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当前共找到 41493 篇文献，本页显示第 1061 - 1080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2026-06-30 |
The HuBMAP Framework for Advancing Data FAIRness
2026-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.01.728946
PMID:42282748
|
研究论文 | 介绍HuBMAP框架在推动数据FAIR原则实施中的实践与成效 | 发展了跨多种检测类型的社区认可元数据报告标准，并通过端到端元数据工作流实现数据FAIR化 | 未明确提及具体局限性，可能包括依赖社区采纳和标准化基础设施的挑战 | 旨在实现生物医学数据的可查找、可访问、可互操作和可重用（FAIR） | 来自40多个机构的10000多个数据集，涵盖50多种检测类型（如单细胞测序和空间组学） | 其他 | NA | 单细胞测序、空间组学 | NA | 元数据 | 10000多个数据集，来自40多个机构 | 10x Genomics, Illumina, BGI | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq, BGI MGISEQ | 10x Chromium单细胞3'测序、10x Visium空间转录组学、Illumina NovaSeq测序平台、BGI MGISEQ测序系统 |
| 1062 | 2026-06-30 |
Scalable in vivo cardiac functional genomics with compressed AAV-Perturb-seq reveals a common mitochondrial response to perturbation
2026-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.01.729445
PMID:42282780
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研究论文 | 开发压缩AAV-Perturb-seq方法，在目标器官中进行高通量功能基因组学研究，并揭示线粒体转录组的普遍性应激反应 | 发展压缩AAV-Perturb-seq技术，允许每个细胞进行多次随机扰动并通过统计框架解卷积信号，实现在体内扩大的功能基因组规模 | 仅在小鼠心肌细胞中测试了585个基因敲除，可能需要进一步验证跨物种和扰动方式的普适性 | 建立可扩展的体内功能基因组学平台，以直接识别人类疾病的治疗靶点 | 小鼠心肌细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | CRISPR筛选, 单细胞RNA测序, 腺相关病毒介导 | 统计解卷积模型 | 单细胞转录组数据 | 585个基因敲除实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1063 | 2026-06-30 |
BTK inhibition enhances immunovirotherapy in glioblastoma via tertiary lymphoid structure modulation
2026-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.01.729275
PMID:42282778
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研究论文 | BTK抑制通过调节三级淋巴结构增强胶质母细胞瘤的免疫病毒治疗效果 | 首次发现BTK抑制剂依鲁替尼能通过促进肿瘤浸润三级淋巴结构形成，增强溶瘤单纯疱疹病毒对胶质母细胞瘤的治疗效果 | NA | 探究BTK抑制增强溶瘤病毒疗法抗胶质母细胞瘤效果的机制 | 胶质母细胞瘤细胞、肿瘤浸润髓系细胞、T细胞和三级淋巴结构 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞mRNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人GBM12异种移植模型和同源GSC005小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 1064 | 2026-06-30 |
Modeling the role of urokinase-type plasminogen activator, uPA, and circulating cancer-associated fibroblasts (cCAFs) in breast cancer cell extravasation
2026-06-03, Clinical & experimental metastasis
IF:4.2Q2
DOI:10.1007/s10585-026-10411-3
PMID:42234219
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研究论文 | 研究尿激酶型纤溶酶原激活剂（uPA）和循环肿瘤相关成纤维细胞（cCAFs）在乳腺癌细胞外渗过程中的作用 | 首次揭示CAFs通过上调乳腺癌细胞中PLAU/uPA表达促进肿瘤细胞从毛细血管后微静脉外渗至肺实质的机制 | 仅使用小鼠尾静脉模型和三阴性乳腺癌细胞系，未在患者样本中验证uPA/PLAU的临床相关性 | 阐明循环肿瘤相关成纤维细胞如何辅助乳腺癌细胞从血管外渗到肺实质 | 三阴性乳腺癌MDA-MB231细胞、CAF23成纤维细胞、HUVEC内皮细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、siRNA敲低 | NA | 基因表达数据、体外结合实验数据 | 小鼠尾静脉注射模型（未明确样本量） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 未在摘要中明确提及具体平台配置 |
| 1065 | 2026-06-30 |
HyperNiche: Learning Heterophilic Cellular Niches with Hypergraph Neural Networks
2026-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.30.728986
PMID:42282514
|
研究论文 | 提出HyperNiche，一个基于超图框架的方法，用于从空间转录组数据中建模高阶、异质性的细胞微环境 | 通过兼容性驱动的机制学习以锚点为中心的超边，同时捕获细胞间的同质性和异质性关系，并解耦节点角色为锚点和成员表示，整合空间几何到超边构建中 | 未明确说明 | 建模空间转录组数据中高阶、异质性的细胞微环境，以理解复杂的空间组织结构与肿瘤微环境 | 乳腺癌和肺癌组织微阵列中的细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌, 肺癌 | 空间转录组学 | 超图神经网络 | 空间转录组数据 | 高多重Xenium空间转录组数据集，来自乳腺癌和肺癌组织微阵列 | NA | 空间转录组学 | Xenium | 高多重Xenium空间转录组学 |
| 1066 | 2026-06-30 |
Multi-Scale Genetic and Transcriptomic Analyses Identify Druggable Targets for Epilepsy
2026-Jun, Current medical science
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11596-026-00194-9
PMID:42012806
|
研究论文 | 通过整合GWAS、eQTL和单细胞转录组数据，识别癫痫的因果基因及可药物化靶点 | 首次结合大脑bulk和单细胞eQTL数据与GWAS进行孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析，识别FGFR3驱动的FGF信号通路为癫痫的关键分子轴 | 研究基于脑组织表达数据，未涵盖其他组织或细胞类型的调控影响 | 利用多尺度遗传和转录组学分析，识别癫痫的可药物化靶点 | 癫痫因果基因（FGFR3、PM20D1、ZNF564、HAGH、CAPN15、CCDC117、DARS1-AS1）及候选化合物Ro-4396686 | 机器学习 | 癫痫 | GWAS, eQTL, scRNA-seq, 孟德尔随机化, 贝叶斯共定位 | NA | 遗传数据, 转录组数据 | 多组公共数据库样本（GWAS、eQTL）及独立RNA-seq队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1067 | 2026-06-30 |
High-throughput generation of patient-derived cancer stem cells for precision medicine using a microwell-chip platform
2026-Jun, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-026-01957-1
PMID:42129300
|
研究论文 | 利用微孔芯片平台从有限乳腺癌临床样本中高通量生成患者来源的肿瘤干细胞，用于精准医疗 | 开发了一种微孔细胞芯片培养平台，能够从少量临床样本（如穿刺活检）中快速、高通量生成均匀的微肿瘤球，并在8天内实现功能性肿瘤干细胞富集和个性化药物测试 | 未明确提及，但可能涉及样本大小限制或临床转化的进一步验证 | 实现从有限临床样本中高通量分离功能性肿瘤干细胞，以推动精准肿瘤学中基于肿瘤干细胞的药物评估 | 乳腺癌患者来源的肿瘤干细胞和微肿瘤球 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 16名乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1068 | 2026-06-30 |
Circulating B7H6 is associated with reduced NKp30 receptor expression and improved lung transplant recipient survival
2026-06-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1093/ajrcmb/aanag017
PMID:41738213
|
研究论文 | 研究循环B7H6与NKp30受体表达降低及肺移植受者生存率改善的关联 | 首次发现囊性纤维化患者中NKp30受体特异性下调，并揭示可溶性B7H6在肺移植结果中的保护性作用 | 样本量较小，未明确NKp30下调的分子机制 | 探究自然杀伤细胞受体在肺移植受者预后中的作用 | 肺移植受者（囊性纤维化和慢性阻塞性肺疾病患者）及健康供者 | 自然语言处理 | 肺移植排斥、囊性纤维化 | 光谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 血浆、外周血单个核细胞 | 6名囊性纤维化受者、6名慢性阻塞性肺疾病受者、7名健康供者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 1069 | 2026-06-30 |
Benchmarking plant single cell RNA-sequencing sample processing strategies
2026-Jun, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-026-00800-5
PMID:42106556
|
研究论文 | 系统比较了植物单细胞RNA测序的样本处理策略，包括原生质体富集技术和scRNA-seq平台 | 首次全面评估了多种原生质体富集技术（传统流式、成像流式、磁珠分选）与不同scRNA-seq平台（10x Chromium、BD Rhapsody）在植物单细胞研究中的表现，并揭示了计算算法对双细胞识别的误判问题 | 研究仅以拟南芥根为模型，未涵盖其他植物组织或物种，且未评估其他scRNA-seq平台（如Smart-seq2） | 优化植物单细胞RNA测序的样本处理流程，提高数据质量 | 拟南芥根细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 拟南芥根样本，具体数量未在摘要中提及 | 10x Genomics, BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, BD Rhapsody | 10x Chromium Single Cell 3', BD Rhapsody Single-Cell Analysis System |
| 1070 | 2026-06-30 |
Design of Single-Atom Nanozymes for Precision Treatment of Erectile Dysfunction with Integrated Single-Cell RNA Sequencing and Machine Learning
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524169
PMID:41980199
|
研究论文 | 结合单细胞RNA测序和机器学习设计单原子纳米酶用于糖尿病勃起功能障碍的精准治疗 | 提出将单细胞RNA测序与机器学习相结合的数据驱动框架，用于设计具有特定酶模拟活性的单原子纳米酶，实现疾病特异性治疗 | 仅基于已发表研究构建纳米酶数据库，可能未涵盖所有潜在纳米酶类型，且Fe-DMOF的临床转化尚需进一步验证 | 开发一种集成单细胞RNA测序和机器学习的框架，设计用于精准治疗糖尿病勃起功能障碍的纳米酶 | 糖尿病勃起功能障碍患者的海绵体组织样本和细胞 | 数字病理学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1071 | 2026-06-30 |
Combinatorial and Inducible CRISPRa/i Enables Canalized hiPSC Forward Programming and Iterative Refinement via Single-Cell Genomics
2026-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.31.729073
PMID:42282825
|
研究论文 | 开发了一种名为CIRI的组合可诱导CRISPRa/i平台，实现人类iPSC的前向编程和单细胞基因组学迭代优化 | 首次在人类诱导多能干细胞中建立了可编程、可诱导的组合基因调控逻辑平台，实现了多模态调控和高效前向编程 | 未明确提及局限性 | 建立人类干细胞模型中的可编程合成生物学框架，实现高效的前向编程和优化 | 人类诱导多能干细胞及其衍生的心肌器官和骨骼肌细胞 | 机器学习和合成生物学 | NA | CRISPRa/i，单细胞RNA测序 | CRISPRa/i组合调控模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 使用组合双向导RNA的单细胞RNA测序筛选 |
| 1072 | 2026-06-30 |
Single-cell analysis of Plasmodium falciparum transcripts after drug perturbation identifies feedback regulation as well as increased transmission potential
2026-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.27.728291
PMID:42244604
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析疟原虫在药物处理后的转录谱，揭示了药物扰动后的反馈调控及传播潜力增加 | 首次利用大规模单细胞RNA测序技术解析疟原虫对不同药物处理的异质性转录响应，并发现青蒿素处理可诱导配子体相关基因表达富集，暗示传播潜力增强 | 未明确说明样本量及重复实验验证，单细胞数据与同步化群体数据的比较可能存在批次效应 | 评估疟原虫在抗疟药物处理后的单细胞转录响应，并探索利用单细胞转录谱进行药物分类的潜力 | 恶性疟原虫感染的未同步化红细胞 | 机器学习 | 疟疾 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 数十万个单个感染红细胞 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA |
| 1073 | 2026-06-30 |
Distinct senescent β-cell senotypes differentially drive islet aging and dysfunction
2026-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.25.727705
PMID:42244625
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研究论文 | 通过单细胞分辨率的空间蛋白质组学和转录组学以及多重单细胞RNA测序，研究了人类胰腺中衰老β细胞的不同衰老表型及其对胰岛老化和功能障碍的影响 | 首次在单细胞水平上鉴定了人类胰腺中两种功能不同的衰老细胞亚群，分别由CDKN1A和CDKN2A表达区分，揭示了适应性衰老与适应不良性衰老程序的差异 | 摘要未提及具体局限性，但可能包括样本量有限或功能验证的深度不足 | 阐明人类内分泌胰腺中细胞衰老的异质性及其在正常老化和2型糖尿病中的角色 | 26名捐赠者（年龄20-80岁）的完整胰腺和14名捐赠者（年龄34-69岁）的分散胰岛 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序、空间蛋白质组学、转录组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 26个胰腺样本（年龄20-80岁）和14个胰岛样本（年龄34-69岁） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1074 | 2026-06-30 |
Supporting-like cells constitute an alternative steroidogenic lineage conserved in amniotes
2026-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.25.726204
PMID:42244723
|
研究论文 | 揭示支持样细胞在羊膜动物中构成一种保守的替代类固醇生成谱系 | 首次发现支持样细胞（SLCs）在哺乳动物胚胎发育期间可作为主要的类固醇生成细胞谱系，挑战了传统认为间质谱系是性激素唯一来源的观点 | 未明确提及，但可能局限于特定物种（如兔子）和发育阶段，需更多物种验证 | 研究支持样细胞在羊膜动物性腺发育中的类固醇生成功能及其进化保守性 | 兔子胚胎性腺及其他羊膜动物（非哺乳类）的类固醇生成细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞转录组学、类固醇组学、器官成像 | NA | 单细胞转录组数据、类固醇组学数据、图像数据 | 兔子胚胎性腺样本（具体数量未明确） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1075 | 2026-06-30 |
Integrating single-cell analysis and digital pathology for risk stratification in pancreatic cancer
2026-05-26, Clinical & experimental metastasis
IF:4.2Q2
DOI:10.1007/s10585-026-10410-4
PMID:42189258
|
研究论文 | 整合单细胞分析和数字病理学用于胰腺癌风险分层 | 提出了一种整合单细胞RNA测序衍生的转移特征与常规H&E病理图像的基因型-表型工作流程，实现了从基因到表型的风险分层 | 需要更大规模的独立验证研究和机制实验才能进行临床转化 | 探索是否可以从H&E图像中提取反映胰腺癌转移相关生物学特征的风险信号，并整合单细胞RNA测序数据实现风险分层 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的原发和转移肿瘤组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, H&E染色, 转录组分析 | LASSO回归, 双流病理组学管道 | 图像, 转录组数据, 临床病理数据 | TCGA队列、6个独立GEO亚组、外部CPTAC子集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用了GSE154778数据集的单细胞RNA测序数据 |
| 1076 | 2026-06-30 |
Intermittent parathyroid hormone employs autonomous and non-autonomous mechanisms to drive osteogenesis from Ebf3-expressing skeletal progenitor cells
2026-May-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.21.726951
PMID:42244729
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研究论文 | 间歇性甲状旁腺激素通过内在和外在机制驱动Ebf3表达骨骼祖细胞的成骨分化 | 揭示了间歇性甲状旁腺激素通过同时激活细胞内在转录重编程和外源性微环境重塑的双重机制，协调骨骼祖细胞命运决定 | 未明确提及局限性 | 阐明系统激素信号如何协调成体组织干细胞命运决定的机制 | Cxcl12丰富网状细胞（表达Ebf3的多能间充质祖细胞） | 机器学习 | 骨质疏松症 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型及绝经后女性患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1077 | 2026-06-30 |
Recent advances in omics and genetic tools in schistosome research and control
2026-May-25, International journal for parasitology
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.ijpara.2026.104880
PMID:42184933
|
综述 | 文章总结了组学技术和遗传工具在血吸虫研究和防控中的最新进展，涵盖基因组学、转录组学、蛋白质组学以及CRISPR/Cas9等基因编辑技术，并讨论其在诊断、治疗和可持续控制中的应用前景 | 系统整合了多组学平台（如单细胞转录组学、非编码RNA组学）与功能遗传工具在血吸虫生物学研究中的协同应用，并展望了人工智能与临床转化的结合潜力 | 未明确提及具体技术局限性或数据整合中的挑战，可能对多组学数据融合的算法瓶颈或临床转化障碍讨论不足 | 回顾组学和遗传工具在血吸虫研究中的进展，并探讨其对改善诊断、治疗和可持续控制的意义 | 血吸虫（寄生虫）及其宿主-寄生虫相互作用 | 数字病理学 | 血吸虫病 | 基因组学、单细胞转录组学、非编码RNA组学、蛋白质组学、RNA干扰、CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1078 | 2026-06-30 |
PerturbPlan: An analytical framework for designing Perturb-seq experiments
2026-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.22.727199
PMID:42239142
|
研究论文 | 介绍了一个名为PerturbPlan的交互式网页应用程序，用于设计单细胞CRISPR筛选实验，基于新的解析公式大幅提升计算效率 | 首次提出一个解析公式来估计检测扰动-表达关联的统计功效，相比模拟方法运行时间减少高达七个数量级，并开发了首个交互式工具PerturbPlan | 仅支持两种类型的单细胞CRISPR筛选（Perturb-seq和靶向Perturb-seq），未涵盖其他变异形式 | 开发一个高效、交互式的工具，帮助研究人员设计具有统计功效且成本可控的单细胞CRISPR筛选实验 | Perturb-seq和靶向Perturb-seq（TAP-seq）实验设计 | 机器学习 | NA | CRISPR筛选、单细胞RNA测序 | 解析公式 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1079 | 2026-06-30 |
TDP-43 Acetylation at the Neuroimmune Interface: A Hypothesis-Driven Framework for Peripheral Inflammatory Stratotypes in ALS
2026-May-22, Neurochemical research
IF:3.7Q2
DOI:10.1007/s11064-026-04770-2
PMID:42171861
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综述 | 本文提出TDP-43乙酰化在肌萎缩侧索硬化症（ALS）中连接运动神经元退行性变与系统性免疫调控的假设框架，通过整合单细胞转录组、蛋白质组免疫分析和临床炎症表型数据，探讨位点特异性乙酰化TDP-43与外周炎症特征的相关性 | 将TDP-43从神经病理标志物重新定义为免疫活性哨兵，提出基于乙酰化状态的外周炎症分层模型，并识别出两种具有临床可操作性的内型 | 基于现有数据集的整合分析，缺乏直接的实验验证；乙酰化位点特异性与临床表型的因果关系尚未确立 | 探讨TDP-43乙酰化是否与外周炎症特征相关，并建立ALS的免疫分层框架以指导靶向治疗 | TDP-43乙酰化状态、单核细胞表型、细胞因子模块及血脑屏障功能障碍 | 自然语言处理 | 神经系统疾病 | 单细胞转录组学、蛋白质组免疫分析 | 无 | 文本 | 无 | 无 | 单细胞RNA测序 | 无 | 无 |
| 1080 | 2026-06-30 |
Single-cell atlas reveals the key role of pro-inflammatory IREB2⁺ microglia subsets in the microenvironment of Alzheimer's disease
2026-May-20, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-026-02188-2
PMID:42159858
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示阿尔茨海默病中IREB2阳性小胶质细胞亚群在神经炎症微环境中的关键作用 | 首次识别出IREB2阳性小胶质细胞亚群（IREB2⁺ MC C1）在阿尔茨海默病中显著扩增，并证明IREB2通过NF-κB通路同时驱动小胶质细胞活化和神经元炎症反应，提出IREB2作为双靶点治疗策略的可能性 | 主要基于公共数据库的单细胞数据分析和细胞实验验证，缺乏体内动物模型和临床样本的验证；SH-SY5Y细胞系作为神经元模型的局限性 | 研究铁反应元件结合蛋白2（IREB2）在阿尔茨海默病相关神经炎症中的作用机制 | 阿尔茨海默病脑组织单细胞RNA测序数据和小胶质细胞亚群 | digital pathology | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 从公开数据集中获取的阿尔茨海默病脑组织样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |