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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 10961 - 10980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10961 | 2025-10-07 |
Transcriptomic analysis of EGFR co-expression and activation in glioblastoma reveals associations with its ligands
2025 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdae229
PMID:39959305
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了胶质母细胞瘤中EGFR共表达和激活机制，及其与配体的关联 | 首次系统比较GBM和LUAD中EGFR信号传导模式的差异，并发现BTC和EREG配体与EGFR表达的负相关关系 | 样本量相对有限（TCGA-GBM: 169例，Intellance-2: 166例），且为回顾性分析 | 阐明GBM和LUAD之间EGFR激活和调控分子机制的差异 | 胶质母细胞瘤和肺腺癌患者 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | TCGA-GBM队列169例，Intellance-2队列166例 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10962 | 2025-10-07 |
Dual Role of α-MSH in Colitis Progression: Mediating Neutrophil Differentiation via Bone Marrow
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S503621
PMID:39959638
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研究论文 | 本研究揭示了结肠炎通过激活下丘脑-垂体轴促进α-MSH分泌，进而调控骨髓造血干细胞分化为中性粒细胞的分子机制 | 首次发现α-MSH在结肠炎进展中的双重作用机制，既能增强急性期病原体清除，又能在缓解期诱导持续炎症反应 | 研究主要基于小鼠DSS诱导的结肠炎模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究下丘脑-垂体轴在炎症性肠病发病过程中的作用机制 | DSS诱导的结肠炎小鼠模型 | 免疫学 | 炎症性肠病 | 免疫荧光，RT-qPCR，ELISA，流式细胞术，腺相关病毒介导的基因沉默，联体共生，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，蛋白质数据，细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10963 | 2025-10-07 |
Recruitment of homodimeric proneural factors by conserved CAT-CAT E-boxes drives major epigenetic reconfiguration in cortical neurogenesis
2024-Nov-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae950
PMID:39494521
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研究论文 | 通过整合分析揭示神经发生过程中同源二聚体前神经因子通过CAT-CAT E-boxes驱动表观遗传重编程的机制 | 发现NEUROG2和NEUROD2作为同源二聚体优先结合CAT-CAT E-boxes，并在神经元分化中期阶段发挥最大染色质重塑作用 | 研究主要基于小鼠皮层发育数据，人类中的保守性需要进一步验证 | 探究前神经因子在不同E-box类型上的协作机制及其染色质重塑功能 | 小鼠发育中的皮层神经细胞 | 表观遗传学 | 神经精神疾病 | ChIP-seq, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, DNA甲基化测序, HT-SELEX, DNA足迹分析 | 结构建模 | 基因组学数据，表观基因组数据 | NA | NA | 染色质免疫沉淀测序, 单细胞RNA测序, ATAC测序, DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 10964 | 2025-10-07 |
Uncovering underlying physical principles and driving forces of cell differentiation and reprogramming from single-cell transcriptomics
2024-Aug-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2401540121
PMID:39150785
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研究论文 | 通过从单细胞RNA速度数据学习细胞状态矢量场，量化细胞分化和重编程的非平衡驱动力 | 提出通过景观和通量量化单细胞全局非平衡驱动力的方法，挑战了传统的过渡态估计 | NA | 探索细胞分化和重编程的物理原理和驱动力 | 单细胞转录组数据 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 景观和通量理论模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10965 | 2025-10-07 |
Accurate and efficient integrative reference-informed spatial domain detection for spatial transcriptomics
2024-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02284-9
PMID:38844627
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研究论文 | 开发了一种名为IRIS的计算方法，用于在空间转录组学研究中准确高效地检测空间域 | 独特利用单细胞RNA测序数据进行参考信息化的空间域检测，整合多个SRT切片并同时考虑切片内和切片间的相关性 | NA | 表征空间转录组学研究中的组织空间组织结构 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | 脑部疾病,肿瘤,糖尿病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 计算方法 | 空间转录组数据 | 六个SRT数据集，涵盖不同技术、组织、物种和分辨率 | 10x Genomics | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | 10x Xenium,Stereo-seq | NA |
| 10966 | 2025-10-07 |
Serum and tear autoantibodies from NOD and NOR mice as potential diagnostic indicators of local and systemic inflammation in Sjögren's disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1516330
PMID:39936155
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研究论文 | 本研究通过分析NOD和NOR小鼠模型，探索了干燥综合征相关自身免疫性泪腺炎中血清和泪液自身抗体作为局部和全身炎症诊断指标的潜力 | 首次系统比较了干燥综合征小鼠模型中血清和泪液自身抗体谱的差异，发现泪液IgA同种型自身抗体比IgG具有更高的多样性 | 研究仅限于雄性小鼠模型，未涉及雌性动物或人类样本 | 探索干燥综合征相关自身免疫性泪腺炎的诊断生物标志物 | NOD和NOR雄性小鼠的泪腺、血清和泪液样本 | 免疫学 | 干燥综合征 | 免疫荧光，自身抗体微阵列，单细胞RNA测序 | NA | 图像数据，基因表达数据，蛋白质组数据 | 两种小鼠模型（NOD和NOR）与健康BALB/c小鼠对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10967 | 2025-10-07 |
Mechanism of mTOR/RILP-regulated autophagic flux in increased susceptibility to myocardial ischemia-reperfusion in diabetic mice
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1506401
PMID:39958873
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研究论文 | 本研究探讨了糖尿病小鼠心肌缺血再灌注损伤易感性增加的机制，重点关注mTOR/RILP通路调控的自噬流 | 首次通过单细胞测序分析糖尿病心肌缺血再灌注后自噬相关基因的转录组变化，并揭示mTOR/RILP通路在调节自噬流中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究糖尿病心肌缺血再灌注损伤易感性增加的内在机制 | 糖尿病小鼠模型和高糖培养的心肌细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞测序, qRT-PCR, 蛋白质印迹, 透射电镜, HE染色 | 动物模型和细胞模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 形态学图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10968 | 2025-10-07 |
Gut Isolation from Zebrafish Larvae for Single-cell RNA Sequencing
2023-11-10, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65876
PMID:38009742
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研究论文 | 开发了一种从斑马鱼幼体中分离肠道细胞用于单细胞RNA测序的方法 | 建立了斑马鱼幼体肠道活细胞分离和单细胞RNA测序的完整实验方案 | 方法依赖于手动解剖，可能受操作者技术水平影响 | 研究胃肠道发育和功能障碍的分子机制 | 斑马鱼幼体（受精后5天）的肠道细胞 | 单细胞组学 | 肠道神经肌肉疾病 | 单细胞RNA测序，荧光激活细胞分选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 斑马鱼幼体肠道细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10969 | 2025-10-07 |
Peripheral Blood Single-Cell Sequencing Uncovers Common and Specific Immune Aberrations in Fibrotic Lung Diseases
2023-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.20.558301
PMID:37786685
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示纤维化肺病患者外周血中共同和特异性的免疫异常 | 首次系统性比较IPF和FHP两种纤维化肺病的外周血免疫细胞异常，发现单核细胞变化为共同特征而淋巴细胞异常具有疾病特异性 | 样本量相对有限（83个样本），需要更大规模研究验证发现 | 鉴定特发性肺纤维化和纤维化过敏性肺炎患者的共同和特异性免疫异常 | IPF和FHP患者及健康对照的外周血和支气管肺泡灌洗样本 | 单细胞组学 | 肺纤维化疾病 | 单细胞RNA测序，V(D)J谱分析，RNA速度分析，伪时间分析 | Seurat, Monocle3, Velocyto, scVelo, CellRank, Connectome, CellRanger, Immcantation | 单细胞转录组数据，免疫受体序列数据 | 83个样本中的327,990个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，单细胞V(D)J测序 | 10x Chromium | 10x Genomics 5'基因表达和V(D)J谱分析 |
| 10970 | 2025-10-07 |
Integrative analysis of bulk and single-cell RNA sequencing data reveals distinct subtypes of MAFLD based on N1-methyladenosine regulator expression
2023-Jun, Liver research
IF:2.0Q3
DOI:10.1016/j.livres.2023.06.001
PMID:39958950
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研究论文 | 通过整合分析bulk和单细胞RNA测序数据，基于m1A调控因子表达将MAFLD分为不同分子亚型 | 首次揭示m1A甲基化修饰在MAFLD异质性中的作用，并识别出关键的m1A调控基因 | 样本量相对有限，需要进一步实验验证 | 探究m1A甲基化修饰在MAFLD发病机制和异质性中的作用 | MAFLD患者肝脏组织 | 生物信息学 | 代谢相关脂肪性肝病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | WGCNA, 细胞通讯网络分析 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 6个肝脏样本的33,168个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10971 | 2025-10-07 |
Nanoparticle stereochemistry-dependent endocytic processing improves in vivo mRNA delivery
2023-04, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-023-01138-9
PMID:36864143
|
研究论文 | 本研究探讨了脂质纳米颗粒中立体化学对mRNA体内递送效率的影响 | 首次证明多组分胶体系统中单一化合物的立体化学能够显著影响纳米颗粒在体内的mRNA递送效率 | 研究主要聚焦于肝脏细胞，对其他组织器官的适用性尚需验证 | 探究立体化学对脂质纳米颗粒mRNA递送效率的影响机制 | 含有不同立体化学构型羟基胆固醇的脂质纳米颗粒 | 纳米医学 | NA | 单细胞RNA测序，成像技术 | NA | 基因表达数据，成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10972 | 2025-10-07 |
A novel Bayesian framework for harmonizing information across tissues and studies to increase cell type deconvolution accuracy
2023-01-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac616
PMID:36631398
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研究论文 | 提出一种新颖的贝叶斯框架tranSig，通过整合跨组织和研究的信息来提高细胞类型反卷积的准确性 | 开发了首个利用跨组织和研究的共享细胞类型特异性表达模式的贝叶斯框架来改进scRNA-seq签名矩阵推断 | NA | 提高从单细胞RNA测序数据推断细胞类型签名矩阵的准确性，以改进细胞类型反卷积分析 | 外周血、支气管肺泡灌洗液和主动脉的批量RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 贝叶斯模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 10973 | 2025-10-07 |
The regenerating skeletal muscle niche drives satellite cell return to quiescence
2022-Jun-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104444
PMID:35733848
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研究论文 | 本研究揭示了骨骼肌再生过程中卫星细胞重返静止状态的机制及时间窗口 | 首次确定了卫星细胞在肌肉损伤后5-10天重返静止状态的时间窗口，并发现非细胞自主信号网络调控卫星细胞命运决定 | 未详细阐明具体的信号分子机制 | 探究骨骼肌再生过程中卫星细胞重返静止状态的时机和调控机制 | 骨骼肌卫星细胞 | 单细胞生物学 | 肌肉再生障碍 | 单细胞测序，细胞移植实验 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10974 | 2025-10-07 |
Distinct Injury Responsive Regulatory T Cells Identified by Multi-Dimensional Phenotyping
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.833100
PMID:35634302
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研究论文 | 通过多维表型分析技术鉴定损伤响应性调节性T细胞的独特特征 | 首次通过多组学技术全面表征损伤响应性CD44+ Treg细胞，揭示其克隆扩增和功能特异性 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证 | 解析损伤响应性调节性T细胞的分子特征和功能机制 | 小鼠CD4+调节性T细胞（Tregs） | 免疫学 | 组织损伤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, TCR repertoire分析, 质谱流式细胞术 | NA | 基因表达数据, TCR序列数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 10975 | 2025-10-07 |
Cobolt: integrative analysis of multimodal single-cell sequencing data
2021-12-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02556-z
PMID:34963480
|
研究论文 | 提出Cobolt方法用于整合分析多模态单细胞测序数据 | 不仅能分析联合模态平台的数据，还提供了整合不同模态测量的多个数据集的一致框架 | NA | 开发多模态单细胞测序数据的整合分析方法 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 多组学单细胞测序 | NA | NA |
| 10976 | 2025-10-07 |
RETRACTION: Prognostic Value and Potential Mechanism of Cellular Senescence and Tumor Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma: Insights From Bulk Transcriptomics and Single-Cell Sequencing Analysis
2025-Mar, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24453
PMID:39584580
|
撤稿声明 | 本文宣布撤回一篇关于肝细胞癌中细胞衰老与肿瘤微环境预后价值的研究论文 | NA | 该文章因同行评审过程存在问题而被撤稿 | NA | NA | NA | 肝细胞癌 | 批量转录组学，单细胞测序分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 10977 | 2025-10-07 |
Revolutionizing prognosis: Introducing cell death index (CDI) as a powerful prognostic tool for CSCC patients
2025-Mar, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24265
PMID:39887534
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研究论文 | 本研究构建了细胞死亡指数(CDI)作为宫颈鳞癌的新型预后预测工具 | 首次提出细胞死亡指数的概念，并基于23个基因构建预后模型 | 使用公共数据库数据，需要进一步临床验证 | 开发宫颈鳞癌的预后预测指标 | 宫颈鳞癌患者 | 生物信息学 | 宫颈癌 | RNA-seq, scRNA-seq | 预后模型 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的训练和验证队列 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 10978 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomic analysis identifies epithelium-macrophage crosstalk in endometriotic lesions
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111790
PMID:39935459
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研究论文 | 通过空间转录组学分析揭示了子宫内膜异位病灶中上皮细胞与巨噬细胞之间的相互作用机制 | 首次发现浅表腹膜子宫内膜异位病灶上皮细胞通过补体3驱动炎症信号并促进巨噬细胞向促修复表型转化 | 仅关注浅表腹膜病灶，未涉及其他类型子宫内膜异位病变 | 阐明子宫内膜异位病灶中细胞类型特异性基因表达变化及细胞间通讯机制 | 子宫内膜异位病灶和患者匹配的在位子宫内膜组织 | 空间转录组学 | 子宫内膜异位症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 患者匹配的子宫内膜异位病灶和在位子宫内膜组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10979 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome sequencing in synovial joint: insights of new progenitors and targets in joint development and disease
2025-Feb-17, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf008
PMID:39957282
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序技术在滑膜关节发育和疾病研究中的应用与进展 | 系统总结了单细胞测序技术在揭示滑膜关节细胞异质性、发育机制和疾病病理方面的新见解 | NA | 探讨单细胞转录组测序在滑膜关节发育和疾病研究中的应用价值 | 滑膜关节（包括膝关节、颞下颌关节和脊柱关节） | 单细胞组学 | 骨关节炎、类风湿关节炎、椎间盘退变 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10980 | 2025-10-07 |
Peptide amphiphiles alleviate myocardial endoplasmic reticulum stress to enhance cardiomyocyte-macrophage communication and promote macrophage M2 polarization
2025-Feb-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.12.042
PMID:39710208
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向受损心肌细胞的级联响应药物递送系统CT-PA@Sal，通过缓解内质网应激改善心肌细胞-巨噬细胞通讯并促进巨噬细胞M2极化 | 首次利用肽两亲性分子构建靶向受损心肌细胞的级联响应药物递送系统，实现内质网应激抑制剂Salubrinal的特异性释放 | 未明确说明样本规模及临床前研究的具体局限性 | 开发治疗心肌缺血再灌注损伤的靶向药物递送策略 | 心肌细胞和巨噬细胞的细胞间通讯 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |