单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27707 篇文献，本页显示第 10801 - 10820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10801 | 2024-08-05 |
Building gene regulatory networks from scATAC-seq and scRNA-seq using Linked Self Organizing Maps
2019-11, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1006555
PMID:31682608
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用自组织映射（SOM）将scATAC-seq区域与scRNA-seq基因连接的新方法。 | 提出了一种新的方法克服了现有分析方法在处理高噪声和稀疏数据集时的挑战，并能够生成草图式的调节网络。 | 该方法可能仍依赖于特定的时间序列分析和细胞类型的多样性。 | 研究的目的是开发一种新的分析方法，以整合不同单细胞测定的数据。 | 研究对象为小鼠前B细胞分化过程中的基因表达和染色质数据。 | 数字病理学 | NA | scATAC-seq 和 scRNA-seq | 自组织映射（SOM） | 基因组数据 | NA |
| 10802 | 2024-08-05 |
LAmbDA: label ambiguous domain adaptation dataset integration reduces batch effects and improves subtype detection
2019-11-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz295
PMID:31038689
|
研究论文 | 本文开发了一种独立于物种和数据集的迁移学习框架LAmbDA，旨在减少批次效应并改善细胞亚型检测 | LAmbDA框架能够在多个数据集和物种之间进行模型训练，解决了标记模糊的问题并提高了细胞亚型识别的准确性 | 研究主要集中在模拟数据和特定组织（如胰腺和大脑）上，可能在其他实际后台数据中的表现尚不明确 | 研究旨在开发一种新的方法，减少数据集间的系统偏差，并提高细胞亚型的分类精度 | 研究对象为不同物种和组织的单细胞RNA测序数据集中的细胞亚型 | 生物计算 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 前馈神经网络（Feedforward Neural Network） | 单细胞RNA测序数据 | 模拟数据集1: n/a; 模拟数据集2: n/a; 胰腺数据集: n/a; 大脑数据集: n/a |
| 10803 | 2024-08-05 |
Heterogeneity and plasticity in healthy and atherosclerotic vasculature explored by single-cell sequencing
2019-Oct-01, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvz185
PMID:31350876
|
综述 | 文章探讨了通过单细胞测序研究健康和动脉粥样硬化血管中的异质性和可塑性。 | 提出了异质性和可塑性的定义，并通过单细胞测序探讨了血管中的新知识。 | 当前单细胞测序研究在重复次数、细胞数量和空间信息的丧失方面存在一些局限性。 | 研究单细胞测序在揭示血管异质性中的应用及其局限性。 | 研究了健康和动脉粥样硬化血管中的细胞异质性和可塑性。 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞测序（SCS） | NA | RNA序列数据 | 使用了不同数量的细胞，具体数量不详 |
| 10804 | 2024-08-05 |
Decoding human fetal liver haematopoiesis
2019-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1652-y
PMID:31597962
|
research paper | 本文研究了人类胎儿肝脏中的确定性造血过程 | 通过单细胞转录组分析，揭示了人类发育过程中血液和免疫细胞的谱系 | 在对人类的理解方面仍然有限，特别是在特定的微环境影响下 | 探讨胎儿肝脏中的造血干细胞和多能前体的自我更新及分化机制 | 大约140,000个肝脏细胞和74,000个皮肤、肾脏和卵黄囊细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 约140,000个肝脏细胞和74,000个皮肤、肾脏和卵黄囊细胞 |
| 10805 | 2024-08-05 |
Embracing Systems Toxicology at Single-Cell Resolution
2019-Aug, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2019.04.003
PMID:31768481
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞分辨率下的系统毒理学。 | 介绍了单细胞RNA测序如何改变系统毒理学研究，能够敏感地检测细胞变化并精确识别受毒物影响的细胞 | NA | 研究系统毒理学在单细胞解析中的应用 | 主要集中在通过单细胞技术研究细胞特定的变化和响应轨迹 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 10806 | 2024-08-05 |
Deciphering the impact of aging on splenic endothelial cell heterogeneity and immunosenescence through single-cell RNA sequencing analysis
2024-Jul-18, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-024-00452-1
PMID:39026350
|
研究论文 | 本研究构建了年轻和老年小鼠脾脏内皮细胞转录组的单细胞RNA图谱 | 揭示了年龄相关的分子变化及内皮细胞与免疫细胞之间的潜在相互作用 | 本研究没有涉及人类脾脏内皮细胞的相关研究 | 探讨衰老对脾脏内皮细胞异质性和免疫衰老的影响 | 年轻和老年小鼠的脾脏内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 总共识别了十个内皮细胞簇 |
| 10807 | 2024-08-04 |
Cell type mapping of inflammatory muscle diseases highlights selective myofiber vulnerability in inclusion body myositis
2024-Jul, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00645-9
PMID:38834884
|
研究论文 | 本研究揭示了与IBM相关的特定肌纤维脆弱性和细胞类型特异性驱动因素 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学的结合，识别了IBM与其他肌病的不同病理特征和细胞反应 | 对IBM病理进展的因果因素和分子驱动因素仍然了解不足 | 研究IBM的细胞类型特异性驱动因素及其与其他肌病的比较 | 聚焦于IBM患者肌肉活检样本中的细胞类型和基因表达特征 | 数字病理学 | 老年性肌肉疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 生物样本数据 | 来自IBM患者的肌肉活检样本 |
| 10808 | 2024-08-05 |
Exercise rejuvenates microglia and reverses T cell accumulation in the aged female mouse brain
2024-Jul, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14172
PMID:38747044
|
研究论文 | 本研究探讨了运动对衰老女性小鼠大脑微胶质细胞的年轻化及T细胞积累的影响 | 展示了运动对老年微胶质细胞的选择性影响，并重新转变其基因表达特征 | 目前对运动如何具体影响认知的机制仍不明确 | 研究运动如何影响小鼠的脑龄化及相关细胞类型 | 18个月大的女性小鼠 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 18个月大的女性小鼠 |
| 10809 | 2024-08-05 |
[Advancements in Single-cell RNA Sequencing Technology
in the Study of the Tumor Microenvironment in Lung Cancer]
2024-Jun-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
|
综述 | 本综述讨论了单细胞RNA测序技术在研究肺癌肿瘤微环境异质性中的最新进展 | 提出了单细胞RNA测序技术可用于揭示肿瘤微环境中免疫细胞的异质性和新生细胞亚群体 | 传统的批量测序技术无法有效解决单细胞水平的异质性问题 | 探讨如何通过单细胞RNA测序技术深入理解肺癌肿瘤微环境的复杂性 | 研究肿瘤微环境中免疫细胞的组成和功能 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 10810 | 2024-08-05 |
A guide to single-cell RNA sequencing analysis using web-based tools for non-bioinformatician
2024-Jun, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.17036
PMID:38148322
|
研究论文 | 本研究介绍了针对非生物信息学家的单细胞RNA测序分析的网络工具 | 提供了用户友好的网络工具和详细的初学者分析流程 | 需要更多文献来帮助克服使用障碍 | 旨在使研究人员能够进行单细胞RNA测序分析 | 非生物信息学家 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 10811 | 2024-08-04 |
TFvelo: gene regulation inspired RNA velocity estimation
2024-Feb-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45661-w
PMID:38360714
|
研究论文 | TFvelo 是一种扩展 RNA 速度概念的模型，通过引入基因调控信息来提高模型的准确性 | 提出了一种不依赖剪接信息的 RNA 速度估计方法，结合了基因调控信息 | 可能在某些数据集上表现不佳，具体限制未在文中详细说明 | 提高 RNA 速度估计的准确性，拓宽其在单细胞数据上的应用 | 基因动态和细胞伪时间的推断 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 合成数据和多组单细胞 RNA-seq 数据集 | 具体样本数量未在文中说明 |
| 10812 | 2024-08-04 |
Microbial consortium assembly and functional analysis via isotope labelling and single-cell manipulation of polycyclic aromatic hydrocarbon degraders
2024-Jan-08, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wrae115
PMID:38913500
|
研究论文 | 文章提出了一种构建功能性微生物 consortium 的创新方法 | 通过使用单细胞识别和分选技术，首次在原位构建了基于基因组指导的功能性微生物 consortium | 研究中可能未涵盖所有类型的污染物降解微生物 | 探索构建原位功能性微生物 consortium 的方法以提高多环芳香烃的生物降解能力 | 聚焦于降解 phenanthrene 的细菌，如 Achromobacter sp. 和 Pseudomonas sp. | 数字病理学 | NA | 拉曼激活细胞分选-稳定同位素探测 | NA | 基因组数据和细胞功能数据 | 涉及 phenanthrene 降解细菌的单细胞 |
| 10813 | 2024-08-05 |
Global prediction of chromatin accessibility using small-cell-number and single-cell RNA-seq
2019-11-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz716
PMID:31428792
|
研究论文 | 本文展示了如何使用RNA-seq全球预测染色质可及性并推断调控元件活性 | 本文提出了一种基于RNA-seq的预测方法，能在样本细胞数量有限的情况下提供比ATAC-seq更高的准确性 | 虽然RNA-seq在小细胞数量样本中表现良好，但信号的精确性和噪声问题依然存在 | 研究如何使用RNA-seq实现染色质可及性的预测 | 涉及30个细胞的样本以及与ATAC-seq和scATAC-seq的比较 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 基因组数据 | 30个细胞 |
| 10814 | 2024-08-05 |
IL-2 production by self-reactive CD4 thymocytes scales regulatory T cell generation in the thymus
2019-11-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20190993
PMID:31434685
|
研究论文 | 本研究探讨了自反应CD4胸腺细胞产生的IL-2如何调节胸腺中调节性T细胞的生成 | 提出了IL-2作为关键环境因子，由自反应CD4SP胸腺细胞产生，从而调控胸腺中Treg细胞的生成规模 | 未提供对不同类型自反应CD4SP胸腺细胞的全面分析 | 研究IL-2在胸腺中调节性T细胞生成中的作用 | 主要研究成熟的CD4单阳性胸腺细胞及其产生的IL-2 | 免疫学 | 自体免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 10815 | 2024-08-05 |
Cell-type-specific analysis of alternative polyadenylation using single-cell transcriptomics data
2019-11-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz781
PMID:31501864
|
研究论文 | 该文章探讨了使用单细胞转录组数据分析细胞特异性的替代多聚腺苷酸化 | 提出了一种从单细胞RNA测序数据中分析APA调控模式的方法 | 对APA的理解仍然处于初步阶段 | 研究替代多聚腺苷酸化在不同细胞类型中的调控 | 不同组织的多组数据及其细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 多个不同组织的数据集 |
| 10816 | 2024-08-05 |
Applications of single cell RNA sequencing to research of stem cells
2019-Oct-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v11.i10.722
PMID:31692946
|
综述 | 该文章探讨了单细胞RNA测序技术在干细胞研究中的应用 | 强调了单细胞RNA测序在揭示干细胞异质性及其子群体方面的重要性 | 未提及具体的实验数据或研究局限性 | 旨在深入理解干细胞的异质性及其潜在的治疗应用 | 主要研究干细胞的不同亚群体及其基因表达特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 10817 | 2024-08-05 |
Lgr5 and Col22a1 Mark Progenitor Cells in the Lineage toward Juvenile Articular Chondrocytes
2019-10-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2019.08.006
PMID:31522976
|
研究论文 | 本文通过谱系追踪研究识别了Lgr5标记的细胞群体在关节组织形成中的贡献 | 揭示了Lgr5细胞在关节前体的谱系分化及其向关节软骨细胞的进展中的重要性 | 对谱系标记的细胞在整个关节组织形成过程中的具体作用尚不完全了解 | 探索关节形成过程中前体细胞的谱系规格化 | Lgr5和Col22a1标记的前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | NA |
| 10818 | 2024-08-05 |
MULTI-seq: sample multiplexing for single-cell RNA sequencing using lipid-tagged indices
2019-07, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-019-0433-8
PMID:31209384
|
研究论文 | 本研究开发了MULTI-seq，一种使用脂质标记指标的单细胞RNA测序多重化方法 | MULTI-seq提供了一种通用和可扩展的样本条形码策略，能够对任何细胞类型或细胞核进行标记 | 目前未提及任何具体的局限性 | 研究的目的是提高单细胞RNA测序的成本效益和数据质量 | 研究对象包括主要的人类乳腺上皮细胞和来自患者衍生异种移植小鼠模型的多发性肿瘤及转移部位的细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 96个样本及其他来自肿瘤和转移部位的细胞 |
| 10819 | 2024-08-05 |
A Single-Cell Approach to the Elusive Latent Human Cytomegalovirus Transcriptome
2018-06-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.01001-18
PMID:29895640
|
研究论文 | 本研究探讨了人类巨型细胞病毒潜伏转录组的单细胞RNA测序特点 | 通过单细胞RNA测序定义了人类巨型细胞病毒潜伏期的转录组特征 | 在潜伏期的定义和单细胞RNA测序分析中存在众多挑战 | 探讨人类巨型细胞病毒的潜伏转录组特征 | 关注于宿主内不同的细胞亚群体及其潜伏感染 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 10820 | 2024-08-05 |
A general pHLA-CD80 scaffold fusion protein to promote efficient antigen-specific T cell-based immunotherapy
2024-Sep-19, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2024.200827
PMID:39027379
|
研究论文 | 本文介绍了一种通用的pHLA-CD80融合蛋白，以促进有效的抗原特异性T细胞免疫治疗 | 文中提出的APC-mimic融合蛋白有效模仿了抗原呈递细胞的自然抗原呈递模式，能够直接扩展T细胞 | 研究中未提及特定抗原呈递细胞的需求，可能在应用中存在局限 | 研究旨在提高抗原特异性T细胞的激活和扩展 | 研究对象为抗原特异性T细胞及其在小鼠模型中的应用 | NA | 肿瘤 | 单细胞TCR测序（scTCR-seq）和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | OT-1小鼠模型 |