单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 40374 篇文献，本页显示第 1081 - 1100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1081 | 2026-06-05 |
Multi-omics reveals that CTHRC1 secreted by cancer-associated fibroblasts promotes EMT by ITGA5/PI3K/AKT signaling pathway in HNSCC
2026-Jun, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112409
PMID:41651176
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示头颈鳞癌中癌相关成纤维细胞分泌的CTHRC1通过ITGA5/PI3K/AKT信号通路促进上皮间质转化 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了CTHRC1+ CAFs在HNSCC中的空间分布及其通过ITGA5/PI3K/AKT信号轴促进肿瘤进展的机制 | NA | 阐明头颈鳞癌中癌相关成纤维细胞的关键功能分子及其在肿瘤进展中的作用机制 | 头颈鳞癌细胞及癌相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 基于TCGA和多个GEO队列数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 1082 | 2026-06-05 |
MYB: A potential therapeutic target in triple-negative breast cancer based on the PI3K/AKT signaling pathway
2026-Jun, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 基于多组学分析，探讨MYB基因在三阴性乳腺癌中的潜在治疗靶点作用，重点关注PI3K/AKT信号通路 | 首次通过整合113种算法组合、多组学数据（转录组、单细胞RNA测序、空间转录组）和分子对接模拟，系统揭示MYB基因在TNBC与Non-TNBC预后差异中的关键角色，并发现桃红四物汤主要成分与MYB的强结合能力 | 研究主要基于公共数据库数据分析，缺乏独立临床队列验证；分子对接模拟结果需要后续实验验证；桃红四物汤成分与MYB结合的体内外功能验证尚未开展 | 探究PI3K/AKT信号通路中关键基因导致三阴性乳腺癌与非三阴性乳腺癌预后差异的分子机制，寻找潜在治疗靶点 | 三阴性乳腺癌和非三阴性乳腺癌的转录组数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习模型 | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 来自GEO数据库的多个转录组数据集，具体样本数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1083 | 2026-06-05 |
Fibroblasts as regulators of lung immunity, repair and fibrosis
2026-Jun, Nature reviews. Immunology
DOI:10.1038/s41577-026-01268-4
PMID:41680464
|
综述 | 探讨成纤维细胞在肺部免疫、修复和纤维化中的调节作用，重点关注单细胞测序技术揭示的成纤维细胞异质性和功能多样性 | 整合免疫学、力学和代谢调节因子对成纤维细胞功能的影响，揭示慢性炎症、免疫功能障碍、组织生物力学改变和代谢应激如何破坏基质调节平衡导致进行性纤维化 | 未提供 | 研究成纤维细胞在纤维化间质性肺病中的调节机制及其在健康与疾病状态下的核心调控程序 | 成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞测序 | 未提供 | 未提供 | 未提供 | 未提供 | 单细胞RNA测序 | 未提供 | 未提供 |
| 1084 | 2026-06-05 |
Vascular basement membrane laminins modulate functional zonation of cerebral microvessels
2026-Jun, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X251410040
PMID:41696806
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究血管基底膜层粘连蛋白对脑微血管功能区域化的调控作用 | 首次揭示层粘连蛋白α4和α5缺失对脑微血管内皮细胞动脉标记物表达及毛细血管后微静脉特性的调控效应，并发现层粘连蛋白α5的补偿性上调增强血管连接蛋白表达和收缩性 | NA | 探究基底膜层粘连蛋白是否影响脑血管的区域差异性，并揭示其分子机制 | 缺乏主要血管层粘连蛋白（层粘连蛋白α4和α5）的小鼠及其野生型同窝对照的脑血管 | 计算机视觉 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 缺乏层粘连蛋白α4和α5的小鼠及其野生型同窝对照组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1085 | 2026-04-12 |
Expanding plant single-cell transcriptomics toward the analysis of cell-type-specific isoforms
2026-Jun, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.03.008
PMID:41963136
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1086 | 2026-06-05 |
Ustekinumab resistance in individuals with ulcerative colitis is associated with an alteration of a subset of proinflammatory mucosal regulatory T cells
2026-Jun-01, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izag059
PMID:41984825
|
研究论文 | 探讨乌司奴单抗治疗溃疡性结肠炎患者耐药性与黏膜调节性T细胞亚群改变的关系 | 通过单细胞RNA测序、T细胞受体测序、多参数流式细胞术和空间转录组学等多模态方法，首次揭示了黏膜调节性T细胞表型和转录特征与乌司奴单抗治疗响应性的关联，并鉴定出OX40、GITR、GPR15和PIM2等关键分子作为潜在生物标志物 | 样本量较小，亚组分析中仅部分患者进行了多参数流式细胞术和空间转录组学检测，研究仅在单中心进行，需要更大规模多中心队列验证 | 阐明与乌司奴单抗治疗响应性相关的黏膜免疫变化，为治疗决策提供指导 | 接受乌司奴单抗治疗的溃疡性结肠炎患者 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序，多参数流式细胞术，空间转录组学，免疫组化 | NA | 基因表达数据，图像 | 接受乌司奴单抗治疗的患者队列，包括响应者和非响应者，具体数量未明确提及 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'文库制备和测序，10x Visium空间转录组学分析 |
| 1087 | 2026-06-05 |
Single-cell transcriptomics reveals a differential response of human bronchial epithelial cell-types to cadmium chloride
2026-Jun, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-026-04344-9
PMID:41807791
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示人支气管上皮细胞类型对氯化镉的差异化反应 | 首次利用单细胞RNA测序技术在高分辨率下解析人支气管上皮不同细胞类型对有毒化合物氯化镉的急性反应，发现了传统批量分析无法捕捉的细胞类型特异性转录特征 | 未提及具体局限性 | 评估单细胞转录组学在分析复杂组织对有毒化合物急性反应中的附加价值 | 人支气管上皮细胞（纤毛细胞、分泌细胞、基底细胞） | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自3名独立供体的完全分化黏膜纤毛上皮，共18,255个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1088 | 2026-06-05 |
Glutathione peroxidase 3 preserves hepatocyte mitochondrial quality control to enhance macrophage pro-regenerative phenotype during liver regeneration
2026-Jun, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70695
PMID:42216503
|
研究论文 | 该研究探讨了谷胱甘肽过氧化物酶3（GPX3）在肝脏再生中的作用机制 | 首次发现GPX3通过抑制VDAC1寡聚化维持线粒体质量控制，从而促进肝脏再生，并揭示了GPX3缺陷导致mtDNA释放激活cGAS-STING通路影响巨噬细胞功能的新机制 | NA | 研究肝细胞GPX3在肝脏再生中的作用及其分子机制 | 小鼠70%部分肝切除模型中的肝细胞和巨噬细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肝脏组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1089 | 2026-06-05 |
Epigenetically controlled endothelial promyelocytic leukemia drives liver inflammation and fibrosis
2026-Jun-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI196730
PMID:41842990
|
研究论文 | 发现表观遗传调控的LSEC中PML/BRD4通过相分离驱动促炎信号，促进肝脏炎症和纤维化 | 首次鉴定表观遗传异常的LSEC通过PML/BRD4相分离激活超级增强子，放大促炎血管分泌信号，启动肝脏炎症与纤维化级联反应 | 未提及具体限制 | 阐明肝脏损伤初期触发免疫细胞募集的特定分子事件 | 肝脏窦内皮细胞及单核细胞来源的巨噬细胞 | NA | 肝脏纤维化 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠纤维化肝脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1090 | 2026-06-05 |
Identification of Polyamine Metabolism-Related Biomarkers in Psoriasis: A Study Based on Transcriptomics and Single-Cell Sequencing
2026-Jun, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70289
PMID:42223029
|
研究论文 | 本研究整合转录组学与单细胞RNA测序技术，鉴定与多胺代谢相关的银屑病生物标志物，并阐明其作用机制 | 首次通过整合转录组学和单细胞测序数据，系统性鉴定出5个与多胺代谢相关的银屑病生物标志物（PSME2、PSMB5、PSMC4、PSMB10和SMOX），并揭示成熟树突细胞（mDC）在银屑病进展中的动态分化轨迹 | 样本来源有限，主要依赖公共数据库（GSE13355），且未进行临床队列验证；单细胞测序分析未涵盖所有可能相关的细胞亚群 | 鉴定银屑病中与多胺代谢相关的生物标志物，探索其在炎症和角质形成细胞异常增殖中的作用机制 | 银屑病患者的皮肤组织样本及正常对照样本 | 生物信息学， 转录组学， 单细胞测序， 机器学习 | 银屑病 | RNA测序， 单细胞RNA测序， 差异表达分析， 机器学习算法， 受试者工作特征曲线分析， 蛋白质印迹 | 机器学习模型（三种算法） | 基因表达数据， 单细胞测序数据 | 公开数据集（GSE13355）中的银屑病及对照样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1091 | 2026-06-05 |
Transcription factor 21 deletion from podocyte precursors as a model for congenital nephrotic syndrome
2026-Jun-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00490.2025
PMID:42090190
|
研究论文 | 通过从足细胞前体删除转录因子21建立先天性肾病综合征小鼠模型，并利用单细胞RNA测序分析肾脏损伤机制 | 首次通过从早期足细胞前体删除转录因子21建立先天性肾病综合征小鼠模型，并生成了全面的肾脏单细胞转录组数据集 | 未明确说明限制 | 研究先天性肾病综合征中肾小球和肾小管间质变化机制 | 转录因子21基因敲除小鼠 | 机器学习 | 儿童肾病综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 转录因子21基因敲除小鼠及其对照 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1092 | 2026-06-05 |
Engineered Pericyte-Targeted Extracellular Vesicles Protect Against Hypoperfusion-Induced Cognitive Impairment and Vascular Demyelination
2026-Jun, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70319
PMID:42226579
|
研究论文 | 开发了一种生物正交方法，工程化改造携带环状NGR肽的细胞外囊泡，实现选择性靶向周细胞，并在慢性脑低灌注小鼠模型中验证了其保护作用 | 首次利用生物正交方法将环状NGR肽功能化修饰到细胞外囊泡上，实现选择性靶向CD13表达的脑周细胞，为血管性认知障碍提供新的周细胞靶向治疗策略 | 未提及 | 开发靶向周细胞的细胞外囊泡治疗策略，用于保护低灌注诱导的认知障碍和血管脱髓鞘 | 周细胞靶向的工程化细胞外囊泡（cNGR-EVs） | 数字病理学 | 血管性认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型，具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 1093 | 2026-06-05 |
Endothelial origin of hematopoietic stem cells: Insights from new technologies and unresolved questions
2026-06, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2026.103676
PMID:42102418
|
综述 | 利用新技术综述造血干细胞源自血源性内皮细胞的证据及未解决问题 | 通过整合单细胞转录组学、低输入表观基因组学和单细胞功能分析等高精度技术的最新研究，系统总结了HSC生成性HEC的富集标记、功能特性和发育轨迹，并阐述了从主动脉动脉内皮细胞到前造血干细胞的多个精细细胞阶段的连续特性 | 未提及具体局限性 | 总结和解决关于造血干细胞起源中血源性内皮细胞的性质、起源和命运的争议 | 造血干细胞生成性血源性内皮细胞及其前体细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、低输入表观基因组学、单细胞功能分析 | NA | 基因表达数据、表观基因组数据、单细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 1094 | 2026-06-05 |
Establishment of a dendritic cell differentiation system faithfully recapitulating multiple DC subsets in autoimmune disease
2026-Jun-01, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2026.103658
PMID:42235377
|
研究论文 | 建立一种在自身免疫性疾病中忠实再现多种树突状细胞亚群的分化系统 | 首次构建了在富含干扰素的自身免疫样微环境中重建所有主要人类树突状细胞亚群的体外平台，并揭示了干扰素信号如何塑造树突状细胞谱系特化与功能极化 | 未在论文标题和摘要中明确提及局限性 | 建立生理相关的体外平台以重现自身免疫性疾病中多种树突状细胞亚群，并定义干扰素信号如何影响树突状细胞谱系特化和功能分化 | 人类树突状细胞及其亚群 | NA | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序、多色流式细胞术 | NA | 转录组数据、流式细胞术数据 | 脐带血来源的CD34⁺造血祖细胞（时间点包括分化过程中的3个时点） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1095 | 2026-06-05 |
Oral epithelial barrier: Gatekeeper of mucosal immunity and driver of disease
2026-May-30, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2026.128568
PMID:42235250
|
综述 | 探讨口腔上皮屏障作为黏膜免疫守门人和疾病驱动因子的角色，综述其在健康和疾病中的免疫调控机制 | 提出了上皮炎性记忆的新概念，即上皮干细胞和前体细胞保留过去炎症刺激的持久印记，为理解牙周炎等慢性疾病提供了新视角 | NA | 综述口腔上皮屏障在黏膜免疫和口腔炎症疾病中的核心作用及靶向治疗潜力 | 口腔黏膜上皮及其免疫调控机制 | NA | 口腔炎症性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1096 | 2026-06-05 |
Ndufa4l2 drives the pathological activation of Müller cells in ischemic retinopathy via the PI3K/AKT signaling pathway
2026-May-30, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2026.156567
PMID:42235340
|
research paper | 该研究揭示了Ndufa4l2通过PI3K/AKT信号通路驱动缺血性视网膜病变中Müller细胞病理活化的机制 | 首次鉴定Ndufa4l2为缺血性视网膜病变中Müller细胞病理活化的关键内在驱动因子，并阐明其通过PI3K/AKT信号通路发挥作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人体组织或临床样本中进一步验证 | 探究Ndufa4l2在Müller细胞病理活化中的作用及分子机制 | 缺血性视网膜病变中的Müller细胞 | machine learning | 缺血性视网膜病变 | scRNA-seq, CRISPR/Cas9 | NA | 单细胞转录组数据 | 氧诱导视网膜病变小鼠模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1097 | 2026-06-05 |
Empowering fungal infection research with single-cell RNA sequencing
2026-May-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10304-x
PMID:42215623
|
review | 综述单细胞RNA测序在真菌感染研究中的应用，总结宿主-真菌病原体相互作用的关键发现和动态 | 系统梳理scRNA-seq在真菌感染领域的最新进展，强调其在解析宿主-真菌互作细胞异质性方面的独特优势 | 当前scRNA-seq在真菌感染研究中应用有限，存在技术挑战和研究空白 | 推动单细胞技术在真菌感染研究中的更广泛应用，促进诊断和治疗发展 | 宿主细胞与真菌病原体 | 机器学习 | 真菌感染疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1098 | 2026-06-05 |
THE molecular mechanisms underlying synovial fibroblast differentiation in knee osteoarthritis revealed by single-cell transcriptome sequencing
2026-May-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000047870
PMID:42216392
|
研究论文 | 利用单细胞转录组测序揭示膝骨关节炎中滑膜成纤维细胞分化的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序识别了膝骨关节炎滑膜成纤维细胞的7条分化轨迹和关键标志基因，提供了滑膜成纤维细胞分化的精细分子框架 | 样本量较小，仅包含3例膝骨关节炎样本，且未纳入正常对照或治疗验证 | 深入分析膝骨关节炎滑膜成纤维细胞分化的单细胞转录组数据，识别关键靶基因和分子机制，为临床靶向治疗提供分子水平理论支持 | 膝骨关节炎患者滑膜组织中的滑膜成纤维细胞 | 机器学习 | 膝骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3个膝骨关节炎样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集GSE176308来自基因表达综合数据库 |
| 1099 | 2026-06-05 |
Association of DNA damage repair related genes with prostate cancer: A multi-omics Mendelian Randomization analysis
2026-May-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000049185
PMID:42216412
|
research paper | 采用多组学孟德尔随机化方法探究DNA损伤修复相关基因与前列腺癌的因果关系 | 首次通过多组学孟德尔随机化分析整合DNA损伤修复相关基因的甲基化、表达和蛋白质丰度与前列腺癌风险的遗传因果关联 | 研究基于欧洲人群队列，结论推广至其他种族人群可能存在局限性 | 阐明DNA损伤修复相关基因与前列腺癌风险之间的因果关系 | DNA损伤修复相关基因RPA2和POLI | machine learning | prostate cancer | NGS, single-cell sequencing | NA | multi-omics data | 多个欧洲队列的定量性状位点数据及全基因组关联研究数据 | Illumina | single-cell RNA-seq | Illumina NovaSeq | single-cell sequencing analysis |
| 1100 | 2026-06-05 |
Pan-cancer spatial atlas of tertiary lymphoid structures
2026-05-28, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adz2742
PMID:42207882
|
研究论文 | 通过分析12种癌症类型的空间转录组数据，构建泛癌三级淋巴结构图谱，并表征其空间结构和成熟状态 | 首次构建泛癌三级淋巴结构空间图谱，结合超高通量单细胞空间分析揭示成熟过程中的细胞生态位重塑，并开发AI框架从H&E染色图像预测TLS成熟状态 | 未明确提及具体局限性，但可能依赖于公共数据集的可推广性及AI模型的泛化能力 | 系统解析三级淋巴结构的空间组织、成熟状态及其在不同癌症类型中的临床相关性 | 12种癌症类型的空间转录组样本及独立治疗队列的病理图像 | 数字病理学, 计算机视觉 | 癌症（泛癌），肺癌，前列腺癌等 | 空间转录组学, 单细胞空间分析, 组织病理图像AI分析 | 人工智能框架（具体类型未明确，可能为深度学习模型） | 图像，空间转录组数据 | 12种癌症类型的空间转录组样本，TCGA及多个独立治疗队列 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞多组学 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium用于空间转录组分析，10x Chromium用于超高通量单细胞空间分析 |