单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 10741 - 10760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10741 | 2024-08-05 |
Latent periodic process inference from single-cell RNA-seq data
2020-03-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15295-9
PMID:32188848
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Cyclum的自编码器方法，用于从单细胞RNA测序数据中推断潜在的周期性生物过程 | Cyclum显著提高了细胞周期特征化的准确性和稳健性，超越了现有方法 | 对于周期性过程的准确表征仍然具有挑战性 | 研究如何从单细胞RNA测序数据中推断生物发育过程中潜在的周期性过程 | 通过分析不同发育阶段细胞的转录组特征，聚焦于细胞周期的识别 | 数字病理学 | 肿瘤异质性 | RNA测序 | 自编码器 | transcriptomic 数据 | NA |
| 10742 | 2024-08-04 |
A global view of altered ligand-receptor interactions in bone marrow aging based on single-cell sequencing
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.06.020
PMID:39050783
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研究论文 | 基于单细胞转录组测序检测骨髓衰老的配体-受体相互作用 | 首次系统性探讨了衰老对骨髓配体-受体相互作用的影响 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类 | 了解衰老对骨髓的细胞间通讯的影响 | 对年轻和老年小鼠的骨髓细胞进行分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 研究涉及384,124条相互作用和16种骨髓细胞类型 |
| 10743 | 2024-08-05 |
LiverSCA: A comprehensive and user-friendly cell atlas in human hepatocellular carcinoma
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.06.031
PMID:39050786
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研究论文 | 我们开发了一个名为LiverSCA的细胞图谱，旨在支持肝癌相关的研究 | 提供了一个用户友好的网络界面和全面的功能，使研究人员能够轻松访问肝癌肿瘤微环境的细胞和分子景观 | NA | 帮助研究人员在肝癌研究中快速而便捷地探索细胞和分子特征 | 人类肝细胞癌的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 10744 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of ferroptosis and stemness based on single-cell and bulk RNA-sequencing data provide insights into the prognosis and treatment of esophageal carcinoma
2024-Nov-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148701
PMID:38885819
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研究论文 | 本研究基于单细胞和大规模RNA测序数据，探讨了铁死亡与干性在食管癌预后和治疗中的作用 | 构建了一个新颖的与铁死亡相关的干性标记，并识别了两个在食管癌中的标记基因 | 缺乏对铁死亡相关基因与干性标志物在ESCA预后中的联合作用的深入研究 | 探讨铁死亡及干细胞特征对食管癌患者预后和治疗的影响 | 未治疗的食管癌样本中的干细胞与血流动力学相关基因 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 18个未治疗的食管癌样本 |
| 10745 | 2024-08-05 |
IL-17 signaling pathway: A potential therapeutic target for reducing skeletal muscle inflammation
2024-Sep, Cytokine
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cyto.2024.156691
PMID:38986253
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研究论文 | 该研究探讨了IL-17信号通路在骨骼肌炎症中的作用及其治疗潜力 | 研究首次揭示IL-17信号通路在骨骼肌炎症中的重要性，并探讨了抗IL-17抗体的治疗效果 | 尚未充分研究IL-17信号通路与其他炎症通路之间的相互作用 | 研究IL-17信号通路在骨骼肌炎症中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 使用小鼠模型研究IL-17信号通路与骨骼肌炎症的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），酶联免疫吸附实验（ELISA），免疫荧光，Western blot | NA | NA | 使用C57BL6/J小鼠模型进行实验 |
| 10746 | 2024-08-04 |
FASN-mediated fatty acid biosynthesis remodels immune environment in Clonorchis sinensis infection-related intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-Aug, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.03.016
PMID:38508240
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研究论文 | 本文探讨了克隆氏姜蚴感染相关的肝内胆管癌(iCCA)的临床影响及其潜在分子特征。 | 提供了关于FASN介导的脂肪酸生物合成在克隆氏姜蚴感染相关iCCA中的作用的新见解，并展示了FASN抑制剂与免疫疗法联合使用的潜力。 | 当前研究的分子特征尚不够明确，可能需要进一步的验证和探索。 | 研究克隆氏姜蚴感染与肝内胆管癌之间的关系，以及对免疫微环境的影响。 | 251名来自三个医疗中心的肝内胆管癌患者。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、全外显子测序、RNA测序、代谢组学、空间转录组学 | 小鼠模型 | 基因组数据和代谢组数据 | 251名肝内胆管癌患者 |
| 10747 | 2024-08-05 |
Astrocyte-specific activation of sigma-1 receptors in mPFC mediates the faster onset antidepressant effect by inhibiting NF-κB-induced neuroinflammation
2024-Aug, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2024.06.008
PMID:38852761
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研究论文 | 本研究探讨了σ-1受体的星形胶质细胞特异性激活如何通过抑制NF-κB引起的神经炎症，从而中介更快速的抗抑郁药效应 | 本研究首次揭示了YL-0919对抗抑郁效果的星形胶质细胞特异性机制，并强调了σ-1受体在快速抗抑郁中的关键作用 | 本研究专注于小鼠模型，可能限制了结果的广泛适用性 | 本研究旨在揭示YL-0919在抑郁样小鼠中通过星形胶质细胞激活σ-1受体的机制 | 本研究的研究对象为抑郁样小鼠及其星形胶质细胞 | 数字病理学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个抑郁样小鼠样本 |
| 10748 | 2024-08-05 |
Characterize molecular signatures and establish a prognostic signature of gastric cancer by integrating single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing
2024-Jul-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01168-w
PMID:39044041
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和大规模RNA测序，特征化胃癌的分子特征并建立预后特征。 | 通过整合不同维度的数据，识别了226个候选标记基因，并开发了一个高预测准确度的预后模型。 | 疾病的异质性和分子交互的复杂性仍然是挑战。 | 研究胃癌的分子基础，开发个性化治疗策略的预后模型。 | 关注胃癌患者的分子特征和相关的临床参数。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和大规模RNA测序(bulk RNA-seq) | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA |
| 10749 | 2024-08-05 |
Characterization of cuproptosis signature in clear cell renal cell carcinoma by single cell and spatial transcriptome analysis
2024-Jul-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01162-2
PMID:39044005
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组分析对清细胞肾细胞癌中的铜死亡特征进行了表征 | 首次系统研究了铜死亡相关基因与清细胞肾细胞癌肿瘤微环境的关联 | 仅研究了清细胞肾细胞癌，未涉及其他类型肿瘤 | 探讨铜死亡在清细胞肾细胞癌中的作用及其与肿瘤微环境的关系 | 清细胞肾细胞癌的不同阶段的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组测序 | NA | RNA序列数据 | 多阶段清细胞肾细胞癌的样本集 |
| 10750 | 2024-08-05 |
Multi-omics analysis unveils immunosuppressive microenvironment in the occurrence and development of multiple pulmonary lung cancers
2024-Jul-23, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00651-5
PMID:39043808
|
研究论文 | 本研究揭示了多发性肺癌中免疫抑制微环境的特征 | 研究首次全面调查了与不同影像学或病理特征相关的多发性肺癌的分子和免疫特征 | 未提供关于样本来源的详细信息及样本数量的具体分布 | 研究多发性肺癌的发生与发展与其免疫微环境之间的关系 | 收集了27个肺结节及相应的正常组织和血液样本进行分析 | 数字病理学 | 肺癌 | 全外显子测序（WES）和全转录组测序 | NA | 组织样本，血液样本 | 27个肺结节及匹配的正常组织和血液样本 |
| 10751 | 2024-08-05 |
P53 Activation Promotes Maturational Characteristics of Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes in 3-Dimensional Suspension Culture Via FOXO-FOXM1 Regulation
2024-Jul-02, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.123.033155
PMID:38934864
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研究论文 | 本研究探讨了p53激活如何通过调节FOXO和FOXM1的平衡来促进人诱导多能干细胞衍生心肌细胞的成熟特性 | 首次揭示了p53激活在三维悬浮培养中促进hiPSC-CM成熟的机制 | 研究样本量较小，仅为每组3到6个样本，可能影响结果的普遍性 | 研究hiPSC-CM的成熟机制，以促进其临床转化 | 人诱导多能干细胞衍生的心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 每组3到6个hiPSC-CM样本 |
| 10752 | 2024-08-04 |
Leveraging single-cell sequencing analysis and bulk-RNA sequencing analysis to forecast necroptosis in cutaneous melanoma prognosis
2024-Jul, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15148
PMID:39051739
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序和普通RNA测序分析预测皮肤黑色素瘤中的坏死性凋亡 | 研究中提出了一种通过机器学习算法构建的与坏死性凋亡相关的标志（NRS），并验证了其在多组中的预后能力 | 研究主要依赖于公共数据库的数据，可能存在数据的代表性和准确性问题 | 探讨坏死性凋亡在皮肤黑色素瘤预后中的作用 | 主要研究对象为皮肤黑色素瘤患者的细胞，包括不同类型的细胞团和相关基因表达模式 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞测序，普通RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 共分析了四个队列的黑色素瘤数据，包括一个TCGA和三个GEO队列 |
| 10753 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptome Landscape and Cell Fate Decoding in Human Brain Organoids after Transplantation
2024-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202402287
PMID:38711218
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研究论文 | 本文探讨了人脑类器官移植后细胞命运的变化 | 研究揭示了移植后人脑类器官的细胞命运与宿主细胞接近的规律 | 未能详细探讨不同大脑区域对细胞命运的影响机制 | 探讨人脑类器官移植后细胞命运变化的机制 | 人类脑类器官及其移植后命运的细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | 多个用于比较移植前后及不同大脑区域的样本 |
| 10754 | 2024-08-04 |
Gene representation bias in spatial transcriptomics
2024-Jun, Journal of bioinformatics and computational biology
IF:0.9Q4
DOI:10.1142/S0219720024500070
PMID:39036848
|
研究论文 | 本研究探讨了在空间转录组学中，与大规模RNA-seq相比，哪些基因在Visium中常常被低检测到。 | 本研究揭示了在Visium中，特定基因由于聚合酶(T)结构的影响而被低检测的潜在机制。 | 该研究基于有限的人类和小鼠样本，可能未能涵盖所有组织来源的差异。 | 识别在Visium中相比大规模RNA-seq常常低检测的基因及其潜在机制。 | 研究对象包括28个人类样本和19个小鼠样本，涉及多种组织源。 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 基因计数矩阵 | 28个人类样本和19个小鼠样本 |
| 10755 | 2024-08-04 |
NDMNN: A novel deep residual network based MNN method to remove batch effects from scRNA-seq data
2024-Jun, Journal of bioinformatics and computational biology
IF:0.9Q4
DOI:10.1142/S021972002450015X
PMID:39036845
|
研究论文 | 提出一种名为NDMNN的新颖方法来去除scRNA-seq数据中的批次效应 | NDMNN方法结合了密集深度残差网络模型和MNN方法，显著改善了批次效应的修正 | NA | 主要研究如何有效去除单细胞RNA测序数据中的批次效应 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 深度残差网络 | 数据 | NA |
| 10756 | 2024-08-05 |
Dynamic Transcriptional Programs During Single NK Cell Killing: Connecting Form to Function in Cellular Immunotherapy
2024-Jun, Cellular and molecular bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s12195-024-00812-3
PMID:39050513
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研究论文 | 本文探讨了在单个NK细胞杀伤过程中转录程序的动态变化，并将形态与功能连接起来。 | 结合了单细胞RNA测序和活细胞成像的方法，以深入理解NK细胞的杀伤表型。 | 研究限于NK-92细胞系与HeLa细胞的共培养，可能不完全反映真实生理状态。 | 目标是揭示NK细胞杀伤机制中的转录调控。 | 主要研究NK细胞与HeLa宫颈癌细胞的相互作用。 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 使用NK-92细胞系和HeLa细胞进行共培养，样本量未具体说明 |
| 10757 | 2024-08-05 |
Multi-omics analysis of human tendon adhesion reveals that ACKR1-regulated macrophage migration is involved in regeneration
2024-May-07, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-024-00324-w
PMID:38714649
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研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了ACKR1调控的巨噬细胞迁移参与人类肌腱粘连的再生过程 | 发现了一种新的抗纤维化巨噬细胞群体及其来源 | 研究中的抗纤维化机制仍需进一步验证和探讨 | 研究肌腱损伤后肌腱粘连的纤维化微环境 | 分析人类和小鼠的肌腱粘连组织样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白组学 | NA | 组织样本 | 超过74000个单细胞 |
| 10758 | 2024-08-05 |
Marmosets contain multitudes
2024-Apr-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97866
PMID:38661001
|
研究论文 | 单细胞RNA测序揭示了眉猴在其兄弟姐妹之间携带遗传上不同细胞的程度 | 首次通过单细胞RNA测序展示了眉猴的遗传多样性 | 未提及具体的实验范围或样本来源 | 探讨眉猴细胞的遗传多样性 | 眉猴的细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 10759 | 2024-08-04 |
STIGMA: Single-cell tissue-specific gene prioritization using machine learning
2024-02-01, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2023.12.011
PMID:38228144
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研究论文 | 本文介绍了一种使用单细胞RNA-seq数据的针对特定组织的基因优先排序方法STIGMA | STIGMA通过学习不同细胞类型在健康器官生成过程中的基因表达动态，弥补了现有方法未能捕捉细胞亚群体表达异质性的不足 | 未提及具体局限性 | 研究主要致力于利用单细胞转录组数据优先排序与罕见先天疾病相关的候选基因 | 研究对象包括小鼠肢体和人类胎心的单细胞RNA-seq数据集，以及特定先天性疾病患者的基因变异 | 机器学习 | 先天性疾病 | 单细胞RNA-seq（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及7,958个个体的研究，特定病例的样本数量未明确说明 |
| 10760 | 2024-08-04 |
Integrative Pan-Cancer Analysis Reveals the Oncogenic Role of MND1 and Validation of MND1's Role in Breast Cancer
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S458832
PMID:39051055
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研究论文 | 本研究全面分析了MND1在多种癌症中的表达和生物学功能 | 发现MND1在多种癌症中特别是乳腺癌中具有促进肿瘤进展的作用，并且能够作为生物标志物用于癌症预后和免疫治疗 | 本研究主要依赖于数据库分析，缺乏大规模临床样本的实验证据 | 探讨MND1在不同癌症中的角色及其与乳腺癌的关系 | MND1在不同类型癌症中的表达、预后意义及功能进行研究 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 免疫组化染色、CCK8、EdU、克隆形成和流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 分析了来自不同癌症的多种样本及相关数据库 |