单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27897 篇文献，本页显示第 10661 - 10680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10661 | 2024-08-05 |
scCRT: a contrastive-based dimensionality reduction model for scRNA-seq trajectory inference
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae204
PMID:38701412
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研究论文 | 提出了一种用于轨迹推断的新型降维模型scCRT，以提高单细胞RNA测序的分析性能 | scCRT模型结合了细胞级和聚类级对比模块，以利用先前信息学习准确的细胞表示 | 模型依赖于先前的细胞状态信息，可能对数据的依赖性较强 | 旨在提高单细胞RNA测序中轨迹推断的准确性和效率 | 研究对象为单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 对比学习模型 | 数据集 | 共有135个数据集，包括54个真实数据集和81个合成数据集 |
| 10662 | 2024-08-04 |
Sirtuin 6 ameliorates bleomycin-induced pulmonary fibrosis via activation of lipid catabolism
2024-Mar, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31027
PMID:37099691
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研究论文 | 本文探讨了SIRT6在减轻博来霉素诱导的肺纤维化中的作用 | 首次揭示了SIRT6通过激活脂质分解代谢来改善肺纤维化 | 对SIRT6在肺纤维化机制中的具体作用尚需进一步研究 | 研究SIRT6在肺纤维化中的保护机制 | 人类肺组织中的SIRT6及其对小鼠的影响 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 高通量测序 | NA | 数据 | 小鼠模型及单细胞测序数据库 |
| 10663 | 2024-08-04 |
Cell-type deconvolution of bulk-blood RNA-seq reveals biological insights into neuropsychiatric disorders
2024-02-01, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2023.12.018
PMID:38306997
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研究论文 | 本研究通过对大规模血液RNA测序数据进行细胞类型解卷积，提供了精神疾病的生物学见解 | 本研究使用计算推断细胞类型比重和基因表达，发现了多个未通过常规分析得出的与精神疾病相关的基因 | 该研究的细胞类型特定信号可能仍会受到某些因素的影响，且未使用单细胞测序 | 探讨基因变异与精神疾病风险之间的因果机制 | 来自1730例患有双相情感障碍和精神分裂症个体的全血样本 | 数字病理学 | 精神疾病 | RNA测序 | NA | 血液样本 | 1730个全血样本 |
| 10664 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptome analysis reveals distinct cell populations in dorsal root ganglia and their potential roles in diabetic peripheral neuropathy
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0306424
PMID:39083491
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研究论文 | 单细胞转录组分析揭示了背根神经节中不同细胞群体及其在糖尿病周围神经病中的潜在作用 | 首次系统性地分析了背根神经节的细胞组成及其在糖尿病周围神经病中的作用 | 缺乏对背根神经节在糖尿病周围神经病发病机制的深入探索 | 深入了解背根神经节的细胞类型组成及其在糖尿病周围神经病中的角色 | 健康对照组及糖尿病周围神经病大鼠的背根神经节组织 | 数字病理学 | 糖尿病周围神经病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 来自健康对照组和糖尿病周围神经病大鼠的背根神经节组织 |
| 10665 | 2024-08-05 |
Systems biology-based analysis exploring shared biomarkers and pathogenesis of myocardial infarction combined with osteoarthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1398990
PMID:39086489
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研究论文 | 本研究通过系统生物学探讨了心肌梗死和骨关节炎共享的生物标志物和发病机制 | 首次揭示了DUSP1、FOS和THBS1作为心肌梗死和骨关节炎的三个新共享生物标志物及其相关信号通路 | 未提及研究的具体局限性 | 探讨心肌梗死与骨关节炎的共享生物标志物和发病机制 | 心肌梗死（MI）和骨关节炎（OA）患者的基因表达数据 | 数字病理学 | 心肌梗死与骨关节炎 | 基因表达分析，单细胞RNA测序，RT-qPCR | 无特定模型类型 | 基因表达数据 | 涉及心肌细胞和软骨细胞的样本，具体样本数量未说明 |
| 10666 | 2024-08-05 |
HIF2A mediates lineage transition to aggressive phenotype of cancer-associated fibroblasts in lung cancer brain metastasis
2024, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2024.2356942
PMID:38778816
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研究论文 | 这篇文章探讨了HIF2A在肺癌脑转移中促进癌症相关成纤维细胞的谱系转变及其侵袭性表型的机制 | 本研究揭示了肺癌脑转移中HIF-2α诱导的CAF谱系转变及其功能改变的新机制 | 本研究的局限性在于数据主要来源于单细胞RNA测序，可能无法全面反映所有CAF的复杂性 | 本研究的目的是探讨肺癌脑转移中的肿瘤微环境变化及CAF的作用 | 研究对象为不同转移阶段的肺癌患者的CAF及其在脑转移中的表现 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 大规模RNA测序, 多重免疫组化 | NA | RNA数据 | 包括四对脑转移和原发肺癌样本的配对样本 |
| 10667 | 2024-08-05 |
Integrative single-cell analysis of longitudinal t(8;21) AML reveals heterogeneous immune cell infiltration and prognostic signatures
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1424933
PMID:39086485
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研究论文 | 本研究对t(8;21)急性髓性白血病患者的免疫微环境进行了综合单细胞分析 | 本研究通过scRNA-seq发现了与疾病进展和药物耐受性相关的独特T细胞特征 | 论文未提及具体的样本数量及其来源，限制了结果的普遍性 | 探究急性髓性白血病患者的免疫细胞浸润状况与预后的关系 | t(8;21)急性髓性白血病患者的免疫细胞特征 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞浸润数据 | 包括原发和纵向t(8;21)急性髓性白血病样本以及外部队列 |
| 10668 | 2024-08-04 |
Molecular and immune signatures, and pathological trajectories of fatal COVID-19 lungs defined by in situ spatial single-cell transcriptome analysis
2023-08, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29009
PMID:37563850
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研究论文 | 本研究通过原位测序分析了COVID-19死亡患者肺部的单细胞分子和细胞特征 | 首次建立了COVID-19肺部细胞和分子特征的空间单细胞图谱 | 仅针对死后肺组织进行研究，可能无法全面代表所有COVID-19患者的肺部病理 | 旨在定义COVID-19肺部的分子和免疫特征及病理轨迹 | 研究对象为COVID-19死亡患者的肺部组织样本 | 数字病理学 | 肺炎COVID-19 | 原位测序（ISS） | 稀疏非负矩阵分解（SNMF） | 转录组数据 | 研究中涉及221个基因，分析了1719459个细胞 |
| 10669 | 2024-08-04 |
The progenitor basis of cortical projection neuron diversity
2023-08, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2023.102726
PMID:37148649
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研究论文 | 本研究探讨了不同类型的神经祖细胞如何产生皮层投射神经元的多样性。 | 创新点在于通过细胞类型解析的追踪方法来理解神经祖细胞在投射神经元多样性中的作用。 | 目前关于中间祖细胞在投射神经元多样性中的角色仍然研究不足。 | 研究神经祖细胞如何产生皮层投射神经元的多样性和层级组织。 | 主要研究对象为辐射胶质细胞和中间祖细胞。 | 神经科学 | NA | 细胞类型解析遗传命运追踪，轴突追踪，空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 10670 | 2024-08-05 |
Protective Renalase Deficiency in β-Cells Shapes Immune Metabolism and Function in Autoimmune Diabetes
2023-08-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0030
PMID:37216639
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研究论文 | 本文探讨了肾素缺乏如何影响自身免疫糖尿病中β细胞的免疫代谢和功能 | 首次揭示了肾素缺乏在移植的β细胞中调节局部免疫细胞代谢和功能的能力 | 研究仅在小鼠模型中进行，缺乏对人类适用性的验证 | 本研究旨在了解肾素缺乏对自身免疫糖尿病中β细胞的影响 | 主要研究对象为小鼠模型中的β细胞和浸润的免疫细胞 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 细胞 | NA |
| 10671 | 2024-08-05 |
Ezh2 Knockout in B Cells Impairs Plasmablast Differentiation and Ameliorates Lupus-like Disease in MRL/lpr Mice
2023-08, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42492
PMID:36897808
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研究论文 | 本研究评估了EZH2在B细胞中的表达对狼疮病理机制的影响 | 首次揭示EZH2缺失对浆细胞发育和狼疮样疾病的改善效果 | 研究主要集中在小鼠模型，临床相关性尚需进一步验证 | 评估EZH2在B细胞中的角色及其与狼疮发病机制的关系 | MRL/lpr小鼠模型中的B细胞和人类狼疮患者的B细胞 | 数字病理 | 狼疮 | 单细胞RNA测序 | 鼠模型 | 细胞类型数据 | 小鼠模型和人类狼疮患者的多样本 |
| 10672 | 2024-08-05 |
Stimulation of Immune Checkpoint Molecule B and T-Lymphocyte Attenuator Alleviates Experimental Crescentic Glomerulonephritis
2023-08-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000159
PMID:37367205
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研究论文 | 这篇文章探讨了免疫检查点分子BTLA在实验性新月型肾小管肾炎中的作用 | 这项研究首次揭示BTLA在新月型肾小管肾炎中的保护作用和抗体治疗的潜力 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能在临床应用中存在差异 | 研究BTLA在新月型肾小管肾炎中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | BTLA缺陷小鼠和野生型小鼠的实验 | 免疫学 | 肾炎 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 生物样本（小鼠模型） | 使用BTLA缺陷小鼠和野生型小鼠进行实验，但具体样本量未提及 |
| 10673 | 2024-08-05 |
Distinct Inflammatory Milieu in Patients With Right Heart Failure
2023-08, Circulation. Heart failure
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研究论文 | 这项研究探讨了右心衰竭患者的循环炎症环境 | 识别了可预测患者预后的新生物标志物soluble CD163和CXCL12 | 样本数量较小，且需进一步研究这些分子如何影响心衰表现和疾病进展 | 了解右心衰竭与肝脏相互作用的机制 | 包括正常心脏功能的对照组和满足右心衰竭标准的心衰患者 | 数字病理学 | 心衰 | 多重蛋白检测和单细胞RNA测序 | NA | 血液样本和组织成像 | 三组患者的血液样本，具体数量未说明 |
| 10674 | 2024-08-05 |
Spatially patterned 3D model mimics key features of cancer metastasis to bone
2023-08, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本文报道了空间模式化的组织工程3D模型，模仿乳腺癌和前列腺癌骨转移的关键特征 | 提出了一种空间模式化的3D骨转移模型，可以模拟骨特异性侵袭和癌症对骨重塑的诱导性失调 | 缺乏对这些模型的广泛验证和应用研究 | 填补缺乏生理相关的体外模型的空白，探索骨转移的生物学 | 乳腺癌和前列腺癌的骨转移 | 数字病理学 | 乳腺癌和前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 3D模型 | NA | NA |
| 10675 | 2024-08-05 |
Characterization of altered molecular mechanisms in Parkinson's disease through cell type-resolved multiomics analyses
2023-04-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abo2467
PMID:37058563
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研究论文 | 通过细胞类型解析的多组学分析，揭示帕金森病中改变的分子机制。 | 首次通过多组学数据整合提供了细胞类型特异性的cREs失调及其对帕金森病相关基因的转录影响。 | 未具体讨论其他神经退行性疾病的相关性及其影响。 | 研究帕金森病的细胞类型依赖性转录调控机制。 | 健康对照者和帕金森病患者的113,207个细胞核样本。 | 数字病理学 | 帕金森病 | 转录组学和表观基因组学 | NA | 单细胞转录组和表观基因组数据 | 113,207个细胞核 |
| 10676 | 2024-08-05 |
Perspectives on Bulk-Tissue RNA Sequencing and Single-Cell RNA Sequencing for Cardiac Transcriptomics
2022, Frontiers in molecular medicine
DOI:10.3389/fmmed.2022.839338
PMID:39086967
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评论 | 本文探讨了心脏转录组学中对大规模组织RNA测序和单细胞RNA测序的看法 | 提出了单细胞测序在心脏功能和衰竭研究中的应用潜力 | 尚未完全理解心脏内细胞类型之间的复杂相互作用 | 旨在为使用NGS技术进行转录组研究的研究人员提供入门指南 | 关注心脏在功能和衰竭中的遗传和转录组贡献 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 下一代测序 (NGS) | NA | NA | NA |
| 10677 | 2024-08-07 |
Drosophila Voltage-Gated Sodium Channels Are Only Expressed in Active Neurons and Are Localized to Distal Axonal Initial Segment-like Domains
2020-10-14, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0142-20.2020
PMID:32928889
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研究论文 | 本文研究了果蝇电压门控钠通道在神经元中的表达和亚细胞定位，发现这些通道主要在活跃神经元的远端轴突初始段样域中表达。 | 首次确定了果蝇神经元中动作电位起始的特定位置，即远端轴突段（DAS），并揭示了该位置与电压门控钠通道的富集相关。 | 研究主要集中在果蝇的神经元上，可能不完全适用于其他类型的神经元或生物体。 | 确定果蝇神经元中动作电位的起始位置，并探讨其与电压门控钠通道表达的关系。 | 果蝇的电压门控钠通道及其在神经元中的表达和定位。 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组测序，全细胞膜片钳电生理记录 | NA | 转录组数据，电生理数据 | 胚胎和幼虫中枢神经系统中的神经元，成年中枢神经系统中的神经元 |
| 10678 | 2024-08-05 |
Second-Strand Synthesis-Based Massively Parallel scRNA-Seq Reveals Cellular States and Molecular Features of Human Inflammatory Skin Pathologies
2020-10-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.09.015
PMID:33053333
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研究论文 | 该文章介绍了一种新的高通量单细胞RNA测序方法，旨在揭示人类炎症性皮肤病的细胞状态和分子特征 | 文章提出了Seq-Well S方法，通过随机引物二链合成技术提高了转录本捕获和基因检测的效率 | 由于关注点主要集中在皮肤炎症，可能未能涵盖所有相关的生物学样本和病理特征 | 研究的目的是开发一种高保真和高通量的单细胞RNA测序平台 | 研究对象是五种人类炎症性皮肤疾病 | 数字病理学 | 炎症性皮肤病 | RNA-seq | NA | NA | 五种人类皮肤炎症疾病的样本 |
| 10679 | 2024-08-07 |
Prospects for Use of Single-Cell Sequencing to Assess DNA Methylation in Asthma
2020-Oct-03, Medical science monitor : international medical journal of experimental and clinical research
IF:2.2Q3
DOI:10.12659/MSM.925514
PMID:33009362
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在评估哮喘中DNA甲基化作用的应用前景 | 单细胞测序技术能够揭示不同细胞群中基因的甲基化和表达情况，相较于传统的多组学测序，能更好地反映哮喘的发病机制 | 目前关于哮喘中DNA甲基化的研究较少，且主要使用单细胞测序技术的研究有限 | 研究单细胞测序技术在揭示哮喘中DNA甲基化功能和调控机制的作用 | 哮喘中的DNA甲基化 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 10680 | 2024-08-07 |
Heterogeneous expression of the SARS-Coronavirus-2 receptor ACE2 in the human respiratory tract
2020-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2020.102976
PMID:32971472
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和免疫组织化学技术，系统研究了人类呼吸道中SARS-CoV-2受体ACE2的表达情况及其与COVID-19严重程度风险因素的关系 | 首次详细描述了ACE2蛋白在人类呼吸道中的分布，并探讨了其与COVID-19易感性的关系 | NA | 研究SARS-CoV-2受体ACE2在人类呼吸道中的表达及其与COVID-19严重程度的关系 | 人类呼吸道中的ACE2蛋白表达 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 蛋白质 | NA |