单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 10661 - 10680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10661 | 2024-08-04 |
Dissecting prostate Cancer: Single-Cell insight into Macrophage Diversity, molecular Prognosticators, and the role of Peptidylprolyl Isomerase F
2024-Sep-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112599
PMID:38959543
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研究论文 | 本研究探讨了前列腺癌中的单细胞转录组学，确定了巨噬细胞的异质性及其预后基因标记。 | 揭示了前列腺癌肿瘤微环境中的巨噬细胞异质性和功能特化，并识别了与预后相关的基因，特别是PPIF的作用。 | 研究主要依赖于现有的单细胞RNA测序数据，可能存在选择偏倚或数据完整性的问题。 | 研究前列腺癌中的肿瘤微环境及其与巨噬细胞的相互作用，识别潜在的预后基因。 | 前列腺癌的单细胞转录组学数据以及与巨噬细胞相关的基因。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 分析了9,178个细胞，归类为10种主要细胞类型 |
| 10662 | 2024-08-04 |
CYP24A1 affected macrophage polarization through degradation of vitamin D as a candidate biomarker for ovarian cancer prognosis
2024-Sep-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112575
PMID:38963981
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研究论文 | 本研究探讨了CYP24A1如何通过维生素D降解影响巨噬细胞极化，并作为卵巢癌预后候选生物标志物。 | 发现CYP24A1通过调节巨噬细胞极化与维生素D的相互作用，促进卵巢癌的恶性进展。 | 研究在体外构建了异种移植模型，但缺乏临床样本验证。 | 旨在筛选与卵巢癌预后相关的线粒体相关基因。 | 主要研究CYP24A1在卵巢癌细胞中的表达及其功能。 | 数字病理 | 卵巢癌 | 单细胞测序技术 | NA | 基因表达数据 | 使用TCGA卵巢癌数据进行分析 |
| 10663 | 2024-08-05 |
The complex association between the immune system and the skeletal system in osteoporosis: A study of single-cell RNA sequencing
2024-Sep-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112611
PMID:38976947
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研究论文 | 本研究探讨了免疫系统与骨骼系统在骨质疏松症中的复杂关系 | 揭示了特定细胞亚群及其细胞间相互作用在骨质疏松症发病机制中的关键角色 | 缺乏对临床样本的广泛验证以增强研究结果的适用性 | 探索免疫系统与骨骼系统之间的生态联系以寻找临床预防和治疗的新策略 | 以人类腰椎层组织为研究对象，进行了单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人类腰椎层组织的质量控制单细胞样本 |
| 10664 | 2024-08-04 |
Deciphering the spatiotemporal transcriptional landscape of intestinal diseases (Review)
2024-09, Molecular medicine reports
IF:3.4Q2
DOI:10.3892/mmr.2024.13281
PMID:38994768
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综述 | 本文总结了空间转录组学在肠道疾病中的应用。 | 通过空间转录组技术，深入揭示了肠道中细胞、基因、蛋白及信号之间的相互作用。 | NA | 探讨空间转录组学如何帮助理解与胃肠道相关的疾病机制。 | 肠道中的不同细胞类型及其相互作用。 | 数字病理学 | 肠道疾病 | 空间转录组学(ST) | NA | NA | NA |
| 10665 | 2024-08-05 |
From genes to therapy: A comprehensive exploration of congenital heart disease through the lens of genetics and emerging technologies
2024-Sep, Current problems in cardiology
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.cpcardiol.2024.102726
PMID:38944223
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综述 | 本研究全面探索了先天性心脏病(CHD)的遗传学和新兴技术。 | 探讨了单基因和多基因因素对CHD的影响，并强调了新兴技术在该领域的变革性影响。 | 关于CHD病因的主要部分仍然不清楚，且研究可能未覆盖所有相关因素。 | 提升对先天性心脏病遗传机制的理解，以改善诊断和开发新疗法。 | 先天性心脏病的遗传学及其相关的疾病机制。 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 靶向新一代测序(NGS)、全基因组测序(WGS)、全外显子测序(WES)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、人诱导多能干细胞(hiPSCs) | NA | NA | NA |
| 10666 | 2024-08-05 |
Correlation of Professional Antigen-Presenting Tbet+CD11c+ B Cells With Bone Destruction in Untreated Rheumatoid Arthritis
2024-Aug, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42857
PMID:38570939
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研究论文 | 本研究探讨了Tbet+CD11c+ B细胞与未治疗的类风湿关节炎（RA）患者骨破坏之间的关联 | 首次揭示了Tbet+CD11c+ B细胞在未治疗RA中的功能特性及其对骨破坏的促进作用 | 样本量较小，且仅涉及未治疗RA患者，可能影响结果的广泛性 | 研究CD21-/low Tbet+CD11c+ MBCs与骨破坏及其他临床参数的关联 | 未治疗的类风湿关节炎患者的外周血记忆B细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 流式细胞术、单细胞RNA测序和V(D)J测序 | NA | 血液样本 | 36个来自未治疗RA患者的样本 |
| 10667 | 2024-08-05 |
Vaccine Therapy for Heart Failure Targeting the Inflammatory Cytokine Igfbp7
2024-Jul-30, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文研究了针对炎性细胞因子Igfbp7的疫苗治疗心力衰竭的效果 | 提出了通过疫苗靶向Igfbp7改善老化内皮细胞引起的心脏功能障碍的创新方法 | 研究主要在小鼠模型上进行，临床应用的验证尚未完成 | 探究炎性细胞因子Igfbp7在心力衰竭中的作用及其作为疫苗靶点的可能性 | 研究对象为小鼠模型和心力衰竭患者的心脏组织 | 数字病理学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序、毛细管电泳-飞行时间-质谱系统 | AAV9（腺相关病毒血清型9） | 组织样本 | 使用了小鼠模型和心力衰竭患者的组织样本 |
| 10668 | 2024-08-04 |
Unveiling heterogeneity and prognostic markers in ductal breast cancer through single-cell RNA-seq
2024-Jul-27, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03325-1
PMID:39068476
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了导管乳腺癌的细胞异质性及其预后标志物 | 首次通过单细胞RNA测序分析乳腺癌细胞的异质性，识别CYP24A1和TFPI2作为潜在的预后标志物 | 研究主要依赖生物信息学分析，可能缺乏大规模临床样本验证 | 调查导管乳腺癌细胞的异质性机制及潜在预后标志物 | 导管乳腺癌细胞，特别是Type 1和Type 2导管上皮细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | Lasso回归，Cox比例风险回归 | 基因表达数据 | NA |
| 10669 | 2024-08-07 |
Developing a simple and rapid method for cell-specific transcriptome analysis through laser microdissection: insights from citrus rind with broader implications
2024-Jul-27, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-024-01242-y
PMID:39068421
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研究论文 | 本文开发了一种简单快速的激光显微切割方法，用于细胞特异性转录组分析，并通过柑橘皮的研究展示了其有效性 | 本文省略了样本固定和防冻剂添加步骤，采用新鲜样本快速冷冻并立即进行冷冻切片，缩短了脱水时间并省略了组织清除步骤，提高了RNA提取的质量和效率 | NA | 开发一种改进的、简单且高效的激光显微切割方法，用于细胞特异性转录组分析 | 柑橘皮组织及其细胞 | 分子生物学 | NA | 激光显微切割、下一代测序 | NA | 转录组数据 | 柑橘皮组织的多个厚度切片 |
| 10670 | 2024-08-04 |
Decoding the spatiotemporal heterogeneity of tumor-associated macrophages
2024-Jul-27, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02064-1
PMID:39068459
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review | 本综述探讨了肿瘤微环境中肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的空间和时间异质性 | 创新点在于揭示了TAMs的不同亚型、起源及功能，以及其与其他肿瘤微环境成分的复杂相互作用 | 该综述可能未覆盖所有相关研究，且主要基于现有文献，缺乏新的实验数据 | 研究肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤微环境中的作用及其潜在治疗靶点 | 研究对象为肿瘤相关巨噬细胞及其在肿瘤微环境中的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序，空间多组学 | NA | 文献 | NA |
| 10671 | 2024-08-04 |
IRF8 deficiency-induced myeloid-derived suppressor cell promote immune evasion in lung adenocarcinoma
2024-Jul-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05519-7
PMID:39049031
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研究论文 | 该文章探讨了IRF8缺乏如何通过促进骨髓来源抑制细胞（MDSCs）影响肺腺癌的免疫逃逸机制 | 发现IRF8是LUAD骨髓细胞中MDSC分化的重要调节因子，并通过IL6-JAK-STAT3信号通路调节MDSC的分化 | 未提及样本的具体来源及其多样性，可能影响结果的广泛适用性 | 探索肺腺癌患者的肿瘤免疫逃逸机制，以期扩展受益于免疫疗法的患者群体 | 以954个肺腺癌患者的RNA-seq数据和15个单细胞RNA-seq数据为研究对象 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 954个肺腺癌患者的群体数据和15个单细胞数据 |
| 10672 | 2024-08-04 |
Interneuron diversity in the human dorsal striatum
2024-Jul-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50414-w
PMID:39039043
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研究论文 | 本文揭示了人类背侧纹状体中抑制神经元的多样性及其转录组特征 | 提出了一个全面的纹状体抑制神经元分类法，包括八个主要类别和十四个子类别 | 文章未提及样本的具体来源限制和潜在的偏倚 | 理解背侧纹状体抑制神经元的多样性及其对基底节电路和相关疾病的影响 | 人类尸检后的尾状核和壳核样本 | 数字病理 | 神经精神疾病 | snRNA-seq 和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 尾状核和壳核的尸检样本 |
| 10673 | 2024-08-05 |
sNucConv: A bulk RNA-seq deconvolution method trained on single-nucleus RNA-seq data to estimate cell-type composition of human adipose tissues
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110368
PMID:39071890
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研究论文 | 本研究介绍了sNucConv，一种基于单核RNA测序数据训练的bulk RNA-seq去卷积方法，用于估计人类脂肪组织的细胞类型组成 | sNucConv利用深度学习方法，首次将snRNA-seq数据应用于bulk RNA-seq的去卷积并进行了模型验证 | 研究仅依赖于特定的snRNA-seq样本，可能限制了模型在其他组织类型的普适性 | 开发一种新方法以提高对脂肪组织细胞类型组成的估计精度 | 针对人类的脂肪组织细胞类型进行研究 | 数字病理学 | NA | snRNA-seq, bulk RNA-seq | 深度学习模型 (Scaden) | RNA-seq数据 | 使用了5个hSAT和7个hVAT的snRNA-seq数据进行训练，此外验证中使用了5个hSAT和5个hVAT样本 |
| 10674 | 2024-08-04 |
Molecular analysis of human tick-bitten skin yields signatures associated with distinct spatial and temporal trajectories - A proof-of-concept study
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33600
PMID:39071681
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研究论文 | 本研究揭示了人类被蜱虫叮咬皮肤样本的分子机制，分析了不同时间和空间轨迹的特征 | 该研究首次通过空间转录组学技术分析叮咬后皮肤样本，识别了与时间和个体特异性相关的分子特征 | 样本数量和个体多样性可能限制了研究结果的广泛应用 | 揭示蜱虫叮咬后皮肤的分子机制 | 从同一参与者获得的蜱虫叮咬样本（病例）和对侧皮肤样本（对照） | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 同一参与者的蜱虫叮咬和对侧皮肤样本 |
| 10675 | 2024-08-04 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing revealed an epigenetic signature predicts prognosis and tumor microenvironment colorectal cancer heterogeneity
2024-Jul-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v16.i7.3032
PMID:39072180
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研究论文 | 本研究建立了一种能够预测结直肠癌预后的表观遗传标记 | 研究中的标记在不同数据集中经过验证，显示出良好的预后预测能力 | 该研究未提到样本的种类和数量的详细信息 | 研究的目标是构建一个稳健的结直肠癌预后标记 | 研究对象为结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq | NA | 基因组和转录组数据 | 使用了TCGA队列和六个独立数据集 |
| 10676 | 2024-08-05 |
Single cell transcriptomic analysis reveals tumor immune infiltration by NK cells gene signature in lung adenocarcinoma
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33928
PMID:39071697
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了肺腺癌中NK细胞的肿瘤免疫浸润特征 | 引入了NK基因特征分数（NKGS），用于区分NK1和NK2细胞 | 研究可能受到样本量和数据集的限制 | 了解肺腺癌中NK细胞的多样性特征 | 主要研究肺腺癌中的NK细胞群体 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归 | 基因表达数据 | 多个初级肺癌（MPLC）数据集中的样本 |
| 10677 | 2024-08-05 |
Constructing an immune-related prognostic signature for predicting prognosis and immune response in hepatocellular carcinoma
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e34012
PMID:39071637
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研究论文 | 本研究旨在建立一个与免疫相关的肝细胞癌预后模型 | 首次在肝细胞癌中建立了一个免疫相关的预后模型 | 研究可能受到样本选择和数据集限制的影响 | 旨在分析肝细胞癌的免疫相关预后 | 研究对象为肝细胞癌患者及其免疫相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | Kaplan-Meier生存曲线，Cox回归分析 | 基因表达数据 | 438名肝细胞癌患者 |
| 10678 | 2024-08-05 |
Disease-specific transcriptional programs govern airway goblet cell metaplasia
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e34105
PMID:39071568
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研究论文 | 这篇文章探讨了慢性肺部炎症疾病中气道杯状细胞变性相关的转录程序 | 揭示了哮喘、囊性纤维化和慢性阻塞性肺病中杯状细胞变性的相似性和差异性 | 对该领域的分子机制和特征理解仍然有限 | 研究杯状细胞变性在肺疾病中的分子机制 | 人类肺部的单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 公共单细胞RNA测序数据集 |
| 10679 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals special basal cells and fibroblasts in idiopathic pulmonary fibrosis
2024-07-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-66947-5
PMID:38982264
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现特定的基底细胞和成纤维细胞在特发性肺纤维化中具有重要作用 | 识别出几种之前未被认识的基底细胞亚型以及与细胞外基质相关的成纤维细胞群体，提供了对特发性肺纤维化中基底细胞和成纤维细胞复杂性和多样性的创新见解 | 样本量较小，仅包括五个特发性肺纤维化样本和三个健康对照样本 | 探讨导致特发性肺纤维化的分子机制 | 特发性肺纤维化患者的肺组织样本以及健康对照样本 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 肺组织样本 | 8个样本（5个特发性肺纤维化样本和3个健康对照样本） |
| 10680 | 2024-08-04 |
Development of human pancreatic cancer avatars as a model for dynamic immune landscape profiling and personalized therapy
2024-Jul-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9071
PMID:38968363
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研究论文 | 本研究开发了基于人类胰腺癌组织的个性化“化身”，用于动态免疫微环境分析和个性化治疗。 | 论文展示了一种新的个性化有机体模型，可以在时间和空间上报告胰腺癌微环境，并能够反映临床反应。 | 尚未提及具体局限性 | 研究旨在创建一个新的模型，评估胰腺癌治疗的免疫微环境和个性化疗法。 | 研究对象为胰腺导管腺癌（PDAC）和其微环境。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 多重免疫荧光和空间转录组学 | 个性化有机体模型 | 组织切片数据 | 具体样本量尚未提及 |