单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27924 篇文献，本页显示第 10961 - 10980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10961 | 2024-08-05 |
Decoding ecosystem heterogeneity and transcriptional regulation characteristics of multi-subtype renal cell carcinoma
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33196
PMID:39044973
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研究论文 | 本研究全面分析了肾细胞癌的细胞多样性和细胞间通信网络。 | 通过使用单细胞RNA测序技术，首次揭示了肾细胞癌亚型中特定的巨噬细胞和CAF细胞亚群及其作用状态。 | 研究未涉及所有可能的细胞类型和细胞间交互的全面性。 | 本研究旨在深入理解肾细胞癌的细胞异质性及其调控特征。 | 研究对象为不同亚型的肾细胞癌，重点分析巨噬细胞和癌症相关成纤维细胞的功能状态。 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了多种肾癌亚型的单细胞RNA测序数据 |
| 10962 | 2024-08-04 |
MetalinksDB: a flexible and contextualizable resource of metabolite-protein interactions
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae347
PMID:39038934
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研究论文 | 本文介绍了一个名为MetalinksDB的资源，用于代谢物与蛋白质之间的相互作用 | MetalinksDB比现有的代谢物-受体资源大一个数量级，并能够根据具体的生物学背景进行定制 | 目前的细胞间知识资源对于代谢物关注的范围有限，但MetalinksDB致力于对此进行扩展 | 研究代谢物与蛋白质之间的相互作用，以理解其在细胞功能中的重要性 | 代谢物和蛋白质的相互作用，特别是在肾癌和急性肾损伤中的作用 | 数字病理学 | 肾癌 | 空间转录组学 | 知识图谱 | 多组学数据 | NA |
| 10963 | 2024-08-04 |
Single-Cell multiomics reveals ENL mutation perturbs kidney developmental trajectory by rewiring gene regulatory landscape
2024-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.09.591709
PMID:38766219
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研究论文 | 研究单细胞多组学揭示ENL突变通过重塑基因调控景观来扰乱肾脏发育轨迹 | 该研究首次揭示了与Wilms肿瘤相关的ENL突变如何在单细胞水平上重塑基因调控网络并影响肾脏发育 | 该研究主要集中于小鼠模型，可能不完全适用于人类肾脏发育的研究 | 探讨表观遗传调控因子突变在肾脏发育和病理生理中的作用 | Wilms肿瘤相关的ENL突变及其对肾脏发育的影响 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组学，组蛋白乙酰化结合活性抑制 | 小鼠模型 | 基因组数据 | NA |
| 10964 | 2024-08-05 |
Astrocyte-like subpopulation of NG2 glia in the adult mouse cortex exhibits characteristics of neural progenitor cells
2024-02, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24471
PMID:37772368
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研究论文 | 本研究探讨了成年小鼠皮层中NG2胶质细胞的特性及其在缺血后的功能 | 首次发现NG2胶质细胞具有神经祖细胞的表型，并显示其在缺血后可能发展为神经元样细胞 | 研究主要集中在小鼠模型中，结果是否适用于人类尚需进一步验证 | 调查缺血脑中NG2胶质细胞的特性及功能 | 使用转基因小鼠标记NG2表达细胞及其后代 | 数字病理学 | 脑缺血 | 单细胞RNA测序、膜片钳技术 | NA | 基因表达数据、免疫组化分析 | 转基因小鼠的不同亚群体，具体样本数量未说明 |
| 10965 | 2024-08-05 |
A disulfidptosis-related lncRNAs cluster to forecast the prognosis and immune landscapes of ovarian cancer
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1397011
PMID:39045330
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研究论文 | 本文探讨了与二硫化物死亡相关的长链非编码RNA（DRLs）在卵巢癌预后和免疫特征中的作用 | 首次构建了一个基于DRLs的卵巢癌预后模型，并揭示了其与RNA甲基化和免疫细胞浸润的相关性 | 未深入探讨DRLs在卵巢癌治疗中的具体机制 | 研究与二硫化物死亡相关的lncRNAs在卵巢癌中的预后和免疫特征 | 卵巢癌患者的lncRNA数据和临床信息 | 数字病理学 | 卵巢癌 | qRT-PCR, 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 随机生存森林 | 临床数据，RNA表达数据 | 卵巢癌和正常样本的lncRNA数据，具体样本数量未说明 |
| 10966 | 2024-08-05 |
Single cell RNA sequencing of human FAPs reveals different functional stages in Duchenne muscular dystrophy
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1399319
PMID:39045456
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研究论文 | 这篇文章探讨了单细胞RNA测序在人类FAPs中的应用，以了解杜兴肌肉萎缩症中的不同功能阶段 | 首次使用单细胞RNA测序揭示了DMD患者与健康对照组FAPs在转录谱上的显著差异 | 样本量有限，只有9个额外样本进行了qPCR验证，可能影响结果的普遍性 | 揭示FAPs在杜兴肌肉萎缩症中的功能多样性及其分子机制 | 健康个体和杜兴肌肉萎缩症患者的FAPs | 数字病理学 | 杜兴肌肉萎缩症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12个样本（健康和DMD患者的FAPs） |
| 10967 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing uncovers cellular heterogeneity and the progression of heterotopic ossification of the elbow
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1434146
PMID:39045052
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了肘部异位骨化的细胞异质性和进展 | 识别了13个HOE细胞簇并进一步分析了4种主要细胞类型的亚簇，提供了更高分辨率的细胞图谱 | 该研究尚未深入探讨HOE细胞的交互作用在不同阶段的具体作用机制 | 探索肘部异位骨化的细胞起源和进展 | 主要研究对象为肘部异位骨化患者中的不同细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 10968 | 2024-08-05 |
Integrative transcriptome-proteome approach reveals key hypoxia-related features involved in the neuroprotective effects of Yang Xue oral liquid on Alzheimer's and Parkinson's disease
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1411273
PMID:39045051
|
研究论文 | 本研究探讨了缺氧相关基因在杨血口服液对阿尔茨海默病和帕金森病神经保护效应中的作用 | 首次整合转录组和蛋白质组分析，确定了与缺氧相关的关键基因，开发了人工智能驱动的缺氧标志 | 未提及具体实验的局限性 | 研究杨血口服液对阿尔茨海默病和帕金森病的神经保护作用及其机制 | 阿尔茨海默病和帕金森病患者的缺氧相关基因 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病, 帕金森病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 1713，来自九个独立队列 |
| 10969 | 2024-08-05 |
Mincle receptor in macrophage and neutrophil contributes to the unresolved inflammation during the transition from acute kidney injury to chronic kidney disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1385696
PMID:38770013
|
研究论文 | 本文揭示了Mincle受体在急性肾损伤向慢性肾病过渡期间在巨噬细胞和中性粒细胞中的作用 | 研究首次探讨了Mincle在急性肾损伤向慢性肾病转变过程中的角色及其机制 | 尚未明确Mincle在慢性转变过程中的所有影响 | 研究急性肾损伤向慢性肾病转变过程中的炎症机制 | 以小鼠为模型研究Mincle在急性肾损伤后炎症和纤维化中的作用 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 在急性肾损伤后，对多时间点的小鼠样本进行分析 |
| 10970 | 2024-08-04 |
PPARγ agonist treatment reduces fibroadipose tissue in secondary lymphedema by exhausting fibroadipogenic PDGFRα+ mesenchymal cells
2023-Dec-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.165324
PMID:38131378
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研究论文 | 本研究探讨了PPARγ激动剂rosiglitazone如何通过耗尽PDGFRα+间充质细胞来减少继发性淋巴水肿中的纤维脂肪组织 | 首次提出PPARγ激动剂可以通过减少PDGFRα+细胞的数量来治疗继发性淋巴水肿导致的纤维化和脂肪组织沉积 | 本研究主要在小鼠模型中进行，缺乏长期的人体临床研究数据 | 研究rosiglitazone治疗继发性淋巴水肿的潜力，特别是其对纤维化和脂肪沉积的影响 | 小鼠模型和人类组织样本中的PDGFRα+间充质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术、组织学评估 | NA | 组织样本 | 人类和小鼠组织样本 |
| 10971 | 2024-08-05 |
Global and cell type-specific immunological hallmarks of severe dengue progression identified via a systems immunology approach
2023-Dec, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01654-3
PMID:37872316
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研究论文 | 本研究通过系统免疫学方法识别出重症登革热进展的全球和细胞类型特异性免疫特征 | 首次揭示了重症登革热在儿童血液中的DENV靶细胞及其免疫学特征 | 该研究主要集中在儿童群体，未考虑成年人病例的免疫变化 | 定义重症登革热进展中的DENV靶细胞和免疫学特征 | 研究对象为儿童的血液样本及其中的免疫细胞 | 数字病理学 | 登革热 | 病毒包涵单细胞RNA测序（viscRNA-Seq 2）和靶向蛋白组学 | NA | 血液样本 | NA |
| 10972 | 2024-08-05 |
Genome-wide identification and functional prediction of BYPASS1-related (BPS1) homologs in soybean
2023-Aug, Molecular breeding : new strategies in plant improvement
IF:2.6Q2
DOI:10.1007/s11032-023-01403-2
PMID:37496826
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研究论文 | 本文系统研究了大豆中的BYPASS1相关基因家族及其功能预测 | 首次全面识别并分类了大豆中的BYPASS1相关基因，并探讨了其与根结表型的潜在关联 | 未能详细阐明BYPASS1相关基因的具体功能和机制 | 研究大豆中BYPASS1相关基因家族及其在植物生长发育中的作用 | 大豆及其野生种中的BYPASS1相关基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 遗传变异数据、表型变异数据、转录组数据 | 涉及23个大豆基因和20个野生大豆基因 |
| 10973 | 2024-08-04 |
COVID-19 of differing severity: from bulk to single-cell expression data analysis
2023 Jul-Aug, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2023.2239620
PMID:37486005
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研究论文 | 本研究分析了COVID-19不同严重程度的关键模块和基因。 | 确定了轻型和重型COVID-19的关键基因和免疫细胞浸润的差异。 | 研究样本数量相对较小，可能限制了对结果的推广性。 | 研究COVID-19不同严重程度的生物标志物和潜在靶向药物。 | 轻型COVID-19（mCOVID-19）与重型COVID-19（sCOVID-19）患者的基因表达。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | WGCNA | 基因表达数据 | 16个关键基因来自轻型COVID-19，10个关键基因来自重型COVID-19，另外分析了8个健康对照和8个轻型COVID-19患者的外周血单核细胞 |
| 10974 | 2024-08-05 |
A neural network-based method for exhaustive cell label assignment using single cell RNA-seq data
2022-Jan-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-04473-4
PMID:35042860
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研究论文 | 本文开发了一种基于神经网络的方法NeuCA，用于使用单细胞RNA-seq数据进行细胞注释。 | 该方法利用细胞类型的层次结构信息来提高注释准确性，特别是对于相似细胞类型的数据。 | 该方法可能对未知细胞类型仍然标记为未分配，特别是在无法预期未知细胞类型的情况下。 | 本文旨在提高单细胞RNA测序数据的细胞注释准确性。 | 研究对象为单细胞RNA测序数据，特别是来自已研究组织的数据。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | RNA-seq数据 | 应用于八个真实数据集 |
| 10975 | 2024-08-05 |
InterCellar enables interactive analysis and exploration of cell-cell communication in single-cell transcriptomic data
2022-Jan-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02986-2
PMID:35017628
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研究论文 | InterCellar是一个互动平台，支持科学家分析和探索单细胞转录组数据中的细胞-细胞通信 | Strikingly, InterCellar使实验室科学家能够在无需编程技能的情况下分析和探索细胞-细胞通信 | 尽管InterCellar提供了便捷的分析功能，但其效果仍然依赖用户对生物学信号的理解 | 本研究旨在提供一个无编程需求的工具，帮助分析单细胞转录组数据中的细胞-细胞通信 | 主要研究COVID-19和黑色素瘤中的细胞-细胞交互 | 数字病理学 | COVID-19, 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 数据驱动分析 | 分析了来自COVID-19和黑色素瘤的细胞-细胞交互数据 |
| 10976 | 2024-08-05 |
Morphological characteristics and a single-cell analysis provide insights into function of immune and fat storage in the lamprey supraneural body
2022-Jan, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2021.106131
PMID:34838690
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研究论文 | 本文探讨了灯盏细鱼上神经体的形态特征和单细胞分析，揭示了其在免疫和脂肪储存中的功能 | 首次利用单细胞转录组测序揭示上神经体中至少四种细胞类型及其独特的分子组成 | 对上神经体细胞的生理功能知之甚少，仍需深入研究 | 探究上神经体在免疫和脂肪储存中的生理功能 | 研究了上神经体中的白色脂肪细胞、粒细胞、淋巴细胞和红细胞等多种细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 10977 | 2024-08-05 |
Novel method to repair articular cartilage by direct reprograming of prechondrogenic mesenchymal stem cells
2021-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2021.174416
PMID:34606836
|
研究论文 | 本研究提出了一种通过直接重编程前软骨源间充质干细胞来修复关节软骨的新方法 | 本研究创新性地利用外部电场促进前软骨形成，而无需基因修饰或外源性因子 | 本研究未提到对动物模型的长期应用效果 | 旨在提高用于修复软骨缺损的软骨细胞的生成效率 | 使用犬的脂肪来源间充质干细胞（ADSCs）作为研究对象 | 数字病理学 | NA | 电刺激（ES） | NA | 单细胞RNA测序分析 | 犬的ADSC微团 |
| 10978 | 2024-08-05 |
Significance and limitations of the use of next-generation sequencing technologies for detecting mutational signatures
2021-Nov, DNA repair
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.dnarep.2021.103200
PMID:34411908
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综述 | 本文探讨了不同的下一代测序技术在检测突变特征中的重要性和限制 | 文章总结了多种下一代测序技术的应用及其固有的测序偏见与技术伪影 | 每种测序技术都有其固有的偏见和可能产生的技术伪影，这可能影响突变特征的可靠提取 | 研究不同下一代测序技术检测突变模式及解读突变特征的相关性和前景 | 聚焦于人类癌症的突变特征及其与环境因素和DNA修复通路的关系 | 数字病理学 | 肿瘤 | 下一代测序技术（NGS） | NA | 基因组数据 | NA |
| 10979 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome atlas of the leaf and root of rice seedlings
2021-Oct-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2021.06.001
PMID:34340913
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了水稻幼苗的叶子和根部的转录组特征 | 首次构建了水稻幼苗的单细胞转录组图谱，并揭示了细胞类型特异的转录响应与环境刺激之间的关系 | 目前的研究仅关注于特定的环境胁迫下的转录组特征，可能未涵盖所有可能的应激条件 | 研究水稻幼苗在不同环境刺激下的单细胞转录组特征及其细胞特异性响应 | 水稻幼苗的237,431个个体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 237,431个个体细胞 |
| 10980 | 2024-08-05 |
Tissue-specific smooth muscle cell subtypes identified by transcriptional profiling
2021-Oct, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2021.106055
PMID:34411694
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研究论文 | 本文研究了不同组织中特定平滑肌细胞(SMCs)的转录组特征 | 识别了平滑肌细胞的新亚型并揭示其在不同组织内的功能多样性 | 研究基于小鼠数据，可能不完全适用于人类 | 探讨特定平滑肌细胞的转录组特征及其适应性 | 提取了来源于八种小鼠组织的平滑肌细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八种小鼠组织的平滑肌细胞样本 |