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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10801 | 2025-10-06 |
Identification of biomarkers for Laryngeal squamous cell carcinoma through Mendelian randomization and integrated bioinformatics analysis
2025-Jul-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03114-w
PMID:40679719
|
研究论文 | 通过整合多组学数据和孟德尔随机化方法,识别喉鳞状细胞癌的生物标志物并构建预后模型 | 首次系统分析泛凋亡相关基因在LSCC中的作用,结合单细胞RNA测序数据构建预后模型并验证其临床价值 | 样本量相对有限,需要更大规模的前瞻性研究验证模型的临床应用价值 | 识别喉鳞状细胞癌的生物标志物并构建预后预测模型 | 喉鳞状细胞癌患者样本和正常对照样本 | 生物信息学 | 喉癌 | RNA-seq, scRNA-seq, CNV分析, qRT-PCR | Lasso-Cox回归模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 拷贝数变异数据 | 训练集:114例LSCC和12例正常样本;验证集:270例LSCC样本;scRNA-seq:2例LSCC样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 10802 | 2025-10-06 |
Architecture mechanics mediated osteogenic progression in bone regeneration of artificial scaffolds
2025-Jul-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv8804
PMID:40680128
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人工骨支架结构通过应力刺激调控骨再生的生物力学机制 | 首次阐明了支架结构诱导应力刺激(SASS)对细胞的生物力学机制,发现了SASS通过调控间充质干细胞粘着斑和成骨分化通路平衡骨重塑过程 | 研究仅针对石墨、富勒烯和金刚石三种支架材料,未涵盖其他生物材料体系 | 探究支架结构通过力学刺激调控骨再生的生物力学机制 | 骨间充质干细胞、破骨细胞、成骨细胞及临界尺寸骨缺损动物模型 | 骨组织工程 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10803 | 2025-10-06 |
Nicotinamide boosts oocyte quantity and quality by promoting N4-acetylation modification in lupus mice
2025-Jul-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu0955
PMID:40680131
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示烟酰胺通过促进N4-乙酰化修饰改善狼疮小鼠卵母细胞数量和质量的作用机制 | 首次绘制狼疮小鼠卵母细胞acC修饰图谱,揭示NAT10介导的acC修饰在卵母细胞发育异常中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 探究系统性红斑狼疮影响卵母细胞发育的分子机制及烟酰胺的治疗潜力 | 系统性红斑狼疮小鼠模型的卵母细胞 | 生殖医学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞转录组测序, 翻译组测序, acC-RNA免疫沉淀测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 翻译组数据, 表观遗传修饰数据 | 狼疮小鼠卵母细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 翻译组测序, 表观遗传学测序 | NA | NA |
| 10804 | 2025-10-06 |
NPLOC4 constructs tumor immunosuppressive microenvironment in pan-cancer and hepatocellular carcinoma
2025-Jul-17, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究探讨NPLOC4在泛癌和肝细胞癌肿瘤免疫微环境中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | 首次系统揭示NPLOC4在肿瘤免疫微环境中的免疫抑制作用及其作为免疫治疗新靶点的潜力 | 研究主要基于公共数据库数据,部分发现需进一步实验验证 | 探究NPLOC4在肿瘤免疫微环境中的作用机制和治疗价值 | 多种肿瘤类型和肝细胞癌患者组织样本及肿瘤细胞系 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | qRT-PCR, 免疫组织化学, 单细胞测序分析 | NA | mRNA表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞测序数据 | 多个公共数据库数据及肝细胞癌患者癌组织和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10805 | 2025-10-06 |
Mechanism of Initial Favorable Response to Decitabine in TP53-Mutated MDS/AML and Potential Mechanisms of Subsequent Relapse
2025-Jul-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3192
PMID:40397797
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研究论文 | 本研究探讨了TP53突变MDS/AML患者对地西他滨初始治疗产生良好反应及后续复发的潜在机制 | 首次通过整合靶向测序、纳米孔DNA甲基化测序和单细胞转录组学,系统分析TP53突变患者在地西他滨治疗过程中白血病细胞与免疫群体的动态变化 | 样本量有限,属于II期临床研究,需要更大规模研究验证 | 阐明TP53突变MDS/AML患者对地西他滨治疗反应及复发的分子机制 | 骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病患者 | 血液肿瘤学 | 骨髓增生异常综合征,急性髓系白血病 | 靶向髓系panel测序,纳米孔DNA胞嘧啶甲基化测序,单细胞转录组学 | NA | 基因组测序数据,甲基化数据,单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,但为系列样本(治疗前、治疗完成时、形态学缓解期和复发期) | NA | 单细胞RNA-seq,DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 10806 | 2025-10-06 |
Enhancer-driven gene regulatory networks reveal transcription factors governing T cell adaptation and differentiation in the tumor microenvironment
2025-Jul-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.04.030
PMID:40425012
|
研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示调控肿瘤微环境中组织驻留记忆CD8 T细胞分化的转录因子网络 | 首次通过配对单细胞RNA测序和ATAC测序技术,构建增强子驱动的调控网络,揭示KLF2和BATF转录因子在Trm样TIL形成中的拮抗作用 | 研究基于模型系统,需要在人类患者样本中进一步验证 | 阐明肿瘤微环境中CD8 T细胞组织驻留记忆表型形成的调控机制 | T细胞受体匹配的CD8 T细胞,包括感染和癌症模型中的T细胞 | 单细胞多组学 | 实体恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 10807 | 2025-10-06 |
Prenatally derived macrophages support choroidal health and decline in age-related macular degeneration
2025-Jul-07, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20242007
PMID:40261298
|
研究论文 | 本研究揭示了人类脉络膜中两种FOLR2表达不同的巨噬细胞群体及其在年龄相关性黄斑变性中的变化 | 首次发现脉络膜中存在产前来源的FOLR2+巨噬细胞,并证明其在AMD中数量减少和功能失调 | 研究主要基于观察性数据,机制验证仍需进一步实验 | 探究人类脉络膜的免疫细胞组成及其在年龄相关性黄斑变性中的作用 | 人类脉络膜组织和巨噬细胞 | 眼科疾病研究 | 年龄相关性黄斑变性 | 3D多重免疫荧光,单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 图像,基因表达数据,细胞计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10808 | 2025-10-06 |
The Dichotomy of Tumor Control by Recruited and Resident Tumor-Associated Macrophages
2025-Jul-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6977440/v1
PMID:40630529
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤相关巨噬细胞中不同亚群在肿瘤控制中的双重作用 | 首次明确区分了组织驻留间质巨噬细胞不同亚群的促瘤和抑瘤功能,并发现CCR5阻断可改善肿瘤控制 | 研究主要聚焦于黑色素瘤和肺腺癌模型,在其他癌症类型中的普适性需进一步验证 | 阐明肿瘤相关巨噬细胞不同亚群在肿瘤进展中的功能异质性 | 肿瘤相关巨噬细胞(包括recMacs和IMs) | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤,肺腺癌 | 空间转录组学,基因敲除模型 | Pf4 Cx3cr1小鼠模型 | 基因表达数据,空间定位数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10809 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing in Hirschsprung's disease tissues reveals lack of neuronal differentiation in the aganglionic colon segment
2025-Jul-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.01.662516
PMID:40631286
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析先天性巨结肠症组织,揭示无神经节结肠段中神经元分化缺失的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和全基因组测序系统比较先天性巨结肠患者健康与无神经节结肠段的细胞组成差异 | 样本量有限,未明确说明具体患者数量 | 探究先天性巨结肠症无神经节结肠段神经元分化障碍的分子机制 | 先天性巨结肠患者的健康与无神经节结肠组织 | 单细胞组学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序, 全基因组测序 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10810 | 2025-10-06 |
Examination of an iPSC model of human eye development reveals progressive emergence of critical embryonic cell types
2025-Jul-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-06602-9
PMID:40596144
|
研究论文 | 通过多时间点形态学和转录组分析研究人类iPSC衍生的眼发育模型(SEAM)中关键胚胎细胞类型的渐进出现过程 | 开发了模拟人类全眼发育早期阶段的2D模型,首次实现了多种胚胎细胞类型的同步发育研究 | 模型仅覆盖28天的分化过程,可能无法完全模拟更长期的发育事件 | 建立人类眼发育的体外模型并解析关键细胞类型的发育轨迹 | 人类iPSC衍生的SEAM眼细胞模型 | 发育生物学 | 眼发育疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | SEAM模型 | 转录组数据, 形态学数据 | 多时间点(第0、14、28天)的批量RNA-seq和单细胞RNA-seq分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 10811 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic and chromatin dynamics of the human brain in PTSD
2025-Jul, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09083-y
PMID:40533550
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研究论文 | 通过单细胞转录组和染色质分析揭示创伤后应激障碍患者前额叶皮层的细胞特异性分子调控机制 | 首次在超过200万个细胞核中系统分析PTSD的细胞类型特异性表观基因组调控机制,整合遗传、转录组和表观遗传数据 | 使用死后脑组织样本,可能无法完全反映活体状态;样本量相对有限 | 解析创伤后应激障碍的细胞特异性分子调控机制 | 111例人类大脑背外侧前额叶皮层组织(含PTSD、重度抑郁症患者和对照组) | 单细胞组学 | 创伤后应激障碍 | 单细胞转录组测序, 染色质可及性分析, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 表观遗传数据, 空间转录组数据 | 111例人脑样本,超过200万个细胞核 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10812 | 2025-10-06 |
Technologies for Decoding Cancer Metabolism with Spatial Resolution
2025-Jul-01, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041553
PMID:39284668
|
综述 | 本文讨论了三种新兴的代谢组学技术在解码癌症代谢中的应用 | 聚焦空间代谢组学、单细胞代谢组学和细胞器代谢组学三种新兴技术 | NA | 研究癌症代谢及其技术发展 | 癌细胞代谢途径 | 代谢组学 | 癌症 | 代谢组学、质谱分析 | NA | 代谢物数据 | NA | NA | 空间代谢组学, 单细胞代谢组学, 细胞器代谢组学, 单细胞转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 10813 | 2025-10-06 |
A spatial transcriptomic atlas of the host response to oropharyngeal candidiasis
2025-Jun-30, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00849-25
PMID:40586608
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研究论文 | 利用空间转录组学技术构建宿主对口腔念珠菌病免疫反应的细胞图谱 | 首次通过空间转录组学揭示口腔念珠菌感染微环境中2型免疫反应和M2巨噬细胞的平衡作用,发现新型富含脯氨酸抗菌蛋白家族 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探索口腔念珠菌病感染环境中免疫平衡机制 | 小鼠口腔念珠菌感染模型中的舌组织 | 空间转录组学 | 口腔念珠菌病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术 |
| 10814 | 2025-10-06 |
Protocol for deep-learning-driven cell type label transfer in single-cell RNA sequencing data
2025-Jun-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103768
PMID:40232935
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研究论文 | 介绍使用SIMS工具进行单细胞RNA测序数据中细胞类型标签转移的详细操作流程 | 提出了一个基于深度学习的标准化协议,用于单细胞RNA测序数据中的细胞类型标签转移,支持多种使用方式 | NA | 开发单细胞RNA测序数据中细胞类型标签转移的标准化操作流程 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10815 | 2025-10-06 |
Identifying condition-related cell-cell communication events using supervised tensor analysis
2025-Jun-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.15.571918
PMID:38168391
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研究论文 | 开发了一种名为STACCato的监督张量分析工具,用于识别与生物条件相关的细胞间通讯事件 | 首次将监督张量分析方法应用于细胞间通讯研究,能够同时调整混杂因素和考虑CCC事件间的依赖关系 | 方法主要基于scRNA-seq数据,可能不适用于其他类型的数据 | 开发统计方法来识别与生物条件相关的细胞间通讯事件 | 细胞间通讯事件 | 生物信息学 | 狼疮,自闭症 | 单细胞RNA测序 | 张量回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10816 | 2025-10-06 |
Radiotherapy promotes cuproptosis and synergizes with cuproptosis inducers to overcome tumor radioresistance
2025-Jun-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.03.031
PMID:40215978
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研究论文 | 本研究揭示了放疗通过调控铜代谢诱导铜死亡的新机制,并提出联合铜离子载体治疗可克服肿瘤放疗抵抗 | 首次发现放疗可诱导铜死亡,阐明其通过上调CTR1和耗竭谷胱甘肽的分子机制,并鉴定BACH1-MT1E/X轴是放疗抵抗的关键调控通路 | 研究主要聚焦于食管癌模型,未验证其他癌种中的普适性 | 探索放疗与铜死亡的关联机制,开发克服肿瘤放疗抵抗的新策略 | 食管癌细胞系、患者肿瘤样本、细胞系来源和患者来源的异种移植模型 | 肿瘤生物学 | 食管癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 放疗不敏感患者的食管肿瘤样本及多种实验模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 10817 | 2025-10-06 |
Habitual Exercise Modulates Neuroimmune Interaction to Mitigate Aortic Stiffness
2025-Jun-06, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325656
PMID:40304034
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研究论文 | 本研究探讨了习惯性运动通过调节神经免疫相互作用缓解血管紧张素II诱导的主动脉硬化的机制 | 首次揭示了运动通过β2-肾上腺素能受体调节巨噬细胞与交感神经的相互作用,进而抑制成纤维细胞活化和细胞外基质沉积的新机制 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体验证;神经免疫相互作用的详细分子通路仍需进一步阐明 | 探究运动如何调节交感神经与免疫细胞的相互作用以缓解主动脉硬化 | C57BL/6小鼠模型,包括野生型、Ccr2敲除小鼠和Col1a1-tdT报告基因小鼠 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,神经化学去神经术,细胞通讯分析 | 动物模型 | 基因表达数据,蛋白质表达数据,生理测量数据 | 未明确样本数量的小鼠实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10818 | 2025-10-06 |
Transcriptomic profiling after B cell depletion reveals central and peripheral immune cell changes in multiple sclerosis
2025-Jun-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI182790
PMID:40067358
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索B细胞耗竭疗法如何调节多发性硬化症患者的免疫景观 | 首次使用单细胞RNA测序全面分析B细胞耗竭治疗后中枢和外周免疫细胞的变化,揭示细胞类型特异性重编程 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 研究B细胞耗竭疗法对多发性硬化症患者免疫系统的调节机制 | 多发性硬化症患者在接受B细胞耗竭治疗前后的脑脊液和外周血免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10819 | 2025-10-06 |
Spatial characterization of interface dermatitis in cutaneous lupus reveals novel chemokine ligand-receptor pairs that drive disease
2025-May-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.05.574422
PMID:38260617
|
研究论文 | 本研究通过空间多组学技术揭示了皮肤红斑狼疮界面皮炎中角质细胞损伤驱动淋巴细胞募集的分子机制 | 首次系统描绘了皮肤红斑狼疮界面皮炎中角质细胞损伤到免疫细胞募集的完整信号通路,并鉴定出AIM2-Casp8-IL-18-CXCL6/CXCR1和CCL8/CCR2等新型趋化因子配体-受体对 | 样本量相对有限,研究主要聚焦于特定临床亚型 | 阐明皮肤红斑狼疮界面皮炎的免疫发病机制 | 皮肤红斑狼疮患者的水疱活检组织和穿刺活检组织 | 数字病理学 | 皮肤红斑狼疮 | 光谱流式细胞术, 96重免疫分析靶向蛋白质组学, 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 数字空间分析 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 流式细胞数据 | 皮肤红斑狼疮患者和健康供者的活检样本 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 靶向蛋白质组学 | 数字空间分析技术 | 96重免疫分析靶向蛋白质组学检测皮肤间质液中184种蛋白质分析物 |
| 10820 | 2025-10-06 |
High KYNU Expression Is Associated with Poor Prognosis, KEAP1/STK11 Mutations, and Immunosuppressive Metabolism in Patient-Derived but Not Murine Lung Adenocarcinomas
2025-May-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17101681
PMID:40427178
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现KYNU基因在肺腺癌中的双峰表达模式与患者预后不良相关,并揭示了其在免疫抑制代谢中的作用 | 首次系统揭示KYNU在肺腺癌中的双峰表达特征及其与KEAP1/STK11共突变的关联,发现其在人类与小鼠模型中表达模式的物种特异性差异 | 人类与小鼠模型中KYNU表达模式存在显著差异,这为临床前建模带来挑战 | 发现与肺腺癌患者预后相关的双峰表达基因,揭示其潜在的致癌基因型和治疗靶点 | 肺腺癌患者样本和鼠类肺腺癌模型 | 癌症基因组学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组学、代谢组学、批量转录组分析 | 模型聚类分析 | 基因表达数据、突变数据、代谢物数据 | 多个肺腺癌数据集(具体样本数未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |