单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 1061 - 1080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2025-04-15 |
Role of TGF-β/SMAD/YAP/TAZ signaling in skeletal muscle fibrosis
2025-Mar-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00541.2024
PMID:39925133
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研究论文 | 探讨TGF-β/SMAD/YAP/TAZ信号通路在骨骼肌纤维化中的作用 | 揭示了TGF-β通过YAP/TAZ调控FAPs向肌成纤维细胞分化的新机制，并提出YAP/TAZ作为肌肉纤维增殖性疾病的潜在治疗靶点 | 对FAPs分化为肌成纤维细胞的核调控因子理解尚处于初级阶段 | 研究TGF-β信号通路在骨骼肌纤维化中的作用机制 | 骨骼肌纤维化过程中的FAPs分化和YAP/TAZ活性 | 分子生物学 | 肌肉萎缩症 | 空间转录组学分析、原代培养 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型和原代培养的FAPs |
| 1062 | 2025-04-15 |
Distinct single-cell transcriptional profile in CD4+ T-lymphocytes among obese children with asthma
2025-Mar-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00270.2024
PMID:39868576
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，比较了肥胖与正常体重哮喘儿童的CD4+ T细胞转录组差异 | 首次在单细胞水平揭示了肥胖哮喘儿童CD4+ T细胞的独特转录特征，发现了与IL-7受体和Rho转录信号通路相关的新机制 | 样本量较小（仅8名参与者），需要在更大规模队列中验证发现 | 探究肥胖哮喘儿童CD4+ T细胞的分子特征及其与疾病严重程度的关系 | 肥胖与正常体重哮喘儿童的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 8名匹配的哮喘儿童（肥胖与正常体重各半） |
| 1063 | 2025-04-15 |
BRD4 inhibition rewires cardiac macrophages toward a protective phenotype marked by low MHC class II expression
2025-Feb-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00438.2024
PMID:39716819
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研究论文 | 本文研究了BRD4抑制如何通过改变心脏巨噬细胞的表型，从而在心力衰竭模型中发挥保护作用 | 揭示了BRD4抑制通过调控巨噬细胞的MHC-II表达和NF-κB信号通路，促进心脏修复的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类心脏疾病的适用性尚需进一步验证 | 探索BET抑制剂JQ1改善心脏结构和功能的细胞机制 | 心脏巨噬细胞和成纤维细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 小鼠缺血/再灌注损伤模型 | 基因表达数据 | 小鼠心脏组织样本 |
| 1064 | 2025-04-15 |
mTOR signaling regulates multiple metabolic pathways in human lung fibroblasts after TGF-β and in pulmonary fibrosis
2025-Feb-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00189.2024
PMID:39745695
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研究论文 | 研究mTOR信号在TGF-β处理后的人类肺成纤维细胞及肺纤维化中调节多种代谢途径的作用 | 揭示了mTOR和ATF4在肺成纤维细胞中调节氨基酸稳态、糖酵解酶和线粒体电子传递链亚基等新的代谢途径 | 研究主要基于体外实验和公开的单细胞RNA-seq数据集，未涉及动物模型验证 | 探讨mTOR和ATF4在肺成纤维细胞代谢重编程中的作用及其在肺纤维化中的潜在治疗靶点 | 人类肺成纤维细胞和肺纤维化患者的肺组织 | 代谢重编程 | 肺纤维化 | RNA测序、代谢组学分析、单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据、代谢组数据 | 人类肺成纤维细胞及公开的单细胞RNA-seq数据集中的患者肺组织样本 |
| 1065 | 2025-04-15 |
Cohesin rad21 mutation dysregulates erythropoiesis and granulopoiesis output within the whole kidney marrow of adult zebrafish
2025-Jan-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00657.2024
PMID:39548947
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研究论文 | 研究cohesin复合体亚基rad21突变对成年斑马鱼肾脏骨髓中红细胞生成和粒细胞生成的影响 | 首次在成年斑马鱼模型中揭示了cohesin亚基rad21杂合突变对造血过程的转录调控紊乱和细胞输出改变 | 未观察到明显的造血细胞形态学异常，突变对造血系统的长期影响尚不明确 | 探究cohesin基因突变对造血系统发育和功能的影响 | 携带rad21杂合突变的成年斑马鱼肾脏骨髓造血系统 | 发育生物学 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 斑马鱼遗传模型 | 转录组数据 | 未明确说明样本量的突变型和野生型斑马鱼 |
| 1066 | 2025-04-15 |
Single-cell transcriptomics reveal distinctive patterns of fibroblast activation in heart failure with preserved ejection fraction
2024-12, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-024-01074-w
PMID:39311911
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research paper | 该研究通过单细胞转录组学揭示了保留射血分数心力衰竭（HFpEF）中成纤维细胞激活的独特模式 | 发现了HFpEF特有的成纤维细胞激活特征，包括代谢、缺氧和炎症转录因子及通路的诱导，以及Angiopoietin-like 4（Angptl4）的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究HFpEF中成纤维细胞激活的分子机制 | 小鼠和人类心肌组织中的间质细胞，特别是成纤维细胞和巨噬细胞 | digital pathology | cardiovascular disease | scRNAseq（单细胞RNA测序） | NA | RNA-seq数据 | 小鼠模型和人类心肌组织样本 |
| 1067 | 2025-04-15 |
Single-cell transcriptome unveils unique transcriptomic signatures of human organ-specific endothelial cells
2024-12, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-024-01087-5
PMID:39508863
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research paper | 该研究通过构建一个包含超过21万个内皮细胞的图谱，揭示了人类不同组织中内皮细胞的转录组、表型、代谢和转录调控的显著差异 | 揭示了毛细血管内皮细胞比其他类型内皮细胞具有更高的异质性，并发现内皮细胞的衰老特性更多由体细胞位置而非组织类型决定 | NA | 探究人类不同组织中内皮细胞的异质性及其与特定疾病的关联 | 人类24个组织中38个区域的超过21万个内皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过21万个内皮细胞，来自24个人类组织的38个区域 |
| 1068 | 2025-04-15 |
Evaluating cell type deconvolution in FFPE breast tissue: application to benign breast disease
2024-09, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae098
PMID:40162103
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研究论文 | 评估FFPE乳腺组织中细胞类型去卷积方法的应用，特别是在良性乳腺疾病中的效果 | 构建了乳腺组织的单细胞RNA-seq参考数据，测试了多种去卷积方法，并发现深度学习为基础的Scaden方法在FFPE伪影影响下表现最佳 | FFPE伪影显著影响了去卷积方法的性能，误差范围在0.04至0.17之间 | 优化从FFPE样本中定义单个细胞类型组成的策略 | 良性乳腺疾病的FFPE组织样本 | 数字病理学 | 乳腺疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 深度学习 (Scaden) | RNA-seq数据 | 62个良性乳腺疾病RNA-seq样本 |
| 1069 | 2025-04-15 |
Integrative single-cell and bulk transcriptomes analyses reveals heterogeneity of serine-glycine-one-carbon metabolism with distinct prognoses and therapeutic vulnerabilities in HNSCC
2024-06-17, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00310-2
PMID:38886346
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research paper | 该研究通过整合单细胞和批量转录组分析，揭示了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中丝氨酸-甘氨酸-一碳代谢的异质性及其对预后和治疗脆弱性的影响 | 首次在HNSCC中系统分析了SGOC代谢的异质性，并构建了4-SGOC基因预后特征，同时提出IMPDH1作为潜在的治疗靶点 | 研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平和代谢组学的验证 | 阐明HNSCC中代谢异质性的生物学作用并推动精准肿瘤学发展 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）患者 | digital pathology | head and neck squamous cell carcinoma | scRNA-seq, bulk transcriptomes, LASSO-COX regression analysis | NA | RNA sequencing data | 未明确提及具体样本数量 |
| 1070 | 2025-04-15 |
Single cell analysis unveils B cell-dominated immune subtypes in HNSCC for enhanced prognostic and therapeutic stratification
2024-04-16, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00292-1
PMID:38622125
|
research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术揭示了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中B细胞主导的免疫亚型，为预后和治疗分层提供了新视角 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别了HNSCC中TIL-Bs的基因表达模式，并建立了基于B细胞的肿瘤分类方法 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能受到样本来源和数量的限制 | 探索HNSCC中肿瘤浸润B细胞（TIL-Bs）在免疫微环境中的作用及其对免疫检查点阻断治疗的影响 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）患者 | digital pathology | head and neck squamous cell carcinoma | scRNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 来自GEO和TCGA数据库的HNSCC样本 |
| 1071 | 2025-04-15 |
Single-cell transcriptomics reveals cell atlas and identifies cycling tumor cells responsible for recurrence in ameloblastoma
2024-02-29, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00281-4
PMID:38424060
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research paper | 通过单细胞转录组学揭示成釉细胞瘤的细胞图谱，并识别导致复发的循环肿瘤细胞 | 首次在单细胞分辨率下揭示了成釉细胞瘤的细胞景观和复发机制，并发现EZH2介导的程序主导了循环肿瘤细胞的干性和复发 | 研究样本可能有限，且未涉及其他潜在的治疗靶点 | 探究成釉细胞瘤的肿瘤起始和复发机制 | 成釉细胞瘤的肿瘤细胞亚群 | digital pathology | ameloblastoma | single-cell transcriptomics | NA | transcriptomic data | 成釉细胞瘤患者来源的类器官 |
| 1072 | 2025-04-15 |
Tim4 deficiency reduces CD301b+ macrophage and aggravates periodontitis bone loss
2024-02-28, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-023-00270-z
PMID:38418808
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研究论文 | 本研究探讨了Tim4缺乏如何减少CD301b+巨噬细胞并加剧牙周炎骨丢失 | 首次揭示了Tim4作为CD301b巨噬细胞的上游调控因子，通过p38 MAPK信号通路调节CD301b巨噬细胞表型 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证 | 探究Tim4在牙周炎中对CD301b巨噬细胞的调控机制 | CD301b巨噬细胞及其上游调控因子Tim4 | 免疫学 | 牙周炎 | 高通量RNA测序、单细胞RNA测序、流式细胞术 | 小鼠模型 | RNA测序数据、流式细胞数据 | 未明确说明具体样本数量 |
| 1073 | 2025-04-15 |
PRX1-positive mesenchymal stem cells drive molar morphogenesis
2024-02-19, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00277-0
PMID:38369512
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序分析和谱系追踪模型，揭示了PRX1阳性间充质细胞在小鼠磨牙形态发生中的关键作用 | 发现了PRX1阳性间充质细胞通过Wnt5a-WNT信号通路调控牙齿形态的新机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类牙齿发育中验证 | 探究调控牙齿形态的关键因素 | 小鼠磨牙发育过程中的PRX1阳性间充质细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 谱系追踪 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 1074 | 2025-04-15 |
Spatial transcriptomics reveals that metabolic characteristics define the tumor immunosuppression microenvironment via iCAF transformation in oral squamous cell carcinoma
2024-01-30, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-023-00267-8
PMID:38287007
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研究论文 | 通过空间转录组学揭示了口腔鳞状细胞癌中代谢特征通过iCAF转化定义肿瘤免疫抑制微环境的机制 | 利用单细胞和空间转录组学测序技术，揭示了高代谢区域中成纤维细胞通过乳酸转化为iCAFs，进而招募Tregs形成免疫抑制微环境的机制 | 研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平验证 | 阐明口腔鳞状细胞癌中不同代谢区域与肿瘤免疫微环境的关系 | 口腔鳞状细胞癌组织 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞测序(SC), 空间转录组学(ST), TCGA批量数据 | k-means聚类, SPOTlight反卷积, CellPhoneDB, NicheNet | 转录组数据 | 未明确说明样本数量 |
| 1075 | 2025-04-14 |
Glomerular mesangial cells derived complement factor H regulates complement activation, influences cell proliferation, and maintains actin cytoskeleton
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114544
PMID:40157080
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研究论文 | 本研究探讨了补体因子H（CFH）在肾小球系膜细胞中的功能，包括其在补体激活调节、细胞增殖影响以及肌动蛋白细胞骨架维持中的作用 | 揭示了肾小球系膜细胞衍生的CFH不仅具有经典的补体激活调节功能，还具有影响细胞增殖和维持细胞骨架的非经典功能 | 外源性补充的CFH未能影响细胞增殖和细胞骨架，其具体机制尚不明确 | 研究CFH在肾小球系膜细胞中的功能及其在补体激活、细胞增殖和细胞骨架维持中的作用 | 原代人肾小球系膜细胞（pHGMCs） | 细胞生物学 | IgA肾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1076 | 2025-04-14 |
Pan-HDAC inhibitor LAQ824 inhibits the progression of pancreatic ductal adenocarcinoma and suppresses immune escape by promoting antigen presentation
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114528
PMID:40158429
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研究论文 | 本研究探讨了泛组蛋白去乙酰化酶抑制剂LAQ824在胰腺导管腺癌(PDAC)中的治疗潜力及其在调节免疫逃逸机制中的作用 | 首次揭示了LAQ824通过上调MHC-I介导的抗原提呈增强PDAC免疫原性的新机制，并确定了HDAC1是PDAC细胞中MHC-I的关键抑制因子 | 研究主要基于小鼠模型，尚未进行临床试验验证 | 评估LAQ824对PDAC的治疗效果及其免疫调节机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC) | 肿瘤免疫治疗 | 胰腺癌 | IHC、流式细胞术、RNA测序、单细胞RNA测序 | C57BL/6J小鼠皮下肿瘤模型 | 体内外实验数据 | 未明确说明样本数量 |
| 1077 | 2025-04-14 |
The characterization and validation of regulated cell death-related genes in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114509
PMID:40158428
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研究论文 | 本研究系统调查了调控性细胞死亡（RCD）机制在慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）发病和进展中的作用 | 首次在CRSwNP中描绘了8种RCD亚型的激活特征，并构建了具有诊断潜力的细胞死亡指数（CDI） | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证 | 探究RCD机制在CRSwNP发病和进展中的作用 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎 | 转录组分析、WGCNA、LASSO回归、scRNA-seq、qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 多个GEO数据集（GSE136825等）及临床组织样本 |
| 1078 | 2025-04-14 |
Targeting inflammation and necroptosis in diabetic kidney disease: A novel approach via PPARα modulation
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114562
PMID:40174339
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研究论文 | 本研究探讨了PPARα在糖尿病肾病(DKD)中通过调节炎症和坏死性凋亡的作用机制 | 首次揭示了PPARα通过抑制RIP1/RIP3/MLKL介导的坏死性凋亡来延缓DKD进展的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的转化效果尚需进一步验证 | 阐明PPARα在DKD中的保护作用机制并探索其治疗潜力 | 糖尿病肾病小鼠模型和肾小管上皮细胞 | 分子病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序、AAV9病毒载体转染 | DKD小鼠模型 | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量 |
| 1079 | 2025-04-14 |
Multiomic spatial atlas shows deleted in malignant brain tumors 1 (DMBT1) glycoprotein is lost in colonic dysplasia
2025-May, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6406
PMID:40026233
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研究论文 | 该研究通过多组学空间图谱揭示了在结肠发育不良中DMBT1糖蛋白的缺失 | 结合单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫荧光技术，揭示了DMBT1在炎症与发育不良结肠中的双向调控 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，可能不完全反映人类结肠癌的全部复杂性 | 理解结肠肿瘤发生过程中宿主与微生物的相互作用 | 结肠发育不良和正常结肠组织 | 数字病理学 | 结肠癌 | scRNA-seq, 空间转录组学, 免疫荧光 | NA | RNA-seq数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 小鼠模型和人类腺瘤发育不良样本 |
| 1080 | 2025-04-14 |
Cancer-associated fibroblast heterogeneity in chordoma†
2025-May, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6420
PMID:40088426
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评论 | 本文讨论了脊索瘤中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的异质性及其在肿瘤进展中的作用 | 定义了脊索瘤中的炎症性CAF亚型（iCAF），并探讨其与不良预后和肿瘤侵袭的关联 | 在CAFs调控肿瘤表型中区分相关性和因果关系仍是一个重大挑战 | 研究脊索瘤中CAFs的异质性及其在肿瘤生态系统中的作用 | 脊索瘤中的癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞转录组学和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |