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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 10861 - 10880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10861 | 2025-02-23 |
By integrating single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing, plasma cells signature and tertiary lymphoid structures were verified to contribute to outcome in lung adenocarcinoma
2025-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-1746
PMID:39974398
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，验证了浆细胞特征和三级淋巴结构在肺腺癌预后中的作用 | 结合单细胞RNA测序和批量RNA测序技术，首次系统性地探讨了浆细胞和三级淋巴结构在肺腺癌预后中的具体作用 | 研究主要依赖于公开数据库的数据，缺乏独立验证队列 | 探讨三级淋巴结构和浆细胞在肺腺癌预后中的作用 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据, 临床信息 | 来自GEO和TCGA数据库的肺腺癌患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 10862 | 2025-10-07 |
Mapping cell-cell fusion at single-cell resolution
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.627873
PMID:39896473
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研究论文 | 开发了一种名为CMDuo的分子工具平台，用于在单细胞水平上追踪和分析肿瘤细胞群体中的细胞融合事件 | 通过结合报告基因表达和工程化荧光相关索引序列与随机生成的核苷酸条形码，首次实现了对单个细胞融合事件起源和结果的高通量映射 | NA | 研究细胞融合在癌症进展和治疗反应中的作用 | 三阴性乳腺癌细胞 | 单细胞分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | CMDuo | ClonMapper Duo平台，结合报告基因表达和工程化荧光相关索引序列与随机生成的核苷酸条形码 |
| 10863 | 2025-10-07 |
HPV integration in head and neck cancer: downstream splicing events and expression ratios linked with poor outcomes
2025-Jan-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633627
PMID:39896613
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研究论文 | 本研究通过分析头颈癌样本的RNA测序数据，探讨HPV整合对剪接事件和基因表达比例的影响及其与临床预后的关联 | 首次基于RNA特征（HPV-人类融合转录本和HPV基因转录比例）对HPV整合阳性患者进行分类，并发现特定亚组患者临床预后较差 | 主要基于RNA分析而非DNA分析，样本量有限（102例HPV阳性参与者） | 研究HPV整合在头颈癌中的致癌机制及其与临床结局的关系 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 头颈癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 261例HPV相关HNSCC样本（包括bulk和单细胞RNA-seq），其中102例HPV阳性参与者的DNA整合事件 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10864 | 2025-10-07 |
Classifying cell cycle states and a quiescent-like G0 state using single-cell transcriptomics
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.16.589816
PMID:38659838
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研究论文 | 开发了一种高分辨率细胞周期分类器ccAFv2，用于单细胞转录组数据中细胞周期状态和静止样G0状态的分类 | 能够区分六个细胞周期状态和一个静止样G0状态，并包含可调参数过滤不确定分类，在分类更多状态的同时性能优于或相当于现有方法 | G0、G1和Late G1状态在神经上皮细胞类型中表现良好，但在其他细胞类型中准确性较低 | 开发高精度的细胞周期状态分类工具 | 人类神经干细胞及来自三个胚层的各种细胞类型 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 细胞周期分类器 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10865 | 2025-10-07 |
Piscis: a novel loss estimator of the F1 score enables accurate spot detection in fluorescence microscopy images via deep learning
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.31.578123
PMID:38352551
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研究论文 | 提出了一种名为Piscis的深度学习算法，通过新型SmoothF1损失函数实现荧光显微镜图像中RNA斑点的自动检测 | 开发了SmoothF1损失函数，可近似F1分数并直接惩罚假阳性和假阴性，同时保持可微性以用于深度学习训练 | NA | 开发无需手动参数调优的自动斑点检测算法，用于空间转录组学图像分析 | RNA FISH荧光显微镜图像中的转录本斑点 | 计算机视觉 | NA | RNA FISH，空间转录组学，深度学习 | 深度学习算法 | 荧光显微镜图像 | 358张手动标注的实验RNA FISH图像和240张合成图像 | NA | 空间转录组学，单分子RNA荧光原位杂交 | NA | NA |
| 10866 | 2025-10-07 |
Dimensionality reduction for visualizing spatially resolved profiling data using SpaSNE
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf002
PMID:39960663
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研究论文 | 开发了一种名为SpaSNE的空间感知降维方法，用于可视化空间分辨分析数据 | 首次将空间信息整合到t-SNE降维方法中，专门针对空间分辨分析数据设计 | NA | 开发适用于空间分辨分析数据的降维和可视化方法 | 空间分辨分析数据 | 空间转录组学 | NA | 空间分辨分析技术 | t-SNE, UMAP, SpaSNE | 空间分子数据 | 多个公共数据集，涵盖不同疾病、组织和细胞类型 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单分子荧光原位杂交 | Visium, STARmap, MERFISH | 10x Visium空间转录组平台 |
| 10867 | 2025-10-07 |
Exploring the cellular and molecular basis of murine cardiac development through spatiotemporal transcriptome sequencing
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf012
PMID:39960664
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研究论文 | 利用空间转录组测序技术探索小鼠心脏发育过程并构建早期心脏发育的时空细胞图谱 | 首次构建了小鼠早期心脏发育的全面时空细胞图谱，揭示了心脏细胞谱系的空间组织和关键基因动态变化 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类或其他物种中验证 | 探索小鼠心脏发育的细胞和分子基础 | 小鼠心脏发育过程 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10868 | 2025-02-23 |
The landscape of cell regulatory and communication networks in the human dental follicle
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1535245
PMID:39974190
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人类牙囊的细胞组成和调控网络，揭示了牙囊在发育和生物学功能中的复杂调控机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术全面解析了人类牙囊的细胞组成和基因调控网络，揭示了血管和免疫细胞在牙囊生物学活动中的相互作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能缺乏对蛋白质水平和功能验证的深入分析 | 揭示人类牙囊的细胞组成和调控机制，以理解其在牙周组织发育和生物学功能中的作用 | 人类牙囊 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10869 | 2025-02-23 |
Research hotspots and frontiers in the tumor microenvironment of colorectal cancer: a bibliometric study from 2014 to 2024
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1525280
PMID:39975599
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研究论文 | 本文通过文献计量学方法分析了2014年至2024年间结直肠癌肿瘤微环境的研究现状、热点和未来趋势 | 首次对2014年至2024年间结直肠癌肿瘤微环境的研究进行文献计量分析，揭示了该领域的研究热点和未来趋势 | 研究仅基于Web of Science核心合集数据库，可能未涵盖所有相关文献 | 提供结直肠癌肿瘤微环境领域的当前研究状态、热点和未来趋势的全面图景 | 结直肠癌肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 748篇出版物 | NA | NA | NA | NA |
| 10870 | 2025-10-07 |
Failure of metabolic checkpoint control during late-stage granulopoiesis drives neutropenia in reticular dysgenesis
2024-Dec-26, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024123
PMID:39378586
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析网状发育不全患者样本和CRISPR模型，揭示了线粒体腺苷酸激酶2功能缺失导致中性粒细胞减少症的代谢调控机制 | 首次发现代谢检查点在造血不同阶段的差异调控作用，揭示了AK2缺陷在粒细胞生成晚期导致mTOR信号异常激活和代谢失衡的新机制 | 研究主要基于体外模型和患者样本，缺乏体内功能验证实验 | 探究网状发育不全综合征中代谢检查点调控失常导致中性粒细胞减少的分子机制 | 人类造血干细胞、粒细胞前体细胞、网状发育不全患者样本 | 单细胞生物学 | 免疫缺陷综合征 | 单细胞转录组测序, CRISPR基因编辑 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 网状发育不全患者样本和原代人类造血干细胞CRISPR模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10871 | 2025-10-07 |
Genetic inference and single cell expression analysis of potential targets in heart failure and breast cancer
2024-Oct-26, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-06010-y
PMID:39460820
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研究论文 | 通过遗传推断和单细胞表达分析探索心力衰竭与乳腺癌的潜在遗传靶点 | 整合全基因组关联研究、单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法，首次系统揭示ITM2B基因在乳腺癌中的功能作用 | 研究样本量未明确说明，体外实验仅针对MCF7细胞系，缺乏体内验证 | 探索心力衰竭和乳腺癌的潜在遗传靶点并验证其因果关系 | 心力衰竭和乳腺癌相关的遗传变异及ITM2B基因 | 生物信息学 | 乳腺癌,心血管疾病 | GWAS, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 免疫荧光 | NA | 基因组数据, 单细胞表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10872 | 2025-10-07 |
Astrocytes Modulate a Specific Paraventricular Thalamus→Prefrontal Cortex Projection to Enhance Consciousness Recovery from Anesthesia
2024-Aug-21, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1808-23.2024
PMID:38926088
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研究论文 | 本研究揭示了星形胶质细胞通过调控丘脑室旁核→前额叶皮层特定神经通路促进七氟醚麻醉后意识恢复的新机制 | 首次发现星形胶质细胞Kir4.1通道在麻醉恢复中的关键作用，并鉴定出丘脑室旁核中两种不同的谷氨酸能神经元亚型 | 研究仅使用雄性小鼠模型，未验证在雌性动物中的适用性；机制研究主要集中于PVT-mPFC通路 | 探索星形胶质细胞在麻醉后意识恢复中的调控机制 | 雄性小鼠的丘脑室旁核星形胶质细胞和谷氨酸能神经元 | 神经科学 | 麻醉相关意识障碍 | 单细胞RNA测序,电生理记录,膜片钳技术 | 动物模型 | 基因表达数据,电生理数据 | 雄性小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10873 | 2025-10-07 |
Trem2 Agonist Reprograms Foamy Macrophages to Promote Atherosclerotic Plaque Stability-Brief Report
2024-07, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.320797
PMID:38695172
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研究论文 | 本研究探讨Trem2激动剂抗体AL002a通过重编程泡沫巨噬细胞功能来促进动脉粥样硬化斑块稳定性 | 首次证明Trem2激动剂治疗可通过改变泡沫巨噬细胞转录组来改善斑块稳定性，而非单纯减少斑块负荷 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类中验证；治疗时间相对较短 | 测试Trem2激动剂抗体是否能通过增强巨噬细胞存活和减少坏死核心形成来改善动脉粥样硬化斑块稳定性 | 动脉粥样硬化易感小鼠(Ldlr-/-)和泡沫巨噬细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，体外功能验证 | NA | 基因表达数据，组织学数据 | 动脉粥样硬化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10874 | 2025-10-07 |
Pharmacological suppression of the OTUD4/CD73 proteolytic axis revives antitumor immunity against immune-suppressive breast cancers
2024-Mar-26, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176390
PMID:38530357
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现OTUD4/CD73蛋白水解轴是治疗免疫抑制性三阴性乳腺癌的潜在靶点，并开发了特异性抑制剂ST80 | 首次揭示OTUD4通过去泛素化稳定CD73的机制，开发了特异性抑制剂ST80，并证明其能增强抗PD-L1疗法的效果 | 研究主要基于临床前模型，尚未进行人体临床试验 | 开发针对免疫抑制性乳腺癌的新型免疫治疗策略 | 三阴性乳腺癌(TNBC)及其肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 多组学分析，空间转录组学，实验验证 | NA | 多组学数据，空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10875 | 2025-10-07 |
Steatosis drives monocyte-derived macrophage accumulation in human metabolic dysfunction-associated fatty liver disease
2023-Nov, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100877
PMID:37869071
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研究论文 | 本研究探讨了代谢功能障碍相关脂肪肝病中巨噬细胞异质性与肝脏脂肪变性的关系 | 首次在人类MAFLD中系统描述巨噬细胞亚群组成，发现单核细胞源性巨噬细胞与肝脏脂肪变性程度相关，并揭示其在脂质摄取中的独特作用 | 样本量较小（n=21），单细胞RNA测序仅对3个样本进行，缺乏长期随访数据 | 研究人类MAFLD早期阶段巨噬细胞异质性及其与肝脏脂肪变性的关系 | 接受减重手术的21名参与者的肝组织样本及小鼠肝脂肪变性模型 | 单细胞生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫荧光，H&E显微镜，MRI，电子显微镜 | NA | 基因表达数据，图像数据，临床数据 | 21名人类参与者，其中3个样本进行单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10876 | 2025-10-07 |
Spatial and single-nucleus transcriptomic analysis of genetic and sporadic forms of Alzheimer's Disease
2023-Jul-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.24.550282
PMID:37546983
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研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞核RNA测序分析阿尔茨海默病的遗传性和散发性形式 | 首次结合空间转录组学和单细胞核RNA测序技术，同时研究散发性AD和唐氏综合征相关AD，并进行跨物种比较 | 样本数量未明确说明，研究主要聚焦于早期和晚期AD阶段 | 探索阿尔茨海默病的转录组特征及其在空间和细胞类型水平的变化 | 人类皮质样本（早期AD、晚期AD、唐氏综合征相关AD）和5xFAD转基因小鼠模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，单细胞核RNA测序，淀粉样斑块成像 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据，影像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10877 | 2025-10-07 |
SEC-seq: association of molecular signatures with antibody secretion in thousands of single human plasma cells
2023-06-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39367-8
PMID:37322036
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研究论文 | 开发了一种名为SEC-seq的新方法，能够在单细胞水平上将抗体分泌量与表面标志物和转录组信息关联 | 利用含腔水凝胶纳米小瓶捕获细胞分泌物，首次实现了在数千个单个人类浆细胞中同时分析IgG分泌量、表面标志物和转录组 | NA | 建立分泌功能与分子特征关联的分析方法 | 人类B细胞和浆细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术,成像流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质分泌数据,表面标志物数据 | 数千个单个人类浆细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | SEC-seq（分泌组关联单细胞测序） |
| 10878 | 2025-10-07 |
Integrative analysis of bulk RNA and single-cell sequencing data reveals a liquid-liquid phase separation signature for clear cell renal cell carcinoma
2025-Apr-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149313
PMID:39921047
|
研究论文 | 本研究通过整合分析bulk RNA和单细胞测序数据，建立了一个基于液-液相分离相关基因的透明细胞肾细胞癌预后和免疫治疗反应预测标志 | 首次构建了基于液-液相分离相关基因的ccRCC预后特征，并验证了其与免疫浸润、免疫治疗反应的关系 | NA | 建立透明细胞肾细胞癌的预后和免疫治疗反应预测标志 | 透明细胞肾细胞癌患者和细胞 | 生物信息学 | 肾癌 | bulk RNA测序, 单细胞测序 | 单变量Cox回归, LASSO算法 | 基因表达数据 | TCGA数据库中的ccRCC样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 10879 | 2025-10-07 |
Proliferation of renal macrophage via MR/CSF1 pathway induced with aldosterone and inhibited by esaxerenone
2025-Mar-06, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114208
PMID:39923576
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研究论文 | 本研究探讨醛固酮通过MR/CSF1通路诱导肾脏巨噬细胞增殖的机制及其抑制剂的影响 | 首次揭示醛固酮诱导的肾脏巨噬细胞增殖主要来源于驻留巨噬细胞且以M1亚型为主，并阐明MR/CSF1通路的关键调控作用 | 巨噬细胞的高度可塑性和异质性使得增殖细胞的起源和亚型仍存在部分不明确之处 | 探究醛固酮诱导的肾脏巨噬细胞增殖机制及治疗策略 | 肾脏巨噬细胞 | 病理生理学 | 肾脏疾病 | 免疫荧光、流式细胞术、单细胞测序 | NA | 细胞图像、流式数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10880 | 2025-10-07 |
A comprehensive pan-cancer examination of transcription factor MAFF: Oncogenic potential, prognostic relevance, and immune landscape dynamics
2025-Mar-06, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114105
PMID:39923580
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研究论文 | 通过多组学方法对转录因子MAFF进行泛癌分析，评估其致癌潜力、预后价值和免疫景观动态 | 首次对MAFF进行全面的泛癌分析，整合转录组、蛋白质、单细胞和空间转录组数据，探索其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 系统评估MAFF在多种癌症中的表达模式、预后价值和免疫调控作用 | 多种癌症类型的肿瘤组织和正常组织 | 生物信息学 | 泛癌分析 | 转录组分析、单细胞分析、空间转录组、分子对接 | Cox回归分析、Spearman相关分析、GSEA、GSVA | 转录组数据、蛋白质数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 来自GDC和UCSC XENA数据库的多癌种样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 转录组测序 | NA | NA |