单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27986 篇文献，本页显示第 10861 - 10880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10861 | 2024-08-04 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing revealed an epigenetic signature predicts prognosis and tumor microenvironment colorectal cancer heterogeneity
2024-Jul-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v16.i7.3032
PMID:39072180
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研究论文 | 本研究建立了一种能够预测结直肠癌预后的表观遗传标记 | 研究中的标记在不同数据集中经过验证，显示出良好的预后预测能力 | 该研究未提到样本的种类和数量的详细信息 | 研究的目标是构建一个稳健的结直肠癌预后标记 | 研究对象为结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq | NA | 基因组和转录组数据 | 使用了TCGA队列和六个独立数据集 |
| 10862 | 2024-08-05 |
Single cell transcriptomic analysis reveals tumor immune infiltration by NK cells gene signature in lung adenocarcinoma
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33928
PMID:39071697
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了肺腺癌中NK细胞的肿瘤免疫浸润特征 | 引入了NK基因特征分数（NKGS），用于区分NK1和NK2细胞 | 研究可能受到样本量和数据集的限制 | 了解肺腺癌中NK细胞的多样性特征 | 主要研究肺腺癌中的NK细胞群体 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归 | 基因表达数据 | 多个初级肺癌（MPLC）数据集中的样本 |
| 10863 | 2024-08-05 |
Constructing an immune-related prognostic signature for predicting prognosis and immune response in hepatocellular carcinoma
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e34012
PMID:39071637
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研究论文 | 本研究旨在建立一个与免疫相关的肝细胞癌预后模型 | 首次在肝细胞癌中建立了一个免疫相关的预后模型 | 研究可能受到样本选择和数据集限制的影响 | 旨在分析肝细胞癌的免疫相关预后 | 研究对象为肝细胞癌患者及其免疫相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | Kaplan-Meier生存曲线，Cox回归分析 | 基因表达数据 | 438名肝细胞癌患者 |
| 10864 | 2024-08-05 |
Disease-specific transcriptional programs govern airway goblet cell metaplasia
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e34105
PMID:39071568
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研究论文 | 这篇文章探讨了慢性肺部炎症疾病中气道杯状细胞变性相关的转录程序 | 揭示了哮喘、囊性纤维化和慢性阻塞性肺病中杯状细胞变性的相似性和差异性 | 对该领域的分子机制和特征理解仍然有限 | 研究杯状细胞变性在肺疾病中的分子机制 | 人类肺部的单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 公共单细胞RNA测序数据集 |
| 10865 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals special basal cells and fibroblasts in idiopathic pulmonary fibrosis
2024-07-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-66947-5
PMID:38982264
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现特定的基底细胞和成纤维细胞在特发性肺纤维化中具有重要作用 | 识别出几种之前未被认识的基底细胞亚型以及与细胞外基质相关的成纤维细胞群体，提供了对特发性肺纤维化中基底细胞和成纤维细胞复杂性和多样性的创新见解 | 样本量较小，仅包括五个特发性肺纤维化样本和三个健康对照样本 | 探讨导致特发性肺纤维化的分子机制 | 特发性肺纤维化患者的肺组织样本以及健康对照样本 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 肺组织样本 | 8个样本（5个特发性肺纤维化样本和3个健康对照样本） |
| 10866 | 2024-08-04 |
Development of human pancreatic cancer avatars as a model for dynamic immune landscape profiling and personalized therapy
2024-Jul-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9071
PMID:38968363
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研究论文 | 本研究开发了基于人类胰腺癌组织的个性化“化身”，用于动态免疫微环境分析和个性化治疗。 | 论文展示了一种新的个性化有机体模型，可以在时间和空间上报告胰腺癌微环境，并能够反映临床反应。 | 尚未提及具体局限性 | 研究旨在创建一个新的模型，评估胰腺癌治疗的免疫微环境和个性化疗法。 | 研究对象为胰腺导管腺癌（PDAC）和其微环境。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 多重免疫荧光和空间转录组学 | 个性化有机体模型 | 组织切片数据 | 具体样本量尚未提及 |
| 10867 | 2024-08-05 |
Hypoxia inhibits the iMo/cDC2/CD8+ TRMs immune axis in the tumor microenvironment of human esophageal cancer
2024-Jul-04, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-008889
PMID:38964786
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研究论文 | 本研究探讨了食管癌肿瘤微环境中的iMo/cDC2/CD8+ TRMs免疫轴的调控机制 | 首次揭示了CD8+ TRMs在食管癌中的抗肿瘤作用及其免疫调控的特征 | 本研究的机制探索仍需进一步验证，样本数量较小 | 深入了解人类食管癌肿瘤微环境的免疫特征及其潜在调控机制 | 主要研究食管癌患者肿瘤及其邻近组织中的免疫环境 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，质量细胞计数 | NA | 组织样本 | 来自治疗前患者的肿瘤及邻近组织样本 |
| 10868 | 2024-08-05 |
Identification of a clinically efficacious CAR T cell subset in diffuse large B cell lymphoma by dynamic multidimensional single-cell profiling
2024-Jul, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00768-3
PMID:38750245
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研究论文 | 本研究通过动态多维单细胞分析识别出在弥漫性大B细胞淋巴瘤中具有临床疗效的CAR T细胞亚群。 | 引入了时间延迟成像显微镜和单细胞RNA测序的功能性分析，首次识别出多功能CD8 T细胞的特征。 | 研究可能限于特定的患者群体，尚需在更广泛的样本中验证CD8-fit T细胞的普适性。 | 研究CD8-fit T细胞在大B细胞淋巴瘤患者中的作用及其临床应用。 | 研究对象为接受CAR T细胞治疗的大B细胞淋巴瘤患者。 | 数字病理学 | 淋巴癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞功能评估数据 | 由多名大B细胞淋巴瘤患者的输注产品组成 |
| 10869 | 2024-08-05 |
Macrophage biomimetic nanoparticle-targeted functional extracellular vesicle micro-RNAs revealed via multiomics analysis alleviate sepsis-induced acute lung injury
2024-Jun-23, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02597-z
PMID:38910259
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研究论文 | 这项研究通过多组学分析识别功能性细胞外囊泡小RNA，并探寻其在脓毒症诱导的急性肺损伤中的作用 | 提出了一种新方法来筛选功能性EV-miRNAs，并强调了巨噬细胞来源EV在急性肺损伤中的关键作用 | 尚未明确揭示更有效的EV-miRNA作为治疗靶标的策略 | 研究脓毒症患者的急性肺损伤中，细胞外囊泡小RNA的功能性及其治疗潜力 | 脓毒症患者的血清EV微RNA档案及对应器官的单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序和多组学分析 | NA | RNA数据 | 涉及脓毒症患者的血清和小鼠模型 |
| 10870 | 2024-08-04 |
Multiomics integration-based immunological characterizations of adamantinomatous craniopharyngioma in relation to keratinization
2024-Jun-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06840-1
PMID:38906852
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研究论文 | 该文章对低恶性肿瘤的免疫微环境进行了综合分析 | 文章通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了ACP微环境中的免疫特征及细胞间网络 | 同一研究中的样本量限制可能影响结果的普适性 | 阐明ACP微环境的免疫特征，以扩展潜在治疗靶点的知识 | 研究对象为58,081个核，主要集中在ACP样本的微环境中 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 细胞核数据 | 58,081个细胞核 |
| 10871 | 2024-08-04 |
The crosstalk role of CDKN2A between tumor progression and cuproptosis resistance in colorectal cancer
2024-06-17, Aging
DOI:10.18632/aging.205945
PMID:38888512
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研究论文 | 本文探讨了CDKN2A在结直肠癌中与肿瘤进展及杯死亡抗性之间的相互作用 | 揭示了CDKN2A通过调节糖酵解和铜稳态在杯死亡抗性中的作用，并与肿瘤恶性表型和促进肿瘤微环境相关联 | 尚未明确CDKN2A在杯死亡抗性及其与肿瘤发展的具体机制 | 综合研究CDKN2A在结直肠癌细胞中的分布、表达及其与肿瘤进展的关系 | 结直肠癌细胞及其相关的细胞通路和免疫浸润 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序、空间转录组学、病理图像分析、TCGA多组学分析 | NA | NA | NA |
| 10872 | 2024-08-05 |
Identification of JUN gene and cellular microenvironment in response to PD-1 blockade treatment in lung cancer patients via single-cell RNA sequencing
2024-06-13, Aging
DOI:10.18632/aging.205932
PMID:38874497
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研究论文 | 本研究探讨了JUN基因及细胞微环境在肺癌患者PD-1阻断治疗中的反应 | 提出了肿瘤微环境中的细胞类型通过特定基因影响PD-1阻断免疫疗法效果的假设，并识别了JUN基因作为PD-1反应生物标志物 | 目前对PD-1阻断治疗反应的生物标志物仍然有限 | 探索非小细胞肺癌中PD-1/PDL-1阻断的分子机制 | 肺腺癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织数据 | 肺腺癌患者的组织样本，具体样本数量未提及 |
| 10873 | 2024-08-04 |
A Review of the Application of Spatial Transcriptomics in Neuroscience
2024-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00603-4
PMID:38374297
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综述 | 这篇文章回顾了空间转录组学在神经科学中的应用 | 全面概述了空间转录组学在神经科学中的关键方法、数据资源和技术应用 | 缺乏对空间转录组学在神经科学中的深入研究 | 调查空间转录组学在神经科学中的应用和发展方向 | 空间转录组学数据分析方法及其在神经科学中的应用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 数据分析方法 | NA |
| 10874 | 2024-08-05 |
scEM: A New Ensemble Framework for Predicting Cell Type Composition Based on scRNA-Seq Data
2024-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-023-00601-y
PMID:38368575
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研究论文 | 本研究提出了一种新颖的集成框架scEM，用于基于单细胞RNA测序数据预测细胞类型组成 | 提出了一种新的集成细胞类型识别方法scEM，通过熵权法学习共识相似性矩阵，弥补了当前方法的不足 | 缺乏对不同数据集和性能指标的标准化比较分析 | 研究旨在填补细胞类型组成预测领域的分析空白 | 对20种先进的无监督细胞类型识别方法进行评估 | 计算机视觉 | NA | scRNA-seq | 集成模型 | 真实scRNA-seq数据集 | 24个不同规模的真实scRNA-seq数据集 |
| 10875 | 2024-08-05 |
Inference of Gene Regulatory Networks Based on Multi-view Hierarchical Hypergraphs
2024-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00604-3
PMID:38342857
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研究论文 | 该文章提出了一种基于多视图层次超图的基因调控网络推断模型 | 引入了多视图层次超图，以整合多个异质生物信息，模型更好地捕捉多对多的复杂调节关系 | 尚未提及具体限制。 | 旨在改善基因调控网络的推断准确性 | 使用大肠杆菌和酿酒酵母的数据集进行实验验证 | 计算生物学 | NA | 超图卷积网络 | 层次超图模型 | 基因表达数据 | 对5个小鼠和2个人类细胞系的scRNA-seq数据集进行了分析 |
| 10876 | 2024-08-04 |
Comprehensive single-cell RNA-seq analysis using deep interpretable generative modeling guided by biological hierarchy knowledge
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae314
PMID:38960404
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研究论文 | 本文提出了一种深度可解释生成模型d-scIGM，用于单细胞数据分析。 | d-scIGM结合锯齿连接技术和残差网络，并引入生物领域的层次先验知识，增强了模型的可解释性。 | 之前基于生成模型的研究大多限于浅层神经网络，可能限制了模型的能力。 | 探讨细胞异质性并提高单细胞转录组数据分析的可解释性。 | 单细胞转录组数据及其生物学解释。 | 计算机视觉 | 黑色素瘤 | RNA-seq | 深度生成模型 | 单细胞数据 | 涉及多个大规模实验和黑色素瘤数据集 |
| 10877 | 2024-08-05 |
Identification of MUC1-C as a Target for Suppressing Progression of Head and Neck Squamous Cell Carcinomas
2024-May-14, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0011
PMID:38619287
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研究论文 | 本研究报告了MUC1-C蛋白在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其作为抑制癌症进展的靶点 | 揭示了MUC1-C在头颈部鳞状细胞癌中的新角色，并且表明其与肿瘤干细胞状态的联系 | 该研究在临床应用方面的具体有效性尚需进一步验证 | 探究MUC1-C在头颈部鳞状细胞癌的发病机制中的作用 | 头颈部鳞状细胞癌细胞系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 10878 | 2024-08-05 |
High-Throughput Host-Microbe Single-Cell RNA Sequencing Reveals Ferroptosis-Associated Heterogeneity during Acinetobacter baumannii Infection
2024-04-24, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202400538
PMID:38419141
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研究论文 | 该文章首次报告了一种高通量交叉物种双单细胞RNA测序技术，以同时捕获真核和细菌RNA | 创新点在于开发了一种高通量的scRandom-seq技术，能够高效捕获宿主与微生物之间的复杂相互作用 | 限制未具体说明，但涉及高通量技术可能存在样本处理和解析上的挑战 | 研究宿主与微生物之间的相互作用及其在感染中的复杂性 | 研究对象为Acinetobacter baumannii感染模型中的宿主细胞及其与微生物的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | THP-1来源的巨噬细胞和细菌细胞 |
| 10879 | 2024-08-05 |
Dystrophin deficiency impairs cell junction formation during embryonic myogenesis
2024-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.05.569919
PMID:38106055
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研究论文 | 本研究探讨了肌营养不良症中缺少肌营养蛋白对骨骼肌发育的早期影响 | 首次揭示了肌营养蛋白缺失与细胞连接蛋白家族的显著失调有关 | 未提及特定的实验条件或样本的多样性 | 探讨肌营养蛋白缺失对骨骼肌发育的早期后果 | 人类多能干细胞的肌源性轨迹 | 数字病理学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞转录组谱分析 | NA | NA | NA |
| 10880 | 2024-08-05 |
Uncovering the Cellular Microenvironment in Chronic Rhinosinusitis via Single-Cell RNA Sequencing: Application and Future Directions
2024-Apr, Clinical reviews in allergy & immunology
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s12016-024-08992-6
PMID:38687404
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review | 这篇文章回顾了慢性鼻窦炎中单细胞RNA测序的最新进展 | 该文章提供了对慢性鼻窦炎的新见解，探讨了分子生物标志物、信号通路和免疫微环境的关系 | 关于慢性鼻窦炎的异质性及其治疗的具体应用缺乏深入的实验数据 | 探讨慢性鼻窦炎的细胞微环境以及改进诊断和治疗的可能途径 | 慢性鼻窦炎患者的细胞组成、功能与相互作用 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |