的一致性，并系统鉴定了快速进展型MM特有的免疫微环境特征 | 样本量相对有限（18名患者），且为横断面研究，无法完全确定观察到的细胞群变化与疾病进展的因果关系 | 探究多发性骨髓瘤快速进展的免疫微环境机制 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓CD138样本 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 48份骨髓样本（来自18名患者），共计102,207个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1095 | 2026-03-02 |
Correspondence analysis for dimension reduction, batch integration, and visualization of single-cell RNA-seq data
2023-01-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-26434-1
PMID:36681709
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研究论文 | 本文提出了一种基于对应分析（CA）的维度降维方法，用于单细胞RNA-seq数据的处理，以替代常用的主成分分析（PCA），并展示了其在批次整合和可视化方面的优势 | 引入对应分析（CA）作为基于计数的PCA替代方法，避免了对数变换的扭曲，并提出了五种适应scRNAseq数据高稀疏性和过离散性的CA变体，提高了聚类准确性 | 在9个数据集中，CA变体在8个中表现优于或可比，但未在所有数据集中完全超越现有方法，且可能对特定数据分布敏感 | 开发更有效的维度降维方法，以改善单细胞RNA-seq数据的分析和可视化 | 单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 对应分析（CA）及其变体 | 基因表达计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1096 | 2026-03-02 |
HIV-1 activates oxidative phosphorylation in infected CD4 T cells in a human tonsil explant model
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1172938
PMID:37325659
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研究论文 | 本研究利用人扁桃体离体模型，通过单细胞RNA测序分析了HIV-1感染对不同细胞类型转录组的影响，发现感染CD4+ T细胞中氧化磷酸化基因上调，而暴露于病毒的巨噬细胞中NLRP3炎症小体通路基因表达增加 | 首次在人类扁桃体离体模型中，利用单细胞RNA测序技术揭示了HIV-1感染诱导的CD4+ T细胞中氧化磷酸化基因上调及巨噬细胞中NLRP3炎症小体通路激活的转录组变化 | 研究基于离体模型，可能无法完全模拟体内复杂环境；样本来源有限，仅使用健康捐赠者的扁桃体组织 | 探究HIV-1感染在淋巴组织不同细胞类型中诱导的转录组变化及其在慢性炎症机制中的作用 | 人类扁桃体离体组织中的CD4+ T细胞和巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自健康捐赠者的人扁桃体离体组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1097 | 2026-03-02 |
Endocardium-to-coronary artery differentiation during heart development and regeneration involves sequential roles of Bmp2 and Cxcl12/Cxcr4
2022-11-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.10.007
PMID:36347256
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研究论文 | 本研究通过小鼠遗传学和单细胞RNA测序，揭示了心内膜细胞在心脏发育和再生中分化为冠状动脉的分子机制，特别是Bmp2和Cxcl12/Cxcr4信号通路的顺序作用 | 利用时间特异性谱系追踪和新的CXCR4活性报告小鼠系，精确评估了CXCL12/CXCR4信号在动脉形态发生而非血管生成中的特异性作用，并识别了Bmp2表达过渡群体在中期妊娠中的关键角色 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类心脏再生，且未详细探讨成年心脏中的再生潜力 | 探究心内膜细胞分化为冠状动脉的分子机制，以促进心脏损伤后的血管再生 | 小鼠心脏发育过程中的心内膜细胞和冠状动脉内皮细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1098 | 2026-03-02 |
Interactions in CSF1-Driven Tenosynovial Giant Cell Tumors
2022-11-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-1898
PMID:36007098
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探究了腱鞘巨细胞瘤中的细胞相互作用 | 首次在单细胞水平识别TGCT中的两种复发性肿瘤细胞群，并发现其与正常滑膜细胞高度相似，同时揭示了肿瘤细胞不表达CSF1R，为治疗靶点提供了新见解 | 样本量较小（仅3个TGCT和2个GCTB样本），可能限制结果的普适性 | 探究腱鞘巨细胞瘤中的细胞相互作用及潜在治疗靶点 | 腱鞘巨细胞瘤和骨巨细胞瘤样本中的细胞 | 单细胞组学 | 腱鞘巨细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 长读长RNA测序, 免疫荧光, 免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 18,788个单细胞，来自3个TGCT和2个GCTB样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1099 | 2026-03-02 |
Tempo: an unsupervised Bayesian algorithm for circadian phase inference in single-cell transcriptomics
2022-11-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34185-w
PMID:36323668
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Tempo的无监督贝叶斯算法，用于从单细胞转录组数据中推断昼夜节律相位 | Tempo结合了昼夜节钟的领域知识，并量化了相位估计的不确定性，相比现有方法提供了更准确的相位估计和校准良好的不确定性量化 | 未在摘要中明确提及具体限制 | 开发一种计算方法来准确推断单细胞转录组数据中的昼夜节律相位，并量化估计不确定性 | 单细胞转录组数据，特别是与昼夜节律相关的数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯变分推断 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1100 | 2026-03-02 |
SARS-CoV-2 infection of human pluripotent stem cell-derived liver organoids reveals potential mechanisms of liver pathology
2022-Oct-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105146
PMID:36128218
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研究论文 | 本研究利用人诱导多能干细胞衍生的肝脏类器官模拟SARS-CoV-2感染，揭示了病毒感染导致的肝脏病理机制 | 首次使用人诱导多能干细胞衍生的肝脏类器官模型研究SARS-CoV-2感染对肝脏的影响，并结合单细胞测序技术揭示了感染细胞与未感染旁观者细胞的转录组变化 | 研究基于体外类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂的肝脏微环境 | 探究SARS-CoV-2感染导致肝脏病理的潜在分子机制 | 人诱导多能干细胞衍生的肝脏类器官 | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞测序 | 类器官模型 | 转录组数据 | 未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |