单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 10701 - 10720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10701 | 2024-08-05 |
Immunological and microbial shifts in the aging rhesus macaque lung during nontuberculous mycobacterial infection
2024-Jun-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00829-24
PMID:38771046
|
研究论文 | 本研究比较了年轻和老年猕猴在非结核分枝杆菌感染中的免疫和微生物变化 | 本研究揭示了老年猕猴对非结核分枝杆菌感染的免疫反应增强，提供了对人类年龄相关疾病机制的新见解 | 缺乏对非人灵长类动物的更大样本量的研究，可能限制了结果的广泛适用性 | 探究老年猕猴在非结核分枝杆菌感染过程中免疫和微生物的变化 | 研究对象为三只年轻和两只老年的猕猴 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 微生物组数据，免疫细胞反应数据 | 五只猕猴（两只年轻雌性，一只年轻雄性，两个老年雌性） |
| 10702 | 2024-08-05 |
Phenotypic and transcriptional changes in peripheral blood mononuclear cells during alphavirus encephalitis in mice
2024-Jun-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00736-24
PMID:38695564
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研究论文 | 本研究利用小鼠Sindbis病毒感染模型探讨外周血单核细胞在病毒脑炎中的表型和转录组变化 | 首次将单细胞RNA测序与流式细胞术结合，系统分析了小鼠外周血单核细胞的转录和表型变化 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 研究SINV感染对小鼠外周血单核细胞的影响，以理解病毒脑炎的免疫机制 | SINV感染的小鼠，特别是其外周血单核细胞及中枢神经系统内的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | NA |
| 10703 | 2024-08-05 |
Spatial genomic, biochemical and cellular mechanisms underlying meningioma heterogeneity and evolution
2024-Jun, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01747-1
PMID:38760638
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研究论文 | 研究了影响脑膜瘤内部异质性及其演化的空间基因组、 Biochemical 和细胞机制 | 通过空间方法揭示出驱动高等级脑膜瘤内部异质性的基因和蛋白表达程序 | 对驱动内部异质性的可针对机制理解不足 | 揭示脑膜瘤内部异质性与其分子、时间和空间演化之间的联系 | 高等级脑膜瘤和其复发样本 | 数字病理 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序，CRISPR干扰 | NA | 空间转录组 | 配对的原发和复发脑膜瘤样本 |
| 10704 | 2024-08-05 |
Comparative single cell analysis reveals complex patterns of cell type and cell signaling innovations at the fetal-maternal interface
2024-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.01.591945
PMID:38746137
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研究论文 | 本研究揭示了胎盘-母体接口处细胞类型和信号传导创新的复杂模式 | 发现了新型的绒毛膜和决定位细胞类型，并重建了细胞间信号网络 | 研究中未提及样本的具体数量和选择标准 | 探索哺乳动物胎盘-母体接口的细胞类型和信号传导动态 | 对树袋熊、马达加斯加普通刺猬和小鼠等不同哺乳动物胎盘-母体接口的单细胞RNA测序进行分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 10705 | 2024-08-05 |
Deciphering maternal-fetal cross-talk in the human placenta during parturition using single-cell RNA sequencing
2024-Jan-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adh8335
PMID:38198568
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序解密了人类胎盘在分娩期间的母胎相互作用 | 首次建立了人类胎盘的单细胞图谱，并阐明了分娩期间母胎细胞类型和转录活性的变化 | 尚未完全揭示分娩过程中母胎交互作用的细胞贡献和通讯机制 | 研究人类分娩过程中母胎之间的信号传递 | 人类胎盘中的母体和胎儿细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 10706 | 2024-08-04 |
The CEBPB+ glioblastoma subcluster specifically drives the formation of M2 tumor-associated macrophages to promote malignancy growth
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.93473
PMID:38994023
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研究论文 | 本研究探讨了GBM微环境中CEBPB+亚群体与M2肿瘤相关巨噬细胞之间的相互作用。 | 本研究首次揭示了GBM亚群体6与M2型肿瘤相关巨噬细胞之间的显著相关性和CEBPB转录网络的特定调节作用。 | 本研究的局限性在于未能详细探讨其他亚群体与肿瘤相关巨噬细胞之间的相互作用。 | 阐明不同GBM细胞亚群体和非肿瘤细胞之间的相互作用机制。 | 研究对象为GBM中的亚群体6及其与M2型肿瘤相关巨噬细胞的相互作用。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 10707 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing and multiple machine learning algorithms to identify key T-cell differentiation gene for progression of NAFLD cirrhosis to hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1301099
PMID:38993839
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研究论文 | 该文章探讨了T细胞分化基因在NAFLD肝硬化进展为肝细胞癌中的关键作用 | 通过单细胞测序和多种机器学习算法，系统地识别出五种不同的T细胞分化状态，并确定LDHA为核心基因 | 目前的研究主要集中于HCC的发生，而精确的免疫发病机制仍然不明确 | 研究NAFLD肝硬化向肝细胞癌进展过程中T细胞的分化及其相关基因 | 采用来自两种NAFLD肝硬化样本和五个健康样本的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序 | 机器学习算法 | 转录组数据 | 2个NAFLD肝硬化样本和5个健康样本 |
| 10708 | 2024-08-04 |
Mitophagy and clear cell renal cell carcinoma: insights from single-cell and spatial transcriptomics analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1400431
PMID:38994370
|
研究论文 | 本研究探讨了线粒体自噬在透明细胞肾癌中的变化及其对肿瘤微环境的影响 | 揭示了UBB基因及其相关的泛素化过程在透明细胞肾癌发展中的重要性 | NA | 深入研究透明细胞肾癌中线粒体自噬活性变化及其对肿瘤代谢和发展策略的影响 | 透明细胞肾癌肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序和空间转录组学 | NA | 组织样本 | 多个透明细胞肾癌肿瘤组织样本 |
| 10709 | 2024-08-05 |
A High Immune-Related Index with the Suppression of cGAS-STING Pathway is a Key Determinant to Herceptin Resistance in HER2+ Breast Cancer
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.94868
PMID:38993569
|
研究论文 | 本研究探讨了免疫相关指标与HER2+乳腺癌Herceptin耐药性之间的关系 | 提出了一种可信的免疫相关预后指标，该指标考虑了免疫渗透，与Herceptin耐药的乳腺癌有重要关联 | 缺乏理想的预后模型全面考虑免疫渗透 | 研究HER2+乳腺癌中的免疫微环境及其对Herceptin耐药性的影响 | 与HER2+乳腺癌相关的细胞系和样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | Cox回归、XGBoost和Lasso算法 | 基因表达数据 | 85例HER2+乳腺癌样本 |
| 10710 | 2024-08-05 |
Lymphoid tissues contribute to plasma viral clonotypes early after antiretroviral therapy interruption in SIV-infected rhesus macaques
2023-12-13, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adi9867
PMID:38091409
|
研究论文 | 该研究探讨了淋巴组织在抗逆转录病毒治疗中断后早期对血浆病毒克隆类型的贡献 | 此研究首次揭示了淋巴组织在抗逆转录病毒治疗中断后，如何作为病毒来源对血浆病毒克隆类型的影响 | 样本量较小，仅有七只动物被研究，可能限制了结果的普遍性 | 更好地理解在抗逆转录病毒治疗中断后，病毒弹回的细胞和组织来源 | 研究对象为被感染的恒河猕猴 | 数字病理学 | HIV感染 | 病毒条形码测序、完整前病毒DNA测定、单细胞RNA测序、CODEX与RNAscope原位杂交 | NA | 组织和血液样本 | 七只恒河猕猴 |
| 10711 | 2024-08-05 |
Tppp3+ synovial/tendon sheath progenitor cells contribute to heterotopic bone after trauma
2023-Jul-21, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-023-00272-x
PMID:37479686
|
研究论文 | 这篇文章研究了滑膜/腱鞘祖细胞在创伤后异位骨形成中的作用 | 首次揭示了Tppp3+祖细胞在创伤后异位骨形成中的异常成骨分化 | 目前尚未完全理解特定细胞表型和驱动机制的复杂性 | 探讨滑膜/腱鞘祖细胞对异位骨形成的贡献及其机制 | 使用Tppp3诱导报告小鼠等模型研究滑膜/腱鞘祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | 使用了Tppp3报告小鼠及其他相关小鼠模型 |
| 10712 | 2024-08-05 |
Automated time-lapse data segmentation reveals in vivo cell state dynamics
2023-06-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf1814
PMID:37267354
|
研究论文 | 本文探讨了胚胎发育中的细胞状态动态和群体细胞行为。 | 创新点在于结合单细胞RNA测序数据和活体时间推移细胞追踪数据，定量映射细胞状态到胚胎上，并分析了细胞运动状态的时间平均模式。 | 限制在于个体胚胎的瞬时偏差可能影响整体细胞运动的对称性，未深入探讨这些偏差的具体影响。 | 研究胚胎发育过程中的细胞状态转变及其叠加效应。 | 以斑马鱼尾芽为研究对象，通过分析细胞基因表达和运动状态。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 时间推移数据 | 多个斑马鱼胚胎 |
| 10713 | 2024-08-05 |
Robust segregation of donor and recipient cells from single-cell RNA-sequencing of transplant samples
2023, Frontiers in transplantation
DOI:10.3389/frtra.2023.1161146
PMID:38993922
|
研究论文 | 本文提出了一种新方法，通过单细胞RNA测序准确区分供体和受体细胞。 | 创新性地开发了一种新的两阶段基因型发现方法，对移植样本具有较强的鲁棒性，能够在更低的基因型比例下更准确地区分供体和受体细胞。 | 尚未提及文章的具体限制 | 旨在开发用于移植生物学背景下的单细胞RNA测序的生物信息学工具。 | 研究对象为移植样本中的单细胞，包括供体和受体细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 包括虚拟数据及实际的器官移植的单细胞RNA测序数据 |
| 10714 | 2024-08-05 |
A multicenter study benchmarking single-cell RNA sequencing technologies using reference samples
2021-09, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00748-9
PMID:33349700
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研究论文 | 本文比较了不同技术和实验室生成的单细胞RNA测序数据集 | 提出了在选择算法以实现准确生物解释方面的指导 | 尽管结果具有较高的可重复性，但可能在不同平台的算法选择上仍存在挑战 | 旨在优化单细胞RNA测序研究中的平台和软件选择 | 使用乳腺癌细胞和B细胞作为参考样本进行比较 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个来源的细胞样本，包括乳腺癌细胞和B细胞 |
| 10715 | 2024-08-05 |
Gene Deconvolution Reveals Aberrant Liver Regeneration and Immune Cell Infiltration in Alcohol-Associated Hepatitis
2021-08, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.31759
PMID:33619773
|
研究论文 | 本文通过基因解卷积揭示了与酒精相关性肝炎中异常的肝脏再生和免疫细胞浸润 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了慢性肝病中细胞组成的显著变化，尤其是在严重急性肝炎患者中 | 样本数量有限，可能影响结果的广泛性和适用性 | 探讨慢性肝病中肝细胞再生和免疫细胞浸润的差异性贡献 | 健康肝脏和慢性肝病患者的肝细胞及免疫细胞 | 数字病理学 | 酒精相关性肝炎 | RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 有限数量的慢性肝病患者样本 |
| 10716 | 2024-08-05 |
Functionally Diverse Inflammatory Responses in Peripheral and Liver Monocytes in Alcohol-Associated Hepatitis
2020-Oct, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/hep4.1563
PMID:33024916
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研究论文 | 本研究探讨了酒精相关肝炎中外周和肝脏单核细胞的功能多样性炎症反应 | 揭示了在酒精相关肝炎中不同单核细胞亚群对炎症反应的不同表达特征 | 研究可能未考虑其他慢性肝病与酒精相关肝炎的比较 | 研究酒精相关肝炎中单核细胞的炎症反应机制 | 酒精相关肝炎患者和健康对照的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 酒精相关肝炎患者和健康对照的外周血单核细胞 |
| 10717 | 2024-08-05 |
Lineage Tracing: Computational Reconstruction Goes Beyond the Limit of Imaging
2019-Feb-28, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2019.0006
PMID:30764600
|
综述 | 本文介绍了计算生物学方法与传统谱系追踪的结合，以克服成像方法的局限性 | 提出了单细胞RNA测序谱系分析、DNA条形码或遗传伤痕分析等新颖的计算方法 | 成像基础的谱系追踪方法在可扩展性和缺乏分子信息方面存在限制 | 探讨细胞谱系追踪在生物过程研究中的应用 | 细胞及其后代的命运追踪 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序, DNA条形码 | NA | RNA序列数据 | 涉及多种细胞类型 |
| 10718 | 2024-08-05 |
CellFishing.jl: an ultrafast and scalable cell search method for single-cell RNA sequencing
2019-02-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1639-x
PMID:30744683
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研究论文 | 本文提出了一种用于单细胞RNA测序的新方法CellFishing.jl，用于搜索相似细胞和检测重要基因 | CellFishing.jl提供了一种高精度和高通量的细胞搜索方法，且速度明显快于现有最先进的软件 | NA | 提升单细胞RNA测序数据中细胞搜索的效率和精度 | 多个单细胞RNA测序数据集中的细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | NA | 超过一百万个细胞 |
| 10719 | 2024-08-05 |
IRIS-EDA: An integrated RNA-Seq interpretation system for gene expression data analysis
2019-02, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1006792
PMID:30763315
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研究论文 | 本文介绍了一种名为IRIS-EDA的RNA-Seq数据分析集成工具，旨在简化基因表达数据的分析和解释。 | IRIS-EDA首次提供了根据FAIR数据原则加速提交数据和结果到NCBI的基因表达数据库的框架。 | NA | 开发一个用户友好的平台，以进行RNA-Seq和单细胞RNA-Seq数据的计算分析。 | RNA-Seq和单细胞RNA-Seq数据的基因表达分析。 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 10720 | 2024-08-05 |
Dermal Condensate Niche Fate Specification Occurs Prior to Formation and Is Placode Progenitor Dependent
2019-01-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2018.11.034
PMID:30595537
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研究论文 | 本文揭示了皮肤凝聚物前体的命运规范在形成之前发生，并且依赖于皮肤板的前体 | 研究确定了皮肤凝聚物的未聚集前体及其分子时序，为皮肤发育提供了新的见解 | 对细胞命运转变具体时序的理解仍然不够全面，可能需要进一步研究y | 研究皮肤凝聚物前体的命运规范及其发育轨迹 | 本文研究了皮肤凝聚物前体及其在发育过程中的角色 | 数字病理学 | NA | 3D和4D显微镜观察，单细胞转录组学 | NA | NA | NA |