单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 10941 - 10960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10941 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics predict novel potential regulators of acute epithelial restitution in the ischemia-injured intestine
2024-Jun-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.28.601271
PMID:38979337
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析预测了缺血损伤肠道中急性上皮修复的新型潜在调节因子 | 首次在猪模型中识别出表达细胞迁移转录途径的修复性肠细胞亚群，并预测CSF-1作为年龄依赖性修复反应的上游调节因子 | 研究基于猪模型，结果向人类转化的适用性需要进一步验证 | 探索年龄依赖性肠道屏障修复的分子机制，寻找改善新生儿肠道损伤预后的潜在治疗靶点 | 幼猪和新生猪的肠道黏膜上皮细胞，猪肠道上皮细胞系IPEC-J2 | 单细胞转录组学 | 肠道缺血损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 猪肠道黏膜上皮细胞（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10942 | 2025-10-07 |
Elevated phagocytic capacity directs innate spinal cord repair
2024-Jun-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.11.598515
PMID:38915507
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研究论文 | 本研究通过比较斑马鱼和哺乳动物脊髓损伤后的免疫反应，揭示了高吞噬能力在脊髓先天修复中的核心作用 | 发现斑马鱼巨噬细胞具有高吞噬能力并促进脊髓再生，鉴定出关键基因，并证明人类同源基因可加速损伤修复 | 研究主要基于斑马鱼模型，在哺乳动物中的直接应用效果需进一步验证 | 探究脊髓损伤后免疫细胞在组织修复中的作用机制 | 斑马鱼和哺乳动物的巨噬细胞 | 发育生物学 | 脊髓损伤 | 单细胞转录组测序，基因敲除，细胞移植 | NA | 基因表达数据，功能实验数据 | 斑马鱼脊髓损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10943 | 2025-10-07 |
The cancer-associated fibroblasts interact with malignant T cells in mycosis fungoides and promote the disease progression
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1474564
PMID:39963655
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示蕈样肉芽肿中恶性T细胞与癌症相关成纤维细胞的相互作用机制 | 首次在蕈样肉芽肿中发现恶性T细胞具有组织驻留记忆T细胞和中央记忆T细胞双重表型，并揭示CAFs通过IL-6/JAK2/STAT3/SOX4和IL-6/HIF-1α/SOX4通路促进疾病进展的正反馈循环 | 样本量有限，主要关注晚期蕈样肉芽肿患者 | 探究蕈样肉芽肿的发病机制及肿瘤微环境的作用 | 晚期蕈样肉芽肿患者的肿瘤组织、癌旁正常组织和外周血单个核细胞，以及健康对照 | 单细胞基因组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 晚期蕈样肉芽肿患者和健康对照的样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10944 | 2025-10-07 |
High throughput single cell metagenomic sequencing with semi-permeable capsules: unraveling microbial diversity at the single-cell level in sewage and fecal microbiomes
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1516656
PMID:39968047
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研究论文 | 本研究验证了使用微流控和半透性胶囊技术对污水和猪粪便样本进行高通量单细胞宏基因组测序的方法 | 开发了结合半透性胶囊和组合拆分-合并单扩增基因组条形码的高通量单细胞测序方法，可在单细胞水平解析微生物多样性 | 仅测试了污水和猪粪便两种样本类型，样本量相对有限 | 开发和应用高通量单细胞测序技术研究微生物群落 | 污水和猪粪便样本中的单个细菌细胞 | 宏基因组学 | NA | 单细胞测序，微流控技术，组合拆分-合并单扩增基因组条形码，短读长测序 | NA | 基因组测序数据 | 污水样本和猪粪便样本各1个，深测序检测1,796和1,220个SAGs，浅测序检测12,731和17,909个SAGs | Atrandi | 单细胞测序，微流控技术 | 半透性胶囊技术 | 微流控和半透性胶囊单细胞分离技术，结合组合拆分-合并单扩增基因组条形码 |
| 10945 | 2025-10-07 |
High-Quality Brain and Bone Marrow Nuclei Preparation for Single Nuclei Multiome Assays
2023-12-22, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65715
PMID:38189499
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研究论文 | 本文介绍了用于10X Genomics多组学测序流程的大脑和骨髓样本高质量细胞核制备方法 | 开发了针对大脑和骨髓组织的标准化细胞核制备方案，确保产生高质量的单细胞核悬浮液 | 仅针对大脑和骨髓两种特定组织类型，未验证其他组织类型的适用性 | 建立优化的单细胞核制备流程以提高多组学测序数据质量 | 大脑组织和骨髓组织样本 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞多组学测序，单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | 基因组学数据，表观遗传学数据 | NA | 10x Genomics | single-cell multi-omics, single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | 10x Chromium | 10X Genomics droplet-based single-cell profiling platform for multiome assays |
| 10946 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals gonadal dynamic changes during sex differentiation in hermaphroditic protogynous orange-spotted grouper ( Epinephelus coioides)
2023-03-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10947 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals evolution of immune landscape during glioblastoma progression
2022-06, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01215-0
PMID:35624211
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胶质母细胞瘤进展过程中免疫景观的演变 | 首次在EGFR驱动的小鼠胶质母细胞瘤模型中揭示免疫细胞组成的纵向变化，并发现肿瘤进展过程中小胶质细胞向巨噬细胞和髓源性抑制细胞的演化规律 | 研究主要基于小鼠模型，人类患者样本验证有限 | 探究胶质母细胞瘤进展过程中免疫微环境的动态变化 | EGFR驱动的遗传小鼠胶质母细胞瘤模型和人类患者活检样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学，流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据 | 遗传小鼠模型和人类患者活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10948 | 2025-02-07 |
Correction to: Single-cell RNA-seq reveals diverse molecular signatures associated with Methotrexate resistance in primary central nervous system lymphoma cells
2025-Mar, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-024-04922-w
PMID:39913048
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10949 | 2025-10-07 |
In Vivo Time-Resolved Single-Cell RNA-Seq Reveals Chemotherapy-Induced Transcriptional Dynamics in Tumor Infiltrating Lymphocytes
2025-Feb-18, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c05648
PMID:39908452
|
研究论文 | 开发了一种名为scDyna-seq的时间分辨单细胞RNA测序方法，用于在体内追踪基因表达动态 | 首次实现了在体内环境中进行时间分辨的单细胞RNA测序，能够跨越血脑屏障和血胎屏障，并兼容其他单细胞多组学方法 | 研究主要基于小鼠膀胱癌模型，尚未在人类临床样本中验证 | 研究化疗药物对肿瘤浸润淋巴细胞转录动态的影响 | 小鼠膀胱癌模型中的肿瘤浸润淋巴细胞 | 单细胞测序技术 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，代谢RNA标记，4-硫尿苷标记 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠膀胱癌模型 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞多组学 | scDyna-seq，scTCR-seq | 基于4-硫尿苷标记的时间分辨单细胞RNA测序技术 |
| 10950 | 2025-10-07 |
Radiogenomic method combining DNA methylation profiles and magnetic resonance imaging radiomics predicts patient prognosis in skull base chordoma
2025-Feb-17, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-025-01836-w
PMID:39962547
|
研究论文 | 本研究开发了一种结合DNA甲基化谱和MRI影像组学的放射基因组学方法，用于预测颅底脊索瘤患者的预后 | 首次将DNA甲基化特征与MRI影像组学特征相结合构建预后预测模型，实现了非侵入性的患者风险分层 | 样本量相对较小（训练集40例，验证集122例），需要更大规模的研究验证 | 开发一种便捷有效的脊索瘤预后分类方法 | 颅底脊索瘤患者 | 医学影像分析 | 脊索瘤 | DNA甲基化分析，单细胞RNA-seq，影像组学 | 放射基因组学模型 | DNA甲基化数据，MRI图像 | 训练集40例，验证集122例，额外验证集14例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10951 | 2025-10-07 |
Autonomous function of Antennapedia in adult muscle precursors directly connects Hox genes to adult muscle development
2025-Feb-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204341
PMID:39918891
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和Hox基因扰动实验揭示了Antennapedia在果蝇成虫飞行肌发育中的直接调控作用 | 首次发现Antp通过调控细胞周期速率和Hedgehog信号通路直接参与成虫飞行肌发育，挑战了T2节段为'Hox-free'区域的传统观点 | 研究主要聚焦于果蝇T2节段，其他节段或物种的适用性需要进一步验证 | 探究Hox基因在果蝇成虫肌肉发育中的直接调控机制 | 果蝇翅膀盘和成虫肌肉前体细胞(AMPs) | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学, CRISPR基因编辑, 功能获得性实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10952 | 2025-10-07 |
Landscape of four different stages of human gastric cancer revealed by single-cell sequencing
2025-Feb-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i2.97125
PMID:39958562
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示人类胃癌四个不同阶段的细胞景观和肿瘤微环境动态变化 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘胃癌四个临床分期（I-IV期）的细胞组成和相互作用网络 | 样本量较小（仅4名患者），需要更大队列验证发现 | 探索胃癌肿瘤微环境中细胞群体的分布和动态变化 | 胃癌患者癌组织和癌旁组织 | 单细胞组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 4名患者8个组织的73645个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10953 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomes reveal cell-type-specific and sample-specific gene function in human cancer
2025-Feb-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e42218
PMID:39959484
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研究论文 | 通过单细胞转录组数据分析揭示人类癌症中细胞类型特异性和样本特异性基因功能 | 构建基于共表达网络和邻近投票方法的评估框架，首次系统比较单细胞与批量转录组在基因功能预测中的性能差异 | 研究仅基于116,814个细胞的数据，可能未涵盖所有癌症类型和细胞类型 | 探索单细胞RNA测序在理解癌症基因功能中的作用 | 人类癌症细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 共表达网络，邻近投票方法 | 单细胞转录组数据 | 116,814个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, Smart-seq2 | 10x Genomics平台与Smart-seq2平台的比较 |
| 10954 | 2025-10-07 |
Matrix mechano-sensing at the invasive front induces a cytoskeletal and transcriptional memory supporting metastasis
2025-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56299-7
PMID:39952917
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研究论文 | 本研究揭示了细胞外基质在肿瘤侵袭前沿通过机械感知诱导细胞骨架和转录记忆，从而支持转移的机制 | 首次在体内外模型中系统表征肿瘤不同区域的ECM组织特征，发现转移灶能重现原发肿瘤的ECM特征，并识别出与不良预后相关的机械炎症程序 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，在人类肿瘤中的直接验证仍需进一步研究 | 探究细胞外基质组织如何影响肿瘤局部侵袭和远处转移 | 人类和鼠类肿瘤样本，包括原发肿瘤和转移灶 | 癌症生物学 | 肿瘤转移 | 空间转录组学，体外培养模型 | 鼠类肿瘤模型 | 组织样本，转录组数据 | 人类和鼠类肿瘤样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10955 | 2025-10-07 |
One-carbon metabolism is distinct metabolic signature for proliferative intermediate exhausted T cells of ICB-resistant cancer patients
2025-Feb-14, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02332-z
PMID:39952933
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据，发现一碳代谢是免疫检查点抑制剂耐药患者中增殖性中间耗竭T细胞的独特代谢特征 | 首次揭示一碳代谢在增殖性中间耗竭T细胞中的特异性表达，并发现其与CD137信号通路的关联 | 研究主要基于转录组数据分析，需要进一步实验验证一碳代谢的功能机制 | 阐明一碳代谢在肿瘤免疫微环境中的功能作用，特别是对免疫治疗耐药性的影响 | 肺癌、胶质母细胞瘤、肾细胞癌、结直肠癌和三阴性乳腺癌患者 | 生物信息学 | 多种癌症 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多种癌症类型的患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 10956 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis identifies Ifi27l2a as a gene regulator of microglial inflammation in the context of aging and stroke in mice
2025-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56847-1
PMID:39953063
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现Ifi27l2a是衰老和脑卒中背景下小胶质细胞炎症的关键调控基因 | 首次发现Ifi27l2a在神经退行性疾病中的作用机制，证明其通过促进线粒体ROS产生驱动小胶质细胞炎症反应 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本仅使用尸检脑组织，样本来源有限 | 探索缺血性脑卒中中小胶质细胞炎症的调控机制 | 年轻和老年小鼠脑组织、细胞培养模型、人类尸检脑样本 | 单细胞生物学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠脑组织、人类尸检脑样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10957 | 2025-10-07 |
An integrated multi-omics analysis identifies protein biomarkers and potential drug targets for psoriatic arthritis
2025-Feb-14, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07698-5
PMID:39953266
|
研究论文 | 通过整合多组学分析鉴定银屑病关节炎的蛋白质生物标志物和潜在药物靶点 | 首次采用全蛋白质组孟德尔随机化分析鉴定出7个与银屑病关节炎显著相关的血浆蛋白生物标志物 | NA | 识别银屑病关节炎的生物标志物和治疗靶点 | 银屑病关节炎患者 | 生物信息学 | 银屑病关节炎 | 多组学分析, 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, 全表型关联研究 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞RNA测序数据, 遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10958 | 2025-10-07 |
CCR7 in esophageal squamous cell carcinoma: an identification from single-cell and bulk transcriptome sequencing
2025-Feb-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01927-3
PMID:39953263
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组测序揭示了CCR7在食管鳞状细胞癌中的表达机制及其与KRAS信号通路的关联 | 首次在单细胞水平系统分析CCR7在食管鳞癌中的表达特征，并发现其与KRAS信号通路激活的正相关性 | 研究样本来源有限，主要依赖公共数据库数据，需要更多实验验证 | 揭示CCR7在食管鳞状细胞癌中的具体作用机制 | 食管鳞状细胞癌细胞 | 单细胞转录组学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 细胞功能实验 | Seurat软件分析 | 基因表达数据 | 28,281个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 10959 | 2025-10-07 |
Role of CD4+ T cells in cancer immunity: a single-cell sequencing exploration of tumor microenvironment
2025-Feb-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06167-1
PMID:39953548
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综述 | 通过单细胞测序技术探讨CD4+ T细胞在肿瘤免疫微环境中的作用 | 整合单细胞测序数据系统阐述CD4+ T细胞表型异质性及其在肿瘤免疫中的功能特异性 | NA | 探讨CD4+ T细胞在肿瘤免疫微环境中的功能作用及治疗潜力 | CD4+ T淋巴细胞及其在肿瘤微环境中的亚群 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10960 | 2025-10-07 |
A morphological cell atlas of the freshwater sponge Ephydatia muelleri with key insights from targeted single-cell transcriptomes
2025-Feb-14, EvoDevo
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s13227-025-00237-7
PMID:39953556
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研究论文 | 本研究通过构建淡水海绵Ephydatia muelleri的形态学细胞图谱并结合靶向单细胞转录组分析，揭示了海绵细胞类型的多样性和功能复杂性 | 首次描述了海绵中多种新型细胞特征，包括极化外上皮、新型收缩筛细胞、动纤毛和非动纤毛细胞，并通过活细胞成像展示了中胶层运动细胞的独特行为特征 | 研究主要聚焦于单一海绵物种，对非两侧对称动物形态学的理解仍有限，可能无法完全代表所有海绵物种的细胞多样性 | 旨在弥合两侧对称动物与非两侧对称动物在细胞和组织层面理解的差距，探索动物细胞类型和组织结构的进化起源 | 淡水海绵Ephydatia muelleri的细胞和组织类型 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组测序，活细胞成像 | NA | 转录组数据，形态学图像 | 三种细胞类型（囊细胞、领细胞和原始细胞）的活细胞样本，其中包含5个领细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |