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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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10661 | 2025-10-07 |
IL-33 potentiates histaminergic itch
2024-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.08.038
PMID:37984799
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研究论文 | 本研究揭示了IL-33通过肥大细胞和IL-13依赖机制增强组胺诱导的瘙痒 | 首次发现IL-33可不依赖感觉神经元信号直接通过肥大细胞-IL-13通路增强组胺性瘙痒 | 主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 探究IL-33是否能增强组胺诱导的瘙痒及其机制 | 小鼠模型、人类和小鼠皮肤样本、肥大细胞 | 免疫学 | 慢性自发性荨麻疹 | 单细胞RNA测序、微阵列分析、条件性基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据、行为学数据 | 多种小鼠模型和人类皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
10662 | 2025-10-07 |
Single cell RNA-seq: a novel tool to unravel virus-host interplay
2024-Mar, Virusdisease
DOI:10.1007/s13337-024-00859-w
PMID:38817399
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综述 | 本文探讨单细胞RNA测序技术在解析病毒-宿主相互作用机制中的应用价值 | 突破传统测序技术局限,首次实现单细胞水平解析病毒与宿主互作动态 | 技术方法仍需完善,多组学整合分析能力有待提升 | 推动单细胞测序技术在病毒-宿主相互作用研究中的应用发展 | 病毒与宿主细胞的相互作用机制 | 单细胞组学 | 病毒性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10663 | 2025-10-07 |
Illuminating the terminal nerve: Uncovering the link between GnRH-1 neuron and olfactory development
2024-03, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25599
PMID:38488687
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了终末神经神经元在GnRH-1神经元形成和迁移中的关键作用 | 首次发现Prokr2在终末神经神经元中的表达,并通过单细胞技术确认终末神经与嗅觉神经元的差异 | 研究主要基于小鼠模型,人类直接证据有限 | 阐明嗅觉系统与GnRH-1神经元发育的机制联系 | 小鼠胚胎发育过程中的终末神经神经元和GnRH-1神经元 | 发育神经生物学 | 卡尔曼综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10664 | 2025-10-07 |
Application of Single Cell Gene Expression Technologies to Neurotoxicology
2024-Mar, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2023.100458
PMID:38617035
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综述 | 探讨单细胞RNA测序技术在神经毒理学研究中的应用价值 | 首次系统阐述单细胞转录组技术在解决神经毒理学中细胞类型特异性差异和选择性脆弱性等挑战的潜力 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于技术前景的理论分析 | 探索单细胞基因表达技术在神经毒理学领域的应用前景 | 神经元细胞及复杂组织模型中的多种细胞类型 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10665 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Salivary Gland Endothelial Cells
2024-03, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345231219987
PMID:38411696
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示唾液腺内皮细胞在纤维化和再生过程中的配体-受体相互作用 | 首次系统比较稳态与损伤状态下唾液腺内皮细胞的转录特征,并预测其与其他细胞类型的动态相互作用变化 | 研究仅基于雌性小鼠模型,样本量有限,且预测的相互作用需要实验验证 | 探索唾液腺内皮细胞在纤维化和再生过程中的细胞间通讯机制 | 成年雌性小鼠颌下腺和舌下腺的基质富集细胞 | 单细胞生物学 | 唾液腺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量,使用成年雌性小鼠唾液腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10666 | 2025-10-07 |
Multiscale differential geometry learning of networks with applications to single-cell RNA sequencing data
2024-03, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108211
PMID:38422960
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研究论文 | 本文提出了一种多尺度微分几何策略,用于解决单细胞RNA测序数据分析中的挑战 | 首次将多尺度微分几何方法应用于scRNA-seq数据分析,通过构建多尺度细胞间相互作用流形来揭示复杂细胞网络关系 | NA | 开发新的计算方法以提升单细胞RNA测序数据的分析能力 | 单细胞RNA测序数据中的细胞网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 多尺度微分几何模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10667 | 2025-10-07 |
Molecular and Spatial Signatures of Mouse Embryonic Endothelial Cells at Single-Cell Resolution
2024-03, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323956
PMID:38348657
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组技术绘制了小鼠胚胎内皮细胞的时空异质性图谱 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘胚胎内皮细胞异质性,发现动脉和静脉内皮细胞共享具有静脉特征的毛细血管前体细胞 | 研究局限于小鼠胚胎模型,人类相关性需要进一步验证 | 揭示血管系统发育过程中内皮细胞异质性建立机制 | E9.5、E12.5和E15.5小鼠胚胎的内皮细胞和内皮祖细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 多重错误鲁棒荧光原位杂交, CRISPR基因敲除 | 轨迹推断, 网络分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 7682个E9.5至E15.5内皮细胞进行单细胞测序,15448个内皮细胞进行空间转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 液滴式单细胞RNA测序 |
10668 | 2025-10-07 |
Atlas of expression of acyl CoA binding protein/diazepam binding inhibitor (ACBP/DBI) in human and mouse
2025-Feb-26, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07447-w
PMID:40011442
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研究论文 | 本研究绘制了酰基辅酶A结合蛋白/地西泮结合抑制剂(ACBP/DBI)在人类和小鼠组织中的表达图谱 | 首次系统揭示ACBP/DBI在哺乳动物特定细胞类型中的保守表达机制及其共调控网络 | 研究主要基于数据库挖掘,缺乏实验验证 | 探究ACBP/DBI在人类和小鼠不同器官中的表达模式及调控机制 | 人类和小鼠的正常组织、恶性肿瘤组织 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,转录组学,蛋白质组学,系统数据挖掘 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据,单细胞RNA测序数据 | 人类和小鼠多种组织器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10669 | 2025-10-07 |
KRT7 promotes pancreatic cancer metastasis by remodeling the extracellular matrix niche through FGF2-fibroblast crosstalk
2025-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-84129-1
PMID:40011455
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研究论文 | 本研究揭示了KRT7通过FGF2-成纤维细胞相互作用重塑细胞外基质微环境促进胰腺癌肝转移的机制 | 首次发现KRT7通过调控FGF2分泌影响癌症相关成纤维细胞功能,重塑转移前微环境 | 样本量有限,机制研究主要基于动物模型 | 探究KRT7在胰腺癌转移中的作用机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本和肿瘤细胞 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | RNA测序,蛋白质组学,单细胞RNA测序 | 原位肿瘤模型小鼠 | 基因表达数据,蛋白质数据 | 24个PDAC样本的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10670 | 2025-10-07 |
Immunological profile of lactate metabolism-related genes in Psoriasis a comprehensive analysis based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2025-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91237-z
PMID:40011693
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研究论文 | 通过整合分析批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,研究银屑病中乳酸代谢相关基因的免疫学特征 | 首次结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据系统分析银屑病中乳酸代谢相关基因的免疫学作用 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 阐明乳酸代谢在银屑病发病机制中的作用 | 银屑病患者皮肤组织 | 生物信息学 | 银屑病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个数据集(GSE13355, GSE109248)的合并样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
10671 | 2025-10-07 |
Immune dysregulation in COVID-19 induced ARDS in kidney transplant recipients revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91439-5
PMID:40011702
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示肾移植受者与非移植受者在COVID-19诱发ARDS中的免疫失调差异 | 首次构建肾移植受者COVID-19相关ARDS的单细胞图谱,发现S100A9+巨核细胞亚群和XAF1+效应T细胞亚群的特异性变化 | 样本来源仅限于外周血,未涉及肺部局部免疫反应;样本量相对有限 | 探索肾移植受者与非移植受者在COVID-19诱发ARDS中的免疫应答差异,寻找潜在治疗靶点 | 肾移植受者、非移植受者的COVID-19相关ARDS患者及健康对照 | 单细胞组学 | COVID-19相关急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | 细胞聚类分析、富集分析 | 单细胞转录组数据 | 108,320个外周血细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
10672 | 2025-10-07 |
Combining single-cell ATAC and RNA sequencing for supervised cell annotation
2025-Feb-26, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06084-6
PMID:40011801
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研究论文 | 本研究探索了结合单细胞ATAC和RNA测序数据在监督式细胞注释中的效果 | 首次系统评估了结合单细胞ATAC和RNA测序数据在监督式细胞注释中的性能提升,而非仅关注无监督方法 | 在神经元细胞注释中未观察到性能提升,结果可能受细胞类型和数据集特性影响 | 评估多组学数据整合对监督式细胞类型注释性能的改善 | 人类外周血单个核细胞(PBMC)和阿尔茨海默病神经元细胞 | 单细胞多组学分析 | 阿尔茨海默病 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | 随机森林, 支持向量机, 逻辑回归, scVI | 单细胞多组学数据 | 两个独立数据集:PBMC和神经元细胞 | 10x Genomics | 单细胞多组学 | 10x Chromium | 10x Genomics多组学平台 |
10673 | 2025-10-07 |
Pathological and molecular insights into intravenous leiomyomatosis: an integrative multi-omics study
2025-Feb-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05919-9
PMID:40011937
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研究论文 | 通过整合多组学方法研究静脉内平滑肌瘤病的病理和分子特征 | 首次对静脉内平滑肌瘤病进行综合多组学分析,揭示了染色体10q缺失与血管形态作为预测侵袭性行为的重要标志物 | 样本量有限,疾病罕见性限制了研究的规模 | 探索静脉内平滑肌瘤病的发生发展机制,为诊断和治疗提供新见解 | 静脉内平滑肌瘤组织、子宫肌瘤组织和正常子宫肌层组织 | 数字病理学 | 平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析, H&E染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据, 病理图像 | 8对配对的IVL和正常子宫肌层新鲜冷冻组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
10674 | 2025-10-07 |
Exploring the hepatic-ophthalmic axis through immune modulation and cellular dynamics in diabetic retinopathy and non-alcoholic fatty liver disease
2025-Feb-26, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00730-z
PMID:40011971
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析探索糖尿病视网膜病变和非酒精性脂肪肝病中的免疫调节和细胞动态变化 | 首次系统揭示T细胞、巨噬细胞和内皮细胞在DR和NAFLD中的共同基因特征及CD45信号通路的关键作用 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 阐明糖尿病视网膜病变和非酒精性脂肪肝病之间的肝-眼轴相互作用机制 | T细胞、巨噬细胞、内皮细胞等免疫相关细胞群体 | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变,非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序,差异基因表达分析,伪时间分析,细胞通讯分析 | CellChat,GSEA,GSVA | 单细胞RNA测序数据 | 从GEO数据库获取的PDR和NAFLD数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10675 | 2025-10-07 |
Enhanced conversion of T cells into CAR T cells by modulation of the MAPK/ERK pathway
2025-Feb-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.101970
PMID:39938523
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研究论文 | 通过调节MAPK/ERK通路增强T细胞向CAR T细胞的转化效率 | 首次通过单细胞多组学分析揭示CAR T细胞生成过程中的分子事件,发现ERK2磷酸酶在CAR T细胞中上调 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 改善CAR T细胞的生成效率 | 健康供体和患者的T细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
10676 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatial analysis reveals the interaction between ITLN1+ foam cells and SPP1+ macrophages in atherosclerosis
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1510082
PMID:40017519
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间分析揭示了动脉粥样硬化中ITLN1+泡沫细胞与SPP1+巨噬细胞之间的相互作用机制 | 首次发现VSMC来源的ITLN1+泡沫细胞与SPP1+FABP5+巨噬细胞通过MIF-(CD74+CD44)和SPP1-CD44配体-受体轴相互作用 | 需要进一步验证这些机制以开发有效的免疫治疗策略 | 研究动脉粥样硬化发病机制中不同细胞群体的调控功能 | 动脉粥样硬化斑块中的细胞群体,特别是VSMC来源的ITLN1+泡沫细胞和SPP1+FABP5+巨噬细胞 | 单细胞分析, 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析, 伪时间轨迹分析 | CellChat, GO分析, KEGG通路分析 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
10677 | 2025-10-07 |
Single-cell Analysis Highlights Anti-apoptotic Subpopulation Promoting Malignant Progression and Predicting Prognosis in Bladder Cancer
2025, Cancer informatics
IF:2.4Q3
DOI:10.1177/11769351251323569
PMID:40018511
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研究论文 | 通过单细胞分析识别膀胱癌中具有抗凋亡特性的肿瘤亚群及其在肿瘤进展中的作用 | 首次在膀胱癌中鉴定出具有抗凋亡特性的肿瘤亚群,揭示了该亚群通过特定信号通路与微环境相互作用促进肿瘤进展的机制 | NA | 阐明膀胱癌肿瘤异质性对患者预后的影响机制 | 膀胱癌肿瘤样本和类器官 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型, 风险预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
10678 | 2025-10-07 |
Brain-wide alterations revealed by spatial transcriptomics and proteomics in COVID-19 infection
2024-Nov, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00730-z
PMID:39543407
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研究论文 | 通过空间转录组学和蛋白质组学分析COVID-19感染后全脑范围的分子改变 | 首次结合多种实验和分析方法揭示COVID-19对全脑范围的影响,发现与年龄相关神经退行性疾病重叠的分子通路改变 | 样本量相对有限(总计42例),仅研究严重急性/亚急性COVID-19病例 | 探究SARS-CoV2感染后神经系统症状的病理生理机制 | COVID-19患者和匹配肺部病理对照的尸检脑组织 | 空间生物学 | COVID-19神经系统并发症 | 空间转录组学, 批量基因表达分析, 蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 42例尸检脑组织(COVID-19患者和对照) | NA | 空间转录组学, 批量RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
10679 | 2025-03-01 |
Single-cell RNA sequencing data identify a conserved population of metallothionein-expressing macrophages that may be ubiquitous in vital human organs
2024-Oct, Clinical and translational discovery
DOI:10.1002/ctd2.348
PMID:40018369
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
10680 | 2025-10-07 |
Cellular transitions during cranial suture establishment in zebrafish
2024-Aug-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50780-5
PMID:39138165
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了斑马鱼颅缝发育过程中非成骨性间充质细胞通过BMP拮抗作用调控骨形成的机制 | 首次在斑马鱼颅缝中段鉴定出表达BMP拮抗剂和促血管生成因子的非成骨性间充质细胞亚群 | 研究局限于斑马鱼模型,未验证在哺乳动物中的保守性 | 探究颅缝发育过程中骨形成调控机制 | 斑马鱼颅缝发育 | 发育生物学 | 颅缝早闭 | 单细胞转录组学,谱系追踪,突变分析 | NA | 基因表达数据,成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |