单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27897 篇文献，本页显示第 10701 - 10720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10701 | 2024-08-05 |
Recessively Inherited Deficiency of Secreted WFDC2 (HE4) Causes Nasal Polyposis and Bronchiectasis
2024-07-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202308-1370OC
PMID:38626355
|
研究论文 | 本研究识别了一种与鼻息肉和支气管扩张症相关的隐性遗传缺陷。 | 该研究首次确认了WAP四硫化物核心结构域2导致支气管扩张症的分子病因。 | 研究样本量较小，仅研究了来自10个家庭的11个个体。 | 识别与严重鼻窦炎、鼻息肉和肺部感染相关的支气管扩张症中的新型基因缺陷。 | 分析来自美国、欧洲、亚洲和非洲的多个独立家庭的个体。 | 数字病理学 | 支气管扩张症 | 下一代测序、定量PCR、单细胞RNA测序 | NA | 基因组DNA、RNA、血清样本 | 11个个体，来自10个独立家庭 |
| 10702 | 2024-08-05 |
CD34+ synovial fibroblasts exhibit high osteogenic potential in synovial chondromatosis
2024-Jul, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-024-03892-9
PMID:38602543
|
研究论文 | 本研究旨在识别在滑膜软骨症中异常分化的祖细胞和可能的致病信号通路 | 识别了滑膜软骨症中CD34+滑膜成纤维细胞的高骨生成潜力及其相关信号通路 | 研究的样本来源于关节置换手术，可能存在样本选择偏差 | 识别滑膜软骨症中的异常分化祖细胞及相关的信号通路 | 来自滑膜软骨症患者的滑膜样本和组织细胞 | 数字病理学 | 滑膜软骨症 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 滑膜软骨症患者的样本和来自骨关节炎的对照样本 |
| 10703 | 2024-08-04 |
Glioma hexokinase 3 positively correlates with malignancy and macrophage infiltration
2024-Jun, Metabolic brain disease
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11011-023-01333-0
PMID:38687460
|
研究论文 | 这项研究全面评估了HK3在胶质瘤中的表达分布和免疫学效应 | 首次系统研究HK3与胶质瘤肿瘤微环境特征的关系 | 研究主要基于公共数据库，可能存在数据的不完整性和偏倚 | 探讨HK3在胶质瘤中的作用及其与肿瘤微环境的关系 | 胶质瘤患者样本和癌症相关公共数据集 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 免疫组化技术、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自GTEx、CCLE、TCGA和CGGA的数据集 |
| 10704 | 2024-08-05 |
Impact of tumour stroma-immune interactions on survival prognosis and response to neoadjuvant chemotherapy in bladder cancer
2024-Jun, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105152
PMID:38728838
|
研究论文 | 本研究探讨了肿瘤基质与免疫相互作用对膀胱癌存活预后和新辅助化疗反应的影响 | 开发了一种基于影像组学特征的肿瘤基质预测模型，用于非侵入性评估膀胱癌患者的肿瘤基质比例 | 研究为回顾性分析，可能受制于已有数据的局限性 | 研究肿瘤基质与免疫相互作用对膀胱癌患者临床结果的影响 | 830名膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序、免疫组化、单细胞RNA测序、影像组学 | NA | 临床数据 | 830 |
| 10705 | 2024-08-05 |
Rejuvenation of peripheral immune cells attenuates Alzheimer's disease-like pathologies and behavioral deficits in a mouse model
2024-May-31, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl1123
PMID:38809977
|
研究论文 | 本研究探讨了免疫复兴作为阿尔茨海默病治疗策略的潜力 | 该研究首次通过年轻骨髓移植恢复了老年小鼠血液免疫细胞中与衰老和AD相关基因的表达 | 研究仅在小鼠模型中进行，未在临床试验中验证其有效性 | 研究免疫复兴在阿尔茨海默病治疗中的应用 | 老年小鼠的免疫系统及其在阿尔茨海默病中的作用 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 老年小鼠 |
| 10706 | 2024-08-04 |
Spot-Based Global Registration for Subpixel Stitching of Single-Molecule Resolution Images for Tissue-Scale Spatial Transcriptomics
2024-04-30, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.3c05686
PMID:38621224
|
研究论文 | 该文章提出了一种名为基于点的全球配准(SBGR)的新策略，用于高分辨率图像的对齐。 | 提出的SBGR方法通过关注识别的分子点而非原始图像，实现了超像素精度的图像拼接，并克服了现有图像拼接方法的局限。 | 该方法在背景信号异质性和分子标记信号微弱的情况下仍需提高适应性。 | 研究旨在开发一种新方法，以提高单分子分辨率图像在组织尺度空间转录组学中的拼接精度。 | 研究对象为组织尺度的单分子分辨率图像。 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 图像 | NA |
| 10707 | 2024-08-05 |
ScRNA-seq reveals novel immune-suppressive T cells and investigates CMV-TCR-T cells cytotoxicity against GBM
2024-Apr-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-008967
PMID:38688579
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了新的免疫抑制T细胞，并研究了CMV-TCR-T细胞对胶质母细胞瘤的细胞毒性 | 首次识别了在CMV感染下的胶质母细胞瘤中的新型免疫细胞亚群，特别是FXYD6+ T细胞作为免疫抑制T细胞 | CMV感染对GBM免疫微环境的具体影响机制尚不完全明确，工程化TCR-T细胞的长期效果尚需进一步研究 | 研究CMV感染对胶质母细胞瘤免疫微环境的影响以及CMV-TCR-T细胞的治疗潜力 | CMV感染的胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 涉及CMV感染的胶质母细胞瘤患者的多种样本 |
| 10708 | 2024-08-04 |
Pten regulates endocytic trafficking of cell adhesion and Wnt signaling molecules to pattern the retina
2024-Apr-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114005
PMID:38551961
|
研究论文 | 本研究展示了磷酸酶和张力同源物（Pten）如何通过调节细胞粘附分子和Wnt蛋白的囊泡运输来控制视网膜星爆细胞的间距 | 揭示了Pten在星爆细胞模式形成中的作用，以及与Down综合征细胞粘附分子Dscam的协同效应 | 对具体机制的深入探讨和长时间的观察尚待进一步研究 | 探讨Pten如何通过调节内吞运输模式来决定视网膜星爆细胞的排列 | 主要研究视网膜星爆细胞及其相关的细胞粘附和信号传导分子 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 分子标志物和囊泡蛋白组 | NA |
| 10709 | 2024-08-05 |
Well-Paired-Seq2: High-Throughput and High-Sensitivity Strategy for Characterizing Low RNA-Content Cell/Nucleus Transcriptomes
2024-04-23, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.3c05785
PMID:38597061
|
研究论文 | 本文介绍了一种新型的高通量高灵敏度策略Well-Paired-Seq2，用于表征低RNA含量细胞/细胞核的转录组 | 该研究创新地利用尺寸排斥和准静态流体动力学实现高效细胞捕获，并显著提高了转录组的检测灵敏度 | 未提及具体的样本类型和数量限制 | 研究旨在解决低RNA含量细胞的转录组分析中的灵敏度和通量问题 | 研究对象为低RNA含量的单细胞及细胞核转录组 | 数字病理学 | 肾透明细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 无具体样本数量，提到的分析样本包括冷冻临床样本 |
| 10710 | 2024-08-04 |
Multi-Omics Pan-Cancer Analysis of Procollagen N-Propeptidase Gene Family of ADAMTS as Novel Biomarkers to Associate with Prognosis, Tumor Immune Microenvironment, Signaling Pathways, and Drug Sensitivities
2024-Apr-12, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2904151
PMID:38682182
|
研究论文 | 本研究旨在进行ADAMTS的procollagen N-propeptidase亚组的全癌症分析 | 首次揭示了PNPSA成员在肿瘤免疫微环境和预后中的双重角色，及其在不同癌症中的潜在生物标志物和治疗靶点 | 本研究主要依赖于公开数据库，可能存在数据的不一致性和局限性 | 探讨PNPSA在全癌症中的表达、基因组变异及其与肿瘤进展的关系 | ADAMTS家族的procollagen N-propeptidase亚组的成员 | 数字病理学 | 肿瘤 | 多组学分析 | NA | 基因组数据 | 基于多个集成的开放数据库进行分析，样本数未特定说明 |
| 10711 | 2024-08-04 |
CD301 and LSECtin glycan-binding receptors of innate immune cells serve as prognostic markers and potential predictors of immune response in breast cancer subtypes
2024-04-01, Glycobiology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/glycob/cwae003
PMID:38206856
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研究论文 | 这篇文章探讨了糖基化在乳腺癌不同亚型中的作用，并确认CD301和LSECtin作为预后标志物和免疫反应的潜在预测因子 | 本研究首次系统性地确定了改变的糖基化在乳腺癌中的相关性，并识别了特定的糖结合受体作为预后指标 | 研究仅基于特定的样本群体，可能无法广泛适用所有乳腺癌患者 | 研究旨在探索糖基化改变在乳腺癌中的预后作用 | 研究对象为一大批不同组织病理类型的侵袭性乳腺癌样本（n = 1859） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 重组C型糖结合受体 | 无 | 组织微数组 | 1859个侵袭性乳腺癌样本 |
| 10712 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals periodontal ligament fibroblast heterogeneity with distinct IL-1β and RANKL expression in periodontitis
2024-Apr, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mocell.2024.100059
PMID:38554844
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研究论文 | 这项研究揭示了牙周韧带成纤维细胞在牙周炎中的异质性，并探讨了IL-1β和RANKL的不同表达。 | 首次揭示了牙周韧带成纤维细胞的异质性，并确定了与骨吸收相关的不同细胞亚群。 | 研究中仅使用了人类牙周炎患者的单细胞RNA测序数据，未涉及其他类型的样本或疾病模型。 | 研究牙周韧带成纤维细胞在牙周炎中的功能和异质性。 | 人类牙周炎患者的牙周韧带成纤维细胞亚群。 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 来自人类牙周炎患者的多个单细胞样本数据 |
| 10713 | 2024-08-04 |
Landscape of Epstein-Barr virus gene expression and perturbations in cancer
2024-Feb-02, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3911441/v1
PMID:38352479
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研究论文 | 该文章研究了EB病毒在癌症中的基因表达及其扰动 | 首次识别出RPMS1非编码RNA通过干扰素反应的破坏支持癌细胞特性 | 研究中未详细探讨癌细胞和健康细胞的具体环境交互 | 探索EB病毒在癌症中的基因表达及其对癌细胞特性的影响 | 研究与EB病毒相关的肿瘤及其细胞特性 | 数字病理学 | NA | 长读长单分子测序 | NA | 转录组数据 | 通过单细胞测序分离了来自同一组织活检的癌细胞和健康细胞 |
| 10714 | 2024-08-04 |
Integrated analyses of single-cell transcriptome and Mendelian randomization reveal the protective role of FCRL3 in multiple sclerosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1428962
PMID:39076991
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和孟德尔随机化分析，发现FCRL3在多发性硬化中的保护作用 | 创新点在于整合了单细胞转录组和孟德尔随机化分析来寻找MS的新治疗靶点 | 本文未提及具体的实验验证或临床试验数据 | 发现多发性硬化的新治疗靶点 | 对FCRL3在多发性硬化中的作用进行分析 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序，孟德尔随机化 | NA | 基因组数据，单细胞转录组数据 | 收集了1123个在七种外周细胞类型中观察到的表达变化 |
| 10715 | 2024-08-04 |
Methazolamide Can Treat Atherosclerosis by Increasing Immunosuppressive Cells and Decreasing Expressions of Genes Related to Proinflammation, Calcification, and Tissue Remodeling
2024, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2024/5009637
PMID:39081633
|
研究论文 | 本研究探讨了美唑胺通过增加免疫抑制细胞和减少与炎症、钙化及组织重塑相关基因表达来治疗动脉粥样硬化的机制 | 首次将美唑胺的治疗机制与动脉粥样硬化发病机制结合起来，揭示了其在免疫调节方面的作用 | 研究主要基于小鼠模型，临床相关性尚待进一步验证 | 探讨美唑胺在动脉粥样硬化治疗中的作用及其机制 | 使用ApoE-/-小鼠建立的动脉粥样硬化动物模型 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 单细胞测序 | NA | 生物样本数据 | ApoE-/-小鼠，数量未具体提及 |
| 10716 | 2024-08-04 |
Elucidating the multifaceted role of MGAT1 in hepatocellular carcinoma: integrative single-cell and spatial transcriptomics reveal novel therapeutic insights
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1442722
PMID:39081317
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研究论文 | 本研究探讨了糖基转移酶相关基因在肝细胞癌中的作用，提供了新的免疫治疗见解 | 利用单细胞和空间转录组学结合的技术揭示了MGAT1作为潜在免疫治疗靶点的创新潜力 | 未提供特定的研究限制信息 | 探讨糖基转移酶基因在肝细胞癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响 | 肝细胞癌中不同细胞亚群及其糖基转移酶基因的活性 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学和空间转录组学 | NA | RNA-seq | 未提供特定样本数量信息 |
| 10717 | 2024-08-05 |
SIGLEC15, negatively correlated with PD-L1 in HCC, could induce CD8+ T cell apoptosis to promote immune evasion
2024, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2024.2376264
PMID:38988824
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研究论文 | 本研究探讨了SIGLEC15在肝细胞癌中的功能角色及其对免疫逃逸的影响 | 发现SIGLEC15在肝细胞癌组织中增加，并与PD-L1呈负相关，以促进免疫逃逸 | 未能直接影响肿瘤增殖的机制尚不完全清楚 | 阐明SIGLEC15在肝细胞癌中的作用及其如何促进免疫逃逸 | 主要研究肝细胞癌中的SIGLEC15表达及其对CD8+ T细胞的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | PCR分析、免疫组化、流式细胞术、RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本、RNA序列数据 | 使用了HCC样本和小鼠模型的多种细胞系及单细胞样本 |
| 10718 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies downregulated phosphodiesterase 8B as a novel oncogene in IDH-mutant glioma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1427200
PMID:38989284
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，识别下调的磷酸二酯酶8B为IDH突变胶质瘤中的新型癌基因 | 本研究首次阐明磷酸二酯酶8B在高等级胶质瘤中的独特表达模式，并揭示其作为代谢相关癌基因的双重角色 | 研究主要集中在胶质瘤的代谢通路和基因表达，未深入分析其他可能影响结果的因素 | 本研究旨在揭示不同等级胶质瘤的细胞和代谢特征 | 研究对象是高等级（胶质母细胞瘤，WHO IV级）和低等级（少突胶质瘤，WHO II级）胶质瘤 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 包括多个胶质瘤细胞类型的样本，具体样本量未提供 |
| 10719 | 2024-08-04 |
PGF2α signaling drives fibrotic remodeling and fibroblast population dynamics in mice
2023-Dec-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172977
PMID:37934604
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研究论文 | 本研究探讨了PGF2α信号传导在小鼠中驱动纤维化重塑和成纤维细胞群体动态的作用 | 本研究机制性地识别了在特发性肺纤维化中一个易感的成纤维细胞亚群，并确认了PGF2α信号转导在该病中的作用 | 未明确提及具体的临床实验数据或人类样本验证 | 探讨PGF2α及其受体在特发性肺纤维化发病机制中的作用 | 使用带有呼吸表面活性蛋白C基因突变的小鼠模型 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 使用了多个IER-SftpcI73T小鼠样本及其交叉品系的对照组 |
| 10720 | 2024-08-04 |
A Universal Method for Crossing Molecular and Atlas Modalities using Simplex-Based Image Varifolds and Quadratic Programming
2023-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.28.534622
PMID:37034802
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研究论文 | 本文阐明了一种在分子尺度转录组学和组织尺度图谱之间建立对应关系的解决方案 | 提出了一种通用算法，通过交替优化LDDMM和二次规划方法，解决坐标和潜在转录特征分数的最小化几何形状的变换 | NA | 研究目的在于结合分子和细胞数据，创建一个统一的坐标系统 | 主要涉及分子尺度转录组学数据和组织尺度图谱数据 | 数字病理学 | NA | LDDMM优化与二次规划 | NA | 转录组学数据 | NA |