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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1061 | 2025-10-05 |
Research Progress of Natural Killer Cells in Hashimoto's Thyroiditis
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S545646
PMID:40964505
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综述 | 本文综述了自然杀伤细胞在桥本甲状腺炎发病机制中的双重作用及最新研究进展 | 整合单细胞RNA测序技术揭示NK细胞功能异质性,阐明NK细胞通过不同机制在疾病不同阶段发挥促炎或调节作用 | NA | 探讨自然杀伤细胞在桥本甲状腺炎发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | 桥本甲状腺炎患者及自然杀伤细胞 | 自然语言处理 | 桥本甲状腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1062 | 2025-10-05 |
Randomized Spatial PCA (RASP): a computationally efficient method for dimensionality reduction of high-resolution spatial transcriptomics data
2024-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.20.629785
PMID:39763720
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研究论文 | 提出一种名为RASP的计算高效空间转录组数据降维方法 | 开发了基于随机化两阶段PCA框架的空间感知降维方法,计算速度比现有方法快几个数量级 | NA | 开发高效的空间转录组数据降维方法 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 随机化主成分分析 | PCA | 空间基因表达数据 | 四个公开ST数据集(人类和小鼠组织) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Xenium | 10x Visium, Stereo-Seq, MERFISH, 10x Xenium |
1063 | 2025-10-05 |
An integrated single-nucleus and spatial transcriptomics atlas reveals the molecular landscape of the human hippocampus
2024-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.26.590643
PMID:38712198
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研究论文 | 通过整合单核和空间转录组学数据构建人类海马体分子图谱 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术揭示人类海马体细胞类型的分子特征和空间分布 | 研究样本仅来自10名神经典型成年捐赠者,样本量相对有限 | 解析人类海马体细胞类型的分子特征和空间组织 | 人类前海马体组织 | 空间转录组学 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 非负矩阵分解(NMF) | 空间转录组数据, 单核RNA测序数据 | 10名成年神经典型捐赠者的相邻组织切片 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
1064 | 2025-10-05 |
Addressing the mean-variance relationship in spatially resolved transcriptomics data with spoon
2024-Nov-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.04.621867
PMID:39574747
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研究论文 | 提出一种名为spoon的统计框架,用于解决空间转录组数据中的均值-方差关系偏差,从而更准确地识别空间可变基因 | 首次在空间转录组数据中证明均值-方差关系的存在,并提出使用经验贝叶斯技术消除这种技术偏差的新方法 | 方法性能仅在模拟和真实空间转录组数据中进行了验证,未在其他类型空间组学数据中测试 | 开发更准确识别空间可变基因的统计方法 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 经验贝叶斯模型 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1065 | 2025-10-05 |
Shear stress is uncoupled from atheroprotective KLK10 in atherosclerotic plaques
2024-11, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
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研究论文 | 本研究通过比较健康和动脉粥样硬化条件下内皮细胞对生理剪切应力的转录组反应,揭示了动脉粥样硬化斑块中生理剪切应力与保护性因子KLK10的解耦现象 | 首次发现动脉粥样硬化斑块中生理剪切应力与保护性因子KLK10的解耦机制,揭示了疾病状态下内皮细胞对机械力刺激反应能力的改变 | 研究主要基于小鼠模型,需要在人类样本中进一步验证;单细胞RNA测序样本量有限 | 探究动脉粥样硬化条件下内皮细胞对生理剪切应力保护性反应的改变机制 | 小鼠主动脉内皮细胞,包括健康C57BL/6小鼠、轻度病变Apoe-/-正常饮食小鼠和重度病变Apoe-/-高脂饮食小鼠 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,3D光片成像,计算流体动力学 | NA | 单细胞转录组数据,成像数据 | 三组小鼠模型的内皮细胞(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1066 | 2025-10-05 |
Glutathione accelerates the cell cycle and cellular reprogramming in plant regeneration
2024-Oct-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.28.569014
PMID:38168452
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研究论文 | 本研究揭示了谷胱甘肽通过加速细胞周期和细胞重编程在植物再生中的关键作用 | 首次发现损伤附近细胞通过缩短G1期显著提高分裂速率,并鉴定出G1期存在短暂的谷胱甘肽核内峰值 | 研究主要基于拟南芥根系,在其他植物系统中的普适性有待验证 | 探究细胞重编程过程中的细胞周期动态 | 拟南芥根系细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 活体成像 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
1067 | 2025-10-05 |
SpotSweeper: spatially-aware quality control for spatial transcriptomics
2024-Jun-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.06.597765
PMID:38895212
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研究论文 | 开发了一种名为SpotSweeper的空间转录组学质量控制方法 | 首次提出考虑空间位置信息的质量控制方法,能够识别局部异常值和区域伪影 | 仅使用公开数据进行验证,缺乏更广泛的数据集验证 | 开发专门针对空间转录组数据的质量控制方法 | 空间转录组数据中的低质量点和组织伪影 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 多尺度方法 | 空间转录组数据 | 公开数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium平台 |
1068 | 2025-10-05 |
Treatment of HCC with claudin-1-specific antibodies suppresses carcinogenic signaling and reprograms the tumor microenvironment
2023-02, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.10.011
PMID:36309131
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研究论文 | 本研究通过靶向非连接性Claudin-1的单克隆抗体治疗肝细胞癌,揭示了其抑制肿瘤生长和重塑肿瘤微环境的作用机制 | 首次探索非连接性Claudin-1作为肝细胞癌治疗靶点的潜力,并开发特异性靶向该蛋白的人源化单克隆抗体 | 目前仍处于临床前研究阶段,尚未进行人体临床试验 | 研究Claudin-1作为肝细胞癌治疗靶点的可行性和作用机制 | 肝细胞癌患者来源的细胞模型和动物模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大量患者来源的细胞系异种移植模型和患者来源的异种移植小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1069 | 2025-10-05 |
Immunobiology of primary sclerosing cholangitis
2025-Oct-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001080
PMID:39226402
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综述 | 本文全面概述了原发性硬化性胆管炎(PSC)的免疫生物学研究进展 | 重点关注组织驻留免疫概念及单细胞RNA测序和空间转录组学等新技术带来的新认知 | 部分新发现免疫细胞类型的胆道定位及其在PSC免疫发病机制中的作用仍不完全清楚 | 探讨免疫系统在PSC发病机制中的关键作用 | 原发性硬化性胆管炎(PSC)患者肝脏免疫细胞 | 免疫生物学 | 原发性硬化性胆管炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
1070 | 2025-10-05 |
Tumor-derived CD109 orchestrates reprogramming of tumor-associated macrophages to dampen immune response
2025-Oct, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.03.035
PMID:40220905
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研究论文 | 本研究揭示肿瘤源性可溶性CD109通过重编程肿瘤相关巨噬细胞抑制免疫反应的机制 | 首次发现sCD109作为'分泌型免疫检查点'通过双重机制调控CD73表达,并证明CD109与PD-L1双重阻断可增强免疫治疗效果 | 研究主要基于临床前模型,需要进一步临床验证 | 探索iCCA中免疫抑制蛋白及其在肿瘤免疫微环境重塑中的调控机制 | 肝内胆管癌(iCCA)及其肿瘤免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 肝内胆管癌 | 蛋白质组学分析、单细胞转录组学、飞行时间质谱流式、RNA测序、质谱分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 质谱分析 | NA | NA |
1071 | 2025-10-05 |
Decoding the resistin-CAP1 pathway in intermediate monocytes mediating liver allograft rejection
2025-Oct, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.04.037
PMID:40345627
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示了中间单核细胞通过resistin-CAP1通路在肝移植排斥反应中的关键作用 | 首次在肝移植领域应用空间转录组学技术,发现中间单核细胞通过resistin-CAP1信号轴参与T细胞介导的排斥反应,并创新性地使用纳米金技术递送siRNA验证其治疗潜力 | 研究样本量相对有限(24个大鼠样本),主要在动物模型中进行验证,人类临床应用的可行性需要进一步验证 | 探索肝移植排斥反应的新免疫治疗靶点 | 大鼠移植肝脏和外周血单个核细胞样本,人类T细胞功能验证 | 数字病理 | 肝移植排斥反应 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术, 多因子检测, 纳米金技术 | CellChat配体-受体分析 | 基因表达数据, 空间分布数据 | 24个大鼠移植肝脏和外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
1072 | 2025-10-05 |
Preterm Birth Conditions Alter Muscle Stem Cells and Their Niche, Causing Lasting Impairments in Muscle Regeneration and Function
2025-Oct, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.70058
PMID:40955870
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研究论文 | 本研究探讨早产相关条件如何通过改变肌肉干细胞及其微环境导致肌肉再生和功能持久性损伤 | 首次揭示早产通过TNF-α/NF-κB信号通路和巨噬细胞相互作用破坏肌肉干细胞功能的机制,并证明TNF-α抑制剂可恢复肌肉再生能力 | 人类样本数量有限,仅显示趋势;动物模型不能完全模拟人类早产的所有特征 | 理解早产相关条件对骨骼肌发育和功能的长期影响机制 | 啮齿动物模型和人类早产婴儿肌肉样本 | 发育生物学 | 早产相关并发症 | 单细胞转录组测序,体外细胞培养,离体肌肉收缩特性分析,体内肌肉损伤实验 | NA | 基因表达数据,细胞培养数据,肌肉功能数据 | 啮齿动物模型和人类婴儿肌肉样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1073 | 2025-10-05 |
Single-Cell Transcriptomic Atlas of Peripheral Blood Reveals B-Cell-Driven Signature Predictive of Acute Pancreatitis Severity
2025-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70350
PMID:40959459
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了外周血中B细胞驱动的特征可预测急性胰腺炎严重程度 | 首次发现MZB1表达浆细胞在急性胰腺炎中的扩张与疾病严重程度相关,并建立了九基因B细胞转录组特征预测模型 | 样本量相对有限(初始队列7例患者),需要更大规模研究验证 | 开发预测急性胰腺炎严重程度的免疫生物标志物 | 急性胰腺炎患者外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序,T细胞和B细胞受体分析 | 基因特征预测模型 | 单细胞转录组数据,血清免疫球蛋白和细胞因子数据 | 发现队列7例患者,验证队列14例患者,内部验证114例,外部验证AP患者87例,AP合并非AP败血症174例 | NA | 单细胞RNA-seq, 免疫受体分析 | NA | NA |
1074 | 2025-10-05 |
Deep learning-based feature discovery for decoding phenotypic plasticity in pediatric high-grade gliomas single-cell transcriptomics
2025-Oct, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110971
PMID:40848317
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研究论文 | 利用深度学习和图机器学习解码儿童高级别胶质瘤单细胞转录组中的表型可塑性特征 | 首次通过复杂网络动力学和图机器学习识别了pHGG亚型中谱系特异性可塑性的关键决定因素,发现了调控胶质瘤形态发生的网络相互作用 | NA | 解码儿童高级别胶质瘤单细胞转录组中的表型可塑性机制 | 儿童高级别胶质瘤(pHGGs)亚型:IDHWT胶质母细胞瘤和K27M突变型弥漫性中线胶质瘤 | 机器学习 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序 | 深度学习, 图机器学习 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1075 | 2025-10-05 |
MIF Facilitates Resistance to Androgen Deprivation Therapy by Regulating AMPD2 Expression in Prostate Cancer Cells
2025-Sep-19, The Prostate
DOI:10.1002/pros.70053
PMID:40968720
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研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9筛选和单细胞RNA测序发现MIF通过调控AMPD2表达促进前列腺癌细胞对雄激素剥夺疗法的耐药性 | 首次揭示MIF在ADT耐药中的关键作用机制,并发现AR信号通路对MIF的负调控关系 | 未涉及AR-V7剪接变体对MIF的调控作用,机制研究仍需深入 | 探索前列腺癌对雄激素剥夺疗法产生耐药性的分子机制 | 前列腺癌细胞 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | CRISPR/Cas9基因敲除筛选, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1076 | 2025-10-05 |
Fibroblast-Specific Loss of TGF-β Signaling Mediates Lipomatous Metaplasia in the Infarcted Heart
2025-Sep-19, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了心肌梗死后成纤维细胞特异性TGF-β信号缺失导致脂肪化生和心脏功能障碍的新机制 | 首次发现成纤维细胞特异性TGF-β信号缺失通过Smad非依赖性途径促进成纤维细胞向脂肪细胞转化 | 主要基于小鼠模型,人类数据验证相对有限 | 探究心肌梗死后脂肪化生的细胞分子机制 | 小鼠心脏成纤维细胞和人类心肌梗死患者样本 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 转录组分析 | NA | 基因表达数据, 组织学图像, 超声心动图数据 | 转基因小鼠模型和人类心肌梗死患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1077 | 2025-10-05 |
Loss of BAP1 defines a unique subtype of TP53-mutated de novo AML and confers sensitivity to BCL-xL inhibitors
2025-Sep-18, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024026417
PMID:40540751
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研究论文 | 本研究揭示了BAP1缺失与TP53突变在急性髓系白血病中的协同作用机制 | 首次发现BAP1缺失与TP53突变在AML中的共现现象,并证明其通过基因组不稳定性和表观遗传失调共同促进红系白血病发生 | 未明确BAP1缺失与TP53突变协同作用的具体分子通路细节 | 探究TP53突变AML中BAP1缺失的致病机制和治疗靶点 | TP53突变急性髓系白血病患者样本和基因工程小鼠模型 | 癌症生物学 | 急性髓系白血病 | RNA测序, 染色质免疫沉淀测序, 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | TP53突变AML患者队列(其中1/3伴BAP1缺失) | NA | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
1078 | 2025-10-05 |
Single-cell and clonal analysis of AL amyloidosis plasma cells and their bone marrow microenvironment
2025-Sep-18, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024719
PMID:40493887
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析AL淀粉样变性患者浆细胞及其骨髓微环境的转录特征 | 首次在初治AL淀粉样变性患者中开展单细胞转录组分析,发现非恶性浆细胞异常扩增和克隆性浆细胞的蛋白稳态基因上调 | 需要未来研究对识别基因进行功能验证 | 阐明AL淀粉样变性浆细胞及其骨髓微环境的功能特征 | AL淀粉样变性患者和健康对照者的骨髓样本 | 单细胞组学 | AL淀粉样变性 | 5'单细胞RNA测序, 定量蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 新诊断未治疗AL淀粉样变性患者和健康受试者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 5'单细胞RNA测序 |
1079 | 2025-10-05 |
Matrix metalloproteinases are hallmark early biomarkers and therapeutic targets in FSHD
2025-Sep-18, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195104
PMID:40966415
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研究论文 | 本研究通过分析活检RNA-seq数据,揭示了基质金属蛋白酶(MMPs)在面肩肱型肌营养不良症(FSHD)中的生物标志物作用和治疗潜力 | 首次发现MMPs表达与FSHD疾病严重程度相关,并确定FAPs和巨噬细胞是MMPs的主要来源,提出MMP抑制剂作为DUX4非依赖性治疗新策略 | 研究主要基于动物模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 探究MMPs在FSHD肌肉退行性病变中的作用机制和治疗潜力 | 面肩肱型肌营养不良症(FSHD)患者活检样本和iDUX4pA FSHD小鼠模型 | 生物医学研究 | 肌肉营养不良症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1080 | 2025-10-05 |
A novel mouse model for LAMA2-related muscular dystrophy with analysis of molecular pathogenesis and clinical phenotype
2025-Sep-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.94288
PMID:40960171
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研究论文 | 本研究通过建立新型LAMA2相关肌营养不良症小鼠模型,分析其分子发病机制和临床表型 | 基于人类LAMA2-MD突变热点区域利用CRISPR-Cas9技术创建新型基因敲除小鼠模型,并首次结合单细胞和批量RNA测序分析分子机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类患者中验证相关发现 | 深入理解LAMA2相关肌营养不良症的分子发病机制 | LAMA2基因敲除小鼠(dy/dy)模型 | 数字病理学 | 肌营养不良症 | CRISPR-Cas9, scRNA-seq, bulk RNA-seq, 免疫荧光 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据, 图像数据 | 新型dy/dy小鼠模型及野生型对照 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |