单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
10721 2024-08-05
DUSP6 mediates resistance to JAK2 inhibition and drives leukemic progression
2023-01, Nature cancer IF:23.5Q1
研究论文 本研究揭示DUSP6在髓系恶性肿瘤转化中的作用及其作为潜在治疗靶点的价值 发现DUSP6的异常表达与疾病转化相关,且DUSP6-RSK1通路可作为药物靶点 未详细探讨DUSP6在不同患者中的具体作用机制 探索DUSP6在髓系恶性肿瘤和急性髓性白血病转化中的角色 靶向DUSP6 的治疗效果及其在患者衍生的异种移植模型中的作用 数字病理学 急性髓性白血病 单细胞RNA测序 PDX模型 基因表达数据 多名患者的骨髓干细胞和祖细胞
10722 2024-08-05
Mesenchymal cell replacement corrects thymic hypoplasia in murine models of 22q11.2 deletion syndrome
2022-11-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 该文章探讨了在22q11.2缺失综合症小鼠模型中,间充质细胞替代如何纠正胸腺发育不良的机制。 发现间充质细胞是造成22q11.2缺失综合症小鼠模型中胸腺发育不良的原因,并通过正常间充质细胞替代进行纠正。 没有提到该研究的具体局限性 研究22q11.2缺失综合症导致的胸腺发育不良的分子基础及其纠正方法。 使用22q11.2缺失综合症的小鼠模型作为研究对象。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 包括小鼠模型的胚胎胸腺
10723 2024-08-05
Controlled Cycling and Quiescence Enables Efficient HDR in Engraftment-Enriched Adult Hematopoietic Stem and Progenitor Cells
2020-09-01, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文研究了通过控制细胞周期和静止状态来提高成年造血干细胞和祖细胞中同源重组修复效率的方法 提出了一种控制循环和静止状态的策略,使得静息干细胞中HDR与NHEJ的比率增加了6倍 文章中未具体说明对所有类型细胞的影响,主要集中在特定亚群体 探讨并重新编程成年造血干细胞和祖细胞中的基因组编辑结果 成年造血干细胞和祖细胞的亚群体 数字病理学 NA 下一代测序、单细胞RNA测序 NA 细胞样本 NA
10724 2024-08-05
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Six Subpopulations Reflecting Distinct Cellular Fates in Senescent Mouse Embryonic Fibroblasts
2020, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了衰老小鼠胚胎成纤维细胞的六个亚群,揭示了不同的细胞命运。 本研究首次在衰老的小鼠胚胎成纤维细胞中识别出六个具有明显异质性的亚群,并发现HOXD8是新的衰老调控因子。 该研究主要基于小鼠模型,其结果可能不完全适用于其他物种或人类。 本研究旨在深入了解衰老小鼠胚胎成纤维细胞中的细胞异质性及其衰老机制。 研究对象为衰老小鼠胚胎成纤维细胞。 数字病理学 衰老相关疾病 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 多个衰老小鼠胚胎成纤维细胞
10725 2024-08-05
Reparative effects after low-dose radiation exposure: Inhibition of atherosclerosis by reducing NETs release
2024-Oct-15, The Science of the total environment
研究论文 该研究探讨了低剂量辐射如何通过减少 NETs 释放来抑制动脉粥样硬化。 首次探讨了低剂量辐射对心血管系统的影响及其抑制动脉粥样硬化的机制。 研究中未涉及不同剂量辐射的长期影响及其在临床中的应用。 研究低剂量辐射对动脉粥样硬化的影响机制。 研究对象为接受低剂量辐射和高脂饮食的动物模型。 数字病理学 心血管疾病 酶联免疫吸附测定法(ELISA) NA 组学数据 高脂饮食下的动物模型
10726 2024-08-04
Single-cell sequencing reveals LRRc17-mediated modulation of cardiac fibroblast ferroptosis in regulating myocardial fibrosis after myocardial infarction
2024-Sep, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究揭示了LRRc17在心脏成纤维细胞中介导铁死亡调节心肌梗死后心肌纤维化的作用 首次阐明了LRRc17在心肌梗死后心脏成纤维细胞铁死亡调节中的具体作用 本研究仅集中于特定基因LRRc17,可能忽视其他影响心肌纤维化的因子 探讨心肌梗死后心肌纤维化的发病机制,并寻找治疗靶点 心脏成纤维细胞(CFs),特别关注LRRc17对铁死亡的调节 数字病理学 心肌梗死 RNA测序,qRT-PCR,Western blotting,Masson染色,细胞活力测定(CCK-8) 体内外心肌梗死模型 基因表达数据 NA
10727 2024-08-05
Cellular and molecular landscape of primary dermatofibrosarcoma protuberans: Insights from single-cell RNA sequencing analysis
2024-Aug, Experimental dermatology IF:3.5Q1
研究论文 这项研究利用单细胞 RNA 测序分析了原发性皮肤纤维肉瘤的细胞和分子特征。 研究揭示了原发性皮肤纤维肉瘤的细胞异质性及其分子机制,并建议了潜在的治疗靶点。 研究可能受到样本数量和特定细胞类型的限制。 研究疾病皮肤纤维肉瘤的细胞和分子特征,以了解其生物学行为。 主要研究皮肤纤维肉瘤中的细胞群体及其相互作用。 数字病理学 皮肤癌 单细胞 RNA 测序 NA 基因表达数据 NA
10728 2024-08-05
MiR-425-5p suppression of Crebzf regulates oocyte aging via chromatin modification
2024-08, GeroScience IF:5.3Q1
研究论文 本研究探讨了miR-425-5p如何通过调节克雷布兹(Crebzf)来影响卵母细胞衰老 提出了miR-425-5p作为治疗女性不孕症的新潜力,并揭示了其通过调控组蛋白甲基转移酶mRNAs的机制 本文未提及具体的样本量和长期影响的研究 研究miR-425-5p在卵母细胞衰老中的作用及其潜在的治疗应用 聚焦于老年女性的卵母细胞及其衰老机制 NA 女性不孕 高通量测序和单细胞RNA测序 NA 生物样本 NA
10729 2024-08-05
The single-cell transcriptomic landscape of the topological differences in mammalian auditory receptors
2024-Jul-29, Science China. Life sciences
研究论文 研究揭示了哺乳动物听觉受体中单细胞转录组的拓扑差异 首次确定了内毛细胞和外毛细胞的独特分子特征,以及与音调相关的新基因 研究主要集中在小鼠模型中,可能不完全适用于人类 探索哺乳动物毛细胞的声音频率选择和其分子基础 哺乳动物内毛细胞和外毛细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 使用了不同位置的内外毛细胞样本
10730 2024-08-05
Detecting novel cell type in single-cell chromatin accessibility data via open-set domain adaptation
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文介绍了一种名为OVAAnno的自动细胞类型注释方法,能够在单细胞ATAC-seq数据中检测未知细胞类型 提出了利用开放集领域适应的技术来检测在训练集中不存在的未知细胞类型 未提及具体的局限性 研究如何在单细胞数据中进行细胞类型注释,尤其是检测未知类型 单细胞ATAC-seq和scRNA-seq数据中的细胞类型 计算机视觉 NA 开放集领域适应 NA 单细胞ATAC-seq和scRNA-seq数据 NA
10731 2024-08-05
CD106 in Tumor-Specific Exhausted CD8+ T Cells Mediates Immunosuppression by Inhibiting TCR Signaling
2024-Jul-02, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究发现CD106在肿瘤特异性耗尽的CD8+ T细胞中特别表达,并通过抑制TCR信号传导介导免疫抑制 揭示了CD106在肿瘤微环境中耗尽的CD8+ T细胞中的免疫抑制作用,并提出其作为癌症免疫治疗的潜在生物标志物和治疗靶点 NA 探讨CD106在肿瘤微环境中对CD8+ T细胞免疫抑制的作用机制 CD8+ T细胞及其在肿瘤微环境中的表达和功能 数字病理学 肿瘤 单细胞RNA测序 NA 临床样本 NA
10732 2024-08-05
Deafness DFNB128 Associated with a Recessive Variant of Human MAP3K1 Recapitulates Hearing Loss of Map3k1-Deficient Mice
2024-Jun-27, Genes IF:2.8Q2
研究论文 本研究描述了一种与人类MAP3K1隐性变体相关的耳聋DFNB128,以及其与耳聋小鼠模型的相似性 首次识别了与非综合征性耳聋相关的新型隐性变体,并显示了其在小鼠耳蜗的表达 仅在一个巴基斯坦家族中进行研究,样本量有限 探索与隐性耳聋相关的新变体以及其机制 巴基斯坦的一个亲属家族,其中有两个兄弟姐妹出现非综合征性耳聋 数字病理学 耳聋 微阵列和外显子测序 基因缺失小鼠模型 转录组数据 一个家族的多个成员,其中两名兄弟姐妹受到影响
10733 2024-08-04
LINC01002 functions as a ceRNA to regulate FRMD8 by sponging miR-4324 for the development of COVID-19
2024-05-11, Virology journal IF:4.0Q2
研究论文 本研究探讨了SARS-CoV-2 N蛋白通过调节LINC01002作为ceRNA的功能,以抑制IFN-β的诱导。 本研究首次揭示了LINC01002通过吸附miR-4324调节FRMD8,并指出其在SARS-CoV-2感染早期干预治疗中的潜力。 本研究的局限性在于仅使用了A549细胞线,未在其他细胞类型中验证结果。 研究SARS-CoV-2 N蛋白在免疫逃逸中的作用机制。 研究的对象为SARS-CoV-2结构蛋白及相关的免疫调节基因。 数字病理学 COVID-19 RNA-seq NA 基因表达数据 使用了A549细胞线及858个差异表达基因
10734 2024-08-05
Single-cell RNA sequencing reveals myeloid and T cell co-stimulation mediated by IL-7 anti-cancer immunotherapy
2024-May, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 该文章探讨了IL-7治疗如何通过激活T细胞和促炎性髓系细胞来诱导抗肿瘤免疫 发现IL-7受体在T细胞、巨噬细胞和树突状细胞上的多重表达,并证实IL-7治疗在小鼠模型中的有效性 在研究中未提供人类患者的临床数据以支持发现 研究IL-7抗癌免疫治疗对T细胞和免疫微环境的共同刺激作用 分析来自多种人类癌症和小鼠肿瘤移植模型的单细胞RNA测序数据 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 来自多个人类癌症的数据与一个小鼠肿瘤移植模型
10735 2024-08-05
Revealing Genetic Dynamics: scRNA-seq Unravels Modifications in Human PDL Cells across In Vivo and In Vitro Environments
2024-Apr-26, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析人类牙周韧带(PDL)细胞在体内和体外环境中的遗传变化 首次通过scRNA-seq揭示了PDL中不同细胞亚群的独特基因特征及其对培养条件的反应 未详细探讨不同捐献者之间的PDL细胞差异及其生物学影响 旨在填补对PDL病理生理学的理解空白 主要人类PDL样本,涉及7个捐献者 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因组数据 7个主要人类PDL样本
10736 2024-08-04
Spatial Transcriptomics Resolve an Emphysema-Specific Lymphoid Follicle B Cell Signature in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-01-01, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1
研究论文 这篇文章探讨了慢性阻塞性肺疾病中气肿特有的淋巴滤泡B细胞特征的转录组学。 本研究通过空间转录组学方法揭示了在气肿患者中B细胞活化的独特特征和转录网络 样本量相对较小,且仅限于特定患者群体 研究气肿对慢性阻塞性肺疾病患者淋巴滤泡中B细胞转录组特征的影响 研究对象为40名慢性阻塞性肺疾病患者和曾经吸烟者的肺部样本 数字病理学 慢性阻塞性肺疾病 空间转录组学 NA 肺部组织样本 40名患者的样本
10737 2024-08-05
Cancer-wide in silico analyses using differentially expressed genes demonstrate the functions and clinical relevance of JAG, DLL, and NOTCH
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本文通过分析差异表达基因揭示了JAG、DLL和NOTCH家族在癌症恶性进展中的功能和临床相关性 通过综合差异表达基因和生存分析,提出了JAG、DLL和NOTCH家族的未被探索的调控功能和协同效应 NA 阐明JAG、DLL和NOTCH家族的普遍功能及其与各种生物功能的联系 15种癌症的差异表达基因 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 15种癌症类型的临床数据
10738 2024-08-05
Multiomics Analysis of Disulfidptosis Patterns and Integrated Machine Learning to Predict Immunotherapy Response in Lung Adenocarcinoma
2024, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究探讨了二硫化物死亡对肺腺癌免疫微环境和免疫治疗的影响 本研究引入了一种基于二硫化物死亡基因的预测风险模型,能够有效预测肺腺癌患者的生存率和治疗结果 未提及具体局限性 研究二硫化物细胞死亡对肺腺癌患者免疫治疗反应的影响 聚焦于与二硫化物死亡相关的基因在肺腺癌中的作用 机器学习 肺癌 转录组学、机器学习算法 预测模型 基因表达数据 使用了来自TCGA数据库的肺腺癌多组学队列
10739 2024-08-05
Nicotinamide phosphoribosyltransferase prompts bleomycin-induced pulmonary fibrosis by driving macrophage M2 polarization in mice
2024, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 该研究探讨了烟酰胺磷酸核糖转移酶(NAMPT)在小鼠中的肺纤维化中驱动巨噬细胞M2极化的作用 研究首次揭示了NAMPT在肺纤维化发病机制中的作用,特别是在巨噬细胞M2极化中的创新机制 该研究主要基于小鼠模型,未能在临床试验中验证结果 研究NAMPT在特发性肺纤维化中的作用及其机制 研究对象为肺纤维化患者的临床样本及小鼠模型 数字病理学 特发性肺纤维化 RNA测序、Western blot、qRT-PCR、ELISA和免疫组化染色 小鼠模型 临床样本和小鼠肺纤维化模型数据 临床样本和小鼠模型,具体样本数量未说明
10740 2024-08-04
Epicardioid single-cell genomics uncovers principles of human epicardium biology in heart development and disease
2023-Dec, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 这篇论文探讨了人类心包生物学在心脏发育和疾病中的原则 该研究首次生成了具有自我组织能力的人类多能干细胞衍生的心包内体,揭示了心包和心肌的形态、分子和功能模式 该研究未明确提及限制因素 了解心包在心脏发育和疾病过程中的功能及其机制 研究对象为人类胚胎发育中心包细胞系和心肌细胞类型 数字病理学 先天性疾病 单细胞转录组学 自我组织体 NA NA
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