单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
10781	2024-08-05	ScRNA-seq reveals novel immune-suppressive T cells and investigates CMV-TCR-T cells cytotoxicity against GBM 2024-Apr-30, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-008967 PMID:38688579	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了新的免疫抑制T细胞，并研究了CMV-TCR-T细胞对胶质母细胞瘤的细胞毒性	首次识别了在CMV感染下的胶质母细胞瘤中的新型免疫细胞亚群，特别是FXYD6+ T细胞作为免疫抑制T细胞	CMV感染对GBM免疫微环境的具体影响机制尚不完全明确，工程化TCR-T细胞的长期效果尚需进一步研究	研究CMV感染对胶质母细胞瘤免疫微环境的影响以及CMV-TCR-T细胞的治疗潜力	CMV感染的胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织	数字病理学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序	NA	组织样本	涉及CMV感染的胶质母细胞瘤患者的多种样本
10782	2024-08-04	Pten regulates endocytic trafficking of cell adhesion and Wnt signaling molecules to pattern the retina 2024-Apr-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.114005 PMID:38551961	研究论文	本研究展示了磷酸酶和张力同源物（Pten）如何通过调节细胞粘附分子和Wnt蛋白的囊泡运输来控制视网膜星爆细胞的间距	揭示了Pten在星爆细胞模式形成中的作用，以及与Down综合征细胞粘附分子Dscam的协同效应	对具体机制的深入探讨和长时间的观察尚待进一步研究	探讨Pten如何通过调节内吞运输模式来决定视网膜星爆细胞的排列	主要研究视网膜星爆细胞及其相关的细胞粘附和信号传导分子	数字病理学	NA	单细胞转录组学	NA	分子标志物和囊泡蛋白组	NA
10783	2024-08-05	Well-Paired-Seq2: High-Throughput and High-Sensitivity Strategy for Characterizing Low RNA-Content Cell/Nucleus Transcriptomes 2024-04-23, Analytical chemistry IF:6.7Q1 DOI:10.1021/acs.analchem.3c05785 PMID:38597061	研究论文	本文介绍了一种新型的高通量高灵敏度策略Well-Paired-Seq2，用于表征低RNA含量细胞/细胞核的转录组	该研究创新地利用尺寸排斥和准静态流体动力学实现高效细胞捕获，并显著提高了转录组的检测灵敏度	未提及具体的样本类型和数量限制	研究旨在解决低RNA含量细胞的转录组分析中的灵敏度和通量问题	研究对象为低RNA含量的单细胞及细胞核转录组	数字病理学	肾透明细胞癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	无具体样本数量，提到的分析样本包括冷冻临床样本
10784	2024-08-04	Multi-Omics Pan-Cancer Analysis of Procollagen N-Propeptidase Gene Family of ADAMTS as Novel Biomarkers to Associate with Prognosis, Tumor Immune Microenvironment, Signaling Pathways, and Drug Sensitivities 2024-Apr-12, Frontiers in bioscience (Landmark edition) DOI:10.31083/j.fbl2904151 PMID:38682182	研究论文	本研究旨在进行ADAMTS的procollagen N-propeptidase亚组的全癌症分析	首次揭示了PNPSA成员在肿瘤免疫微环境和预后中的双重角色，及其在不同癌症中的潜在生物标志物和治疗靶点	本研究主要依赖于公开数据库，可能存在数据的不一致性和局限性	探讨PNPSA在全癌症中的表达、基因组变异及其与肿瘤进展的关系	ADAMTS家族的procollagen N-propeptidase亚组的成员	数字病理学	肿瘤	多组学分析	NA	基因组数据	基于多个集成的开放数据库进行分析，样本数未特定说明
10785	2024-08-04	CD301 and LSECtin glycan-binding receptors of innate immune cells serve as prognostic markers and potential predictors of immune response in breast cancer subtypes 2024-04-01, Glycobiology IF:3.4Q2 DOI:10.1093/glycob/cwae003 PMID:38206856	研究论文	这篇文章探讨了糖基化在乳腺癌不同亚型中的作用，并确认CD301和LSECtin作为预后标志物和免疫反应的潜在预测因子	本研究首次系统性地确定了改变的糖基化在乳腺癌中的相关性，并识别了特定的糖结合受体作为预后指标	研究仅基于特定的样本群体，可能无法广泛适用所有乳腺癌患者	研究旨在探索糖基化改变在乳腺癌中的预后作用	研究对象为一大批不同组织病理类型的侵袭性乳腺癌样本（n = 1859）	数字病理学	乳腺癌	重组C型糖结合受体	无	组织微数组	1859个侵袭性乳腺癌样本
10786	2024-08-05	Single-cell transcriptome analysis reveals periodontal ligament fibroblast heterogeneity with distinct IL-1β and RANKL expression in periodontitis 2024-Apr, Molecules and cells IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.mocell.2024.100059 PMID:38554844	研究论文	这项研究揭示了牙周韧带成纤维细胞在牙周炎中的异质性，并探讨了IL-1β和RANKL的不同表达。	首次揭示了牙周韧带成纤维细胞的异质性，并确定了与骨吸收相关的不同细胞亚群。	研究中仅使用了人类牙周炎患者的单细胞RNA测序数据，未涉及其他类型的样本或疾病模型。	研究牙周韧带成纤维细胞在牙周炎中的功能和异质性。	人类牙周炎患者的牙周韧带成纤维细胞亚群。	数字病理学	牙周炎	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	来自人类牙周炎患者的多个单细胞样本数据
10787	2024-08-04	Landscape of Epstein-Barr virus gene expression and perturbations in cancer 2024-Feb-02, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-3911441/v1 PMID:38352479	研究论文	该文章研究了EB病毒在癌症中的基因表达及其扰动	首次识别出RPMS1非编码RNA通过干扰素反应的破坏支持癌细胞特性	研究中未详细探讨癌细胞和健康细胞的具体环境交互	探索EB病毒在癌症中的基因表达及其对癌细胞特性的影响	研究与EB病毒相关的肿瘤及其细胞特性	数字病理学	NA	长读长单分子测序	NA	转录组数据	通过单细胞测序分离了来自同一组织活检的癌细胞和健康细胞
10788	2024-08-04	Integrated analyses of single-cell transcriptome and Mendelian randomization reveal the protective role of FCRL3 in multiple sclerosis 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1428962 PMID:39076991	研究论文	本研究通过整合单细胞转录组和孟德尔随机化分析，发现FCRL3在多发性硬化中的保护作用	创新点在于整合了单细胞转录组和孟德尔随机化分析来寻找MS的新治疗靶点	本文未提及具体的实验验证或临床试验数据	发现多发性硬化的新治疗靶点	对FCRL3在多发性硬化中的作用进行分析	数字病理学	多发性硬化	单细胞RNA测序，孟德尔随机化	NA	基因组数据，单细胞转录组数据	收集了1123个在七种外周细胞类型中观察到的表达变化
10789	2024-08-04	Methazolamide Can Treat Atherosclerosis by Increasing Immunosuppressive Cells and Decreasing Expressions of Genes Related to Proinflammation, Calcification, and Tissue Remodeling 2024, Journal of immunology research IF:3.5Q2 DOI:10.1155/2024/5009637 PMID:39081633	研究论文	本研究探讨了美唑胺通过增加免疫抑制细胞和减少与炎症、钙化及组织重塑相关基因表达来治疗动脉粥样硬化的机制	首次将美唑胺的治疗机制与动脉粥样硬化发病机制结合起来，揭示了其在免疫调节方面的作用	研究主要基于小鼠模型，临床相关性尚待进一步验证	探讨美唑胺在动脉粥样硬化治疗中的作用及其机制	使用ApoE-/-小鼠建立的动脉粥样硬化动物模型	心血管疾病	动脉粥样硬化	单细胞测序	NA	生物样本数据	ApoE-/-小鼠，数量未具体提及
10790	2024-08-04	Elucidating the multifaceted role of MGAT1 in hepatocellular carcinoma: integrative single-cell and spatial transcriptomics reveal novel therapeutic insights 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1442722 PMID:39081317	研究论文	本研究探讨了糖基转移酶相关基因在肝细胞癌中的作用，提供了新的免疫治疗见解	利用单细胞和空间转录组学结合的技术揭示了MGAT1作为潜在免疫治疗靶点的创新潜力	未提供特定的研究限制信息	探讨糖基转移酶基因在肝细胞癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响	肝细胞癌中不同细胞亚群及其糖基转移酶基因的活性	数字病理学	肝癌	单细胞转录组学和空间转录组学	NA	RNA-seq	未提供特定样本数量信息
10791	2024-08-05	SIGLEC15, negatively correlated with PD-L1 in HCC, could induce CD8+ T cell apoptosis to promote immune evasion 2024, Oncoimmunology IF:6.5Q1 DOI:10.1080/2162402X.2024.2376264 PMID:38988824	研究论文	本研究探讨了SIGLEC15在肝细胞癌中的功能角色及其对免疫逃逸的影响	发现SIGLEC15在肝细胞癌组织中增加，并与PD-L1呈负相关，以促进免疫逃逸	未能直接影响肿瘤增殖的机制尚不完全清楚	阐明SIGLEC15在肝细胞癌中的作用及其如何促进免疫逃逸	主要研究肝细胞癌中的SIGLEC15表达及其对CD8+ T细胞的影响	数字病理学	肝癌	PCR分析、免疫组化、流式细胞术、RNA测序	小鼠模型	组织样本、RNA序列数据	使用了HCC样本和小鼠模型的多种细胞系及单细胞样本
10792	2024-08-05	Single-cell transcriptomic analysis identifies downregulated phosphodiesterase 8B as a novel oncogene in IDH-mutant glioma 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1427200 PMID:38989284	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析，识别下调的磷酸二酯酶8B为IDH突变胶质瘤中的新型癌基因	本研究首次阐明磷酸二酯酶8B在高等级胶质瘤中的独特表达模式，并揭示其作为代谢相关癌基因的双重角色	研究主要集中在胶质瘤的代谢通路和基因表达，未深入分析其他可能影响结果的因素	本研究旨在揭示不同等级胶质瘤的细胞和代谢特征	研究对象是高等级（胶质母细胞瘤，WHO IV级）和低等级（少突胶质瘤，WHO II级）胶质瘤	数字病理学	胶质瘤	单细胞转录组测序	NA	基因表达数据	包括多个胶质瘤细胞类型的样本，具体样本量未提供
10793	2024-08-04	PGF2α signaling drives fibrotic remodeling and fibroblast population dynamics in mice 2023-Dec-22, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.172977 PMID:37934604	研究论文	本研究探讨了PGF2α信号传导在小鼠中驱动纤维化重塑和成纤维细胞群体动态的作用	本研究机制性地识别了在特发性肺纤维化中一个易感的成纤维细胞亚群，并确认了PGF2α信号转导在该病中的作用	未明确提及具体的临床实验数据或人类样本验证	探讨PGF2α及其受体在特发性肺纤维化发病机制中的作用	使用带有呼吸表面活性蛋白C基因突变的小鼠模型	数字病理学	特发性肺纤维化	单细胞RNA测序	小鼠模型	基因表达数据	使用了多个IER-SftpcI73T小鼠样本及其交叉品系的对照组
10794	2024-08-04	A Universal Method for Crossing Molecular and Atlas Modalities using Simplex-Based Image Varifolds and Quadratic Programming 2023-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.03.28.534622 PMID:37034802	研究论文	本文阐明了一种在分子尺度转录组学和组织尺度图谱之间建立对应关系的解决方案	提出了一种通用算法，通过交替优化LDDMM和二次规划方法，解决坐标和潜在转录特征分数的最小化几何形状的变换	NA	研究目的在于结合分子和细胞数据，创建一个统一的坐标系统	主要涉及分子尺度转录组学数据和组织尺度图谱数据	数字病理学	NA	LDDMM优化与二次规划	NA	转录组学数据	NA
10795	2024-08-05	DUSP6 mediates resistance to JAK2 inhibition and drives leukemic progression 2023-01, Nature cancer IF:23.5Q1 DOI:10.1038/s43018-022-00486-8 PMID:36581736	研究论文	本研究揭示DUSP6在髓系恶性肿瘤转化中的作用及其作为潜在治疗靶点的价值	发现DUSP6的异常表达与疾病转化相关，且DUSP6-RSK1通路可作为药物靶点	未详细探讨DUSP6在不同患者中的具体作用机制	探索DUSP6在髓系恶性肿瘤和急性髓性白血病转化中的角色	靶向DUSP6 的治疗效果及其在患者衍生的异种移植模型中的作用	数字病理学	急性髓性白血病	单细胞RNA测序	PDX模型	基因表达数据	多名患者的骨髓干细胞和祖细胞
10796	2024-08-05	Mesenchymal cell replacement corrects thymic hypoplasia in murine models of 22q11.2 deletion syndrome 2022-11-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI160101 PMID:36136514	研究论文	该文章探讨了在22q11.2缺失综合症小鼠模型中，间充质细胞替代如何纠正胸腺发育不良的机制。	发现间充质细胞是造成22q11.2缺失综合症小鼠模型中胸腺发育不良的原因，并通过正常间充质细胞替代进行纠正。	没有提到该研究的具体局限性	研究22q11.2缺失综合症导致的胸腺发育不良的分子基础及其纠正方法。	使用22q11.2缺失综合症的小鼠模型作为研究对象。	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	包括小鼠模型的胚胎胸腺
10797	2024-08-05	Controlled Cycling and Quiescence Enables Efficient HDR in Engraftment-Enriched Adult Hematopoietic Stem and Progenitor Cells 2020-09-01, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2020.108093 PMID:32877675	研究论文	本文研究了通过控制细胞周期和静止状态来提高成年造血干细胞和祖细胞中同源重组修复效率的方法	提出了一种控制循环和静止状态的策略，使得静息干细胞中HDR与NHEJ的比率增加了6倍	文章中未具体说明对所有类型细胞的影响，主要集中在特定亚群体	探讨并重新编程成年造血干细胞和祖细胞中的基因组编辑结果	成年造血干细胞和祖细胞的亚群体	数字病理学	NA	下一代测序、单细胞RNA测序	NA	细胞样本	NA
10798	2024-08-05	Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Six Subpopulations Reflecting Distinct Cellular Fates in Senescent Mouse Embryonic Fibroblasts 2020, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2020.00867 PMID:32849838	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了衰老小鼠胚胎成纤维细胞的六个亚群，揭示了不同的细胞命运。	本研究首次在衰老的小鼠胚胎成纤维细胞中识别出六个具有明显异质性的亚群，并发现HOXD8是新的衰老调控因子。	该研究主要基于小鼠模型，其结果可能不完全适用于其他物种或人类。	本研究旨在深入了解衰老小鼠胚胎成纤维细胞中的细胞异质性及其衰老机制。	研究对象为衰老小鼠胚胎成纤维细胞。	数字病理学	衰老相关疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	多个衰老小鼠胚胎成纤维细胞
10799	2024-08-05	Reparative effects after low-dose radiation exposure: Inhibition of atherosclerosis by reducing NETs release 2024-Oct-15, The Science of the total environment DOI:10.1016/j.scitotenv.2024.174540 PMID:38977089	研究论文	该研究探讨了低剂量辐射如何通过减少 NETs 释放来抑制动脉粥样硬化。	首次探讨了低剂量辐射对心血管系统的影响及其抑制动脉粥样硬化的机制。	研究中未涉及不同剂量辐射的长期影响及其在临床中的应用。	研究低剂量辐射对动脉粥样硬化的影响机制。	研究对象为接受低剂量辐射和高脂饮食的动物模型。	数字病理学	心血管疾病	酶联免疫吸附测定法（ELISA）	NA	组学数据	高脂饮食下的动物模型
10800	2024-08-04	Single-cell sequencing reveals LRRc17-mediated modulation of cardiac fibroblast ferroptosis in regulating myocardial fibrosis after myocardial infarction 2024-Sep, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111293 PMID:38996956	研究论文	本研究揭示了LRRc17在心脏成纤维细胞中介导铁死亡调节心肌梗死后心肌纤维化的作用	首次阐明了LRRc17在心肌梗死后心脏成纤维细胞铁死亡调节中的具体作用	本研究仅集中于特定基因LRRc17，可能忽视其他影响心肌纤维化的因子	探讨心肌梗死后心肌纤维化的发病机制，并寻找治疗靶点	心脏成纤维细胞（CFs），特别关注LRRc17对铁死亡的调节	数字病理学	心肌梗死	RNA测序，qRT-PCR，Western blotting，Masson染色，细胞活力测定（CCK-8）	体内外心肌梗死模型	基因表达数据	NA