单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 10761 - 10780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10761 | 2024-08-05 |
Developing an advanced diagnostic model for hepatocellular carcinoma through multi-omics integration leveraging diverse cell-death patterns
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1410603
PMID:39044829
|
研究论文 | 本研究通过多组学整合构建了一种针对肝细胞癌的先进诊断模型 | 创新性地利用程序性细胞死亡相关基因构建了一个七基因的诊断模型，并揭示了其与免疫检查点抑制治疗的关联 | 样本量相对较小，仅使用了50个样本和104,288个单细胞，可能限制了模型的广泛适应性 | 明确程序性细胞死亡基因在肝细胞癌中的作用并构建诊断模型 | 肝细胞癌患者样本，包括血液来源的外泌体和肿瘤组织 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序和RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 50个样本，104,288个单细胞 |
| 10762 | 2024-08-05 |
Hemicentin-1 is an essential extracellular matrix component during tooth root formation by promoting mesenchymal cells differentiation
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1435241
PMID:39050894
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研究论文 | 该文章探讨了Hemicentin-1在牙根形成中的作用，特别是在牙本质形成过程中的影响 | 识别并强调了Hemicentin-1作为牙根与牙冠之间牙本质形成差异的关键外部矩阵成分 | 未提供与人类牙髓细胞相关的体内实验数据 | 研究Hemicentin-1在牙根形成过程中的作用，特别是其在牙本质形成中的功能 | 使用小鼠的牙齿组织，特别是切牙和磨牙，作为研究对象 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，免疫组化染色，CCK8检测，BrdU检测，创伤愈合检测，ALP染色，茜素红染色 | NA | 组织样本 | 小鼠切牙和磨牙组织样本 |
| 10763 | 2024-08-05 |
Mapping Single-Cell Transcriptomes of Endometrium Reveals Potential Biomarkers in Endometrial Cancer
2024, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S470994
PMID:39050484
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，揭示了子宫内膜癌中的潜在生物标志物 | 首次综合分析了59,397个子宫内膜样本的单细胞转录组，识别出多种细胞亚型及其转录因子活性 | 未提及实验验证阶段的具体样本数据或者临床试验结果 | 研究子宫内膜的动态免疫微环境及其在子宫内膜癌中的作用 | 分析了十个子宫内膜样本中的59397个细胞的转录组 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 10个子宫内膜样本和535个子宫内膜癌样本 |
| 10764 | 2024-08-05 |
Characterization of the Prognosis and Tumor Microenvironment of Cellular Senescence-related Genes through scRNA-seq and Bulk RNA-seq Analysis in GC
2024, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
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研究论文 | 本研究探讨了细胞衰老相关基因在胃癌中的预后作用和分子亚型 | 该研究首次基于细胞衰老相关基因划分胃癌分子亚型并发展了相应的风险模型 | 研究可能缺乏外部验证，依赖于特定的数据库资源 | 研究细胞衰老相关基因在胃癌中的作用和影响 | 胃癌患者的细胞衰老相关基因及其临床信息 | 数字病理学 | 胃癌 | scRNA-seq和Bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 利用了TCGA数据库中各类胃癌患者的临床和基因表达数据 |
| 10765 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Steroidogenesis and Spermatogenesis Impairment in the Testis of db/db Mice
2024, International journal of endocrinology
IF:2.3Q3
DOI:10.1155/2024/8797972
PMID:38817616
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研究论文 | 本研究探讨了db/db小鼠睾丸中类固醇生成和精子发生的障碍机制 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了db/db小鼠中睾丸的类固醇生成和精子发生缺陷 | 本研究仅限于db/db小鼠，可能不适用于其他类型的糖尿病模型 | 探究2型糖尿病对男性类固醇生成和精子发生的影响 | db/db小鼠及其对照C57BL/6J小鼠的睾丸 | 数字病理学 | 糖尿病相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | db/db小鼠和C57BL/6J小鼠 |
| 10766 | 2024-08-05 |
Cellular age explains variation in age-related cell-to-cell transcriptome variability
2023-Dec-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278144.123
PMID:37973195
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研究论文 | 本研究探讨了细胞年龄如何解释不同细胞之间与年龄相关的转录组变异性 | 提出了一种新颖的启发式模型，解释了细胞类型之间衰老速率差异的原因 | 仅基于小鼠的单细胞转录组数据，可能不适用于其他物种 | 研究细胞特定差异如何影响转录组的衰老表现 | 不同细胞类型在多种组织和年龄下的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | 启发式模型 | 转录组 | 小鼠的多样化组织和年龄的单细胞数据 |
| 10767 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq recognized the initiator of epithelial ovarian cancer recurrence
2022-Feb, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-021-02139-z
PMID:34992217
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别出上皮性卵巢癌复发的初始细胞 | 发现了CYR61“应激”亚群作为复发起始细胞，增进了对上皮性卵巢癌复发机制的理解 | 研究中样本可能存在的异质性未能完全消除 | 探究上皮性卵巢癌复发的起源及机制 | 来自原发、未治疗腹膜转移和复发肿瘤的13369个细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 13369个细胞 |
| 10768 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling and the use of AID deficient mice reveal that B cell activation combined with antibody class switch recombination and somatic hypermutation do not benefit the control of experimental trypanosomosis
2021-11, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1010026
PMID:34762705
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研究论文 | 本文研究了在AID缺失小鼠中B细胞活化与抗体类别转换和体细胞高突变对实验性锥虫病控制的影响 | 首次在锥虫感染小鼠的脾细胞上应用scRNA-seq分析，揭示了自然IgM在抗锥虫感染中的独特作用 | 研究主要集中在鼠模型中，可能无法完全反映人类感染的复杂性 | 探讨锥虫感染中B细胞的作用及其对宿主免疫反应的影响 | 锥虫感染的小鼠脾细胞及其B细胞反应 | 数字病理学 | 锥虫病 | scRNA-seq、流式细胞术、ELISA | NA | 细胞 | 锥虫感染的老鼠脾细胞 |
| 10769 | 2024-08-05 |
In silico analysis suggests disruption of interactions between HAMP from hepatocytes and SLC40A1 from macrophages in hepatocellular carcinoma
2021-May-17, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-021-00977-0
PMID:34001107
|
研究论文 | 本研究通过分析HCC微环境中的细胞之间的相互作用，探讨肝癌的增殖机制 | 首次揭示了HAMP与SLC40A1之间的相互作用在肝细胞癌异常增殖中的重要性 | 尚需通过湿实验进行进一步验证 | 识别肝细胞癌及其旁癌组织中的增殖性肝细胞，并探讨其异常增殖的潜在作用 | 增殖性肝细胞及其在HCC和旁癌组织中的基因表达特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了来自HCC及其旁癌组织的单细胞样本 |
| 10770 | 2024-08-05 |
Taming human brain organoids one cell at a time
2021-03, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2020.05.022
PMID:32718852
|
review | 本综述总结了单细胞转录组技术在解析人脑类器官复杂性方面的最新方法、进展和挑战 | 文章创新在于整合了单细胞转录组学和新兴技术，以深入研究人脑发展和疾病特征 | 文章没有讨论具体的应用案例和局限性 | 研究人脑类器官的复杂性及其在发育过程中的基因调控 | 人脑类器官，特别是它们的细胞组成和发育起源 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 10771 | 2024-08-05 |
Connect-seq to superimpose molecular on anatomical neural circuit maps
2020-02-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1912176117
PMID:32034095
|
研究论文 | 本文描述了一种结合逆行病毒追踪和单细胞转录组学的方法，称为“Connect-seq”，用于揭示特定神经回路中上游神经元的分子身份及其信号分子 | Connect-seq方法的创新在于将分子图谱与神经解剖图谱叠加，实现对神经回路功能的分子和遗传学研究 | NA | 探究小鼠大脑神经回路内个体神经元的身份和功能 | 小鼠大脑中的下丘脑神经元，尤其是控制对恐惧和压力生理反应的神经元 | 数字病理 | NA | 逆行病毒追踪和单细胞转录组学 | NA | 分子图谱与神经解剖图谱 | NA |
| 10772 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis of CD8 + T-cell memory inflation
2019, Wellcome open research
DOI:10.12688/wellcomeopenres.15115.1
PMID:31448339
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研究论文 | 本研究分析了持久病毒引起的CD8 T细胞记忆膨胀的转录组特征 | 定义了不同部位记忆膨胀的转录机制，并提供了T细胞记忆的转录图谱 | 未提及具体的局限性 | 探讨持久病毒和疫苗诱导的CD8 T细胞记忆膨胀的转录机制 | MCMV感染小鼠中的病毒特异性CD8 T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自MCMV感染小鼠的特定T细胞群体 |
| 10773 | 2024-08-04 |
Circular RNA-based therapy provides sustained and robust neuroprotection for retinal ganglion cells
2024-Sep-10, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102258
PMID:39045516
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研究论文 | 这篇文章探讨了一种基于环状RNA的疗法，该疗法为视网膜神经节细胞提供持久且强效的保护 | 本研究利用环状RNA（circRNA）来提高神经生长因子（NGF）的蛋白质表达，并为视网膜神经节细胞提供保护，这是一种创新的治疗方法 | 本研究未提及具体的药物传递系统的长期影响和临床转化的可行性 | 研究基于环状RNA的疗法在治疗眼部神经退行性疾病中的效果 | 研究对象为小鼠视神经挫伤模型中的视网膜神经节细胞 | 数字病理学 | 眼部神经退行性疾病 | 脂质纳米颗粒（LNP）制备的circNGF | 小鼠视神经挫伤模型 | 单细胞转录组数据 | 未提供具体样本大小 |
| 10774 | 2024-08-05 |
Endogenous activation of peroxisome proliferator-activated receptor-α in proximal tubule cells in counteracting phosphate toxicity
2024-Aug-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00046.2024
PMID:38870264
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研究论文 | 这篇文章探讨了肾小管上皮细胞内源性活化过氧化物酰化酶-α以对抗磷毒性的机制 | 首次揭示了PPAR-α和脂肪酸β-氧化在肾小管上皮细胞中的内源性激活作为保护肾脏免受磷毒性的机制 | 对内源性机制的理解仍然有限，需进一步研究 | 旨在识别肾脏中对抗磷过负荷的内源性保护机制 | 对于对照组与饮食磷负荷（Phos）小鼠肾脏进行了单细胞RNA测序分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因数据 | 对照组与磷负荷小鼠的肾脏进行了比较 |
| 10775 | 2024-08-05 |
Elevated Cathepsin S Serum Levels in New-Onset Type 1 Diabetes and Autoantibody-Positive Siblings
2024-Aug-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0911
PMID:38701365
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研究论文 | 本文研究了1型糖尿病中溶酶体蛋白酶cathepsin S的潜在生物标志物作用 | 研究首次揭示了1型糖尿病新发患者血清中cathepsin S水平升高与自抗体状态的关联 | 该研究未明确cathepsin S的保护性或有害性作用 | 探讨cathepsin S作为1型糖尿病的新发生物标志物的潜力 | 研究对象包括新发1型糖尿病儿童及其自抗体阳性和阴性兄弟姐妹 | NA | 1型糖尿病 | ELISA、实时qPCR、免疫印迹 | NA | 血清 | 包含新发1型糖尿病儿童和其自抗体阳性及阴性兄弟姐妹的样本 |
| 10776 | 2024-08-05 |
Integrative analysis reveals the potential prognostic roles and immunological values of unc-5 netrin receptor A (UNC5A) in glioma
2024-Jul-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01174-y
PMID:39039366
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研究论文 | 该文章探讨了UNC5A在胶质瘤中的预后和免疫学价值 | 首次综合分析了UNC5A在胶质瘤中的作用，并提出其作为新的预后和免疫标志物的潜力 | 未详细讨论UNC5A在治疗胶质瘤中的具体机制 | 研究UNC5A在胶质瘤中的功能及其与肿瘤免疫的关联 | UNC5A在胶质瘤患者中的表达及其预后意义 | 数字病理学 | 胶质瘤 | scRNA-seq, 蛋白质组学, 大规模RNA-seq | NA | RNA数据 | 使用了TCGA及CGGA数据集中的胶质瘤患者数据 |
| 10777 | 2024-08-05 |
TGF-β1 mediates hypoxia-preconditioned olfactory mucosa mesenchymal stem cells improved neural functional recovery in Parkinson's disease models and patients
2024-Jul-22, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-024-00550-7
PMID:39034405
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研究论文 | 该文章研究了TGF-β1在嗅觉黏膜间充质干细胞改善帕金森病神经功能恢复中的作用 | 首次揭示了TGF-β1在嗅觉黏膜间充质干细胞对神经功能恢复的调节作用及其机制 | 目前的研究主要集中在小鼠模型和初步临床试验，尚缺乏大规模的长期跟踪研究 | 探讨嗅觉黏膜间充质干细胞在帕金森病神经功能恢复中的潜在应用 | 帕金森病模型和患者 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq)、高通量测序的可接触染色质转座酶检测 (ATAC-seq) 和全长转录组同工谱测序 (ISO-seq) | NA | NA | 初步患者队列，具体样本量未说明 |
| 10778 | 2024-08-04 |
Identification of tumor-specific T cell signature predicting cancer immunotherapy response in bladder cancer by multi-omics analysis and experimental verification
2024-Jul-20, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03447-6
PMID:39033098
|
研究论文 | 本文开发了一种基于肿瘤特异性T细胞相关基因的五基因签名，以预测膀胱癌患者对免疫疗法的响应 | 提出了一种新的肿瘤特异性T细胞签名（TstcSig），该签名能够预测膀胱癌免疫疗法的结果 | 目前尚未对TstcSig在其他类型癌症中的预测能力进行广泛验证 | 研究肿瘤特异性T细胞在膀胱癌免疫治疗中的作用及其相关基因 | 膀胱癌患者及其免疫疗法响应的相关基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA和TCR测序 | NA | 基因表达数据 | 在多个免疫治疗队列中验证，包括TCGA和GEO数据库的膀胱癌患者样本 |
| 10779 | 2024-08-05 |
Determining M2 macrophages content for the anti-tumor effects of metal-organic framework-encapsulated pazopanib nanoparticles in breast cancer
2024-Jul-20, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02694-z
PMID:39033109
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研究论文 | 该文章探讨了金属有机框架封装的pazopanib纳米粒子在乳腺癌中的抗肿瘤效果。 | 创新点在于开发了一种新型纳米平台以提高pazopanib的抗肿瘤活性，并通过单细胞RNA测序揭示了其在抑制M2型巨噬细胞方面的作用。 | 研究中可能存在对临床适用性的局限性，尚需进一步的临床试验验证。 | 研究旨在提高pazopanib在乳腺癌治疗中的疗效。 | 研究对象包括四种小鼠肿瘤模型和人类乳腺癌MDA-MB-231模型。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 涉及小鼠和人类的乳腺癌模型 |
| 10780 | 2024-08-05 |
Computing cell state discriminates the aberrant hematopoiesis and activated microenvironment in Myelodysplastic syndrome (MDS) through a single cell genomic study
2024-Jul-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05496-x
PMID:39033303
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研究论文 | 本文通过单细胞基因组研究系统性描绘了骨髓异常造血、风险异质性和T细胞微环境的变化 | 提出了在MDS研究中使用整个骨髓细胞而非仅CD34+细胞可以提供更全面的信息 | 仅涉及五名MDS患者，样本量较小 | 探索骨髓样本中细胞状态与MDS异常造血和激活微环境之间的关系 | 研究五名MDS患者与四名健康供体的骨髓细胞 | 数字病理学 | 骨髓异常增生综合症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 五名MDS患者和四名健康供体的整体骨髓细胞 |