单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27967 篇文献，本页显示第 10881 - 10900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10881 | 2024-08-05 |
Reconstructing differentiation networks and their regulation from time series single-cell expression data
2018-Mar-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.225979.117
PMID:29317474
|
研究论文 | 本研究开发了一种方法，通过整合表达相似性与调控信息来重建动态的发育细胞轨迹 | 该方法不仅考虑了基因表达水平的相似性，还整合了转录因子的调控信息以改善细胞谱系重建 | 该方法在样本多样性、不同步的细胞种群中可能表现不佳 | 旨在通过单细胞RNA测序数据生成详细准确的器官发生模型 | 主要研究小鼠肺部发育数据中的细胞类型和谱系 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq | 概率模型 | 单细胞表达数据 | 涉及小鼠肺部发育数据的实验数据 |
| 10882 | 2024-08-05 |
Lysosomal dysfunction-derived autophagy impairment of gingival epithelial cells in diabetes-associated periodontitis with altered protein acetylation
2024-Sep, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111273
PMID:38950874
|
研究论文 | 本研究探讨了糖尿病相关性牙周炎中牙龈上皮细胞的自噬障碍和溶酶体功能失调之间的关系 | 揭示了高葡萄糖条件下溶酶体功能受损会阻碍自噬通量，从而加重牙龈上皮细胞的炎症反应 | 未明确展示临床治疗效果或长时间的观察研究数据 | 阐明糖尿病相关性牙周炎中牙龈上皮细胞的超炎症反应机制 | 研究对象为糖尿病相关性牙周炎患者的牙龈上皮细胞 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、免疫组化分析、蛋白质组学分析 | NA | 细胞样本 | 研究了来自糖尿病相关性牙周炎患者的临床牙龈上皮样本 |
| 10883 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis of single cell and bulk RNA sequencing reveals the heterogeneity of melanoma tumor microenvironment and predicts the response of immunotherapy
2024-Aug, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01905-5
PMID:38896289
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研究论文 | 本文综合分析了黑色素瘤肿瘤微环境的异质性，并预测了免疫治疗的反应。 | 提出了一种新的预测生物标志物，揭示了黑色素瘤肿瘤微环境的异质性。 | 未提及特定的样本数量和多样性，可能影响结果的普遍适用性 | 研究黑色素瘤的肿瘤微环境异质性及其对免疫治疗反应的预测能力。 | 分析了来自两位黑色素瘤患者的单细胞测序数据。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序及批量RNA测序 | 机器学习模型 | 基因组数据 | 分析了两位黑色素瘤患者的单细胞测序数据 |
| 10884 | 2024-08-04 |
scDrug+: predicting drug-responses using single-cell transcriptomics and molecular structure
2024-Aug, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2024.117070
PMID:38964180
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研究论文 | 本文介绍了scDrug+，一个利用单细胞转录组和药物分子结构预测药物反应的综合管道 | scDrug+能够通过分析新药的分子结构来预测响应，这是一个新颖的研究方向 | 对新发现药物的反应预测研究仍然稀缺 | 研究如何基于单细胞转录组预测药物反应，以推动精准医学 | 研究对象为药物反应及其与转录组特征的关系 | 计算机视觉 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 10885 | 2024-08-05 |
Single-cell insights into mouse testicular toxicity under peripubertal exposure to di(2-ethylhexyl) phthalate
2024-Aug-01, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfae064
PMID:38730545
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研究论文 | 本文首次揭示了小鼠青春期接触环境污染物DEHP后睾丸的单细胞转录组特征 | 研究中首次使用单细胞RNA测序技术分析DEHP暴露对小鼠睾丸的影响 | 研究主要基于小鼠模型，尚需进一步验证结果在其他物种中的适用性 | 探索DEHP在青春期对小鼠睾丸发育的影响及其细胞机制 | 主要研究对象为幼鼠的睾丸及其相关细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 每组8只3周龄的小鼠 |
| 10886 | 2024-08-05 |
CD8+ T Cells Drive Plaque Smooth Muscle Cell Dedifferentiation in Experimental Atherosclerosis
2024-Aug, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320084
PMID:38868941
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研究论文 | 本研究探讨了CD8+ T细胞在既存动脉粥样硬化中对平滑肌细胞的影响 | 发现CD8+ T细胞能够调控平滑肌细胞的表型，促进其去分化并诱导表现出巨噬细胞样和成骨细胞样特征 | 研究未能检测到动脉粥样硬化病灶大小的差异 | 明确CD8+ T细胞在进展性动脉粥样硬化中的作用 | 研究对象为既有动脉粥样硬化病灶的低密度脂蛋白受体缺失小鼠及其平滑肌细胞 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 既有动脉粥样硬化病灶的Ldlr-/-小鼠和初代主动脉平滑肌细胞 |
| 10887 | 2024-08-05 |
Heterogeneous fibroblasts contribute to fibrotic scar formation after spinal cord injury in mice and monkeys
2024-Jul-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50564-x
PMID:39060269
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研究论文 | 这篇文章揭示了脊髓损伤后纤维化瘢痕中成纤维细胞的异质性。 | 这项研究首次通过谱系追踪和单细胞RNA测序展示了成纤维细胞在脊髓损伤后纤维化瘢痕中的分布、起源和功能差异。 | 该研究集中于小鼠和雌性猴子模型，可能在其他物种或人类中不具普遍性。 | 研究脊髓损伤后纤维化瘢痕形成过程中成纤维细胞的异质性。 | 研究对象为小鼠和雌性猴子模型中的成纤维细胞。 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | 小鼠和雌性猴子中多个成纤维细胞亚型 |
| 10888 | 2024-08-05 |
PPAR-γ/NF-kB/AQP3 axis in M2 macrophage orchestrates lung adenocarcinoma progression by upregulating IL-6
2024-Jul-26, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06919-9
PMID:39060229
|
研究论文 | 这项研究探讨了AQP3在肺腺癌中的作用及机制 | 本研究首次揭示了AQP3通过PPAR-γ/NF-κB轴在M2巨噬细胞极化中的重要作用 | 研究中仅涉及5名肺腺癌患者，样本量较小 | 探讨AQP3在肿瘤微环境中对肺腺癌进展的影响 | 研究对象为肺腺癌患者及相关的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 小鼠模型 | 生物样本 | 5名肺腺癌患者的免疫细胞 |
| 10889 | 2024-08-05 |
Preclinical efficacy of peanut-specific IgG4 antibody therapeutic IGNX001
2024-Jul-26, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.07.014
PMID:39069172
|
研究论文 | 本文开发了一种具有说服力的花生特异性IgG4抗体治疗方法 | 利用来自过敏个体的人类IgE单克隆抗体的多样性开发了新的IgG4抗体治疗 | 目前研究仅在小鼠模型中进行，临床效果尚需进一步验证 | 研究一种能够迅速提供保护的花生过敏治疗方法 | 研究花生过敏个体的IgE单克隆抗体及其转化为IgG4抗体的效果 | NA | 花生过敏 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 全血样本 | 来自多个不同人群的过敏个体的全血样本 |
| 10890 | 2024-08-04 |
Open-ST: High-resolution spatial transcriptomics in 3D
2024-Jul-25, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.05.055
PMID:38917789
|
研究论文 | 本文介绍了一种开放源代码的高分辨率3D空间转录组学方法Open-ST | Open-ST提供了一种易于使用、高分辨率、成本效益高且可扩展到3D的空间转录组学方法 | NA | 研究组织在2D和3D中的分子组织 | 小鼠大脑、头颈部肿瘤及患者匹配的健康/转移性淋巴结 | 数字病理学 | NA | 测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠大脑和头颈部肿瘤样本，以及患者匹配的淋巴结 |
| 10891 | 2024-08-05 |
Cytotoxic Lymphocyte-Monocyte Complex Reflects the Dynamics of Coronavirus Disease 2019 Systemic Immune Response
2024-Jul-25, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiae048
PMID:39052699
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研究论文 | 本研究揭示了在外周血中由CD14+单核细胞与不同的细胞毒性淋巴细胞形成的异质性细胞复合体。 | 该研究首次描述了SARS-CoV-2特异性免疫反应中细胞间相互作用的复杂性。 | 本文未讨论细胞相互作用的长期后果及其对其他疾病的影响。 | 探究新冠病毒感染中细胞免疫反应的动态变化。 | 重点研究CD14+单核细胞与SARS-CoV-2特异性细胞毒性淋巴细胞之间的相互作用。 | 数字病理学 | 冠状病毒病 | 单细胞RNA测序和成像流式细胞术分析 | NA | 血液样本 | NA |
| 10892 | 2024-08-05 |
Unveiling the Potential of Migrasomes: A Machine-Learning-Driven Signature for Diagnosing Acute Myocardial Infarction
2024-Jul-22, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12071626
PMID:39062199
|
研究论文 | 本文揭示了迁移体在急性心肌梗死诊断中的潜在作用。 | 本研究采用机器学习框架建立了迁移体相关的预测标志，并揭示了其在急性心肌梗死中的生物机制。 | 目前关于迁移体在急性心肌梗死中的诊断意义仍需进一步探索。 | 本研究旨在探讨迁移体在急性心肌梗死中的诊断价值和生物机制。 | 急性心肌梗死（AMI）相关的迁移体及其基因表达。 | 机器学习 | 心血管疾病 | 机器学习, 单细胞RNA测序 | Stepglm, Lasso | 基因表达数据 | 五个独立的AMI队列共113个机器学习组合 |
| 10893 | 2024-08-04 |
FGF Signaling Regulates Development of the Anterior Fontanelle
2024-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.14.603452
PMID:39071418
|
研究论文 | 本研究探讨了FGF信号如何调控前囟的发育. | 揭示了FGF-WNT信号回路在前囟发育中的区域差异及其与缝合关节形成的关系. | 尚未探讨FGF信号对其他类型缝合的影响. | 研究FGF信号在出生后前囟闭合及其转变为额缝合中的作用. | 使用小鼠基因组学和单细胞转录组学重点分析前囟的细胞. | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞数据 | 小鼠 |
| 10894 | 2024-08-04 |
Characterization of Multicellular Niches Supporting Hematopoietic Stem Cells Within Distinct Zones
2024-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.28.601225
PMID:39071430
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研究论文 | 本研究调查了胎肝中的造血干细胞微环境，揭示了两种不同的细胞生态位 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了造血干细胞的多细胞生态位，改变了以往单细胞模型的理解 | 该研究主要集中在胎肝领域，可能不完全适用于其他环境或成人生理状态 | 研究造血干细胞在不同微环境中的调节机制 | 胎肝和成人骨髓中的造血干细胞及其支持微环境 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 胎肝与成人骨髓中的多种细胞成分 |
| 10895 | 2024-08-05 |
Controlled Noise: Evidence of epigenetic regulation of Single-Cell expression variability
2024-Jul-17, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae457
PMID:39018178
|
研究论文 | 本文研究了染色质可及性与单细胞表达变异性的关系 | 提出了一种创新性测试流程用于检测染色质可及性与单细胞表达变异性之间的关联 | 未提及具体的适用模型或其他细胞类型的验证 | 探讨染色质可及性如何影响单细胞表达的变异性 | 人类造血干细胞与前体细胞的单细胞多组学数据 | 数字病理学 | NA | scATAC-seq 和 scRNA-seq | NA | 单细胞多组学数据 | 配对的 scATAC-seq 和 scRNA-seq 数据 |
| 10896 | 2024-08-04 |
A second wave of Notch signaling diversifies the intestinal secretory lineage
2024-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.15.603542
PMID:39071399
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研究论文 | 本文研究了小肠特定分泌细胞的命运指定及其与Notch信号的关系 | 揭示了一种稀有分泌细胞类型CHEs是如何通过第二波Notch信号通路来区分其他分泌细胞类型的 | 未提及具体的临床样本或在人类以外的动物模型中的测试 | 探讨小肠分泌细胞的起源及其功能 | 主要研究CHEs这一稀有的肠道上皮细胞群体 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用来自大鼠小肠空肠的单细胞样本进行分析 |
| 10897 | 2024-08-04 |
Spatial Transcriptomics and Single-Nucleus Multi-omics Analysis Revealing the Impact of High Maternal Folic Acid Supplementation on Offspring Brain Development
2024-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.12.603269
PMID:39071367
|
研究论文 | 研究母体高叶酸补充对后代大脑发育的影响 | 首次揭示高母体叶酸补充对与神经发生和记忆相关的基因途径的影响 | 研究仅使用了小鼠模型，可能无法完全代表人类情况 | 探讨孕期高叶酸补充对后代大脑发育的影响 | 小鼠模型及其后代 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学和单核多组学分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 10898 | 2024-08-05 |
Ongoing genome doubling promotes evolvability and immune dysregulation in ovarian cancer
2024-Jul-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.11.602772
PMID:39071261
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研究论文 | 本研究展示了全基因组加倍（WGD）在卵巢癌肿瘤进化中的持续突变过程 | 通过单细胞全基因组测序，首次揭示了WGD如何促进细胞多样性和免疫损伤 | 本研究仅分析了65个高等级浆液性卵巢癌样本，可能存在样本代表性不足的问题 | 研究WGD在卵巢癌肿瘤进化中的作用及其对免疫系统的影响 | 65个来自40名患者的高等级浆液性卵巢癌组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞全基因组测序 | NA | 基因组，RNA测序 | 65个样本 |
| 10899 | 2024-08-05 |
The correlation between TRIM28 expression and immune checkpoints in CRPC
2024-Jul-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202400061RR
PMID:38958986
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研究论文 | 本研究探讨了TRIM28在去势耐药前列腺癌中的作用及其分子机制 | 首次揭示TRIM28在去势耐药前列腺癌中的抗肿瘤免疫作用及其通过cGAS-STING信号通路的潜在调控机制 | NA | 阐明TRIM28在去势耐药前列腺癌中的免疫调控作用 | 去势耐药前列腺癌中的TRIM28表达及其与免疫检查点的关系 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 高通量单细胞转录组测序 | TRIM28敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 10900 | 2024-08-04 |
Elucidating the Transcriptional States of Spermatogenesis-Joint Analysis of Germline and Supporting Cell, Mice and Human, Normal and Perturbed, Bulk and Single-Cell RNA-Seq
2024-Jul-12, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070840
PMID:39062554
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review | 这篇综述文章旨在综合分析精子发生的分子基础，探讨健康与病态状态下的差异 | 通过单细胞RNA测序等先进技术，发现了小鼠精子发育的新阶段及其调控因子 | 主要依赖已知的标记以及缺乏对某些关键基因的深入研究 | 更好地理解精子发生的基本生物过程，并识别可能导致男性不育的新基因 | 小鼠和人类的生殖细胞及支持细胞 | 数字病理学 | 男性不育 | scRNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 小鼠和人类样本的结合，具体数量未提供 |