单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 10941 - 10960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10941 | 2024-08-05 |
Cellular heterogeneity and key subsets of tissue-resident memory T cells in cervical cancer
2024-Jul-16, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00637-3
PMID:39014148
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研究论文 | 本研究分析了宫颈癌中组织驻留记忆T细胞的细胞异质性及其关键亚群 | 首次揭示了宫颈癌中组织驻留记忆T细胞的异质性及其在免疫反应中的作用 | 研究仅基于有限的样本数量和组织来源，可能无法涵盖所有的细胞特性 | 探讨组织驻留记忆T细胞在宫颈癌中的异质性及其对癌症免疫的贡献 | 来自11个宫颈癌组织和5个正常宫颈组织的组织驻留记忆T细胞及非组织驻留记忆T细胞 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 12945个组织驻留记忆T细胞和25627个非组织驻留记忆T细胞 |
| 10942 | 2024-08-05 |
Establishing an oxidative stress mitochondria-related prognostic model in hepatocellular carcinoma based on multi-omics characteristics and machine learning computational framework
2024-Jul-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01147-1
PMID:39014263
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研究论文 | 本文建立了一种基于多组学特征和机器学习计算框架的氧化应激线粒体相关预后模型，用于肝细胞癌的预测 | 采用多种机器学习算法构建了一种包含26个基因的共识氧化应激线粒体相关标志物，并筛选出6个具有良好预后价值的基因 | 研究主要依赖于公共数据库数据，可能存在数据异质性和外部验证不足的问题 | 本文旨在探讨线粒体功能与氧化应激在肝细胞癌中的预后价值 | 研究对象为肝细胞癌患者的基因表达数据 | 机器学习 | 肝癌 | 基因表达分析，机器学习 | 多种机器学习算法 | 基因表达数据 | 使用来自TCGA、GEO和ICGC的HCC样本数据 |
| 10943 | 2024-08-05 |
Single cell profiling to determine influence of wheeze and early-life viral infection on developmental programming of airway epithelium
2024-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.08.602506
PMID:39026695
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研究论文 | 本研究旨在表征哮喘儿童气道上皮的发育表型及其与早期呼吸道病毒感染的关系 | 研究发现哮喘儿童的气道上皮在发育过程中表现出异常分化和基底细胞活化，这为理解哮喘的生物学基础提供了新见解 | 该研究主要集中于特定年龄段的儿童，可能无法代表所有年龄组的情况 | 探索幼儿哮喘与早期RSV感染对气道上皮发育编程的影响 | 从不同组别的哮喘与非哮喘儿童中收集的鼻气道上皮细胞 | 数字病理学 | 幼儿哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 共计涉及来自四个相互排斥组的儿童 |
| 10944 | 2024-08-05 |
T-distributed Stochastic Neighbor Network for unsupervised representation learning
2024-Jul-09, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.neunet.2024.106520
PMID:39024709
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研究论文 | 本文提出了一种简单的端到端T-分布随机邻居网络（TsNet）用于无监督表示学习和聚类下游任务 | 引入了适应性连接分布学习模块和基于T-分布随机邻居嵌入的损失函数，显著提高了表示的区分度 | 未提及具体的局限性 | 探索如何从通用数据中提取有意义的结构信息 | 通用数据的聚类表示学习，包括向量、图像和表格数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq | TsNet | 图像，文本 | 涉及真实单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集的聚类 |
| 10945 | 2024-08-05 |
Deciphering the heterogeneity of differentiating hPSC-derived corneal limbal stem cells through single-cell RNA sequencing
2024-Jul-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.06.001
PMID:38942029
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析了人类多能干细胞(hPSC)向角膜缘干细胞(LSCs)分化过程中的异质性 | 首次描述了在hPSC分化过程中出现的四个之前未被描述的细胞状态 | 研究中所涉及的细胞系有限，可能影响结果的普遍性 | 旨在深入理解hPSC向LSCs的分化过程 | 研究了三条hPSC细胞系在向角膜缘干细胞分化过程中的异质性 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | 三条hPSC细胞系 |
| 10946 | 2024-08-05 |
Decoding cellular plasticity and niche regulation of limbal stem cells during corneal wound healing
2024-Jul-06, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03816-y
PMID:38971839
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研究论文 | 本研究探讨了角膜伤害中透明角膜干细胞及其生态位的分子和功能响应 | 定义了透明角膜干细胞的分子特征并重建了角膜上皮细胞的伪时间轨迹，识别了新的转录因子Creb5及其在伤害后的作用 | 尚未深入探讨Creb5和OSM在临床应用中的具体效果 | 揭示透明角膜干细胞在角膜伤害愈合过程中的作用及其调控机制 | 透明角膜干细胞及其生态位细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 来自正常小鼠和角膜上皮缺损模型的组织样本 |
| 10947 | 2024-08-04 |
Applications of single-cell multi-omics in liver cancer
2024-Jul, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101094
PMID:39022385
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综述 | 本文探讨了单细胞多组学在肝癌研究中的应用。 | 强调通过整合多种单模态技术到单细胞分辨率的多组学方法中，推动个体化治疗的发展。 | 当前单细胞多组学在肝癌研究中的应用仍然有限。 | 旨在深入理解肝癌的生物学及其临床影响。 | 主要关注肝细胞癌（HCC）的细胞异质性及其治疗反应机制。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 10948 | 2024-08-05 |
Unveiling mitochondrial and ribosomal gene deregulation and tumor microenvironment dynamics in acute myeloid leukemia
2024-Jul, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00788-2
PMID:38806621
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研究论文 | 该研究揭示了急性髓系白血病中线粒体和核糖体基因的失调及肿瘤微环境的动态 | 使用机器学习方法重新分析scRNA-seq数据，识别急性髓系白血病中枝状细胞的基因模块失调和免疫信号通路的失衡 | 研究可能受到样本规模和数据来源的限制 | 深入理解急性髓系白血病细胞与肿瘤微环境之间的相互作用 | 急性髓系白血病患者的细胞与基因表达数据 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | scRNA-seq | 正常Cox模型和人工神经网络模型 | 基因表达数据 | CSC和G20队列的样本 |
| 10949 | 2024-08-04 |
A bibliometric study of the intellectual base and global research hotspots for single-cell sequencing [2009-2022] in breast cancer
2024-Jun-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33219
PMID:39022007
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研究论文 | 该研究总结并量化了与乳腺癌单细胞测序相关的研究动态和趋势 | 提供了关于乳腺癌单细胞测序的全面和公正的研究状态报告 | 当前缺乏对研究结果的深入分析，未来需更多跨国合作 | 研究乳腺癌单细胞测序的研究动态和热点 | 与乳腺癌单细胞测序相关的研究文章和评论 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 文献数据 | 分析了583篇文章和评论 |
| 10950 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis and experimental verification reveal the molecular characteristics of EGLN3 in pan-cancer and its relationship with the proliferation and apoptosis of lung cancer
2024-Jun-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33206
PMID:39021988
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研究论文 | 这篇文章探讨了EGLN3在各种癌症中的分子特征及其在肺癌增殖和细胞凋亡中的作用 | 本研究首次全面分析了EGLN3在泛癌症中的表达模式及其与免疫细胞浸润的关系 | 本研究的局限性在于未能充分阐明EGLN3在不同癌症类型中的特异性作用 | 研究EGLN3在癌症中的生物功能及其临床意义 | 研究对象为EGLN3及其与肺癌细胞增殖和凋亡的关系 | 数字病理 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞测序, 免疫荧光 | NA | 细胞数据 | NA |
| 10951 | 2024-08-04 |
A Cullin 5-based complex serves as an essential modulator of ORF9b stability in SARS-CoV-2 replication
2024-Jun-28, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01874-5
PMID:38937432
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研究论文 | 本研究揭示了CUL5-TOM70-HSP90α复合体在SARS-CoV-2 ORF9b稳定性调控中的关键作用 | 首次识别CUL5-TOM70-HSP90α复合体作为ORF9b蛋白稳定性的关键调节因子 | 未提及该研究的具体限制 | 探讨SARS-CoV-2中ORF9b蛋白的调控机制 | SARS-CoV-2 ORF9b蛋白及其变异株 | 病毒学 | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 蛋白质 | 对COVID-19患者的肺上皮细胞进行研究 |
| 10952 | 2024-08-05 |
Intense impact of IL-1β expressing inflammatory macrophages in acute aortic dissection
2024-06-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-65931-3
PMID:38937528
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研究论文 | 本文探讨了IL-1β表达的炎症巨噬细胞对急性主动脉夹层的影响 | 首次识别了与急性主动脉夹层相关的新治疗靶点，尤其是IL-1β炎症巨噬细胞的作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能与人类的病理机制存在差异 | 识别与炎症细胞相关的新治疗靶点 | 人类急性主动脉夹层样本和小鼠急性主动脉夹层模型 | 数字病理学 | 急性主动脉夹层 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 小鼠模型 | 组织样本 | 人类样本和小鼠模型的数量未具体说明 |
| 10953 | 2024-08-05 |
Farnesyltransferase inhibition overcomes oncogene-addicted non-small cell lung cancer adaptive resistance to targeted therapies
2024-Jun-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49360-4
PMID:38937474
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研究论文 | 本研究探讨了磷酸酰基转移酶抑制剂在克服非小细胞肺癌适应性抗药性方面的作用 | 该研究揭示了药物适应的共同路径和早期抗药性细胞的特征，并确定了FTI作为有效的治疗组合 | 研究中对分子事件的动力学和序列了解仍然不足 | 研究如何克服非小细胞肺癌对靶向疗法产生的适应性抗药性 | 包括EGFR、ALK、BRAF和KRAS突变的非小细胞肺癌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、实时细胞周期动态监测 | NA | 细胞 | 广泛的肿瘤细胞系，包括多种突变类型 |
| 10954 | 2024-08-04 |
The Absence of Intra-Tumoral Tertiary Lymphoid Structures is Associated with a Worse Prognosis and mTOR Signaling Activation in Hepatocellular Carcinoma with Liver Transplantation: A Multicenter Retrospective Study
2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309348
PMID:38498682
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌（HCC）患者中肿瘤内三级淋巴结构的缺失如何与更差的预后及mTOR信号通路激活相关 | 首次探讨了通过放射学非侵入性预测肝脏移植后的肝细胞癌中的肿瘤内三级淋巴结构的可能性，并建立了相应的分类器 | 该研究的局限性在于为回顾性研究，可能存在选择偏倚和数据的局限性 | 研究肝细胞癌中肿瘤内三级淋巴结构的存在对预后的影响 | 肝细胞癌患者，尤其是接受肝脏移植的患者 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | 分类器 | 肿瘤组织样本 | 最大 cohort，包括多名肝细胞癌患者 |
| 10955 | 2024-08-05 |
miR-124-3p and miR-194-5p regulation of the PI3K/AKT pathway via ROR2 in medulloblastoma progression
2024-Jun, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00762-y
PMID:38632356
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研究论文 | 该文章探讨了miR-124-3p和miR-194-5p通过ROR2调控PI3K/AKT通路在髓母细胞瘤进展中的作用 | 揭示了miR-124-3p和miR-194-5p作为肿瘤抑制因子的作用及其在髓母细胞瘤中的潜在治疗靶点 | 对miRNAs在髓母细胞瘤肿瘤发生中的具体作用尚不明确 | 研究miR-124-3p和miR-194-5p在髓母细胞瘤进展中的调控机制 | 关注miR-124-3p、miR-194-5p及ROR2在髓母细胞瘤组织和细胞系中的表现 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、qRT-PCR、免疫荧光、Western blot | NA | 生物组织样本 | NA |
| 10956 | 2024-08-05 |
Integrating Multi-omics Data for Alzheimer's Disease to Explore Its Biomarkers Via the Hypergraph-Regularized Joint Deep Semi-Non-Negative Matrix Factorization Algorithm
2024-Apr-15, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-024-02211-9
PMID:38619646
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研究论文 | 本文提出了一种超图正则化联合深度半非负矩阵分解算法，以集成与阿尔茨海默病相关的多组学数据 | 本文的创新点在于提出了一种新算法HR-JDSNMF，通过高阶关联挖掘和多层次数据分解来整合多组学数据 | 尽管该方法优于多种其他算法，但可能仍存在在更大规模的真实世界数据上验证结果的限制 | 本研究旨在探讨阿尔茨海默病的多组学生物标志物 | 研究对象包括与阿尔茨海默病相关的基因组学、转录组学和影像数据 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 正电子发射断层扫描（PET）、单核苷酸多态性（SNP）、基因表达 | 深度半非负矩阵分解（JDSNMF） | 基因组数据、转录组数据、影像数据 | 实验数据通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）收集，但具体样本大小未提及 |
| 10957 | 2024-08-04 |
Techniques for Rapidly Sampling Six Crucial Organs in Adult Xenopus
2024-Feb-16, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66489
PMID:38436453
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研究论文 | 本文介绍了一种快速采样成年非洲爪蟾六个重要器官的技术 | 提出了针对成年非洲爪蟾的器官识别和解剖的标准化方法，支持现代定量蛋白组学和单细胞转录组学的需求 | 未明确提到样本保存方法对实验结果的具体影响 | 标准化成年非洲爪蟾的组织采样，促进多实验室的研究 | 成年非洲爪蟾的心室、肝脏、脂肪组织、胰腺、双肾和皮肤 | 数字病理学 | NA | 定量蛋白组学、单细胞转录组学、原位杂交、免疫组化、组织学等 | NA | 组织样本 | NA |
| 10958 | 2024-08-04 |
Isolation and Phenotypic Characterization of Tumor-Infiltrating NK Cells in Skin Carcinoma
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2023_512
PMID:38329617
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研究论文 | 本研究探讨了皮肤癌中肿瘤浸润性自然杀伤(NK)细胞的分离和表型特征。 | 本研究创新性地展示了肿瘤浸润性和循环NK细胞在转录程序中的显著差异，强调了它们在肿瘤微环境中的特异功能。 | 本研究未提及样本量和方法的具体局限性。 | 本项目旨在建立一种全面的技术，以隔离和深入表征皮肤癌中肿瘤浸润性NK细胞。 | 研究对象为来自人类黑色素瘤转移的NK细胞。 | 数字病理 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 10959 | 2024-08-04 |
Identification of macrophage-related genes in bladder cancer patients using single-cell sequencing and construction of a prognostic model
2024, American journal of clinical and experimental immunology
IF:1.4Q4
DOI:10.62347/VLDZ7581
PMID:39022795
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研究论文 | 本研究评估了膀胱癌患者肿瘤微环境中巨噬细胞相关基因的表达并构建了预后模型 | 使用单细胞测序技术识别并分析膀胱癌患者中的巨噬细胞相关基因。 | NA | 评估膀胱癌患者肿瘤微环境中巨噬细胞相关基因的表达并构建预后模型 | 膀胱癌患者的肿瘤微环境中的巨噬细胞相关基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 10960 | 2024-08-04 |
Startle: A star homoplasy approach for CRISPR-Cas9 lineage tracing
2023-12-20, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.11.005
PMID:38128483
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研究论文 | 提出了一种新颖的星形同义性进化模型，用于CRISPR-Cas9细胞系追踪 | 开发了专门的星形同义性模型以描述CRISPR-Cas9诱导突变的进化特点 | 未提及具体的应用限制 | 旨在改进CRISPR-Cas9诱导突变的细胞谱系追踪方法 | 研究CRISPR-Cas9诱导突变的细胞系谱系 | 数字病理学 | 肺腺癌 | CRISPR-Cas9 | 星形同义性模型 | 模拟细胞谱系追踪数据，鼠类转移性肺腺癌数据 | NA |