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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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10621 | 2024-08-04 |
Landscape of Epstein-Barr virus gene expression and perturbations in cancer
2024-Feb-02, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3911441/v1
PMID:38352479
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研究论文 | 该文章研究了EB病毒在癌症中的基因表达及其扰动 | 首次识别出RPMS1非编码RNA通过干扰素反应的破坏支持癌细胞特性 | 研究中未详细探讨癌细胞和健康细胞的具体环境交互 | 探索EB病毒在癌症中的基因表达及其对癌细胞特性的影响 | 研究与EB病毒相关的肿瘤及其细胞特性 | 数字病理学 | NA | 长读长单分子测序 | NA | 转录组数据 | 通过单细胞测序分离了来自同一组织活检的癌细胞和健康细胞 |
10622 | 2024-08-04 |
Integrated analyses of single-cell transcriptome and Mendelian randomization reveal the protective role of FCRL3 in multiple sclerosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1428962
PMID:39076991
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和孟德尔随机化分析,发现FCRL3在多发性硬化中的保护作用 | 创新点在于整合了单细胞转录组和孟德尔随机化分析来寻找MS的新治疗靶点 | 本文未提及具体的实验验证或临床试验数据 | 发现多发性硬化的新治疗靶点 | 对FCRL3在多发性硬化中的作用进行分析 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序,孟德尔随机化 | NA | 基因组数据,单细胞转录组数据 | 收集了1123个在七种外周细胞类型中观察到的表达变化 |
10623 | 2024-08-04 |
Methazolamide Can Treat Atherosclerosis by Increasing Immunosuppressive Cells and Decreasing Expressions of Genes Related to Proinflammation, Calcification, and Tissue Remodeling
2024, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2024/5009637
PMID:39081633
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研究论文 | 本研究探讨了美唑胺通过增加免疫抑制细胞和减少与炎症、钙化及组织重塑相关基因表达来治疗动脉粥样硬化的机制 | 首次将美唑胺的治疗机制与动脉粥样硬化发病机制结合起来,揭示了其在免疫调节方面的作用 | 研究主要基于小鼠模型,临床相关性尚待进一步验证 | 探讨美唑胺在动脉粥样硬化治疗中的作用及其机制 | 使用ApoE-/-小鼠建立的动脉粥样硬化动物模型 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 单细胞测序 | NA | 生物样本数据 | ApoE-/-小鼠,数量未具体提及 |
10624 | 2024-08-04 |
Elucidating the multifaceted role of MGAT1 in hepatocellular carcinoma: integrative single-cell and spatial transcriptomics reveal novel therapeutic insights
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1442722
PMID:39081317
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研究论文 | 本研究探讨了糖基转移酶相关基因在肝细胞癌中的作用,提供了新的免疫治疗见解 | 利用单细胞和空间转录组学结合的技术揭示了MGAT1作为潜在免疫治疗靶点的创新潜力 | 未提供特定的研究限制信息 | 探讨糖基转移酶基因在肝细胞癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响 | 肝细胞癌中不同细胞亚群及其糖基转移酶基因的活性 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学和空间转录组学 | NA | RNA-seq | 未提供特定样本数量信息 |
10625 | 2024-08-05 |
SIGLEC15, negatively correlated with PD-L1 in HCC, could induce CD8+ T cell apoptosis to promote immune evasion
2024, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2024.2376264
PMID:38988824
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研究论文 | 本研究探讨了SIGLEC15在肝细胞癌中的功能角色及其对免疫逃逸的影响 | 发现SIGLEC15在肝细胞癌组织中增加,并与PD-L1呈负相关,以促进免疫逃逸 | 未能直接影响肿瘤增殖的机制尚不完全清楚 | 阐明SIGLEC15在肝细胞癌中的作用及其如何促进免疫逃逸 | 主要研究肝细胞癌中的SIGLEC15表达及其对CD8+ T细胞的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | PCR分析、免疫组化、流式细胞术、RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本、RNA序列数据 | 使用了HCC样本和小鼠模型的多种细胞系及单细胞样本 |
10626 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies downregulated phosphodiesterase 8B as a novel oncogene in IDH-mutant glioma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1427200
PMID:38989284
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,识别下调的磷酸二酯酶8B为IDH突变胶质瘤中的新型癌基因 | 本研究首次阐明磷酸二酯酶8B在高等级胶质瘤中的独特表达模式,并揭示其作为代谢相关癌基因的双重角色 | 研究主要集中在胶质瘤的代谢通路和基因表达,未深入分析其他可能影响结果的因素 | 本研究旨在揭示不同等级胶质瘤的细胞和代谢特征 | 研究对象是高等级(胶质母细胞瘤,WHO IV级)和低等级(少突胶质瘤,WHO II级)胶质瘤 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 包括多个胶质瘤细胞类型的样本,具体样本量未提供 |
10627 | 2024-08-04 |
PGF2α signaling drives fibrotic remodeling and fibroblast population dynamics in mice
2023-Dec-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172977
PMID:37934604
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研究论文 | 本研究探讨了PGF2α信号传导在小鼠中驱动纤维化重塑和成纤维细胞群体动态的作用 | 本研究机制性地识别了在特发性肺纤维化中一个易感的成纤维细胞亚群,并确认了PGF2α信号转导在该病中的作用 | 未明确提及具体的临床实验数据或人类样本验证 | 探讨PGF2α及其受体在特发性肺纤维化发病机制中的作用 | 使用带有呼吸表面活性蛋白C基因突变的小鼠模型 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 使用了多个IER-SftpcI73T小鼠样本及其交叉品系的对照组 |
10628 | 2024-08-04 |
A Universal Method for Crossing Molecular and Atlas Modalities using Simplex-Based Image Varifolds and Quadratic Programming
2023-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.28.534622
PMID:37034802
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研究论文 | 本文阐明了一种在分子尺度转录组学和组织尺度图谱之间建立对应关系的解决方案 | 提出了一种通用算法,通过交替优化LDDMM和二次规划方法,解决坐标和潜在转录特征分数的最小化几何形状的变换 | NA | 研究目的在于结合分子和细胞数据,创建一个统一的坐标系统 | 主要涉及分子尺度转录组学数据和组织尺度图谱数据 | 数字病理学 | NA | LDDMM优化与二次规划 | NA | 转录组学数据 | NA |
10629 | 2024-08-05 |
DUSP6 mediates resistance to JAK2 inhibition and drives leukemic progression
2023-01, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-022-00486-8
PMID:36581736
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研究论文 | 本研究揭示DUSP6在髓系恶性肿瘤转化中的作用及其作为潜在治疗靶点的价值 | 发现DUSP6的异常表达与疾病转化相关,且DUSP6-RSK1通路可作为药物靶点 | 未详细探讨DUSP6在不同患者中的具体作用机制 | 探索DUSP6在髓系恶性肿瘤和急性髓性白血病转化中的角色 | 靶向DUSP6 的治疗效果及其在患者衍生的异种移植模型中的作用 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | PDX模型 | 基因表达数据 | 多名患者的骨髓干细胞和祖细胞 |
10630 | 2024-08-05 |
Mesenchymal cell replacement corrects thymic hypoplasia in murine models of 22q11.2 deletion syndrome
2022-11-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI160101
PMID:36136514
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研究论文 | 该文章探讨了在22q11.2缺失综合症小鼠模型中,间充质细胞替代如何纠正胸腺发育不良的机制。 | 发现间充质细胞是造成22q11.2缺失综合症小鼠模型中胸腺发育不良的原因,并通过正常间充质细胞替代进行纠正。 | 没有提到该研究的具体局限性 | 研究22q11.2缺失综合症导致的胸腺发育不良的分子基础及其纠正方法。 | 使用22q11.2缺失综合症的小鼠模型作为研究对象。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括小鼠模型的胚胎胸腺 |
10631 | 2024-08-05 |
Controlled Cycling and Quiescence Enables Efficient HDR in Engraftment-Enriched Adult Hematopoietic Stem and Progenitor Cells
2020-09-01, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108093
PMID:32877675
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研究论文 | 本文研究了通过控制细胞周期和静止状态来提高成年造血干细胞和祖细胞中同源重组修复效率的方法 | 提出了一种控制循环和静止状态的策略,使得静息干细胞中HDR与NHEJ的比率增加了6倍 | 文章中未具体说明对所有类型细胞的影响,主要集中在特定亚群体 | 探讨并重新编程成年造血干细胞和祖细胞中的基因组编辑结果 | 成年造血干细胞和祖细胞的亚群体 | 数字病理学 | NA | 下一代测序、单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | NA |
10632 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Six Subpopulations Reflecting Distinct Cellular Fates in Senescent Mouse Embryonic Fibroblasts
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00867
PMID:32849838
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了衰老小鼠胚胎成纤维细胞的六个亚群,揭示了不同的细胞命运。 | 本研究首次在衰老的小鼠胚胎成纤维细胞中识别出六个具有明显异质性的亚群,并发现HOXD8是新的衰老调控因子。 | 该研究主要基于小鼠模型,其结果可能不完全适用于其他物种或人类。 | 本研究旨在深入了解衰老小鼠胚胎成纤维细胞中的细胞异质性及其衰老机制。 | 研究对象为衰老小鼠胚胎成纤维细胞。 | 数字病理学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个衰老小鼠胚胎成纤维细胞 |
10633 | 2024-08-05 |
Reparative effects after low-dose radiation exposure: Inhibition of atherosclerosis by reducing NETs release
2024-Oct-15, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2024.174540
PMID:38977089
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研究论文 | 该研究探讨了低剂量辐射如何通过减少 NETs 释放来抑制动脉粥样硬化。 | 首次探讨了低剂量辐射对心血管系统的影响及其抑制动脉粥样硬化的机制。 | 研究中未涉及不同剂量辐射的长期影响及其在临床中的应用。 | 研究低剂量辐射对动脉粥样硬化的影响机制。 | 研究对象为接受低剂量辐射和高脂饮食的动物模型。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 酶联免疫吸附测定法(ELISA) | NA | 组学数据 | 高脂饮食下的动物模型 |
10634 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing reveals LRRc17-mediated modulation of cardiac fibroblast ferroptosis in regulating myocardial fibrosis after myocardial infarction
2024-Sep, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111293
PMID:38996956
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研究论文 | 本研究揭示了LRRc17在心脏成纤维细胞中介导铁死亡调节心肌梗死后心肌纤维化的作用 | 首次阐明了LRRc17在心肌梗死后心脏成纤维细胞铁死亡调节中的具体作用 | 本研究仅集中于特定基因LRRc17,可能忽视其他影响心肌纤维化的因子 | 探讨心肌梗死后心肌纤维化的发病机制,并寻找治疗靶点 | 心脏成纤维细胞(CFs),特别关注LRRc17对铁死亡的调节 | 数字病理学 | 心肌梗死 | RNA测序,qRT-PCR,Western blotting,Masson染色,细胞活力测定(CCK-8) | 体内外心肌梗死模型 | 基因表达数据 | NA |
10635 | 2024-08-05 |
Cellular and molecular landscape of primary dermatofibrosarcoma protuberans: Insights from single-cell RNA sequencing analysis
2024-Aug, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15121
PMID:39081004
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研究论文 | 这项研究利用单细胞 RNA 测序分析了原发性皮肤纤维肉瘤的细胞和分子特征。 | 研究揭示了原发性皮肤纤维肉瘤的细胞异质性及其分子机制,并建议了潜在的治疗靶点。 | 研究可能受到样本数量和特定细胞类型的限制。 | 研究疾病皮肤纤维肉瘤的细胞和分子特征,以了解其生物学行为。 | 主要研究皮肤纤维肉瘤中的细胞群体及其相互作用。 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞 RNA 测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
10636 | 2024-08-05 |
MiR-425-5p suppression of Crebzf regulates oocyte aging via chromatin modification
2024-08, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-00875-6
PMID:37532927
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研究论文 | 本研究探讨了miR-425-5p如何通过调节克雷布兹(Crebzf)来影响卵母细胞衰老 | 提出了miR-425-5p作为治疗女性不孕症的新潜力,并揭示了其通过调控组蛋白甲基转移酶mRNAs的机制 | 本文未提及具体的样本量和长期影响的研究 | 研究miR-425-5p在卵母细胞衰老中的作用及其潜在的治疗应用 | 聚焦于老年女性的卵母细胞及其衰老机制 | NA | 女性不孕 | 高通量测序和单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | NA |
10637 | 2024-08-05 |
The single-cell transcriptomic landscape of the topological differences in mammalian auditory receptors
2024-Jul-29, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2672-1
PMID:39083201
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研究论文 | 研究揭示了哺乳动物听觉受体中单细胞转录组的拓扑差异 | 首次确定了内毛细胞和外毛细胞的独特分子特征,以及与音调相关的新基因 | 研究主要集中在小鼠模型中,可能不完全适用于人类 | 探索哺乳动物毛细胞的声音频率选择和其分子基础 | 哺乳动物内毛细胞和外毛细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了不同位置的内外毛细胞样本 |
10638 | 2024-08-05 |
Detecting novel cell type in single-cell chromatin accessibility data via open-set domain adaptation
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae370
PMID:39073828
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研究论文 | 本文介绍了一种名为OVAAnno的自动细胞类型注释方法,能够在单细胞ATAC-seq数据中检测未知细胞类型 | 提出了利用开放集领域适应的技术来检测在训练集中不存在的未知细胞类型 | 未提及具体的局限性 | 研究如何在单细胞数据中进行细胞类型注释,尤其是检测未知类型 | 单细胞ATAC-seq和scRNA-seq数据中的细胞类型 | 计算机视觉 | NA | 开放集领域适应 | NA | 单细胞ATAC-seq和scRNA-seq数据 | NA |
10639 | 2024-08-05 |
CD106 in Tumor-Specific Exhausted CD8+ T Cells Mediates Immunosuppression by Inhibiting TCR Signaling
2024-Jul-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0453
PMID:38635899
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研究论文 | 本研究发现CD106在肿瘤特异性耗尽的CD8+ T细胞中特别表达,并通过抑制TCR信号传导介导免疫抑制 | 揭示了CD106在肿瘤微环境中耗尽的CD8+ T细胞中的免疫抑制作用,并提出其作为癌症免疫治疗的潜在生物标志物和治疗靶点 | NA | 探讨CD106在肿瘤微环境中对CD8+ T细胞免疫抑制的作用机制 | CD8+ T细胞及其在肿瘤微环境中的表达和功能 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床样本 | NA |
10640 | 2024-08-05 |
Deafness DFNB128 Associated with a Recessive Variant of Human MAP3K1 Recapitulates Hearing Loss of Map3k1-Deficient Mice
2024-Jun-27, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15070845
PMID:39062623
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研究论文 | 本研究描述了一种与人类MAP3K1隐性变体相关的耳聋DFNB128,以及其与耳聋小鼠模型的相似性 | 首次识别了与非综合征性耳聋相关的新型隐性变体,并显示了其在小鼠耳蜗的表达 | 仅在一个巴基斯坦家族中进行研究,样本量有限 | 探索与隐性耳聋相关的新变体以及其机制 | 巴基斯坦的一个亲属家族,其中有两个兄弟姐妹出现非综合征性耳聋 | 数字病理学 | 耳聋 | 微阵列和外显子测序 | 基因缺失小鼠模型 | 转录组数据 | 一个家族的多个成员,其中两名兄弟姐妹受到影响 |