单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 10921 - 10940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10921 | 2025-10-07 |
Spatial single-cell maps reveal ST6GAL1 promoting ovarian cancer metastasis
2025-Feb, Glycoconjugate journal
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s10719-025-10177-y
PMID:39883364
|
研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组技术揭示了ST6GAL1在促进卵巢癌腹膜转移中的作用 | 首次整合空间和单细胞转录组数据揭示ST6GAL1在卵巢癌转移中的空间分布特征和代谢活性变化 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证功能机制 | 探究ST6GAL1在卵巢癌腹膜转移中的作用机制 | 卵巢癌上皮细胞，特别是腹膜转移灶 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组，RNA测序 | RCTD（稳健细胞类型分解），伪时间轨迹分析 | 转录组数据，空间定位数据 | GSE130000和GSE211956数据集，TCGA RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10922 | 2025-10-07 |
Decidual stromal cells: fibroblasts specialized in immunoregulation during pregnancy
2025-Feb, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2024.12.007
PMID:39947975
|
综述 | 本文探讨蜕膜基质细胞作为妊娠期间具有免疫调节功能的特化成纤维细胞的作用 | 提出蜕膜基质细胞是组织特化型成纤维细胞的新观点，并系统比较两者在免疫调节功能的相似性 | 主要基于已有研究进行理论分析，缺乏直接实验证据验证 | 阐明蜕膜基质细胞在妊娠免疫调节中的功能机制 | 人类和小鼠的蜕膜基质细胞 | 生殖医学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10923 | 2025-10-07 |
Integrating multiscale mathematical modeling and multidimensional data reveals the effects of epigenetic instability on acquired drug resistance in cancer
2025-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012815
PMID:39951474
|
研究论文 | 通过整合多尺度数学模型与多维数据，揭示表观遗传不稳定性对癌症获得性耐药的影响 | 从进化角度开发了包含表观遗传和细胞群体动力学的多尺度数学模型，首次识别表观遗传不稳定性作为药物耐受持久细胞亚群出现的关键动力学特征 | 模型主要基于PC9细胞系数据，需要在更广泛的癌症类型中验证 | 阐明药物耐受持久细胞促进获得性耐药形成的生物学和动力学机制 | PC9肺癌细胞系及药物耐受持久细胞 | 计算生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，随机模拟，定量分析 | 多尺度数学模型 | 单细胞RNA测序数据，多维实验数据 | PC9细胞系药物处理数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10924 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic atlas of different endometriosis indicating that an interaction between endometriosis-associated mesothelial cells (EAMCs) and ectopic stromal cells may influence progesterone resistance
2025-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70216
PMID:39968688
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序建立了不同类型子宫内膜异位症的单细胞转录组图谱，揭示了间皮细胞与异位基质细胞通过FN1-AKT通路相互作用影响孕酮抵抗的机制 | 首次在卵巢子宫内膜异位症中发现间皮细胞，并揭示不同类型子宫内膜异位症中间皮细胞经历不同程度的上皮-间质转化过程 | 样本量较小（仅6例患者），需要更大规模研究验证发现 | 探索不同类型子宫内膜异位症之间的分子特征差异和孕酮抵抗机制 | 子宫内膜异位症患者的腹膜子宫内膜异位症、深部浸润型子宫内膜异位症和卵巢子宫内膜异位症组织样本 | 单细胞转录组学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例患者的手术活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10925 | 2025-10-07 |
A single-cell mass cytometry-based atlas of the developing mouse brain
2025-Jan, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01786-1
PMID:39695302
|
研究论文 | 本研究通过单细胞质谱流式技术构建了发育中小鼠大脑的蛋白质表达图谱 | 首次在单细胞水平系统表征发育中小鼠大脑的蛋白质丰度，揭示了与RNA表达差异的功能性细胞状态 | 研究仅针对特定发育时间点的小鼠模型，未涵盖所有脑区发育阶段 | 构建发育中小鼠大脑的单细胞蛋白质表达图谱 | C57/BL6小鼠胚胎期E11.5至出生后P4的整个大脑及四个脑区组织 | 单细胞分析 | NA | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序，免疫组织化学，RNAscope原位杂交 | NA | 单细胞蛋白质表达数据，单细胞RNA表达数据 | 24,290,787个细胞，每个样本2-4个生物学重复 | NA | 单细胞蛋白质组学，单细胞RNA测序 | NA | 40抗体panel的质谱流式分析 |
| 10926 | 2025-10-07 |
Mendelian randomization and multiomics comprehensively reveal the causal relationship and potential mechanism between atrial fibrillation and gastric cancer
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1446661
PMID:39963672
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和多组学分析全面揭示心房颤动与胃癌之间的因果关系及潜在机制 | 首次综合运用孟德尔随机化、蛋白互作网络、单细胞测序和发育轨迹分析，系统揭示AF与GC的因果关联及成纤维细胞在其中的关键作用 | 研究基于遗传工具变量和公共数据库，需进一步实验验证机制 | 探究心房颤动与胃癌之间的因果关系及分子机制 | 心房颤动患者与胃癌患者的遗传和分子数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA-seq, 蛋白互作网络分析, 富集分析, 转录因子分析 | 两样本孟德尔随机化模型 | 遗传数据, 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 136个AF相关SNPs, 62个AF-GC共关联基因, TCGA-STAD数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 高通量测序 | NA | NA |
| 10927 | 2025-10-07 |
Integrated analysis of M2 macrophage-related gene prognostic model and single-cell sequence to predict immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1519677
PMID:39963673
|
研究论文 | 通过整合分析M2巨噬细胞相关基因构建预后模型，结合单细胞测序预测肺腺癌患者的免疫治疗反应 | 首次结合M2巨噬细胞相关基因构建预后特征，并利用单细胞转录组分析揭示分子亚型和异质性 | 研究基于公共数据库的芯片数据，需要进一步实验验证 | 预测肺腺癌患者的免疫治疗疗效和预后 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | WGCNA, LASSO分析, 单细胞转录组分析 | 风险特征模型 | 基因表达芯片数据 | 来自GSE26939和GSE19188数据集的样本 | NA | 基因表达芯片, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10928 | 2025-10-07 |
Identification of Five NK Cell-Related Hub Genes in COPD Using Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S491298
PMID:39963682
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析鉴定COPD中五个NK细胞相关枢纽基因 | 首次通过单细胞RNA测序结合生物信息学方法系统分析COPD中NK细胞亚群的特征基因，并鉴定出五个关键枢纽基因 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于RT-qPCR，需要进一步的功能实验验证 | 探索COPD免疫浸润中的关键基因 | 慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者的免疫细胞 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, LASSO回归, 伪时间分析 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 使用GSE57148和GSE8581数据集，包含COPD患者和正常对照样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10929 | 2025-10-07 |
SPP1 as a Prognostic and Immunotherapeutic Biomarker in Gliomas and Other Cancer Types: A Pan-Cancer Study
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S505237
PMID:39963684
|
研究论文 | 本研究通过泛癌分析探讨SPP1作为胶质瘤和其他癌症预后及免疫治疗生物标志物的作用 | 首次在泛癌水平系统分析SPP1的预后价值和免疫治疗潜力，并通过单细胞测序揭示其在胶质瘤微环境中的特异性表达模式 | 研究主要基于生物信息学分析，临床验证数据有限，需要进一步实验和临床试验确认 | 评估SPP1作为癌症预后和免疫治疗生物标志物的潜力 | 胶质瘤（包括胶质母细胞瘤）及其他26种肿瘤类型 | 生物信息学 | 胶质瘤, 泛癌 | 单细胞测序, 基因敲低, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 临床生存数据 | 来自TCGA、GEO和TISCH数据库的多癌种样本，包括27种肿瘤类型 | UCSC, GEO, TISCH | 单细胞RNA-seq, 泛癌分析 | TCGA Pan-Cancer, TCGA-GBM, UALCAN | UCSC TCGA泛癌数据集、TCGA胶质母细胞瘤数据集、UALCAN分析平台 |
| 10930 | 2025-10-07 |
Competing endogenous RNA networks in ovarian cancer: from bench to bedside
2025, EXCLI journal
IF:3.8Q1
DOI:10.17179/excli2024-7827
PMID:39967908
|
综述 | 全面综述卵巢癌中竞争性内源RNA网络的作用机制及其临床应用前景 | 整合单细胞RNA测序与个性化医疗视角，系统阐述ceRNA网络在卵巢癌中的新型调控机制 | 属于综述性文章，未包含原始实验数据验证 | 探讨ceRNA网络在卵巢癌发生发展中的作用及临床转化价值 | 卵巢癌细胞中的miRNA、circRNA、lncRNA及其构成的ceRNA调控网络 | 自然语言处理 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10931 | 2025-10-07 |
NLSDeconv: an efficient cell-type deconvolution method for spatial transcriptomics data
2024-12-26, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae747
PMID:39705170
|
研究论文 | 提出了一种基于非负最小二乘的空间转录组学数据细胞类型反卷积方法NLSDeconv | 开发了计算效率优于现有18种反卷积方法的新算法 | NA | 解决空间转录组学数据缺乏单细胞分辨率的问题 | 空间转录组学数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 非负最小二乘法 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10932 | 2025-10-07 |
Accurate RNA velocity estimation based on multibatch network reveals complex lineage in batch scRNA-seq data
2024-Dec-18, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-02085-8
PMID:39696422
|
研究论文 | 提出一种名为VeloVGI的新方法，用于在批次单细胞RNA测序数据中准确估计RNA速度并揭示复杂细胞谱系 | 通过结合最优传输和互最近邻方法构建批次数据中的邻居关系，并将图结构整合到编码器中改进速度估计 | 未明确说明方法在更广泛数据集上的适用性和计算效率 | 解决批次效应对RNA速度估计的影响，提高细胞发育轨迹推断的准确性 | 小鼠脊髓和嗅球组织细胞，以及多个公共单细胞RNA测序数据集 | 单细胞生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | VeloVGI（基于图神经网络的编码器模型） | 单细胞RNA测序数据（剪接和未剪接矩阵） | 多个公共数据集，包括小鼠脊髓和嗅球组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10933 | 2025-10-07 |
B-Cell Activation Gene Signature in Blood and Liver of Hepatitis B e Antigen-Positive Patients With Immune Active Chronic Hepatitis B
2024-Dec-16, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiae280
PMID:38847286
|
研究论文 | 本研究通过分析慢性乙型肝炎患者血液和肝脏中B细胞的基因表达谱，揭示了免疫活跃期患者的B细胞激活特征 | 首次在慢性乙型肝炎患者中同时分析血液和肝脏B细胞的基因表达特征，并通过单细胞RNA测序技术识别了naive和记忆B细胞亚群作为主要特征携带者 | 样本量有限，研究主要关注免疫活跃期患者，未涵盖所有慢性HBV感染阶段 | 探究慢性乙型肝炎患者B细胞的激活状态及其在HBV感染中的免疫反应特征 | 免疫活跃期慢性乙型肝炎患者和健康对照者的血液及肝脏B细胞 | 免疫学 | 乙型肝炎 | RNA测序, 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 流式细胞数据 | 慢性乙型肝炎患者和健康对照者样本 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术 | NA | NA |
| 10934 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics predict novel potential regulators of acute epithelial restitution in the ischemia-injured intestine
2024-Jun-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.28.601271
PMID:38979337
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析预测了缺血损伤肠道中急性上皮修复的新型潜在调节因子 | 首次在猪模型中识别出表达细胞迁移转录途径的修复性肠细胞亚群，并预测CSF-1作为年龄依赖性修复反应的上游调节因子 | 研究基于猪模型，结果向人类转化的适用性需要进一步验证 | 探索年龄依赖性肠道屏障修复的分子机制，寻找改善新生儿肠道损伤预后的潜在治疗靶点 | 幼猪和新生猪的肠道黏膜上皮细胞，猪肠道上皮细胞系IPEC-J2 | 单细胞转录组学 | 肠道缺血损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 猪肠道黏膜上皮细胞（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10935 | 2025-10-07 |
Elevated phagocytic capacity directs innate spinal cord repair
2024-Jun-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.11.598515
PMID:38915507
|
研究论文 | 本研究通过比较斑马鱼和哺乳动物脊髓损伤后的免疫反应，揭示了高吞噬能力在脊髓先天修复中的核心作用 | 发现斑马鱼巨噬细胞具有高吞噬能力并促进脊髓再生，鉴定出关键基因，并证明人类同源基因可加速损伤修复 | 研究主要基于斑马鱼模型，在哺乳动物中的直接应用效果需进一步验证 | 探究脊髓损伤后免疫细胞在组织修复中的作用机制 | 斑马鱼和哺乳动物的巨噬细胞 | 发育生物学 | 脊髓损伤 | 单细胞转录组测序，基因敲除，细胞移植 | NA | 基因表达数据，功能实验数据 | 斑马鱼脊髓损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10936 | 2025-10-07 |
The cancer-associated fibroblasts interact with malignant T cells in mycosis fungoides and promote the disease progression
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1474564
PMID:39963655
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示蕈样肉芽肿中恶性T细胞与癌症相关成纤维细胞的相互作用机制 | 首次在蕈样肉芽肿中发现恶性T细胞具有组织驻留记忆T细胞和中央记忆T细胞双重表型，并揭示CAFs通过IL-6/JAK2/STAT3/SOX4和IL-6/HIF-1α/SOX4通路促进疾病进展的正反馈循环 | 样本量有限，主要关注晚期蕈样肉芽肿患者 | 探究蕈样肉芽肿的发病机制及肿瘤微环境的作用 | 晚期蕈样肉芽肿患者的肿瘤组织、癌旁正常组织和外周血单个核细胞，以及健康对照 | 单细胞基因组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 晚期蕈样肉芽肿患者和健康对照的样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10937 | 2025-10-07 |
High throughput single cell metagenomic sequencing with semi-permeable capsules: unraveling microbial diversity at the single-cell level in sewage and fecal microbiomes
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1516656
PMID:39968047
|
研究论文 | 本研究验证了使用微流控和半透性胶囊技术对污水和猪粪便样本进行高通量单细胞宏基因组测序的方法 | 开发了结合半透性胶囊和组合拆分-合并单扩增基因组条形码的高通量单细胞测序方法，可在单细胞水平解析微生物多样性 | 仅测试了污水和猪粪便两种样本类型，样本量相对有限 | 开发和应用高通量单细胞测序技术研究微生物群落 | 污水和猪粪便样本中的单个细菌细胞 | 宏基因组学 | NA | 单细胞测序，微流控技术，组合拆分-合并单扩增基因组条形码，短读长测序 | NA | 基因组测序数据 | 污水样本和猪粪便样本各1个，深测序检测1,796和1,220个SAGs，浅测序检测12,731和17,909个SAGs | Atrandi | 单细胞测序，微流控技术 | 半透性胶囊技术 | 微流控和半透性胶囊单细胞分离技术，结合组合拆分-合并单扩增基因组条形码 |
| 10938 | 2025-10-07 |
High-Quality Brain and Bone Marrow Nuclei Preparation for Single Nuclei Multiome Assays
2023-12-22, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65715
PMID:38189499
|
研究论文 | 本文介绍了用于10X Genomics多组学测序流程的大脑和骨髓样本高质量细胞核制备方法 | 开发了针对大脑和骨髓组织的标准化细胞核制备方案，确保产生高质量的单细胞核悬浮液 | 仅针对大脑和骨髓两种特定组织类型，未验证其他组织类型的适用性 | 建立优化的单细胞核制备流程以提高多组学测序数据质量 | 大脑组织和骨髓组织样本 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞多组学测序，单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | 基因组学数据，表观遗传学数据 | NA | 10x Genomics | single-cell multi-omics, single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | 10x Chromium | 10X Genomics droplet-based single-cell profiling platform for multiome assays |
| 10939 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals gonadal dynamic changes during sex differentiation in hermaphroditic protogynous orange-spotted grouper ( Epinephelus coioides)
2023-03-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10940 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals evolution of immune landscape during glioblastoma progression
2022-06, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01215-0
PMID:35624211
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胶质母细胞瘤进展过程中免疫景观的演变 | 首次在EGFR驱动的小鼠胶质母细胞瘤模型中揭示免疫细胞组成的纵向变化，并发现肿瘤进展过程中小胶质细胞向巨噬细胞和髓源性抑制细胞的演化规律 | 研究主要基于小鼠模型，人类患者样本验证有限 | 探究胶质母细胞瘤进展过程中免疫微环境的动态变化 | EGFR驱动的遗传小鼠胶质母细胞瘤模型和人类患者活检样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学，流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据 | 遗传小鼠模型和人类患者活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |