单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 10641 - 10660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10641 | 2024-08-04 |
LINC01002 functions as a ceRNA to regulate FRMD8 by sponging miR-4324 for the development of COVID-19
2024-05-11, Virology journal
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12985-024-02382-2
PMID:38734674
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研究论文 | 本研究探讨了SARS-CoV-2 N蛋白通过调节LINC01002作为ceRNA的功能，以抑制IFN-β的诱导。 | 本研究首次揭示了LINC01002通过吸附miR-4324调节FRMD8，并指出其在SARS-CoV-2感染早期干预治疗中的潜力。 | 本研究的局限性在于仅使用了A549细胞线，未在其他细胞类型中验证结果。 | 研究SARS-CoV-2 N蛋白在免疫逃逸中的作用机制。 | 研究的对象为SARS-CoV-2结构蛋白及相关的免疫调节基因。 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了A549细胞线及858个差异表达基因 |
| 10642 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals myeloid and T cell co-stimulation mediated by IL-7 anti-cancer immunotherapy
2024-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02617-7
PMID:38424167
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研究论文 | 该文章探讨了IL-7治疗如何通过激活T细胞和促炎性髓系细胞来诱导抗肿瘤免疫 | 发现IL-7受体在T细胞、巨噬细胞和树突状细胞上的多重表达，并证实IL-7治疗在小鼠模型中的有效性 | 在研究中未提供人类患者的临床数据以支持发现 | 研究IL-7抗癌免疫治疗对T细胞和免疫微环境的共同刺激作用 | 分析来自多种人类癌症和小鼠肿瘤移植模型的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 来自多个人类癌症的数据与一个小鼠肿瘤移植模型 |
| 10643 | 2024-08-05 |
Revealing Genetic Dynamics: scRNA-seq Unravels Modifications in Human PDL Cells across In Vivo and In Vitro Environments
2024-Apr-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25094731
PMID:38731950
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析人类牙周韧带(PDL)细胞在体内和体外环境中的遗传变化 | 首次通过scRNA-seq揭示了PDL中不同细胞亚群的独特基因特征及其对培养条件的反应 | 未详细探讨不同捐献者之间的PDL细胞差异及其生物学影响 | 旨在填补对PDL病理生理学的理解空白 | 主要人类PDL样本，涉及7个捐献者 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据 | 7个主要人类PDL样本 |
| 10644 | 2024-08-04 |
Spatial Transcriptomics Resolve an Emphysema-Specific Lymphoid Follicle B Cell Signature in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-01-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202303-0507LE
PMID:37934672
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研究论文 | 这篇文章探讨了慢性阻塞性肺疾病中气肿特有的淋巴滤泡B细胞特征的转录组学。 | 本研究通过空间转录组学方法揭示了在气肿患者中B细胞活化的独特特征和转录网络 | 样本量相对较小，且仅限于特定患者群体 | 研究气肿对慢性阻塞性肺疾病患者淋巴滤泡中B细胞转录组特征的影响 | 研究对象为40名慢性阻塞性肺疾病患者和曾经吸烟者的肺部样本 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 空间转录组学 | NA | 肺部组织样本 | 40名患者的样本 |
| 10645 | 2024-08-05 |
Cancer-wide in silico analyses using differentially expressed genes demonstrate the functions and clinical relevance of JAG, DLL, and NOTCH
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0307943
PMID:39074091
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研究论文 | 本文通过分析差异表达基因揭示了JAG、DLL和NOTCH家族在癌症恶性进展中的功能和临床相关性 | 通过综合差异表达基因和生存分析，提出了JAG、DLL和NOTCH家族的未被探索的调控功能和协同效应 | NA | 阐明JAG、DLL和NOTCH家族的普遍功能及其与各种生物功能的联系 | 15种癌症的差异表达基因 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 15种癌症类型的临床数据 |
| 10646 | 2024-08-05 |
Multiomics Analysis of Disulfidptosis Patterns and Integrated Machine Learning to Predict Immunotherapy Response in Lung Adenocarcinoma
2024, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究探讨了二硫化物死亡对肺腺癌免疫微环境和免疫治疗的影响 | 本研究引入了一种基于二硫化物死亡基因的预测风险模型，能够有效预测肺腺癌患者的生存率和治疗结果 | 未提及具体局限性 | 研究二硫化物细胞死亡对肺腺癌患者免疫治疗反应的影响 | 聚焦于与二硫化物死亡相关的基因在肺腺癌中的作用 | 机器学习 | 肺癌 | 转录组学、机器学习算法 | 预测模型 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA数据库的肺腺癌多组学队列 |
| 10647 | 2024-08-05 |
Nicotinamide phosphoribosyltransferase prompts bleomycin-induced pulmonary fibrosis by driving macrophage M2 polarization in mice
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.94482
PMID:38773984
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研究论文 | 该研究探讨了烟酰胺磷酸核糖转移酶(NAMPT)在小鼠中的肺纤维化中驱动巨噬细胞M2极化的作用 | 研究首次揭示了NAMPT在肺纤维化发病机制中的作用，特别是在巨噬细胞M2极化中的创新机制 | 该研究主要基于小鼠模型，未能在临床试验中验证结果 | 研究NAMPT在特发性肺纤维化中的作用及其机制 | 研究对象为肺纤维化患者的临床样本及小鼠模型 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | RNA测序、Western blot、qRT-PCR、ELISA和免疫组化染色 | 小鼠模型 | 临床样本和小鼠肺纤维化模型数据 | 临床样本和小鼠模型，具体样本数量未说明 |
| 10648 | 2024-08-04 |
Epicardioid single-cell genomics uncovers principles of human epicardium biology in heart development and disease
2023-Dec, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01718-7
PMID:37012447
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研究论文 | 这篇论文探讨了人类心包生物学在心脏发育和疾病中的原则 | 该研究首次生成了具有自我组织能力的人类多能干细胞衍生的心包内体，揭示了心包和心肌的形态、分子和功能模式 | 该研究未明确提及限制因素 | 了解心包在心脏发育和疾病过程中的功能及其机制 | 研究对象为人类胚胎发育中心包细胞系和心肌细胞类型 | 数字病理学 | 先天性疾病 | 单细胞转录组学 | 自我组织体 | NA | NA |
| 10649 | 2024-08-04 |
SEACells infers transcriptional and epigenomic cellular states from single-cell genomics data
2023-Dec, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01716-9
PMID:36973557
|
研究论文 | 本文提出了一种算法SEACells，用于从单细胞基因组数据推断转录组和表观基因组细胞状态 | SEACells通过克服单细胞数据的稀疏性，识别细胞状态的分类，而保留传统细胞聚类所掩盖的异质性 | NA | 探索单细胞数据的细胞状态及其在相关疾病研究中的应用 | 单细胞基因组数据中的细胞状态 | 计算生物学 | COVID-19 | 单细胞测序 | 聚类算法 | 基因组数据 | 分析了多个数据集中的单细胞样本，包括COVID-19患者队列 |
| 10650 | 2024-08-05 |
Multimodal spatiotemporal phenotyping of human retinal organoid development
2023-Dec, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01747-2
PMID:37156914
|
研究论文 | 本研究生成了人类视网膜类器官发展的多模态时空表型 | 开发了一种工具包，用于可视化前体细胞和神经元的位置以及细胞外和亚细胞组分的空间排列 | 缺乏不同空间尺度和分子模式的定量测量 | 研究人类视网膜类器官的发育和疾病 | 人类多能干细胞生成的视网膜类器官和主要成年的视网膜组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 基因组数据和空间分割的细胞核数据 | 时间序列数据集和主要成人视网膜组织 |
| 10651 | 2024-08-04 |
IL-33 Expression Is Lower in Current Smokers at both Transcriptomic and Protein Levels
2023-11-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202210-1881OC
PMID:37708400
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研究论文 | 这项研究探讨吸烟状态对IL-33表达的影响。 | 本研究首次显示吸烟会导致IL-33在转录组和蛋白水平上的减少，特别是在当前吸烟者中。 | 研究主要集中在COPD患者身上，可能不适用于其他疾病。 | 了解吸烟状态如何影响IL-33的表达情况。 | 研究对象为肺气道中的IL-33表达水平和吸烟状态。 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | RNA-seq, 西方印迹分析, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 生物组织样本 | 涉及八个独立的转录组研究和来自COPD患者的肺组织样本 |
| 10652 | 2024-08-05 |
Construction of Prediction Model for Atrial Fibrillation with Valvular Heart Disease Based on Machine Learning
2022-Jul, Reviews in cardiovascular medicine
IF:1.9Q3
DOI:10.31083/j.rcm2307247
PMID:39076905
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研究论文 | 本研究探讨了瓣膜性心脏病进展的分子机制并提供了房颤-瓣膜性心脏病的候选治疗靶点 | 使用机器学习方法筛选了与AF-VHD相关的核心基因，为房颤的生物标志物和治疗靶点提供了新的见解 | 未提及具体的样本特征和临床数据的多样性 | 探讨瓣膜性心脏病进展的分子机制 | 重点分析与房颤-瓣膜性心脏病相关的核心基因 | 机器学习 | 房颤 | RNA微阵列分析、机器学习、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 819个差异表达基因 |
| 10653 | 2024-08-05 |
The history and advances in cancer immunotherapy: understanding the characteristics of tumor-infiltrating immune cells and their therapeutic implications
2020-08, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-020-0488-6
PMID:32612154
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评论 | 本文回顾了癌症免疫治疗的历史和最新进展，重点关注肿瘤浸润免疫细胞的特征及其治疗意义 | 本文强调了单细胞技术在全面分析肿瘤微环境中的应用，提供了肿瘤浸润免疫细胞功能多样性的见解 | 肿瘤微环境的高度异质性和动态特性阻碍了对肿瘤内免疫细胞的精确解析 | 阐明肿瘤浸润免疫细胞的特征并探讨其对癌症免疫治疗的影响 | 肿瘤浸润免疫细胞及其在癌症免疫治疗中的作用 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 10654 | 2024-08-05 |
Unveiling functional heterogeneity in breast cancer multicellular tumor spheroids through single-cell RNA-seq
2020-07-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-69026-7
PMID:32728097
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研究论文 | 本研究揭示了乳腺癌多细胞肿瘤球体中的功能异质性 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了不同细胞亚型之间的功能关系及其对肿瘤发展的促进作用 | 研究仅限于MCF7多细胞肿瘤球体模型，可能不适用于所有类型的乳腺癌 | 研究肿瘤细胞亚群间的功能关系及其在肿瘤进展中的作用 | 乳腺癌细胞系MCF7的多细胞肿瘤球体 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | MCF7多细胞肿瘤球体的单细胞样本，两个时间点的分析 |
| 10655 | 2024-08-05 |
Prototypical pacemaker neurons interact with the resident microbiota
2020-07-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1920469117
PMID:32647059
|
研究论文 | 本研究识别和功能性表征了基底多细胞生物中的原型节律神经元，阐明了其与微生物之间的相互作用 | 识别了原型节律神经元表达丰富的免疫相关基因，并提出了节律神经元进化起源的新模型 | 对节律神经元及其与微生物相互作用的了解仍然有限 | 旨在探讨节律神经元的进化起源及其与微生物的相互作用 | 基底多细胞生物中的原型ANO/SCN/TRPM离子通道表达的节律细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学、免疫化学和功能实验 | NA | NA | NA |
| 10656 | 2024-08-05 |
Meta-Analysis of Leukocyte Diversity in Atherosclerotic Mouse Aortas
2020-07-17, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.120.316903
PMID:32673538
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meta-analysis | 这项综合性荟萃分析确认了动脉粥样硬化小鼠主动脉中的四种已知巨噬细胞亚群，并识别出一种新型巨噬细胞亚群 | 本研究识别出一种类似腔巨噬细胞的新型巨噬细胞亚群，并揭示了一些长期存在的争议 | 本研究克服了个别研究因实验方法而造成的某些细胞群体的过度或不足表示 | 分析动脉粥样硬化小鼠主动脉中的白细胞多样性 | 动脉粥样硬化小鼠主动脉中的免疫细胞群体 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、质量细胞术 | NA | RNA序列数据、细胞表面表型数据 | 9个单细胞RNA测序研究和2个质量细胞术研究 |
| 10657 | 2024-08-05 |
CD70 expression determines the therapeutic efficacy of expanded human regulatory T cells
2020-07-14, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-1097-8
PMID:32665635
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研究论文 | 本文揭示了CD70表达对扩展人类调节性T细胞（Tregs）治疗效果的影响 | 发现经过长期体外刺激后，人类Tregs表现出稳定的CD70表达，而CD27表达减少，这显著影响其调节功能 | 研究主要集中于体外实验，临床应用尚需进一步验证 | 探讨CD70在调节性T细胞治疗中的作用 | 扩展的人类调节性T细胞及其对常规T细胞的共刺激能力 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 人类外周血中的调节性T细胞 |
| 10658 | 2024-08-05 |
Analysis of single-cell RNAseq identifies transitional states of T cells associated with hepatocellular carcinoma
2020-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.133
PMID:32659053
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研究论文 | 该文章分析了与肝细胞癌相关的T细胞过渡状态的单细胞RNAseq数据 | 文章揭示了T细胞功能耗竭的渐进过程及其基因表达特征，提供了免疫治疗的新见解 | 研究主要基于手术切除样本，可能无法完全代表所有HCC患者的T细胞状态 | 探讨肝细胞癌患者T细胞亚群的多样性及其在肿瘤免疫环境中的作用 | 研究对象为235例手术切除的肝细胞癌患者的样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 235例肝细胞癌患者的手术切除样本 |
| 10659 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of human embryos reveals diverse patterns of aneuploidy and mosaicism
2020-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.262774.120
PMID:32641298
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研究论文 | 本研究通过单细胞基因组数据分析人类胚胎中的非整倍体和镶嵌体的多样性模式 | 首次利用单细胞RNA测序数据对人类胚胎中的镶嵌非整倍体进行广泛量化分析 | 研究依赖于已发表的单细胞RNA测序数据，可能无法全面代表所有胚胎情况 | 量化人类胚胎中的非整倍体和镶嵌体现象 | 74个人类胚胎，从囊胚阶段到晚期筛选的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 74个人类胚胎 |
| 10660 | 2024-08-05 |
FB5P-seq: FACS-Based 5-Prime End Single-Cell RNA-seq for Integrative Analysis of Transcriptome and Antigen Receptor Repertoire in B and T Cells
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.00216
PMID:32194545
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研究论文 | 介绍了一种名为FB5P-seq的基于FACS的单细胞RNA序列技术，用于分析B细胞和T细胞的转录组及抗原受体库 | FB5P-seq是一种新颖的、经济高效的单细胞RNA-seq方法，能够实现转录组和成对的BCR或TCR库的综合分析 | NA | 本研究旨在通过新方法分析适应性免疫系统中的B细胞和T细胞的转录组和抗原受体 | 研究对象为表型定义的B细胞和T细胞亚群 | 数字病理学 | NA | FB5P-seq | NA | 转录组数据 | 应用于人类扁桃体B细胞亚群和外周血抗原特异性CD4 T细胞 |