本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']
”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!
除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
10741 | 2025-10-07 |
Type I interferon signaling pathway enhances immune-checkpoint inhibition in KRAS mutant lung tumors
2024-Sep-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2402913121
PMID:39186651
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现KRAS突变肺肿瘤中I型干扰素通路受损,恢复该通路可增强免疫检查点抑制疗效 | 首次揭示KRAS突变肺肿瘤中I型干扰素通路受损是贯穿肿瘤发展的关键特征,证明恢复该通路可使免疫冷肿瘤转化为热肿瘤 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探索KRAS突变肺肿瘤早期发展阶段的功能性改变及其对免疫治疗的影响 | 表达KRAS致癌基因的小鼠肺泡II型细胞及携带p53或LKB1突变的小鼠和人类晚期肿瘤 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10742 | 2025-10-07 |
Transfer learning in a biomaterial fibrosis model identifies in vivo senescence heterogeneity and contributions to vascularization and matrix production across species and diverse pathologies
2023-08, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-00785-7
PMID:37079217
|
研究论文 | 本研究通过生物材料纤维化模型开发了体内衰老特征,并利用迁移学习识别了跨物种和多种病理条件下的衰老细胞异质性 | 建立了体内来源的衰老特征(SenSig),首次鉴定出周细胞和'软骨样'成纤维细胞作为衰老细胞,并发现了IL34-CSF1R-TGFβR信号轴介导的细胞间通讯机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证仍需进一步扩展 | 阐明体内衰老细胞的表型特征及其在组织修复和病理过程中的作用机制 | p16-CreER;Ai14报告基因小鼠、小鼠和人类单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 组织纤维化 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | 迁移学习 | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10743 | 2025-10-07 |
Spatial Transcriptomics Depict Ligand-Receptor Cross-talk Heterogeneity at the Tumor-Stroma Interface in Long-Term Ovarian Cancer Survivors
2023-05-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1821
PMID:36787106
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了卵巢癌肿瘤微环境中配体-受体交互的异质性及其与长期生存的关系 | 首次整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,开发计算方法研究肿瘤微环境中不同肿瘤细胞与癌症相关成纤维细胞亚型之间的空间配体-受体相互作用 | 需要进一步研究确认这种交互是否在调节高级别浆液性卵巢癌恶性表型中发挥作用 | 探索卵巢癌肿瘤微环境中基质异质性及其与患者长期生存的关系 | 高级别浆液性卵巢癌长期生存者和短期生存者的治疗初治肿瘤组织 | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学 | 计算方法 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 高级别浆液性卵巢癌长期生存者和短期生存者的肿瘤样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10744 | 2025-10-07 |
Multiplexed LNP-mRNA vaccination against pathogenic coronavirus species
2022-08-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111160
PMID:35921835
|
研究论文 | 开发针对多种致病性冠状病毒的LNP-mRNA多价疫苗并评估其免疫效果 | 首次开发针对SARS-CoV-2 Delta、SARS-CoV和MERS-CoV的三价LNP-mRNA疫苗,并通过单细胞RNA测序分析疫苗接种后的系统性免疫反应 | 研究仅在动物模型中进行,尚未进行人体临床试验 | 开发针对多种致病性冠状病毒的广谱疫苗 | SARS-CoV-2 Delta、SARS-CoV和MERS-CoV三种冠状病毒 | 疫苗开发 | 冠状病毒感染 | 单细胞RNA测序,LNP-mRNA疫苗技术 | NA | 基因表达数据,抗体反应数据 | 动物模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10745 | 2025-10-07 |
Variant-specific vaccination induces systems immune responses and potent in vivo protection against SARS-CoV-2
2022-05-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100634
PMID:35561673
|
研究论文 | 本研究评估了针对不同SARS-CoV-2变异株的特异性LNP-mRNA疫苗的免疫反应和保护效果 | 首次系统比较野生型和变异株特异性疫苗的免疫反应,并通过单细胞转录组学揭示免疫细胞群体和基因表达的系统性变化 | 研究主要在动物模型中进行,尚未在人体验证 | 评估变异株特异性LNP-mRNA疫苗的免疫效果和保护效力 | SARS-CoV-2病毒变异株(野生型、B.1.351、B.1.617) | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序,BCR-seq,TCR-seq,中和抗体检测 | 动物模型 | 基因表达数据,免疫受体序列数据 | 动物模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq,免疫受体测序 | NA | NA |
10746 | 2025-10-07 |
IL-7 receptor alpha defines heterogeneity and signature of human effector memory CD8+ T cells in high dimensional analysis
2020-09, Cellular immunology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cellimm.2020.104155
PMID:32619811
|
研究论文 | 通过高维质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术,研究IL-7Rα在定义人类效应记忆CD8+ T细胞异质性中的作用 | 首次揭示IL-7Rα在人类效应记忆CD8+ T细胞中具有多样化但有序的表达模式,并定义了细胞亚群的异质性景观 | 未明确说明样本规模和研究人群特征 | 探究IL-7Rα是否可作为定义人类效应记忆CD8+ T细胞异质性的关键分子 | 人类效应记忆CD8+ T细胞 | 免疫学 | NA | 质谱流式细胞术(CyTOF), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 蛋白质表达数据, 基因表达数据 | NA | NA | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10747 | 2025-10-07 |
New insight into GABAergic neurons in the hypothalamic feeding regulation
2018-Nov, The journal of physiological sciences : JPS
DOI:10.1007/s12576-018-0622-8
PMID:30003408
|
综述 | 综述下丘脑GABA能神经元在摄食调节中的研究进展 | 整合光遗传学、在体钙成像和单细胞RNA-seq三大前沿技术揭示GABA能神经元的多样性与摄食调控功能 | NA | 探讨下丘脑不同区域GABA能神经元在摄食调节中的作用机制 | 下丘脑弓状核(ARC)、背内侧下丘脑(DMH)和外侧下丘脑(LH)的GABA能神经元 | 神经科学 | 代谢疾病 | 光遗传学, 化学遗传学, 在体钙成像, 单细胞RNA测序 | NA | 神经活动数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10748 | 2025-10-07 |
Loss of ATG7 in microglia impairs UPR, triggers ferroptosis, and weakens amyloid pathology control
2025-Apr-07, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230173
PMID:39945772
|
研究论文 | 本研究探讨了微胶质细胞中ATG7缺失如何通过影响未折叠蛋白反应和氧化应激导致铁死亡,从而削弱对淀粉样斑块的控制 | 首次揭示ATG7缺失通过降低未折叠蛋白反应和增加氧化应激导致微胶质细胞铁死亡的具体机制 | 研究主要基于AD小鼠模型,人类微胶质细胞的反应可能有所不同 | 探究ATG7在微胶质细胞中对淀粉样斑块控制的分子机制 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的微胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,生化分析,免疫荧光分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,图像数据 | AD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10749 | 2025-10-07 |
Ephrin-B2 acts as a positive regulator of osteogenesis-angiogenesis coupling
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140555
PMID:39894124
|
研究论文 | 本研究探讨了Ephrin-B2信号在成骨-血管生成偶联中的正向调控作用及其机制 | 首次通过单细胞测序发现牙周炎中成骨细胞谱系Ephrin-B2信号缺陷,并构建过表达Ephrin-B2的成骨细胞与内皮细胞共移植系统证实其促进血管化骨再生的作用 | 研究主要基于体外共培养和动物实验,尚未进行临床验证 | 探索Ephrin-B2信号在成骨-血管生成偶联中的作用机制,为牙周组织工程提供指导 | 牙周组织、成骨细胞、人脐静脉内皮细胞(HUVECs) | 单细胞转录组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自公共数据库GEO: GSE171213的牙周组织单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10750 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptional footprint for pseudogene SsCLEC9A is associated with antigen processing and presentation in Sus scrofa
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140629
PMID:39904428
|
研究论文 | 本研究首次发现猪的CLEC9A基因因远古突变成为假基因,但其突变转录本仍影响树突状细胞的抗原呈递功能 | 首次揭示猪CLEC9A基因成为假基因的进化事件,并发现其突变转录本仍具有生物学功能 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 探究假基因SsCLEC9A的转录适应及其在抗原呈递中的作用 | 猪树突状细胞和骨髓造血细胞 | 免疫学 | NA | 荧光激活细胞分选,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10751 | 2025-10-07 |
Pan-cancer characterization of m6A-mediated regulation of T cell exhaustion dynamics and clinical relevancies in human cancers
2025-Mar-11, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2025.102465
PMID:39995977
|
研究论文 | 通过整合多组学数据对m6A修饰在T细胞耗竭动态调控中的泛癌作用进行系统性分析 | 首次在泛癌层面揭示m6A修饰与T细胞耗竭动态的相互作用,并基于此识别出三个具有不同临床预后的分子亚型 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证m6A调控T细胞耗竭的具体机制 | 探索m6A修饰在T细胞耗竭动态调控中的作用及其临床相关性 | 人类多种癌症类型中的T细胞耗竭动态 | 生物信息学 | 泛癌分析 | 单细胞RNA测序,多组学数据分析 | 多变量分析 | 多组学数据,单细胞RNA测序数据,免疫治疗数据集 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10752 | 2025-10-07 |
Liver transcriptome analysis reveals PSC-attributed gene set associated with fibrosis progression
2025-Mar, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101267
PMID:39996122
|
研究论文 | 通过肝脏转录组分析识别与原发性硬化性胆管炎胆道纤维化进展相关的特异性基因特征 | 首次系统识别PSC特异性胆道纤维化基因特征,并通过单细胞RNA测序数据揭示不同细胞类型在纤维化中的特异性作用 | 样本量相对有限,需要进一步功能验证研究 | 识别与原发性硬化性胆管炎胆道纤维化进展相关的特异性基因特征 | 原发性硬化性胆管炎、原发性胆汁性胆管炎和代谢功能障碍相关脂肪性肝病患者的肝脏活检样本 | 转录组学 | 肝脏疾病 | RNA测序,单细胞RNA测序,差异基因表达分析 | NA | 转录组数据 | 47例肝脏活检(PSC 16例,PBC 15例,MASLD 16例),外部验证集73例PSC样本 | NA | RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
10753 | 2025-10-07 |
Intratumoral Injection of Cytotoxic Drugs Plus Hapten Elicits Significant Immune Responses in Sentinel Lymph Nodes: Implications for Cancer Immunotherapy
2025-Mar-01, Pancreas
IF:1.7Q3
DOI:10.1097/MPA.0000000000002439
PMID:39999315
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析前哨淋巴结在胰腺癌原发灶经细胞毒性药物加半抗原瘤内注射治疗后的细胞和基因组变化 | 首次结合细胞毒性药物与半抗原进行瘤内注射,系统揭示前哨淋巴结微环境的动态重组机制 | 研究仅针对胰腺癌模型,未验证其他癌症类型的普适性 | 探索前哨淋巴结在癌症免疫治疗中的作用机制及远隔效应 | 胰腺癌患者的前哨淋巴结 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10754 | 2025-10-07 |
Targeting Zfp36 to combat cardiac hypertrophy: Insights into ferroptosis pathways
2025-Mar, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70247
PMID:40000392
|
研究论文 | 本研究揭示了Zfp36通过调控铁死亡通路抑制心脏肥大的新机制 | 首次证明Zfp36通过Ythdc2/SLC7A11/GSH通路调控铁死亡从而抑制心脏肥大 | Zfp36在心脏肥大中的具体作用机制仍需进一步探索 | 研究Zfp36在心脏肥大中铁死亡的调控功能 | 心肌细胞和心肌组织 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10755 | 2025-10-07 |
Molecular profiling of skin cells identifies distinct cellular signatures in radiation-induced skin injury across various stages in the murine dataset
2025-Feb-25, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00596-w
PMID:40001256
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析辐射诱导皮肤损伤中不同细胞亚群的分子特征和相互作用机制 | 首次在辐射诱导皮肤损伤中系统鉴定32个细胞亚群,揭示循环角质形成细胞通过BMP-Wnt-SMAD通路驱动伤口愈合和纤维化过程 | 研究基于小鼠模型,结果需要进一步在人类样本中验证 | 阐明辐射诱导皮肤损伤的分子机制和细胞相互作用 | C57BL/6小鼠皮肤细胞 | 单细胞基因组学 | 辐射性皮肤损伤 | 单细胞RNA测序, RT-PCR, 多重免疫荧光染色 | Seurat, Cellchat, SCP, ssGSEA | 单细胞转录组数据 | 71,412个细胞,来自辐射后7天和30天及未辐射小鼠皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10756 | 2025-10-07 |
Targeted delivery of CCL3 reprograms macrophage antigen presentation and enhances the efficacy of immune checkpoint blockade therapy in hepatocellular carcinoma
2025-Feb-23, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010947
PMID:39988347
|
研究论文 | 本研究探讨CCL3通过重编程巨噬细胞抗原呈递功能增强肝细胞癌免疫检查点阻断疗法疗效的机制 | 首次揭示CCL3通过CCR5通路增强巨噬细胞代谢和抗原摄取能力,重塑肿瘤免疫微环境并提高免疫治疗敏感性 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 研究CCL3在调节肝细胞癌肿瘤免疫微环境中的作用及其对免疫治疗的增强效果 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的巨噬细胞和T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,多重免疫荧光,共培养系统,共聚焦成像,代谢物检测 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据,影像数据 | 癌症基因组图谱数据库中的人肝细胞癌样本及临床前模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10757 | 2025-10-07 |
SREBF1-based metabolic reprogramming in prostate cancer promotes tumor ferroptosis resistance
2025-Feb-23, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02354-7
PMID:39988626
|
研究论文 | 本研究探讨了前列腺癌中SREBF1介导的代谢重编程与铁死亡抵抗的关联及其治疗潜力 | 首次通过单细胞测序揭示SREBF1在前列腺癌中的高转录活性,并证明其通过代谢重编程促进铁死亡抵抗的新机制 | NA | 探究前列腺癌代谢重编程与铁死亡抵抗的关联及治疗策略 | 正常前列腺组织和不同类型前列腺癌组织 | 生物医学 | 前列腺癌 | 单细胞测序, 转录因子调控网络分析, hdWGCNA, bulk RNA分析 | NA | 单细胞测序数据, 批量RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10758 | 2025-10-07 |
Advances and Challenges in Modeling Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease: A Focus on Kidney Organoids
2025-Feb-19, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13020523
PMID:40002937
|
综述 | 本文总结了常染色体显性多囊肾病器官模型构建的最新进展与挑战 | 重点关注iPSC衍生模型在模拟肾脏发育和病理表型方面的创新应用 | 当前技术存在血管化不足和成熟度有限等挑战 | 探索ADPKD疾病机制和促进药物发现 | 常染色体显性多囊肾病(ADPKD)器官模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞转录组学,微流体生物反应器培养系统 | 器官模型 | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10759 | 2025-10-07 |
The Endothelial Cell-Related Genes EIF1 and HSPA1B Contribute to the Pathogenesis of Alzheimer's Disease by Modulating Peripheral Immunoinflammatory Responses
2025-Feb-16, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci15020205
PMID:40002537
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现内皮细胞相关基因EIF1和HSPA1B通过调节外周免疫炎症反应参与阿尔茨海默病发病机制 | 首次鉴定出内皮细胞相关基因EIF1和HSPA1B作为AD关键基因,并揭示其通过调节外周免疫炎症反应参与AD发病的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证来确认分子机制 | 探索内皮细胞通过调节外周免疫炎症反应参与阿尔茨海默病发病的分子机制 | 阿尔茨海默病患者的内皮细胞和免疫炎症反应 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, LASSO回归, 随机森林算法, GSEA, GSVA, ssGSEA | LASSO, 随机森林 | RNA测序数据 | 数据集GSE157827和队列外周血RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10760 | 2025-10-07 |
EGFR-Mutant Lung Adenocarcinoma Cell-Derived Exosomal miR-651-5p Induces CD8+ T Cell Apoptosis via Downregulating BCL2 Expression
2025-Feb-15, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13020482
PMID:40002895
|
研究论文 | 本研究揭示了EGFR突变肺腺癌细胞通过外泌体miR-651-5p诱导CD8+ T细胞凋亡的机制 | 首次发现EGFR突变肺腺癌细胞通过外泌体传递miR-651-5p下调BCL2表达促进CD8+ T细胞凋亡,并提出miR-651-5p拮抗剂可增强PD-1抑制剂疗效 | NA | 探究EGFR突变非小细胞肺癌患者对PD-1/PD-L1抑制剂疗效不佳的机制 | EGFR突变肺腺癌细胞、CD8+ T细胞、人源化小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 小RNA测序, 单细胞测序, 流式细胞术, 细胞共培养 | NA | 测序数据, 流式细胞数据, 临床标本数据 | NA | NA | small RNA sequencing, single-cell sequencing | NA | NA |