单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27897 篇文献，本页显示第 10681 - 10700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10681 | 2024-08-05 |
An optimized protocol for retina single-cell RNA sequencing
2020, Molecular vision
IF:1.8Q3
PMID:33088174
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研究论文 | 本研究提出了一种优化的视网膜单细胞RNA测序的协议 | 提出了一种温和的视网膜解离方法，最大限度减少细胞死亡并保存细胞形态，同时改进计算管道以提高单细胞RNA测序数据的质量 | 对新鲜与冷冻视网膜在制备细胞或细胞核悬浮液方面的优缺点进行了演示 | 优化视网膜样本的单细胞RNA测序流程，获得更高质量的转录组数据 | 小鼠视网膜样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA | 小鼠视网膜样本的数量未明确说明 |
| 10682 | 2024-08-07 |
Interleukin-36γ-producing macrophages drive IL-17-mediated fibrosis
2019-10-11, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aax4783
PMID:31604843
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了生物材料植入后巨噬细胞亚群的功能和表型特征，特别是在尿膀胱基质（UBM）和聚己内酯（PCL）植入后的不同组织反应。 | 本研究首次识别并表征了在体内生物材料诱导的特定巨噬细胞亚群，这些亚群在不同的组织环境中表现出独特的功能和表型特征。 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来研究需要进一步验证这些发现是否适用于人类。 | 旨在识别和表征生物材料植入后巨噬细胞的功能亚群，并探讨其在组织修复和病理过程中的作用。 | 研究对象包括生物材料植入后的巨噬细胞亚群及其在不同组织环境中的功能和表型特征。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 研究涉及从小鼠尿膀胱基质（UBM）和聚己内酯（PCL）中分离的巨噬细胞样本。 |
| 10683 | 2024-08-05 |
Unveiling major histocompatibility complex-mediated pan-cancer immune features by integrated single-cell and bulk RNA sequencing
2024-Aug-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217062
PMID:38878852
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和大规模RNA测序揭示了主要组织相容性复合体介导的全癌症免疫特征 | 开发了MHC转录特征(MHC.sig)，并展示其作为普遍性的全癌症抗肿瘤免疫标记的潜力 | 未提及潜在的局限性 | 全面探索主要组织相容性复合体在癌症免疫疗法中的作用 | 分析了663,760个细胞的单细胞RNA测序数据以及30种实体肿瘤类型 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，Bulk RNA-seq，空间转录组分析 | NA | RNA测序数据 | 663,760个细胞和30种实体肿瘤类型 |
| 10684 | 2024-08-07 |
Corrigendum to "scRNA-Seq and imaging mass cytometry analyses unveil iNKT cells-mediated anti-tumor immunity in pancreatic cancer liver metastasis" [Cancer Lett. (2023 May 1) 561 216149]
2024-Aug-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217071
PMID:38971695
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10685 | 2024-08-04 |
Blockade of Discoidin Domain Receptor Signaling with Sitravatinib Reveals DDR2 as a Mediator of Neuroblastoma Pathogenesis and Metastasis
2024-Aug-01, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-23-0741
PMID:38670553
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研究论文 | 本研究揭示了DDR2作为神经母细胞瘤发病机制和转移的介导者。 | 此文首次定义了DDR2在神经母细胞瘤中的新功能，以及sitravatinib作为其治疗剂的潜力。 | 研究仅在特定的肿瘤模型中进行，可能无法全面反映在临床中的效果。 | 研究sitravatinib对神经母细胞瘤的影响及其作用机制。 | 主要研究对象为神经母细胞瘤及其相关的受体酪氨酸激酶。 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | NA | 肿瘤模型 | 单细胞测序数据 | 使用了不同的肿瘤相关模型，包括转基因小鼠和人类异种移植 |
| 10686 | 2024-08-04 |
Spatial enrichment and genomic analyses reveal the link of NOMO1 with amyotrophic lateral sclerosis
2024-Aug-01, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae123
PMID:38643019
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研究论文 | 本研究揭示了NOMO1与运动神经元疾病（ALS）之间的关联 | 使用Entropy加权的差异基因表达矩阵工具SpatialE，首次在运动皮层中识别ALS相关基因的空间富集 | 本研究主要依赖于有限的样本量及特定脑区的分析，未能全面涵盖所有与ALS相关的区域 | 旨在研究运动皮层中ALS相关基因的空间分布和与ALS风险的关系 | 本研究分析了6814名ALS患者和3324名对照的基因组数据 | 数字病理学 | 运动神经元疾病 | 全基因组测序和空间转录组学 | NA | 基因组数据和转录组数据 | 6814名ALS患者和3324名对照 |
| 10687 | 2024-08-05 |
Synovial 5-Lipoxygenase-Derived Oxylipins Define a Lympho-Myeloid-Enriched Synovium
2024-Aug, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42848
PMID:38508862
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研究论文 | 本研究探讨了合成的氧脂类在炎症关节中的作用及其与血浆中的氧脂类的关系 | 本研究首次揭示了滑膜5-脂氧合酶衍生的氧脂类在淋巴-骨髓丰富的滑膜中的高表达 | 研究样本数量较小，可能影响结果的广泛适用性 | 确定滑膜氧脂类在炎症关节与血浆氧脂类及滑膜组织学模式的相关性 | 确诊的类风湿关节炎或银屑病关节炎患者的滑膜组织和血浆样本 | 数字病理学 | 风湿性关节炎 | 液相色谱串联质谱 | NA | 血浆和滑膜组织样本 | 32个滑膜组织样本和26个配对血浆样本 |
| 10688 | 2024-08-05 |
Molecular Pathways and Cellular Subsets Associated with Adverse Clinical Outcomes in Overlapping Immune-Related Myocarditis and Myositis
2024-Aug-01, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0011
PMID:38768394
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研究论文 | 该研究探讨了与免疫相关心肌炎和肌炎不良临床结果相关的分子通路和细胞亚群 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了心肌炎和肌炎中的细胞亚群及其潜在的分子机制，提出了新的治疗靶点 | 样本量相对较小，仅包含10例重叠心肌炎和肌炎患者 | 探索免疫检查点疗法引起的心肌炎和肌炎背后的分子机制 | 心肌炎和肌炎患者的心脏和骨骼肌活检样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | 总共20个样本（心肌炎与肌炎重叠患者10个，心肌炎单独患者1个，控制组9个） |
| 10689 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analyses Reveal the Metabolic Heterogeneity and Plasticity of the Tumor Microenvironment during Head and Neck Squamous Cell Carcinoma Progression
2024-Aug-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1344
PMID:38718319
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研究论文 | 本研究揭示了头颈部鳞状细胞癌进展过程中肿瘤微环境的代谢异质性和可塑性 | 确定了SPP1+巨噬细胞作为一种具有高果糖和甘露糖代谢的致瘤和促转移的巨噬细胞亚型 | 没有提供数据样本的长期随访信息 | 定义头颈部鳞状细胞癌发展过程中的肿瘤微环境代谢景观 | 对26个人类患者样本进行单细胞RNA测序 | 数字病理 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 26个样本，包含正常组织、癌前病变、早期癌症、晚期癌症、淋巴结转移和复发肿瘤 |
| 10690 | 2024-08-04 |
Single-cell profiling of sarcomas from archival tissue reveals programs associated with resistance to immune checkpoint blockade
2024-Jul-31, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-2976
PMID:39083415
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研究论文 | 该文章探讨了如何从存档组织中进行肉瘤的单细胞分析，并揭示了与免疫检查点抑制剂抵抗相关的程序 | 提出了一种从冷冻组织中生成多模态单细胞基因组学和全基因组测序数据的新方法 | 由于肉瘤的结构复杂，使用尖端的分子分析方法生成高质量数据存在挑战 | 研究肉瘤的治疗机制及其对免疫检查点抑制剂的抵抗性 | 分析了来自两名接受免疫检查点抑制剂治疗患者的五个未分化多形性肉瘤和三个内膜肉瘤样本的细胞转录组 | 数字病理学 | 肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 75,716个细胞转录组，来自五个UPS和三个INS样本 |
| 10691 | 2024-08-05 |
DISSyphilis and the risk of HIV infection: A Mendelian randomization study
2024-Jul-31, AIDS research and human retroviruses
IF:1.5Q4
DOI:10.1089/AID.2024.0005
PMID:39086230
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研究论文 | 本研究评估了梅毒对HIV感染的因果影响 | 研究发现梅毒与HIV感染之间存在显著的因果关系，并揭示了RPAIN基因的相关遗传变异对HIV感染的影响 | 未在摘要中提供具体的研究限制 | 探讨梅毒对HIV感染的因果效应 | 梅毒和HIV感染的基因组数据 | 数字病理学 | HIV感染 | 孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | NA |
| 10692 | 2024-08-04 |
Single-cell analysis revealed that MTIF2 could promote hepatocellular carcinoma progression through modulating the ROS pathway
2024-Jul-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e34438
PMID:39082024
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研究论文 | 本研究分析了线粒体翻译起始因子2 (MTIF2) 在肝细胞癌 (HCC) 中的表达及其生物功能。 | 研究首次确认MTIF2通过调节反应性氧种 (ROS) 通路促进肝细胞癌的进展，并揭示了MTIF2与SOD2的相互作用。 | 研究可能缺乏临床试验验证和长期随访的数据。 | 探讨MTIF2在HCC中的表达及其在癌症发展的作用。 | 研究对象为HCC组织中MTIF2的表达及其在不同细胞类型中的作用。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | HCC组织和其旁癌组织中的10种细胞类型 |
| 10693 | 2024-08-04 |
Advances in targeting cancer-associated fibroblasts through single-cell spatial transcriptomic sequencing
2024-Jul-29, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00622-9
PMID:39075612
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综述 | 本文总结了针对癌症相关成纤维细胞的最新研究进展 | 结合单细胞RNA测序与空间转录组学解决了癌症相关成纤维细胞的空间景观缺失问题 | 主要为综述文章，可能缺乏新的实验数据 | 探讨癌症相关成纤维细胞在肿瘤组织中的作用及其靶向方法 | 癌症相关成纤维细胞及其在肿瘤微环境中的角色 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 文本 | NA |
| 10694 | 2024-08-04 |
Single-cell hdWGCNA reveals metastatic protective macrophages and development of deep learning model in uveal melanoma
2024-Jul-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05421-2
PMID:39075441
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研究论文 | 本研究揭示了与转移样本相关的关键巨噬细胞亚群，并开发了一种深度学习模型用于预测眼部黑色素瘤患者的预后 | 使用单细胞转录组测序和高维加权基因共表达网络分析，识别出转移保护巨噬细胞及其相关的关键基因，为转移机制提供了新见解 | 研究中未提及样本的多样性和临床特征的考虑，可能影响模型的普适性 | 本研究的目的是识别与眼部黑色素瘤转移相关的巨噬细胞亚群及其功能，并开发预测模型 | 研究对象为眼部黑色素瘤患者的单细胞RNA测序样本 | 数字病理学 | 眼部黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，机器学习 | 卷积神经网络（CNN） | 基因表达数据 | NA |
| 10695 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptome and single-cell reveal the role of nucleotide metabolism in colorectal cancer progression and tumor microenvironment
2024-Jul-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05495-y
PMID:39075485
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研究论文 | 本研究揭示了核苷酸代谢在结直肠癌进展和肿瘤微环境中的作用 | 本研究通过单细胞转录组和空间转录组分析，首次揭示核苷酸代谢在结直肠癌细胞和免疫微环境中的核心基因和作用 | 尚未充分探讨核苷酸代谢的所有潜在影响，仅限于特定细胞群体和基因 | 探讨结直肠癌中核苷酸代谢的具体机制及其在肿瘤微环境中的作用 | 结直腸癌细胞及其相关的免疫微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组，空间转录组 | 机器学习算法 | 转录组数据 | 十种单细胞富集评分方法，经过四个额外的单细胞队列验证 |
| 10696 | 2024-08-05 |
Deciphering decidual deficiencies in recurrent spontaneous abortion and the therapeutic potential of mesenchymal stem cells at single-cell resolution
2024-Jul-29, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03854-6
PMID:39075579
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研究论文 | 本研究探讨了复发性自发性流产中的蜕膜缺陷及间充质干细胞的治疗潜力。 | 首次在单细胞分辨率下评估WJ-MSCs对复发性自发性流产的治疗作用，并识别了新的细胞亚群。 | 目前对WJ-MSCs在复发性自发性流产中作用机制的理解仍然有限。 | 研究复发性自发性流产的病因及WJ-MSCs作为潜在治疗方法的有效性。 | 以小鼠模型为基础，研究正常妊娠组、复发性自发性流产组和WJ-MSC治疗组的蜕膜组织。 | 数字病理学 | 复发性自发性流产 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 鼠模型 | 蜕膜组织样本 | 包括正常妊娠、小鼠复发性流产和WJ-MSC治疗组的样本 |
| 10697 | 2024-08-05 |
CRISPR-Cas9 Genome Editing Allows Generation of the Mouse Lung in a Rat
2024-07-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202306-0964OC
PMID:38507610
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研究论文 | 本研究使用CRISPR-Cas9基因编辑技术在大鼠中生成小鼠肺。 | 这是首次在大鼠中生成小鼠肺，展示了CRISPR-Cas9基因编辑与胚泡补充相结合的潜力。 | 研究仅限于小鼠与大鼠的异种嵌合体，尚未进行其他物种的验证。 | 本研究旨在探索在大鼠中生成小鼠肺的可能性。 | 研究对象包括利用CRISPR-Cas9编辑基因的转基因大鼠与小鼠胚胎干细胞。 | 数字病理学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 细胞 | 使用的样本包括缺乏特定基因的大鼠胚胎及小鼠胚胎干细胞的嵌合体 |
| 10698 | 2024-08-05 |
The novel potential therapeutic target PSMP/MSMP promotes acute kidney injury via CCR2
2024-Jul-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.05.028
PMID:38796708
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研究论文 | 本文探讨了PSMP作为一种新型治疗靶点在急性肾损伤中的作用 | 发现PSMP在急性肾损伤中的增加，并且PSMP缺失可以改善肾功能和减少肾小管损伤 | 目前未提供在人类试验中的应用结果 | 研究PSMP在急性肾损伤中的角色及其作为潜在治疗靶点的可能性 | 急性肾损伤小鼠模型以及患者的肾脏组织、尿液和血浆 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 生物标本 | NA |
| 10699 | 2024-08-04 |
Sequencing the transcriptome of single cells: a path to discovering cellular biodiversity
2024-07-01, Postepy biochemii
DOI:10.18388/pb.2021_532
PMID:39083470
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研究论文 | 这篇文章介绍了单细胞转录组学（scRNA-Seq）技术及其在生物医学、发育生物学和植物生物学中的重要应用 | 该研究展示了通过scRNA-Seq技术发现细胞多样性及其发育过程的新方法 | 本文未提及具体的实验局限性 | 研究单细胞转录组学技术的实验与计算部分 | 涉及组织、类器官、细胞及整个生物体的研究 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | NA | 生成的数据分析 | 可以分析数万到百万个细胞 |
| 10700 | 2024-08-05 |
Coexpression enhances cross-species integration of single-cell RNA sequencing across diverse plant species
2024-07, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-024-01738-4
PMID:38937637
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研究论文 | 本研究展示了共表达如何增强不同植物物种中单细胞RNA测序的跨物种整合 | 利用共表达减小多对多同源基因家族，从而识别一对一的基因对，提升了传统整合方法的性能 | NA | 探讨通过基因表达和细胞类型组成驱动的跨物种差异 | 不同植物物种中的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |