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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1061 | 2025-10-05 |
Automating classification of treatment responses to combined targeted therapy and immunotherapy in HCC
2025-Sep-17, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjaf031
PMID:40974077
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研究论文 | 开发多模态CNN-Transformer模型预测肝细胞癌患者对TKI联合免疫治疗的疗效反应 | 首次构建融合影像和临床特征的多模态深度学习模型,并采用两阶段3D U-Net自动分割系统减少人工干预偏差 | 样本量有限(训练队列181例,验证队列30例),且主要针对无法手术的晚期HCC患者 | 预测肝细胞癌患者对TKI联合免疫治疗的治疗反应 | 晚期肝细胞癌患者 | 计算机视觉 | 肝细胞癌 | 单细胞测序,磁共振成像 | CNN-Transformer,3D U-Net | 影像,临床数据 | 训练队列181例,验证队列30例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1062 | 2025-10-05 |
Harnessing scRNA-seq and bulk RNA-seq to identify CD39+T cell genes for rheumatoid arthritis diagnosis and therapy
2025-Sep-17, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf130
PMID:40974094
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,鉴定CD39+T细胞相关基因作为类风湿关节炎诊断和治疗的生物标志物 | 首次聚焦CD39+T细胞在类风湿关节炎中的作用,发现PELI1等关键基因的诊断价值并构建lncRNA-miRNA-PELI1调控网络 | 未明确说明样本规模和研究人群特征,需要进一步实验验证PELI1的生物学功能 | 识别类风湿关节炎的诊断和治疗生物标志物 | 类风湿关节炎患者的CD39+T细胞 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
1063 | 2025-10-05 |
Effects of Oligolysine-Polyethylene Glycol Coating on the Biodistribution of Wireframe DNA Origami Nanosheets in Zebrafish Embryos
2025-Sep-16, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c05801
PMID:40900000
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研究论文 | 本研究通过斑马鱼胚胎模型分析寡聚赖氨酸-聚乙二醇涂层对线框DNA折纸纳米片生物分布的影响 | 首次结合长期高分辨率活体成像和单细胞RNA测序,在斑马鱼胚胎中研究DNA折纸纳米结构的生物分布和清除机制 | 研究仅限于斑马鱼胚胎模型,结果向其他生物系统的推广性有待验证 | 探究K-PEG涂层对DNA折纸纳米结构在生物体内分布和清除的影响 | 斑马鱼胚胎 | 纳米生物技术 | NA | 单细胞RNA测序,活体成像 | NA | 图像,基因表达数据 | 斑马鱼胚胎 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1064 | 2025-10-05 |
Transcriptional states of lung cancer microenvironment reveal macrophage subtype dynamics linked to disease progression
2025-Sep-16, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf253
PMID:40972001
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和临床数据分析,揭示了肺癌微环境中肿瘤相关巨噬细胞亚型的动态变化与疾病进展的关系 | 建立了7种巨噬细胞亚型的精细分类系统,发现脂质相关TAMs随疾病进展而扩增并具有免疫抑制特性,提出了脂质相关与组织驻留TAMs比率作为预后指标 | 空间转录组分析依赖于反卷积技术推断细胞类型组成,对精细TAM亚群分析的准确性存在依赖 | 解析肺癌微环境中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其在疾病进展中的作用 | 肺腺癌和肺鳞状细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 分层分类, 基于细胞的基因评分 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 临床数据 | 大型癌症队列数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
1065 | 2025-10-05 |
Endothelial plasticity in atrial fibrosis by integrating single-cell sequencing and genetic lineage tracing
2025-Sep-15, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehaf372
PMID:40626706
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和遗传谱系追踪技术,揭示了内皮细胞通过TGF-β1调控心房纤维化的新机制 | 首次发现间充质活化内皮细胞(EndoMA)通过分泌TGF-β1促进成纤维细胞功能,而非通过完全的内皮-成纤维细胞转分化 | 未观察到完全的内皮-成纤维细胞转分化过程,机制研究仍需深入 | 阐明内皮细胞在心房纤维化中的具体作用机制 | 人心房组织、Cdh5-CreERT2;RFP基因工程小鼠、人原代心房内皮细胞和成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪, 免疫荧光, 高内涵筛选 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 窦性心律和房颤患者的心房组织,基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1066 | 2025-10-05 |
Infusion of peripheral blood mononuclear cell alleviates amyloid accumulation and cognitive deficits in Alzheimer's disease
2025-Sep-12, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glaf193
PMID:40971495
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研究论文 | 本研究探讨外周血单个核细胞对阿尔茨海默病淀粉样蛋白积累和认知缺陷的改善作用 | 首次发现外周血单个核细胞移植可减少AD小鼠Aβ斑块和p-Tau沉积并改善认知功能,鉴定JUN基因为AD诊断关键标志物 | 样本量有限,未深入探讨PBMCs作用机制,临床转化需进一步验证 | 探究外周血单个核细胞在阿尔茨海默病中的作用及潜在治疗价值 | 健康对照和AD患者的外周血单个核细胞,野生型小鼠和AD模型小鼠 | 神经退行性疾病研究 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,ROC曲线分析,GO和KEGG通路分析 | NA | 基因表达数据,认知行为数据,病理染色数据 | 健康对照和AD患者PBMCs样本,9月龄和6月龄AD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1067 | 2025-10-05 |
OPIOID-EXPRESSING B CELLS SILENCE TUMOR-INFILTRATING NOCICEPTOR NEURONS
2025-Sep-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7389517/v1
PMID:40951290
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研究论文 | 本研究揭示了阿片类药物通过调节B细胞产生的痛敏肽/孤啡肽(N/OFQ)来影响肿瘤浸润伤害感受神经元活性的新机制 | 首次发现B细胞是N/OFQ的主要来源,并阐明了N/OFQ-OPRL1和CGRP-RAMP1信号通路在调节肿瘤疼痛和抗肿瘤免疫中的相互作用 | 研究主要基于头颈鳞癌和黑色素瘤模型,在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探索癌症疼痛与抗肿瘤免疫之间的分子机制 | 头颈鳞状细胞癌患者、黑色素瘤患者、口腔鳞癌小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 头颈癌, 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 动物模型, 细胞共培养 | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达数据, 临床数据, 行为学数据 | 头颈癌患者回顾性分析, 多种小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1068 | 2025-10-05 |
Integrative genomics elucidates the evolutionary, temporal, and developmental origins of a hydrocephalus risk gene
2025-Sep-02, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.09.01.25334358
PMID:40950474
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研究论文 | 本研究通过整合基因组学方法揭示了脑积水风险基因MAEL的进化起源、时间表达模式和发育谱系特征 | 首次系统描绘MAEL基因在人类大脑发育过程中的进化起源、时空表达模式,并在人类脑积水组织中直接验证其表达降低 | MAEL基因在常用模式生物中序列同源性低,限制了体外和体内机制研究的适用性 | 阐明MAEL基因在脑积水和发育中人类大脑中的进化、时间、发育和谱系表达特征 | 人类大脑组织,包括发育中大脑和脑积水患者手术获取的皮质组织 | 基因组学 | 脑积水 | 单细胞RNA测序,整合基因组学分析 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 49个大脑区域的单细胞RNA测序数据,加上手术获取的脑积水原代皮质组织 | Allen Institute | 单细胞RNA测序 | NA | 发育中人类大脑图谱的单细胞RNA测序数据 |
1069 | 2025-10-05 |
Exploring mechanisms of britannin against colorectal cancer based on experimentally validated network pharmacology
2025-Sep, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-03995-2
PMID:40080155
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研究论文 | 本研究通过实验验证的网络药理学方法探讨了旋覆花素对结直肠癌的作用机制 | 首次结合网络药理学和单细胞RNA测序技术系统研究旋覆花素的抗结直肠癌机制,并发现其对巨噬细胞极化的调控作用 | 研究机制尚未完全阐明,需要进一步验证具体分子靶点 | 探索旋覆花素治疗结直肠癌的作用机制 | 结直肠癌细胞和肿瘤微环境 | 网络药理学 | 结直肠癌 | 网络药理学,单细胞RNA测序,CIBERSORT分析,体外实验,体内实验 | NA | 基因表达数据,实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1070 | 2025-10-05 |
Mapping molecular landscapes in triple-negative breast cancer: insights from spatial transcriptomics
2025-Sep, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04057-3
PMID:40119898
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综述 | 本文综述了空间转录组学在三阴性乳腺癌肿瘤微环境研究中的应用与进展 | 整合空间转录组学与蛋白质组学、成像质谱流式技术,结合AI进行空间分析,推动精准医疗和生物标志物发现 | 需要进一步发展ST技术、计算工具和多中心合作才能将空间转录组学整合到临床常规实践中 | 探讨空间转录组学在三阴性乳腺癌研究中的应用价值 | 三阴性乳腺癌的肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 三阴性乳腺癌 | 空间转录组学 | AI-based spatial analysis | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1071 | 2025-10-05 |
Anti-Peptidylarginine Deiminase 4 Autoantibodies Derived From Patients With Rheumatoid Arthritis Exert Pathogenic Effects by Activating Monocytes and Exacerbating Inflammatory Arthritis
2025-Sep, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43168
PMID:40176290
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研究论文 | 本研究揭示了类风湿关节炎患者来源的抗PAD4自身抗体通过激活单核细胞和加剧炎症性关节炎的致病机制 | 首次证明抗PAD4抗体可直接结合单核细胞并触发炎症级联反应,促进T细胞活化和滑膜成纤维细胞炎症表型 | 研究主要基于胶原诱导性关节炎小鼠模型和体外细胞培养,需要进一步验证在人类患者中的直接病理机制 | 阐明抗PAD4自身抗体在类风湿关节炎发病机制中的具体作用 | 类风湿关节炎患者、胶原诱导性关节炎小鼠模型、人类单核细胞和滑膜成纤维细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、体外细胞培养、流式细胞术 | 胶原诱导性关节炎小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞表型数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及患者来源的抗体、小鼠模型和人类细胞培养 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1072 | 2025-10-05 |
Single-cell epigenetics and multiomics analysis in kidney research
2025-Sep, Clinical and experimental nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1007/s10157-025-02679-8
PMID:40281349
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综述 | 概述单细胞分析技术,重点关注新兴表观基因组学和多组学方法及其在肾脏研究中的应用 | 整合表观基因组与转录组的单细胞多组学分析,揭示驱动细胞异质性的基因调控机制 | NA | 促进肾脏疾病新型生物标志物和治疗靶点的发现及临床转化 | 健康与疾病状态下的肾脏细胞 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序技术 | NA | 表观基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞表观基因组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
1073 | 2025-10-05 |
Colorectal Liver Metastasis Pathomics Model: Integrating Single-Cell and Spatial Transcriptome Analysis With Pathomics for Predicting Liver Metastasis in Colorectal Cancer
2025-Sep, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100805
PMID:40473111
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研究论文 | 本研究开发了一种结直肠癌肝转移病理组学模型,通过整合单细胞转录组、空间转录组分析和病理组学来预测结直肠癌肝转移风险 | 首次通过整合单细胞RNA测序和空间转录组分析识别出肝转移触发恶性细胞,并开发了基于弱监督学习的深度学习模型预测肝转移风险 | 模型在外部验证集表现存在差异(AUC 0.72-0.89),需要进一步验证和优化 | 提高结直肠癌肝转移风险的识别和预测能力 | 结直肠癌患者 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析, 批量RNA测序 | ResNet18, 一类逻辑回归算法 | 全切片图像, 转录组数据 | 癌症基因组图谱-结直肠癌组织学图像内部测试集及两个外部独立验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
1074 | 2025-10-05 |
High-Dimensional Analysis of Type 2 Lymphocyte Dynamics During Mepolizumab or Dupilumab Treatment in Severe Asthma
2025-Sep, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16633
PMID:40566935
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研究论文 | 本研究通过高维流式细胞术分析美泊利单抗和度普利尤单抗治疗对重症哮喘患者2型淋巴细胞的影响 | 首次系统揭示美泊利单抗通过改变2型淋巴细胞的组织归巢受体表达和细胞因子产生能力来减轻气道炎症的新机制 | 样本量较小(特别是度普利尤单抗组仅7例),单细胞RNA测序样本量有限(n=3) | 探究2型生物制剂对重症哮喘患者循环淋巴细胞的影响机制 | 40例重症哮喘患者的外周血单个核细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 高参数流式细胞术, 单细胞RNA测序, 细胞刺激实验 | NA | 流式细胞数据, 单细胞转录组数据 | 40例患者(美泊利单抗33例,度普利尤单抗7例),治疗前及治疗后4、12个月采样 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1075 | 2025-10-05 |
Epithelial Lining Fluid Cystatin SN is a Noninvasive Biomarker for Predicting Type 2 Chronic Rhinosinusitis
2025-Sep, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16652
PMID:40689541
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现ELF中cystatin SN可作为预测2型慢性鼻窦炎的非侵入性生物标志物 | 首次发现cystatin SN在2型慢性鼻窦炎上皮细胞中特异性表达,并验证其在ELF中的诊断价值 | 样本来源和规模可能限制结果的普适性,需要更大规模研究验证 | 识别2型慢性鼻窦炎的非侵入性生物标志物以实现个体化治疗 | 慢性鼻窦炎患者和对照个体的鼻组织和上皮衬液样本 | 生物医学研究 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序, Luminex多重分析, 酶联免疫吸附试验, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白质浓度数据, 临床评分数据 | 慢性鼻窦炎患者和对照个体(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1076 | 2025-10-05 |
Dopaminergic short axon cells integrate sensory and top-down inputs to enhance discriminative learning in the mouse olfactory bulb
2025-Sep, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003375
PMID:40956809
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研究论文 | 本研究揭示了多巴胺能短轴细胞在小鼠嗅球中整合感觉和自上而下输入以增强辨别学习的神经机制 | 发现SACs通过突触和结构可塑性实现基于气味效价的感觉输入调节,并确定胆碱能输入作为效价依赖信号调节SAC活动 | 研究局限于小鼠嗅球系统,机制在其他感觉系统中的普适性仍需验证 | 探索辨别学习中增强感觉表征的神经机制 | 小鼠嗅球中的多巴胺能短轴细胞(SACs) | 神经科学 | NA | 光学成像、空间转录组学、电子显微镜 | NA | 图像、转录组数据、显微结构数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1077 | 2025-10-05 |
Single-cell sequencing analysis reveals the promotion of ELR CXCL genes on angiogenesis and the influence on malignant progression in glioblastoma
2025-Sep-01, Journal of clinical biochemistry and nutrition
IF:2.0Q3
DOI:10.3164/jcbn.25-26
PMID:40963732
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研究论文 | 通过单细胞测序分析揭示ELR CXCL基因在胶质母细胞瘤中促进血管生成并影响恶性进展的作用机制 | 首次在胶质母细胞瘤中鉴定出癌症相关骨髓源性巨噬细胞亚群,并发现其特异性高表达ELR CXCL基因(特别是CXCL3)通过促进血管生成驱动肿瘤恶性进展 | 研究主要基于公共数据库数据,实验验证仍需进一步扩展;细胞亚群功能机制研究深度有限 | 探究胶质母细胞瘤微环境中髓系细胞亚群的异质性及其在肿瘤恶性进展中的作用 | 胶质母细胞瘤组织样本和细胞系 | 单细胞生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 血管生成实验, CCK-8, 集落形成实验, Transwell实验, 流式细胞术 | NA | 单细胞基因表达数据, 实验数据 | 来自GEO数据库的胶质母细胞瘤单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1078 | 2025-10-05 |
Enhanced hematopoietic stem cell self-renewal and engraftment through human lung exosomal communication
2025-Aug-11, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.08.020
PMID:40798884
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研究论文 | 本研究通过单细胞外泌体追踪分析发现肺细胞通过外泌体通讯显著增强造血干细胞自我更新和移植能力 | 首次揭示肺细胞通过外泌体通讯调节造血干细胞稳态的新机制,突破了传统认为造血干细胞稳态仅受骨髓微环境调控的认知 | 研究主要基于实验条件,在临床转化应用中仍需进一步验证 | 探究肺细胞通过外泌体通讯对造血干细胞功能的调控机制 | 造血干细胞,特别是长期造血干细胞 | 单细胞生物学 | 镰状细胞病,骨髓衰竭 | 单细胞RNA测序,外泌体microRNA分析,蛋白质组学 | 单细胞外泌体追踪流程 | 单细胞RNA测序数据,miRNA数据,蛋白质数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq,外泌体分析 | NA | NA |
1079 | 2025-10-05 |
Overexpression of high affinity Type I adenosine receptors promotes the growth of uterine leiomyomas
2025-Jul-03, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf025
PMID:40489662
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研究论文 | 本研究探讨I型腺苷受体(ADORA1)过表达在子宫肌瘤生长中的作用机制 | 首次发现ADORA1受体在子宫肌瘤中的过表达现象,并阐明其通过调控AKT1信号通路促进肿瘤生长的机制 | 研究样本来源未明确说明具体数量,机制研究主要基于体外实验 | 探究细胞外腺苷水平改变促进子宫肌瘤生长的分子机制 | 子宫肌瘤组织标本和原代培养细胞 | 分子病理学 | 子宫肌瘤 | RT-qPCR, western blot, 免疫组织化学, 单细胞转录组学, siRNA干扰 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
1080 | 2025-10-05 |
The immune checkpoint regulator CD40 potentiates myocardial inflammation
2025-Apr, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00633-1
PMID:40217124
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研究论文 | 本研究揭示CD40激动剂通过激活CCR2巨噬细胞和招募效应记忆CD8 T细胞重塑心脏免疫环境,促进心肌炎症 | 首次发现CD40激动剂通过CCR2巨噬细胞与CD8 T细胞间的IL-12b/TNF/IFNγ信号正反馈环路驱动心肌炎症 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究CD40激动剂诱发心肌炎症的潜在机制 | 遗传工程小鼠模型的心脏免疫细胞 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞测序,细胞清除研究 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |