单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 34059 篇文献，本页显示第 1061 - 1080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2025-12-03 |
Belimumab modulates type I interferon signalling in the treatment of systemic lupus erythematosus
2025-Nov-19, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/03t59o
PMID:41328601
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了系统性红斑狼疮患者在接受贝利尤单抗治疗前后的免疫图谱变化 | 首次在单细胞分辨率下揭示了贝利尤单抗通过调节I型干扰素信号通路发挥治疗作用的新机制 | 样本量较小（仅6例患者），且为观察性研究 | 探究贝利尤单抗对系统性红斑狼疮患者免疫图谱的影响 | 系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例活动性系统性红斑狼疮患者（治疗组3例，对照组3例） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1062 | 2025-12-03 |
Dual-modality Molecular Cartography: Integrating Multiplex mRNA Detection with Protein Imaging Mass Cytometry
2025-Nov-14, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68616
PMID:41325369
|
研究论文 | 本文提出了一种双模态分子图谱技术，整合了多重mRNA检测与蛋白质成像质谱流式技术 | 通过金属探针将蛋白质成像质谱流式技术与mRNA原位杂交结合，实现蛋白质和mRNA在单一切片中的同时高维空间分析 | NA | 开发一种整合蛋白质和mRNA检测的双模态空间分析技术，以理解细胞在微环境中的通讯机制 | 组织切片中的蛋白质和mRNA分子 | 数字病理学 | NA | mRNA原位杂交，蛋白质成像质谱流式技术 | NA | 图像，空间分子数据 | NA | NA | 空间转录组学，空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1063 | 2025-12-03 |
Microfluidics-based High-throughput Circulating Tumor Cell Sorting and Single-cell Sequencing Technology
2025-Nov-14, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68708
PMID:41325384
|
研究论文 | 本文提出了一种集成了微流控技术的高通量循环肿瘤细胞分选与单细胞测序方法 | 开发了一种集成了CTCs富集、纯化和单细胞测序的微流控一体化工作流程，克服了传统方法回收率低、工作流程繁琐和污染风险高的限制 | 未在摘要中明确提及 | 开发一种高效、高通量的循环肿瘤细胞分选与单细胞测序技术，以更好地分析CTCs的异质性 | 循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1064 | 2025-12-03 |
Uncovering CD248, MMP28, and SLC16A10 in primary Sjögren's disease: a machine learning-driven SHAP approach for CD4+ T cell-associated biomarker discovery
2025-Nov-14, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/2ffdc4
PMID:41328587
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研究论文 | 本研究通过整合机器学习算法、SHAP可解释性建模、分子对接和单细胞分析，发现了CD248、MMP28和SLC16A10作为原发性干燥综合征的潜在生物标志物和治疗靶点 | 结合12种机器学习算法与SHAP可解释性分析，从转录组数据中识别出与CD4+ T细胞亚群相关的关键基因，并利用单细胞RNA测序和分子对接进行验证，揭示了干燥综合征发病机制中先前未被充分认识的机制 | 需要未来的实验验证来确认其转化潜力 | 促进干燥综合征的早期诊断和治疗 | 干燥综合征患者和健康对照的转录组数据，重点关注CD4+ T细胞亚群 | 机器学习 | 干燥综合征 | 转录组学分析，单细胞RNA测序，分子对接 | 多种机器学习算法（12种），SHAP | 转录组数据 | 训练队列包含382个样本（61名健康对照，321名干燥综合征患者） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1065 | 2025-12-03 |
Mendelian Randomization and ScTranscriptomics Reveal a Lipid Low Malignant Cells Driving Immunosuppression and Matrix Remodeling in Oral squamous cell carcinoma
2025-Nov-13, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.104009
PMID:41237591
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，揭示了口腔鳞状细胞癌中脂质低恶性细胞亚群与不良预后的关联 | 结合孟德尔随机化和单细胞转录组学方法，首次识别出与甘油磷脂代谢低相关的脂质低恶性细胞亚群，并发现其与患者预后不良、迁移能力增强、增殖活性及免疫逃逸特征相关 | NA | 探究口腔鳞状细胞癌中脂质代谢与患者预后不良风险的关系 | 口腔鳞状细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1066 | 2025-12-03 |
Myocardial reprogramming by HMGN1 underlies heart defects in trisomy 21
2025-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09593-9
PMID:41125893
|
研究论文 | 本研究通过人类多能干细胞和小鼠模型，揭示了染色体21上的HMGN1基因在唐氏综合征相关先天性心脏缺陷中的关键作用 | 首次将HMGN1鉴定为唐氏综合征中心脏缺陷的剂量敏感调节因子，并利用CROP-seq技术筛选染色体21基因，阐明了其在房室管心肌细胞重编程中的机制 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，人类临床验证有限，且未全面探索其他染色体21基因的潜在协同效应 | 解析唐氏综合征中先天性心脏缺陷的遗传基础，特别是房室管缺陷的分子机制 | 人类多能干细胞、小鼠模型以及房室管心肌细胞 | 发育生物学与遗传学 | 先天性心脏缺陷与唐氏综合征 | 单细胞转录组学、CRISPR激活单细胞RNA液滴测序（CROP-seq）、基因编辑 | 人类多能干细胞模型、小鼠遗传模型 | 单细胞RNA测序数据、基因表达谱 | 未明确指定具体样本数量，但涉及人类干细胞和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1067 | 2025-12-03 |
Role of long-chain acyl-CoA synthetases in MASH-driven hepatocellular carcinoma and ferroptosis
2025-Nov-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00096.2025
PMID:40875358
|
研究论文 | 本研究通过整合多种组学技术，揭示了代谢功能障碍相关脂肪性肝炎驱动的肝细胞癌中脂质代谢重编程的特征，并阐明了长链酰基辅酶A合成酶家族（特别是ACSL4）在调控铁死亡敏感性及肿瘤免疫微环境中的作用 | 首次在MASH-HCC中系统描绘了脂质代谢全景图，并发现ACSL4在肿瘤组织中特异性富集且与铁死亡敏感性相关，同时揭示了ACSL4在免疫细胞中的表达及其对肿瘤免疫微环境的潜在调控作用 | 研究主要基于观察性数据和体外实验，体内功能验证和具体分子机制有待进一步深入；小鼠模型与人类疾病存在物种差异 | 探究MASH-HCC中脂质代谢重编程的特征及其与铁死亡敏感性的关系，寻找潜在治疗靶点 | 人类MASH-HCC组织样本、人类HCC细胞系、饮食诱导的小鼠MASH-HCC模型 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 人类MASH和MASH-HCC肝脏样本（具体数量未明确），人类HCC细胞系，小鼠MASH-HCC模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1068 | 2025-12-03 |
Neuroprotective role of DNTαβ Cell transplantation on modulating immune microenvironment in spinal cord injured mice
2025-Oct, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.neurot.2025.e00743
PMID:40987706
|
研究论文 | 本研究探讨了DNTαβ细胞移植在脊髓损伤小鼠中通过调节免疫微环境发挥神经保护作用的机制 | 首次利用单细胞测序揭示DNT细胞的异质性，并验证DNTαβ细胞移植通过Gzmb和IFN通路调节免疫反应，促进脊髓损伤后的早期修复和神经保护 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床试验中验证，且具体分子机制需进一步深入探索 | 探究DNTαβ细胞移植对脊髓损伤后免疫微环境的调节作用及其神经保护效果 | 脊髓损伤小鼠模型 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 流式细胞术、单细胞测序、转录组测序、免疫组织化学 | NA | 单细胞测序数据、转录组数据、流式细胞术数据、免疫组织化学图像 | 未明确指定样本数量，但使用小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1069 | 2025-12-03 |
Coxiella burnetii strains elicit distinct inflammatory responses in human macrophages
2025-Aug-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.10.669536
PMID:40832301
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序，揭示了不同毒力Coxiella burnetii菌株感染人肺泡巨噬细胞后诱导的差异性炎症反应 | 首次在单细胞分辨率下比较不同毒力Coxiella burnetii菌株感染人巨噬细胞后的转录组差异，揭示了菌株特异性和细胞异质性对免疫应答的影响 | 研究仅使用人肺泡巨噬细胞，未涉及其他免疫细胞类型；体外感染模型可能无法完全模拟体内感染环境 | 阐明Coxiella burnetii不同菌株与宿主巨噬细胞相互作用的分子机制，为Q热治疗提供新见解 | 人肺泡巨噬细胞感染不同毒力Coxiella burnetii菌株（NMI、G、NMII、Dugway） | 感染免疫学 | Q热 | RNA测序，单细胞RNA测序，细胞因子检测 | NA | 转录组数据，单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1070 | 2025-12-03 |
Multi-region spatial transcriptomics reveals region specific differences in response to amyloid beta (Aβ) plaque induced changes in Alzheimer's Disease (AD)
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.31.667719
PMID:40766691
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研究论文 | 本研究利用多区域空间转录组学技术，揭示了阿尔茨海默病中不同脑区对淀粉样蛋白斑块诱导变化的区域特异性差异 | 首次在AD研究中同时进行匹配的多区域空间转录组学和Aβ免疫荧光染色，揭示了Aβ斑块微环境中细胞类型比例、基因表达和细胞间通讯的区域特异性差异 | 研究样本量较小（仅2名Braak III和Thal 4期AD患者），且仅分析了特定脑区，可能无法代表AD的完整疾病谱系 | 阐明AD中不同脑区对Aβ斑块诱导变化表现出不同脆弱性和恢复力的细胞类型和分子机制 | 两名Braak III和Thal 4期AD患者的四个脑区：内嗅皮层、颞枕皮层、背外侧前额叶皮层和纹状皮层 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据，免疫荧光图像 | 2名AD患者的4个脑区组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1071 | 2025-12-03 |
Uncovering the Regional and Cell Specific Bioactivity of Injectable Extracellular Matrix Biomaterials in Myocardial Infarction through Spatial and Single Nucleus Transcriptomics
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.25.661525
PMID:40667036
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和单核RNA测序技术，揭示了注射性细胞外基质生物材料在心肌梗死中的区域和细胞特异性生物活性 | 首次结合空间转录组学和单核RNA测序技术，系统探究细胞外基质水凝胶在心肌梗死治疗中的区域和细胞特异性生物活性，揭示了未发现的治疗靶点 | 未明确提及样本量或实验设计的局限性，可能缺乏长期疗效评估或临床转化验证 | 探究细胞外基质生物材料在心肌梗死治疗中的治疗活性和机制 | 心肌梗死模型中的心脏组织，包括巨噬细胞、成纤维细胞、淋巴管、血管、平滑肌细胞和心肌细胞等 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | NA |
| 1072 | 2025-12-03 |
TFcomb identifies transcription factor combinations for cellular reprogramming based on single-cell multiomics data
2025-Jun-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279955.124
PMID:40210438
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研究论文 | 本文提出了一种名为TFcomb的计算方法，利用单细胞多组学数据识别细胞重编程所需的转录因子及其组合 | 将寻找重编程转录因子及其组合的任务建模为逆问题，采用Tikhonov正则化保证解的泛化能力，并设计图注意力网络增强基于单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据构建的基因调控网络 | NA | 开发计算工具以识别驱动细胞状态转换的重编程转录因子组合 | 细胞重编程过程 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 图注意力网络 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1073 | 2025-12-03 |
Dissecting multilayer cell-cell communications with signaling feedback loops from spatial transcriptomics data
2025-Jun-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279857.124
PMID:40262896
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研究论文 | 本文介绍了一种名为stMLnet的方法，用于从空间转录组学数据中解析多层细胞间通讯及信号反馈环路 | stMLnet创新性地整合了空间信息和多层信号调控机制，以识别多层细胞间通讯中的信号反馈环路，相比现有方法在配体-受体推断和细胞内靶基因预测方面表现更优 | NA | 开发一种工具以更好地解析空间转录组学数据中的多层细胞间通讯和信号反馈机制 | 空间转录组学数据，包括来自seqFISH+、Slide-seq v2、MERFISH和Stereo-seq等多种技术的样本 | 空间转录组学 | COVID-19感染 | 空间转录组学 | 扩散模型和质量作用模型 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | seqFISH+, Slide-seq v2, MERFISH, Stereo-seq | NA |
| 1074 | 2025-12-03 |
STCC enhances spatial domain detection through consensus clustering of spatial transcriptomics data
2025-Jun-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280031.124
PMID:40355284
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STCC的新型共识聚类框架，用于整合空间转录组学数据中的空间域检测工具，以提高聚类准确性和稳定性 | 开发了STCC共识聚类框架，首次整合了多种先进工具和共识策略（如Onehot-based、average-based、hypergraph-based和wNMF-based方法），以优化空间转录组学数据的空间域检测 | 未明确说明框架在处理高度异质性或复杂组织样本时的具体局限性，且可能依赖于输入参数的设置 | 通过共识策略整合不同工具，提高空间转录组学数据中空间域检测的准确性和稳定性 | 空间转录组学数据，包括模拟数据和来自不同实验平台的真实数据，涉及正常组织和肿瘤样本 | 空间转录组学 | NA | 共识聚类 | NA | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1075 | 2025-12-03 |
Androgen Signaling in Type 2 Innate Lymphoid Cells Drives Sex Differences in Helicobacter -Induced Gastric Inflammation and Atrophy
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.643321
PMID:40166158
|
研究论文 | 本研究揭示了雄激素通过调节2型固有淋巴细胞（ILC2s）的活化来抑制幽门螺杆菌诱导的胃部炎症，解释了男性胃癌发病率随年龄增长而增加的机制 | 首次发现雄激素通过调控ILC2s活性在幽门螺杆菌感染中发挥保护作用，揭示了性别差异在胃部炎症和癌前病变发展中的分子机制 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证；未全面探讨其他性激素如雌激素的潜在影响 | 探究雄激素如何影响幽门螺杆菌感染引起的胃部炎症反应，并解释疾病进展中的性别差异 | C57BL/6小鼠（雄性和雌性）感染猫幽门螺杆菌，以及ILC2和T细胞缺陷小鼠模型 | 免疫学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫细胞通讯网络分析，基因缺陷小鼠模型 | 动物模型（小鼠） | 单细胞转录组数据，组织病理学数据 | 未明确指定样本数量，但涉及雄性和雌性C57BL/6小鼠以及基因缺陷模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1076 | 2025-12-03 |
Disturbed Flow Induces Reprogramming of Endothelial Cells to Immune-like and Foam Cells under Hypercholesterolemia during Atherogenesis
2025-Mar-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4397799/v1
PMID:40092444
|
研究论文 | 本研究验证了血流紊乱与高胆固醇血症共同诱导内皮细胞重编程为免疫样细胞和泡沫细胞，促进动脉粥样硬化斑块形成的双打击假说 | 首次通过单细胞RNA测序和遗传谱系追踪模型，证实血流紊乱与高胆固醇血症协同诱导内皮细胞向免疫样细胞和泡沫细胞转化，揭示了内皮细胞重编程的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据为公开数据集再分析，需进一步实验验证人类样本中的直接证据 | 探究血流紊乱与高胆固醇血症在动脉粥样硬化发生中对内皮细胞重编程的协同作用机制 | 小鼠颈动脉内皮细胞及动脉粥样硬化斑块中的细胞群体 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组织化学染色、遗传谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据、组织染色图像 | 95只小鼠的98,553个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1077 | 2025-12-03 |
Disturbed Flow Induces Reprogramming of Endothelial Cells to Immune-like and Foam Cells under Hypercholesterolemia during Atherogenesis
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.06.641843
PMID:40093090
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系示踪技术，验证了在动脉粥样硬化形成过程中，紊乱血流和高胆固醇血症共同诱导内皮细胞重编程为免疫样细胞和泡沫细胞的“双重打击”假说 | 首次提出并验证了内皮细胞在紊乱血流和高胆固醇血症共同作用下可重编程为免疫样细胞（EndIT）和泡沫细胞（EndFT）的新概念，并提供了直接的谱系示踪证据 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证仍需进一步深入；研究时间点限于术后2周和4周，更长期的动态变化未涉及 | 探究紊乱血流和高胆固醇血症在动脉粥样硬化形成过程中对内皮细胞重编程的协同作用机制 | 小鼠颈动脉内皮细胞，以及从内膜和剩余颈动脉组织中分离的单细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫组织化学染色，谱系示踪 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 来自95只小鼠的98,553个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1078 | 2025-12-03 |
Eosinophils Enhance Granuloma-Mediated Control of Persistent Salmonella Infection
2025-Jan-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5610725/v1
PMID:39801515
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了嗜酸性粒细胞在控制鼠伤寒沙门氏菌持续性感染中的宿主保护作用 | 首次发现嗜酸性粒细胞通过CCL11依赖性机制被招募至肉芽肿，并在控制持续性细菌感染中发挥关键作用 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类感染中得到验证 | 探究嗜酸性粒细胞在宿主对抗持续性细菌感染中的作用机制 | 鼠伤寒沙门氏菌（Tm）感染的小鼠模型 | 感染免疫学 | 细菌感染 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1079 | 2025-12-03 |
Transcriptomic Evaluation of a Stress Vulnerability Network Using Single-Cell RNA Sequencing in Mouse Prefrontal Cortex
2024-Dec-01, Biological psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1016/j.biopsych.2024.05.023
PMID:38866174
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序评估小鼠前额叶皮层中的应激脆弱性网络，揭示了与应激脆弱性相关的细胞类型和基因表达差异 | 首次结合多点在体神经生理学和单细胞RNA测序技术，识别出大脑中潜在应激脆弱性状态涉及的细胞类型和基因 | 研究仅基于小鼠模型，样本量较小（n=12），且性别仅限于C57BL/6品系，可能限制对人类应激脆弱性的直接推广 | 探究应激脆弱性的分子机制，以理解情绪障碍如重度抑郁症的风险因素 | 雄性及雌性C57BL/6小鼠的前额叶皮层细胞 | 神经科学 | 情绪障碍 | 单细胞RNA测序，多点在体神经生理学 | NA | 转录组数据，电生理数据 | 12只C57BL/6小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1080 | 2025-12-03 |
Nonepithelial Gene Expression Correlates With Symptom Severity in Adults With Eosinophilic Esophagitis
2024-Dec, The journal of allergy and clinical immunology. In practice
DOI:10.1016/j.jaip.2024.05.015
PMID:38768900
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研究论文 | 本研究探讨了嗜酸性粒细胞性食管炎（EoE）患者症状严重程度与非上皮细胞基因表达之间的相关性 | 首次将患者报告的症状指标（EEsAI）与食管非上皮细胞基因表达关联，揭示了成纤维细胞等非上皮细胞在EoE症状严重性中的潜在作用 | 样本量相对有限（146名成人），且仅基于回顾性数据分析，未进行实验验证 | 揭示EoE症状变异的分子机制，探索症状严重程度与食管基因表达的关系 | 146名成人EoE患者，根据食管扩张史分组 | 生物信息学 | 嗜酸性粒细胞性食管炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 146名成人EoE患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |