单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
10681 2024-08-04
N4-acetylcytidine of Nop2 mRNA is required for the transition of morula-to-blastocyst
2023-Sep-28, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 本研究探讨了Nop2 mRNA的N4-乙酰胞苷修饰在小鼠早期胚胎发育中的作用 首次揭示了NAT10介导的N4-乙酰胞苷修饰在小鼠前植入期胚胎中对mRNA稳定性和翻译效率的重要性 研究主要集中在小鼠胚胎中,结果可能无法直接推广到其他哺乳动物 旨在了解N4-乙酰胞苷修饰在小鼠早期胚胎发育中的功能 小鼠早期胚胎,包括缺乏NAT10的小鼠胚胎 数字病理学 NA 单细胞测序, RNA-seq, 乙酰化RNA免疫沉淀结合PCR(acRIP-PCR) NA NA NA
10682 2024-08-05
Stem cell antigen-1+cell-derived fibroblasts are crucial for cardiac fibrosis during heart failure
2023-Sep-23, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 本研究探讨了干细胞抗原-1+细胞来源的成纤维细胞在心力衰竭中的关键作用 揭示了非骨髓来源的Sca1+细胞通过Wnt4-PDGFRα通路转化为成纤维细胞并促进心脏纤维化的机制 研究主要基于小鼠模型,可能在应用到人类时存在差异 探讨干细胞在心力衰竭中的作用及机制 小鼠和人类心脏中的干细胞抗原-1+细胞及其转化的成纤维细胞 数字病理学 心力衰竭 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 小鼠的非心肌细胞和人类心力衰竭患者的样本
10683 2024-08-05
CNS Repopulation by Hematopoietic-Derived Microglia-Like Cells Corrects Progranulin deficiency
2023-Sep-12, Research square
研究论文 这篇文章探讨了通过造血干细胞移植来纠正Progranulin缺乏症的方法 提出了一种基于Busulfan和 PLX3397的高效条件处理方案,以增强微胶质细胞的再生 尚未提及该方法在临床应用中的具体限制 研究造血干细胞移植在CNS中替代微胶质细胞的能力 主要研究对象为骨髓来源的微胶质细胞及其在小鼠模型中的应用 数字病理学 NA 单细胞RNA测序和高维CyTOF质谱细胞计数 NA 细胞 小鼠模型,具体样本大小未详细说明
10684 2024-08-04
Single-cell transcriptomics reveal a hyperacute cytokine and immune checkpoint axis after cardiac arrest in patients with poor neurological outcome
2023-Jul-14, Med (New York, N.Y.)
研究论文 本文探讨了心脏骤停后患者的单细胞转录组特征及其与神经预后不良的联系 首次在单细胞水平上揭示心脏骤停后超急性细胞因子和免疫检查点轴 样本量可能有限,可能影响研究结果的广泛适用性 研究心脏骤停后系统性炎症反应与神经损伤之间的关系 心脏骤停患者的单细胞免疫网络 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学 NA 血液样本 心脏骤停患者的外周血细胞
10685 2024-08-05
The meningeal transcriptional response to traumatic brain injury and aging
2023-01-03, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究利用高通量RNA测序技术探讨了脑膜对创伤性脑损伤和衰老的转录反应 该研究揭示了年轻和衰老小鼠在轻微脑损伤后的脑膜转录组动态变化 研究对脑膜生物学的基本认识仍然不足 探讨脑膜对创伤性脑损伤和衰老的转录反应 研究对象为年轻和衰老小鼠的脑膜 数字病理学 神经疾病 RNA测序 NA RNA数据 年轻小鼠和衰老小鼠
10686 2024-08-05
TSEE: an elastic embedding method to visualize the dynamic gene expression patterns of time series single-cell RNA sequencing data
2019-Apr-04, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 提出了一种利用弹性嵌入方法可视化时间序列单细胞RNA测序数据的算法 开发了时间序列弹性嵌入(TSEE)算法,通过整合实验时间信息来增强对时间序列scRNA-seq数据的可视化 NA 旨在开发一种算法以可视化时间序列单细胞RNA测序数据 时间序列单细胞RNA测序数据,主要用于人类和斑马鱼的发育过程 数字病理学 NA RNA-seq 弹性嵌入(EE) 时间序列数据 NA
10687 2024-08-05
Cerebral organoids at the air-liquid interface generate diverse nerve tracts with functional output
2019-04, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 本文探讨了大脑类器官在气液界面培养条件下的神经轨迹形成及其功能输出 通过气液界面培养,显著提高了神经元存活率和轴突生长,显示出不同的神经轨迹形态及功能 研究未提及样本数量的限制或长期功能观察 旨在改善对人脑发育和神经疾病的理解 研究对象为大脑类器官及其形成的神经网络 数字病理学 神经系统疾病 单细胞RNA测序 类器官模型 组织样本 NA
10688 2024-08-05
A diffusion-based microfluidic device for single-cell RNA-seq
2019-03-27, Lab on a chip IF:6.1Q2
研究论文 本文介绍了一种基于扩散的微流体设备,用于单细胞RNA测序 提出的MID-RNA-seq设备通过扩散试剂交换方案简化了单细胞RNA测序的执行 NA 开发一个低输入、高效率的单细胞RNA测序平台 单细胞样本的转录组研究 数字病理学 NA RNA-seq NA NA NA
10689 2024-08-05
Human beta cells generated from pluripotent stem cells or cellular reprogramming for curing diabetes
2019-Mar, Regenerative engineering and translational medicine IF:2.2Q3
评论 本文探讨了使用人类β细胞治疗和治愈糖尿病的方法 提出了通过人类多能干细胞定向分化和细胞重编程生成功能性β细胞的新方法 依赖于发现有效的转录因子组合,该过程可能存在挑战 研究糖尿病治疗中β细胞的生成 人类β细胞及其在糖尿病治疗中的应用 干细胞工程 糖尿病 单细胞RNA测序 NA NA NA
10690 2024-08-05
scRNA-Seq reveals distinct stem cell populations that drive hair cell regeneration after loss of Fgf and Notch signaling
2019-01-25, eLife IF:6.4Q1
研究论文 该文章通过scRNA-Seq研究支持细胞如何驱动毛细胞再生 揭示了五种不同的支持细胞类型及其在毛细胞分化中的基因调控网络 缺乏对哺乳动物毛细胞再生过程中的具体因素的详细探讨 研究支持细胞向毛细胞分化的机制 斑马鱼的毛细胞及其支持细胞 数字病理学 NA scRNA-Seq NA NA NA
10691 2024-08-05
The subiculum is a patchwork of discrete subregions
2018-10-30, eLife IF:6.4Q1
研究论文 这篇文章探讨了小鼠次皮质中锥体细胞的异质性及其组织原则 本研究发现次皮质的锥体细胞可以分解为八个独立的亚类,并呈现出复杂的层级和柱状组织 本文主要基于小鼠模型,结果可能不适用于其他物种或不同的生理条件 研究小鼠次皮质内锥体细胞的异质性及其组织结构 小鼠的次皮质锥体细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
10692 2024-08-05
Evolution of multiple cell clones over a 29-year period of a CLL patient
2016-12-16, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文研究了一名慢性淋巴细胞白血病患者29年的细胞克隆演化过程 首次通过单核苷酸多态性微阵列分析揭示了病程中细胞克隆的演变及其对治疗的反应 仅基于单个患者的数据,样本代表性有限 探讨慢性淋巴细胞白血病的细胞克隆演化及其在治疗中的变化 一名慢性淋巴细胞白血病患者及其细胞克隆的演化 数字病理学 慢性淋巴细胞白血病 单细胞RNA测序, 全基因组测序 NA 基因组数据, 转录组数据 1名患者的多次样本
10693 2024-08-05
Early transcriptional similarities between two distinct neural lineages during ascidian embryogenesis
2024-Oct, Developmental biology IF:2.5Q2
研究论文 本文研究了海鞘胚胎中两种不同神经谱系之间的早期转录相似性 首次揭示了两种不同发育来源的神经前体细胞的全基因组转录动态 对共享转录控制的证据有限,限制了两种神经谱系的比较 探讨在进程性谱系限制过程中不同神经谱系之间的转录状态相似性 海鞘胚胎的不同神经前体细胞及其姐妹细胞谱系 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA 基因组数据 手动解剖的来自两种不同谱系的神经前体细胞
10694 2024-08-05
Single-cell RNA sequencing reveals the gene expression profile and cellular communication in human fetal heart development
2024-Oct, Developmental biology IF:2.5Q2
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序分析人类胎心发展中的基因表达谱和细胞通信 首次通过单细胞RNA测序深入揭示人类胎心各主要细胞类型的分化过程及其间的信号通路 研究主要集中在特定的妊娠周数,可能忽略其他重要时间点的细胞变化 探索人类胎心发育过程中的基因表达和细胞间相互作用 分析不同妊娠周数(GW8, GW10, GW11, GW17)下的人类胎心细胞类型及其基因表达 数字病理学 心脏疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 人类胎心细胞样本来自特定的妊娠周数(GW8, GW10, GW11, GW17)
10695 2024-08-05
Exploring the Pathogenesis of Autoimmune Liver Diseases from the Heterogeneity of Target Cells
2024-Jul-28, Journal of clinical and translational hepatology IF:3.1Q2
review 本综述探讨了靶细胞异质性对自身免疫性肝病病因学的影响 提出了靶细胞的异质性为自身免疫性肝病的病因学提供了新的见解 未提及具体的实验数据或临床试验结果 研究自身免疫性肝病的病因机制及潜在治疗策略 主要关注肝细胞和胆管细胞的异质性 数字病理学 自身免疫性肝病 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA NA
10696 2024-08-05
Myeloid-T cell interplay and cell state transitions associated with checkpoint inhibitor response in melanoma
2024-Jul-12, Med (New York, N.Y.)
研究论文 该文章探讨了黑色素瘤中髓系细胞与T细胞之间的相互作用及其在检查点抑制剂反应中的细胞状态转变 揭示了检查点抑制剂反应前肿瘤免疫微环境的特征,提出通过调节髓系细胞和效应细胞的相互作用以改善免疫治疗反应的可能性 研究主要限于22名阶段III-IV转移性黑色素瘤患者,样本量较小,可能影响结果的普遍性 探讨免疫治疗前肿瘤微环境与黑色素瘤患者对检查点抑制剂反应之间的关系 22名检查点抑制剂初治的阶段III-IV转移性黑色素瘤患者 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 22名患者的肿瘤免疫浸润细胞和外周血单核细胞
10697 2024-08-05
Targeting CSF1R in myeloid-derived suppressor cells: insights into its immunomodulatory functions in colorectal cancer and therapeutic implications
2024-Jul-11, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本研究探讨了CSF1R在结直肠癌中的免疫调节功能及其对骨髓源抑制细胞的影响 探讨了CSF1R和JAK/STAT3信号轴在结直肠癌免疫抑制中的关键作用,并评估了LNCs@CSF1R siRNA与抗PD-1联合治疗的疗效 研究的样本仅限于小鼠模型,可能无法完全反映人类结直肠癌中的相应机制 研究骨髓源抑制细胞在结直肠癌中的免疫抑制作用 主要研究小鼠模型中的骨髓源抑制细胞及其相关信号通路 数字病理学 结直肠癌 RNA-seq NA 转录组数据 小鼠结直肠癌模型
10698 2024-08-04
Deconwolf enables high-performance deconvolution of widefield fluorescence microscopy images
2024-Jul, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本研究开发了Deconwolf,一种用于高性能去卷积宽场荧光显微镜图像的开源软件 Deconwolf能够在普通笔记本电脑上高效运行,并显著提高了在DNA和RNA原位杂交图像中分辨拥挤荧光点的准确性 此文未提及具体的局限性 旨在克服传统显微镜方法在拥挤分子靶标分辨率上的限制 研究针对DNA和RNA原位杂交图像的荧光点及细胞切片中的个体转录本 数字病理学 NA 荧光显微镜 NA 图像 NA
10699 2024-08-05
CellRank 2: unified fate mapping in multiview single-cell data
2024-Jul, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 提出了CellRank 2框架,用于统一研究多视角单细胞数据中的细胞命运 CellRank 2能够结合多种数据视角和时间点信息,提供了对细胞命运的深入分析 尚未提及具体的局限性 研究细胞的命运映射和动态变化 单细胞转录组数据,涉及人类造血和内胚层发育 数字病理 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞数据 多达数百万个细胞的单细胞数据
10700 2024-08-04
Action of circulating and infiltrating B cells in the immune microenvironment of colorectal cancer by single-cell sequencing analysis
2024-Jun-15, World journal of gastrointestinal oncology IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过单细胞测序技术探讨了循环和浸润B细胞在结直肠癌免疫微环境中的作用机制 该研究揭示了结直肠癌中B细胞的异质性及其在肿瘤免疫中的功能差异 样本量相对较小,仅涉及23名结直肠癌患者,可能影响结果的普适性 探讨结直肠癌免疫微环境中循环和浸润B细胞亚群的作用 分析来自23名CRC患者的肿瘤、正常和外周血样本中的B细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞测序 NA 样本 69个样本(包括正常、肿瘤和外周血样本)
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