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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 10881 - 10900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10881 | 2025-10-07 |
[Microglia differential genes and their functions in paraquat-induced Parkinson's disease-like in mice's brains based on single-cell RNA sequencing]
2024-Apr-20, Zhonghua lao dong wei sheng zhi ye bing za zhi = Zhonghua laodong weisheng zhiyebing zazhi = Chinese journal of industrial hygiene and occupational diseases
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序分析百草枯诱导帕金森病样小鼠脑内小胶质细胞亚群的差异基因及相关信号通路 | 首次在百草枯诱导的帕金森病样小鼠模型中通过单细胞RNA测鉴定了小胶质细胞亚群，并发现其向M2表型极化的新机制 | 样本量较小（每组3只小鼠），且仅在细胞系中验证了部分基因表达 | 阐明百草枯诱导帕金森病样脑部变化的机制 | C57BL/6小鼠和小鼠小胶质细胞（BV2细胞） | 单细胞测序分析 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序，实时荧光定量PCR，生物信息学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | 6只6周龄雄性C57BL/6小鼠（对照组和实验组各3只），BV2细胞系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 10882 | 2025-10-07 |
Association of HLA-DRB1*15:01 Status with Transcriptomic Pattern of B cells in CSF in Multiple Sclerosis (P7-6.011)
2024-Apr-09, Neurology
IF:7.7Q1
DOI:10.1212/WNL.0000000000208131
PMID:39977876
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析多发性硬化症患者脑脊液中B细胞的基因表达模式与HLA-DRB1*15:01单倍型状态的关联 | 首次在单细胞水平揭示HLA-DRB1*15:01单倍型状态与多发性硬化症患者脑脊液B细胞转录组模式的关联 | 样本量有限（25个脑脊液样本），且使用公开数据可能受原始研究设计限制 | 探讨HLA-DRB1*15:01单倍型状态对多发性硬化症患者脑脊液B细胞基因表达模式的影响 | 多发性硬化症患者和健康对照者的外周血单核细胞和脑脊液样本 | 单细胞转录组学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序, VDJ分析 | TRUST4, ArcasHLA | 单细胞RNA测序数据 | 25个脑脊液样本中的1376个B系细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10883 | 2025-10-07 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq unravels the molecular feature of M2 macrophages of head and neck squamous cell carcinoma
2024-03, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18083
PMID:38393307
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA-seq和bulk RNA-seq分析头颈鳞状细胞癌中M2巨噬细胞的分子特征 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据构建M2巨噬细胞相关特征模型，并鉴定FCGR2A作为潜在免疫治疗靶点 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 阐明M2肿瘤相关巨噬细胞在头颈鳞状细胞癌中的作用机制 | 头颈鳞状细胞癌患者和肿瘤微环境中的M2巨噬细胞 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | Consensus Clustering, 特征模型 | 基因表达谱, 临床数据 | TCGA数据库HNSC患者数据 + GSE139324单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10884 | 2025-02-21 |
Schwann Cell-Secreted S100B Promotes Wound Healing via Paracrine Modulation
2025-Mar, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241296103
PMID:39711160
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研究论文 | 本研究探讨了Schwann细胞在腭黏膜伤口愈合中的关键作用及其通过S100B/RAGE/NF-κB/Notch旁分泌轴的机制 | 揭示了Schwann细胞通过分泌S100B蛋白在腭黏膜伤口愈合中的关键作用，并阐明了其通过RAGE受体激活NF-κB和Notch信号通路的机制 | 研究主要基于非人灵长类动物模型，尚未在人类中进行验证 | 探究Schwann细胞在腭黏膜伤口愈合中的作用及其分子机制 | 腭黏膜、颊附着龈和皮肤的伤口愈合 | 生物医学 | 伤口愈合 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 非人灵长类动物、大鼠和猴子的皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 10885 | 2025-02-21 |
ERK plays a conserved dominant role in pancreas cancer cell EMT heterogeneity driven by diverse growth factors and chemotherapies
2025-Feb-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.08.637251
PMID:39975093
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研究论文 | 本文通过结合迭代间接免疫荧光成像和互信息建模，研究了胰腺癌细胞中EMT异质性的信号蛋白水平 | 使用互信息建模预测了ERK在胰腺癌细胞EMT异质性中的主导作用，并发现JNK在MEK抑制时的补偿作用 | 单细胞转录组学仅限于基于本体的间接推断，细胞群体水平的研究存在固有困难 | 研究胰腺癌细胞中EMT异质性的信号通路，以促进化疗反应 | 胰腺癌细胞和肿瘤 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 迭代间接免疫荧光成像，互信息建模 | 互信息模型 | 蛋白质测量数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10886 | 2025-02-21 |
NEAT1-mediated regulation of proteostasis and mRNA localization impacts autophagy dysregulation in Rett syndrome
2025-Feb-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf074
PMID:39970285
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研究论文 | 本文研究了长链非编码RNA NEAT1在MeCP2缺陷背景下对Rett综合征（RTT）中蛋白质稳态和mRNA定位的调控作用及其对自噬失调的影响 | 揭示了NEAT1在MeCP2功能中的关键作用，特别是通过RNA-RNA相互作用调控自噬基因的表达和亚细胞定位，从而影响自噬复合物的生物发生 | 研究主要基于人类神经细胞和RTT患者样本，可能无法完全反映体内复杂环境 | 探讨NEAT1在MeCP2缺陷导致的Rett综合征中的作用机制 | 人类神经细胞和RTT患者样本 | 神经科学 | Rett综合征 | 单细胞RNA测序和分子分析 | NA | RNA测序数据 | 人类神经细胞和RTT患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 10887 | 2025-02-21 |
Hepatic Arterial Flow-Induced Portal Tract Fibrosis in Portal Hypertension: The Role of VCAM-1 and Osteopontin-Expressing Macrophages
2025-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.31.634947
PMID:39975181
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研究论文 | 本研究探讨了门静脉高压症中肝动脉血流诱导的门管区纤维化的分子机制，特别是VCAM-1和表达骨桥蛋白的巨噬细胞的作用 | 揭示了肝动脉血流增加通过VCAM-1和Spp1+巨噬细胞介导的门管区纤维化的新机制 | 研究主要基于大鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 研究门静脉高压症中肝动脉血流诱导的门管区纤维化的分子机制 | Sprague-Dawley大鼠 | 病理生理学 | 门静脉高压症 | microCT、单细胞RNA测序、RNA-FISH | NA | 图像、转录组数据 | Sprague-Dawley大鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 10888 | 2025-02-21 |
Hypoxia-induced histone methylation and NF-κB activation in pancreas cancer fibroblasts promote EMT-supportive growth factor secretion
2025-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.30.635486
PMID:39974981
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研究论文 | 本文研究了胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中缺氧诱导的组蛋白甲基化和NF-κB激活如何促进癌症相关成纤维细胞（CAFs）分泌支持上皮-间质转化（EMT）的生长因子 | 揭示了缺氧条件下CAFs通过IGF-2和HGF促进PDAC癌细胞EMT的机制，并发现活性氧激活的NF-κB与缺氧依赖性组蛋白甲基化共同作用促进这些生长因子的表达 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体中进行验证 | 探讨缺氧条件下CAFs如何通过生长因子介导的细胞间通讯促进PDAC癌细胞的EMT | 胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）和癌细胞 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组分析、抑制剂筛选 | NA | 转录组数据、小鼠模型数据 | 患者肿瘤样本和小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 10889 | 2025-02-21 |
Identification of High-Risk Cells in Single-Cell Spatially Resolved Transcriptomics Data Using Deep Transfer Learning
2025-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.30.635803
PMID:39975321
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DEGAS的深度迁移学习算法，用于在单细胞空间分辨转录组数据中识别高风险细胞和区域 | DEGAS算法通过基因表达数据的潜在表示和领域适应，将疾病属性从患者转移到单个细胞，解决了现有方法无法将单个细胞与疾病属性关联的问题 | NA | 识别单细胞空间分辨转录组数据中的高风险细胞和区域，以深入了解特定疾病过程 | 肿瘤样本中的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 深度迁移学习 | 单细胞空间分辨转录组数据 | 包括10X Genomics Xenium和Nanostring CosMx平台的数据，以及新生成的T2D Xenium数据集和公开的黑色素瘤Xenium数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 10890 | 2025-02-21 |
FastCCC: A permutation-free framework for scalable, robust, and reference-based cell-cell communication analysis in single cell transcriptomics studies
2025-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.27.635115
PMID:39975391
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研究论文 | 本文介绍了FastCCC，一种无需排列的框架，用于在单细胞转录组学研究中实现可扩展、稳健且基于参考的细胞间通讯分析 | FastCCC采用快速傅里叶变换卷积计算p值，无需排列，引入模块化代数操作框架捕捉广泛的细胞间通讯模式，并能利用大规模单细胞参考数据增强用户收集数据集的细胞间通讯分析 | NA | 开发一种新的方法来检测单细胞转录组学研究中的细胞间通讯，以理解多细胞生物的功能 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | 快速傅里叶变换卷积 | 单细胞转录组数据 | 约1600万细胞，涵盖19种不同组织类型和450多种独特细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 10891 | 2025-02-21 |
FastTENET: an accelerated TENET algorithm based on manycore computing in Python
2024-11-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae699
PMID:39570606
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研究论文 | 本文提出了一种基于多核计算的加速版TENET算法，称为FastTENET，用于从单细胞RNA测序数据中重建基因调控网络 | FastTENET通过数组计算优化了TENET算法，使其在多核处理器（如GPU）上加速，性能提升高达973倍 | 尽管FastTENET显著提升了计算速度，但其性能提升依赖于硬件（如GPU）的支持 | 解决TENET算法在处理大规模单细胞RNA测序数据时计算时间过长的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | TENET算法 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10892 | 2025-02-21 |
Microfluidic Chip-Based Automatic System for Sequencing Patient-Derived Organoids at the Single-Cell Level
2024-10-22, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c05111
PMID:39399894
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于微流控芯片的自动系统MASSO，用于在单细胞水平上对患者来源的类器官进行测序 | MASSO系统通过在单一微流控芯片上执行所有必要步骤，避免了珍贵PDO的损失，并确保了单PDO细胞的全基因组扩增的高质量，自动化操作过程消除了人为错误，提高了数据重复性 | NA | 解决现有单细胞测序技术在处理临床组织样本来源的PDO时效率低下的问题 | 患者来源的类器官（PDOs） | 数字病理学 | 肺癌 | 全基因组测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10893 | 2025-02-21 |
DEPICT-seq: Single-Cell Transcriptomic Analysis of Rare Cell Subsets Isolated via Nucleic Acid Cytometry
2024-10-15, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c03075
PMID:39287475
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DEPICT-seq的高通量液滴核酸细胞计数方法，用于分离和分析基于核酸标记的稀有细胞亚群 | DEPICT-seq方法结合了批量细胞固定、双乳液数字PCR细胞分选和单细胞分辨率下的全长转录组分析，能够针对感兴趣的核酸标记进行细胞分选和转录组分析 | NA | 开发一种能够深入分析稀有细胞亚群的方法，以理解组织生理学和病理学 | 稀有细胞亚群，特别是T细胞受体（TCR）工程化的T细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 双乳液数字PCR、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10894 | 2025-02-21 |
Correlation of LLT-1 and NLRC4 inflammasome and its effect on glioblastoma prognosis
2024-Sep, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-024-04750-y
PMID:38907949
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研究论文 | 本研究探讨了LLT-1与NLRC4炎症小体在胶质母细胞瘤（GBM）组织中的表达及其相互作用，揭示了它们与肿瘤恶性程度和预后的潜在关联 | 揭示了LLT-1与NLRC4炎症小体在GBM中的共表达及其与肿瘤炎症和进展的潜在关联，提出了新的NK细胞介导的抗胶质瘤途径 | 研究样本量相对较小，且主要基于中国人群数据，可能限制了结果的普适性 | 探讨LLT-1与NLRC4炎症小体在GBM中的表达及其相互作用，以揭示其与肿瘤恶性程度和预后的关联 | 胶质母细胞瘤（GBM）组织 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序（RNA-seq）、免疫荧光实验、单细胞RNA测序分析 | NA | RNA-seq数据、免疫荧光图像 | 296名患者来自中国胶质瘤基因组图谱，52名患者来自CHA医疗记录 | NA | NA | NA | NA |
| 10895 | 2025-10-07 |
OneSC: A computational platform for recapitulating cell state transitions
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.31.596831
PMID:38895453
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研究论文 | 开发了一个用于模拟细胞状态转换的计算平台OneSC | 不同于当前网络推断方法，OneSC优先生成能够产生忠实细胞状态转换和稳定细胞状态的布尔网络 | NA | 开发计算平台以在计算机中模拟细胞状态转换 | 小鼠骨髓祖细胞及其分化轨迹 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机微分方程系统，布尔网络 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10896 | 2025-10-07 |
The transcription factor Aiolos restrains the activation of intestinal intraepithelial lymphocytes
2024-Jan, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01693-w
PMID:38049581
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子Aiolos通过调控肠道上皮内淋巴细胞活化来限制其效应功能 | 首次发现Aiolos作为IELs活化的调节因子，并阐明其通过影响IL-15信号通路和染色质可及性来调控效应功能 | Ikzf3缺陷仅部分解释观察到的表型，表明存在其他调控机制 | 探究Aiolos在肠道上皮内淋巴细胞活化调控中的作用机制 | 小鼠肠道上皮内淋巴细胞 | 免疫学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序，染色质可及性分析，组蛋白乙酰化检测 | NA | 基因表达数据，表观遗传数据 | Ikzf3+/+和Ikzf3-/-小鼠IELs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10897 | 2025-10-07 |
A single-cell analysis of thymopoiesis and thymic iNKT cell development in pigs
2022-07-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111050
PMID:35793622
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建青春期早期猪胸腺细胞图谱，揭示猪胸腺细胞生成和iNKT细胞发育特征 | 首次建立猪胸腺单细胞图谱，发现猪iNKT细胞功能多样性显著不同于小鼠的iNKT0/1/2/17亚群分化模式 | 仅针对早期青春期猪胸腺进行研究，其他发育阶段和组织的免疫特征仍需探索 | 表征猪免疫系统特征，为改善猪健康和作为临床前模型提供基础 | 青春期早期猪胸腺细胞 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过11,000个分化中的iNKT细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10898 | 2025-10-07 |
Immunostimulatory Cancer-Associated Fibroblast Subpopulations Can Predict Immunotherapy Response in Head and Neck Cancer
2022-05-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-3570
PMID:35262677
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定头颈癌中免疫刺激性癌症相关成纤维细胞亚群及其对免疫治疗反应的预测价值 | 首次在头颈癌中识别出能够预测PD-1抑制剂反应的特定癌症相关成纤维细胞亚群，并揭示其功能机制 | 样本量较小（4例患者进行单细胞测序），需要更大规模研究验证 | 研究癌症相关成纤维细胞亚群在头颈癌免疫治疗反应中的作用机制 | 头颈鳞状细胞癌患者肿瘤组织 | 单细胞转录组学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序，体外共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据，批量转录组数据 | 4例患者治疗前后配对样本（单细胞测序），28例患者队列（批量转录组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10899 | 2025-10-07 |
Recent advances in spatially resolved transcriptomics: challenges and opportunities
2022-Mar, BMB reports
IF:2.9Q3
PMID:35168703
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综述 | 本文综述空间分辨转录组学技术的最新进展、挑战与机遇 | 系统比较成像技术与捕获技术的特点，强调整合计算方法在克服技术局限性中的关键作用 | NA | 探讨空间转录组学技术的发展现状及其在生物医学研究中的应用潜力 | 空间转录组学技术及其在组织分析中的应用 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间信息 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 成像技术（单分子分辨率）, 捕获技术（55-100 μm分辨率） |
| 10900 | 2025-10-07 |
The pancreatic tumor microenvironment of treatment-naïve patients causes a functional shift in γδ T cells, impairing their anti-tumoral defense
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2466301
PMID:39945298
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研究论文 | 本研究探讨胰腺导管腺癌肿瘤微环境对γδ T细胞功能的抑制作用 | 首次使用治疗初治患者的类器官条件培养基证明PDAC肿瘤微环境导致γδ T细胞功能转变 | 样本量有限，主要依赖体外实验验证 | 研究胰腺癌肿瘤微环境如何影响γδ T细胞的抗肿瘤功能 | 治疗初治胰腺导管腺癌患者的γδ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,类器官培养 | NA | 流式细胞数据,单细胞转录组数据 | 治疗初治PDAC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |