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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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10781 | 2025-10-07 |
Resolving the bone - optimizing decalcification in spatial transcriptomics and molecular pathology
2025-Mar, Journal of histotechnology
IF:0.6Q4
DOI:10.1080/01478885.2024.2446038
PMID:39723974
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综述与观点文章 | 探讨骨组织脱钙方法在空间转录组学和分子病理学中的优化策略 | 系统分析传统与现代脱钙方法,为骨组织分子完整性保护提供技术改进建议 | NA | 优化骨组织脱钙流程以提升空间转录组学和分子病理学分析质量 | 骨组织和钙化组织 | 空间转录组学 | NA | 脱钙处理,PCR,测序,免疫组织化学,杂交 | NA | 分子病理数据,空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
10782 | 2025-10-07 |
GAMG alleviates liver fibrosis through inducing ferroptosis in inflammatory macrophages via the IRF1/SLC7A11 signaling pathway
2025-Mar, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103509
PMID:39904190
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研究论文 | 本研究探讨了GAMG通过IRF1/SLC7A11信号通路诱导炎症巨噬细胞铁死亡从而缓解肝纤维化的机制 | 首次发现GAMG通过激活IRF1/SLC7A11轴诱导炎症巨噬细胞铁死亡的新机制 | NA | 探究GAMG对肝纤维化的治疗作用及分子机制 | 肝纤维化小鼠模型和炎症巨噬细胞 | 生物医学研究 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序, 质谱代谢组学分析 | NA | 基因表达数据, 代谢组数据 | 肝纤维化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10783 | 2025-10-07 |
Inhibition of glutathione peroxidase 4 suppresses gastric cancer peritoneal metastasis via regulation of RCC2 homeostasis
2025-Mar, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103519
PMID:39908861
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研究论文 | 本研究揭示GPx4通过调控RCC2稳定性促进胃癌腹膜转移的分子机制 | 首次阐明GPx4通过ROS-aurora A通路调控RCC2泛素化降解的分子机制 | 未明确GPx4抑制剂在临床治疗中的具体应用价值 | 探索GPx4在胃癌转移中的作用机制并寻找治疗靶点 | 胃癌细胞及临床样本 | 肿瘤生物学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | 回顾性临床样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
10784 | 2025-10-07 |
Human placental extract improves liver cirrhosis in mice with regulation of macrophages and senescent cells
2025-Mar, Regenerative therapy
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.reth.2025.01.017
PMID:39991509
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研究论文 | 本研究探讨人胎盘提取物通过调节巨噬细胞和衰老细胞改善小鼠肝硬化的作用机制 | 首次发现人胎盘提取物可通过促进巨噬细胞向抗炎M2表型极化并减少衰老细胞数量来改善肝硬化 | 研究仅使用小鼠模型,样本量较小(每组n=8),需要进一步临床验证 | 开发肝硬化的新型治疗方法,替代肝移植 | 四氯化碳诱导的肝硬化小鼠模型 | 空间转录组学 | 肝硬化 | 实时PCR, 免疫染色, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 每组8只小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
10785 | 2025-10-07 |
Single-cell landscape of peripheral blood mononuclear cells in patients with Graves' disease
2025-Feb-25, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqaf038
PMID:39996309
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了格雷夫斯病患者外周血单个核细胞的单细胞景观 | 首次在格雷夫斯病患者中应用单细胞RNA测序技术全面分析外周血单个核细胞的异质性和功能变化 | 样本量相对较小(8名患者和12名健康对照),需要更大规模研究验证 | 阐明格雷夫斯病中免疫异常的具体机制 | 格雷夫斯病患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 格雷夫斯病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 22680个外周血单个核细胞,来自8名GD患者和12名健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10786 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell and bulk RNA sequencing to identify a distinct tumor stem cells and construct a novel prognostic signature for evaluating prognosis and immunotherapy in LUAD
2025-Feb-22, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06243-6
PMID:39987127
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,识别肺腺癌中的肿瘤干细胞特征并构建预后标志物模型 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序识别肺腺癌肿瘤干细胞特征,构建了包含49个基因的预后标志物模型,并发现TAF10作为潜在治疗靶点 | 研究样本量未明确说明,模型验证需要进一步前瞻性研究 | 开发肺腺癌预后评估和免疫治疗效果预测的肿瘤干细胞标志物模型 | 肺腺癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,qRT-PCR,Western blot,免疫组化 | Lasso-Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
10787 | 2025-10-07 |
NK cell immunopotentiators-loaded nanoliposomes enhance ADCC effect for targeted therapy against HER2-positive breast cancer
2025-Feb-22, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-02023-9
PMID:39987140
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研究论文 | 本研究开发了负载NK细胞免疫增强剂的HER2靶向纳米脂质体,用于增强曲妥珠单抗在HER2阳性乳腺癌治疗中的ADCC效应 | 首次将TKD和IP-10p两种免疫调节肽封装于HER2靶向pH敏感纳米脂质体中,通过增强NK细胞浸润和活性来克服曲妥珠单抗耐药性 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未进行临床试验验证 | 开发新型纳米递送系统以增强曲妥珠单抗在HER2阳性乳腺癌中的治疗效果 | HER2阳性乳腺癌患者肿瘤组织及相应的疾病模型 | 肿瘤免疫治疗 | 乳腺癌 | 单细胞测序、生物信息学分析、纳米脂质体技术 | NA | 单细胞测序数据、体外实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10788 | 2025-10-07 |
Interferon-gamma receptor signaling regulates innate immunity during Staphylococcus aureus craniotomy infection
2025-Feb-22, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03376-9
PMID:39987156
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研究论文 | 本研究探讨了干扰素-γ受体信号在金黄色葡萄球菌颅骨切开术感染中对先天免疫的调控作用 | 首次揭示了IFN-γ通过增强巨噬细胞和小胶质细胞的抗菌活性在颅骨切开术感染中的关键保护作用,并发现Th1/Th17比例失衡导致免疫功能失调 | 在粒细胞或巨噬细胞/小胶质细胞条件性敲除IFN-γR1小鼠中未观察到表型,提示存在冗余机制 | 研究IFN-γ信号在颅骨切开术生物膜感染免疫应答中的调控机制 | 金黄色葡萄球菌颅骨切开术感染小鼠模型 | 免疫学 | 细菌感染 | 单细胞转录组测序,条件性基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | 野生型和Ifngr1缺陷小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10789 | 2025-10-07 |
Interpretable single-cell factor decomposition using sciRED
2025-Feb-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57157-2
PMID:39987196
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研究论文 | 开发了一种名为sciRED的可解释单细胞因子分解方法,用于改进scRNA-seq数据分析 | 通过去除已知混杂效应、使用旋转提高因子可解释性、将因子映射到已知协变量、识别可能捕获隐藏生物现象的未解释因子 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的因子分析可解释性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 因子分解模型 | 基因表达数据 | 多个scRNA-seq数据集(肾脏图谱、PBMC数据集、大鼠肝脏图谱、健康人类肝脏图谱) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10790 | 2025-10-07 |
Human nasal turbinate stem cells with specific gene signatures (HAS2, CXCL1, KRTAP1-5, GSTT2B, and C4B) attenuate rheumatoid arthritis
2025-Feb-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-90707-8
PMID:39987230
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研究论文 | 本研究探讨人鼻甲来源干细胞对类风湿性关节炎的治疗效果及其相关基因特征 | 首次发现具有特定基因特征(HAS2、CXCL1、KRTAP1-5、GSTT2B和C4B)的人鼻甲干细胞对类风湿性关节炎具有治疗潜力 | 研究基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;样本量有限(20例健康对照) | 研究人鼻甲干细胞对类风湿性关节炎的治疗效果及机制 | 人鼻甲来源干细胞、胶原诱导性关节炎小鼠模型 | 干细胞治疗 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序、微阵列分析、RT-qPCR、流式细胞术、TRAP染色 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 20名健康对照的鼻甲干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10791 | 2025-10-07 |
Unravelling approaches to study macrophages: from classical to novel biophysical methodologies
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19039
PMID:39989743
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综述 | 本文综述了从经典到新型生物物理学方法研究巨噬细胞的技术进展 | 整合了单细胞测序、单细胞质谱、微流控技术和原子力光谱等前沿生物物理方法研究巨噬细胞 | NA | 探讨研究巨噬细胞的方法学进展 | 巨噬细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞测序, 单细胞质谱, 微流控技术, 扫描探针显微镜, 原子力光谱 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10792 | 2025-10-07 |
Calnexin promotes glioblastoma progression by inducing protective mitophagy through the MEK/ERK/BNIP3 pathway
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.105591
PMID:39990231
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研究论文 | 本研究揭示钙连接蛋白通过MEK/ERK/BNIP3通路诱导保护性线粒体自噬促进胶质母细胞瘤进展的分子机制 | 首次发现CANX通过激活MEK/ERK通路促进BNIP3介导的保护性线粒体自噬,阐明了GBM化疗耐药的新机制 | 研究主要基于细胞和小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究CANX在胶质母细胞瘤进展和化疗耐药中的作用机制 | 胶质母细胞瘤细胞系和颅内异种移植小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序、单细胞测序、透射电镜、Western blot、免疫荧光、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
10793 | 2025-10-07 |
CD34+ PI16+ fibroblast progenitors aggravate neointimal lesions of allograft arteries via CCL11/CCR3-PI3K/AKT pathway
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.104650
PMID:39990233
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研究论文 | 本研究揭示了CD34+ PI16+成纤维祖细胞通过CCL11/CCR3-PI3K/AKT通路促进移植动脉新生内膜病变的机制 | 首次鉴定出CD34+ PI16+成纤维祖细胞亚群,并阐明其通过分泌CCL11激活平滑肌细胞PI3K/AKT通路驱动新生内膜增生的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体组织中验证 | 探究CD34干细胞/祖细胞在移植动脉粥样硬化中的作用机制 | 遗传修饰小鼠模型(BALB/c、C57BL/6J等)和细胞亚群 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 趋化因子抗体微阵列, ELISA, 免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据, 免疫组织化学图像 | 多种遗传修饰小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10794 | 2025-10-07 |
Establishment of a Lactylation-Related Gene Signature for Hepatocellular Carcinoma Applying Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/3547543
PMID:39990773
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞RNA测序分析建立了肝细胞癌的乳酸化相关基因特征 | 首次开发了肝细胞癌的乳酸化相关基因特征,结合单细胞RNA测序揭示了基因在不同细胞类型中的表达模式 | NA | 开发肝细胞癌的乳酸化相关基因特征并评估其预后预测价值 | 肝细胞癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归模型,风险评分模型,列线图 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10795 | 2025-10-07 |
Contribution of cuproptosis and immune-related genes to idiopathic pulmonary fibrosis disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1458341
PMID:39991151
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨铜死亡和免疫相关基因在特发性肺纤维化中的诊断价值 | 首次系统分析铜死亡相关基因在IPF中的作用,并识别出具有诊断价值的免疫相关生物标志物 | 研究基于公共数据库的微阵列数据,需要进一步实验验证 | 探索铜死亡和免疫相关基因对特发性肺纤维化的诊断价值 | 特发性肺纤维化患者基因表达数据 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 微阵列分析,单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | ROC曲线分析 | 基因表达数据 | 四个GEO微阵列数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,微阵列 | NA | NA |
10796 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing of circulating immune cells supports inhibition of TNFAIP3 and NFKBIA translation as psoriatic arthritis biomarkers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1483393
PMID:39991156
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析银屑病关节炎患者循环免疫细胞,发现TNFAIP3和NFKBIA翻译抑制可作为生物标志物 | 首次在单细胞水平揭示TNFAIP3和NFKBIA基因在银屑病关节炎不同T细胞亚群中的差异翻译调控机制 | 样本量较小(仅8个样本),需要更大规模研究验证 | 鉴定区分银屑病关节炎与单纯皮肤银屑病及健康对照的生物标志物 | 银屑病关节炎患者、单纯皮肤银屑病患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 银屑病关节炎 | 单细胞RNA测序, 免疫印迹 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 8个样本(3例PsA, 3例PsC, 2例HC) | NanoString | 单细胞RNA-seq | NanoString nCounter | NanoString nCounter平台用于验证单细胞RNA测序发现的差异表达基因 |
10797 | 2025-10-07 |
Integrative multi-omics and machine learning identify a robust signature for discriminating prognosis and therapeutic targets in bladder cancer
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.105066
PMID:39991573
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法,开发了膀胱癌预后预测模型并识别了潜在治疗靶点 | 首次整合转录组学、蛋白质组学、蛋白乙酰化测序和单细胞RNA测序数据,采用一致性聚类和LASSO Cox回归建立膀胱癌预后模型 | 样本量相对较小(6对肿瘤与癌旁组织),需要更大规模验证 | 开发膀胱癌预后预测模型并识别治疗靶点 | 膀胱癌患者组织样本和公共数据库数据 | 机器学习 | 膀胱癌 | 转录组测序, 蛋白质组测序, 蛋白乙酰化测序, 单细胞RNA测序 | Cox回归, LASSO Cox回归, 一致性聚类 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞数据 | 6对膀胱癌肿瘤与癌旁组织,整合TCGA-BLCA和GSE13507数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序, 蛋白质组测序 | NA | NA |
10798 | 2025-10-07 |
Single-Cell Sequencing Reveals PD-L1-Mediated Immune Escape Signaling in Lung Adenocarcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.103656
PMID:39991571
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示肺腺癌中PD-L1介导的免疫逃逸信号机制 | 首次在单细胞水平系统描绘PD-L1阳性与阴性样本的免疫细胞组成差异,并鉴定出11个与PD-L1/PD-1免疫逃逸轴相关的差异表达基因 | 样本量较小(仅8例患者),缺乏功能性验证实验 | 探究肺腺癌免疫逃逸的分子机制并开发预测和治疗靶点 | 8例肺腺癌患者的肿瘤组织样本 | 单细胞生物学 | 肺腺癌 | 单细胞测序, qPCR | UMAP降维分析 | 单细胞基因表达数据 | 8例患者肿瘤组织,共58,810个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10799 | 2025-10-07 |
Nanomaterial-Mediated Reprogramming of Macrophages to Inhibit Refractory Muscle Fibrosis
2024-Dec, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202410368
PMID:39548911
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研究论文 | 本研究开发了一种功能化纳米材料,通过调控巨噬细胞极化来抑制难治性口面部肌肉纤维化 | 首次设计阳离子纳米材料通过捕获细胞游离核酸调控巨噬细胞表型,揭示其通过TLR7/9-NF-κB信号通路影响纤维-脂肪生成祖细胞亚群转化的新机制 | NA | 开发治疗难治性肌肉纤维化的新策略 | 口面部肌肉纤维化模型中的巨噬细胞和纤维-脂肪生成祖细胞 | NA | 肌肉纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10800 | 2025-10-07 |
scMGATGRN: a multiview graph attention network-based method for inferring gene regulatory networks from single-cell transcriptomic data
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae526
PMID:39417321
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研究论文 | 提出基于多视图图注意力网络的scMGATGRN方法,用于从单细胞转录组数据推断基因调控网络 | 首次将多视图图注意力网络应用于基因调控网络推断,能够同时利用局部特征信息和高阶邻居特征信息 | 未明确说明模型的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性 | 开发更准确的基因调控网络推断方法 | 基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图注意力网络(GAT), 多视图注意力机制 | 单细胞转录组数据 | 7个基准单细胞RNA测序数据集,来自5个细胞系(2个人类,3个小鼠) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |