单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 10621 - 10640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10621 | 2025-10-07 |
Pseudo-Label Guided Structural Discriminative Subspace Learning for Unsupervised Feature Selection
2024-Dec, IEEE transactions on neural networks and learning systems
IF:10.2Q1
DOI:10.1109/TNNLS.2023.3319372
PMID:37796670
|
研究论文 | 提出一种名为伪标签引导结构判别子空间学习的无监督特征选择方法 | 将概率图构建引入特征选择学习过程作为统一框架，并提出伪标签引导学习机制结合基于图的方法和类间散布矩阵最大化思想 | 需要解决NP难问题，存在参数确定和计算复杂度挑战 | 开发更有效的无监督特征选择方法 | 九个真实世界数据集和三个单细胞RNA测序基因数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 子空间学习模型 | 基因表达数据 | 12个数据集（9个通用数据集+3个scRNA-seq数据集） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 10622 | 2025-10-07 |
Genetic variation and molecular profiling of congenital malformations of the female genital tract based on whole-genome sequencing
2024-11, World journal of pediatrics : WJP
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s12519-024-00839-6
PMID:39251565
|
研究论文 | 通过全基因组测序分析女性生殖道先天性畸形的遗传变异和分子特征 | 发现了7个新发拷贝数变异、12个罕见单核苷酸变异和10个罕见3'UTR突变，首次确定ASH1L为致病基因 | 样本量相对有限，主要基于中国人群数据 | 探索女性生殖道先天性畸形的遗传病因和分子机制 | 590名中国个体（95名患者、442名病例对照和53名家族对照） | 基因组学 | 女性生殖道先天性畸形 | 全基因组测序, 单细胞测序 | NA | 基因组数据, 单细胞表达数据 | 590名个体 | NA | 全基因组测序, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10623 | 2025-10-07 |
Joint trajectory inference for single-cell genomics using deep learning with a mixture prior
2024-Sep-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2316256121
PMID:39226366
|
研究论文 | 提出一种基于深度学习和混合先验的统计方法VITAE，用于单细胞基因组数据的轨迹推断 | 将潜在层次混合模型与变分自编码器相结合，实现同时轨迹推断和数据整合，并提供细胞投影的不确定性量化 | NA | 开发更准确可靠的单细胞轨迹推断方法 | 单细胞测序数据中的细胞发育轨迹 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器(VAE), 层次混合模型 | 单细胞基因组数据 | 三个小鼠新皮质单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学 | NA | NA |
| 10624 | 2025-10-07 |
Acyl-coenzyme a binding protein (ACBP) - a risk factor for cancer diagnosis and an inhibitor of immunosurveillance
2024-Sep-06, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02098-5
PMID:39242519
|
研究论文 | 本研究探讨了酰基辅酶A结合蛋白(ACBP/DBI)作为癌症风险因子和免疫监视抑制剂的作用 | 首次发现ACBP/DBI可作为癌症发展的风险预测因子，并证明其中和抗体能增强化疗免疫疗法的疗效 | 研究主要基于临床前模型，需要进一步的人体临床试验验证 | 探究ACBP/DBI在癌症发展和免疫监视中的作用机制 | 癌症患者、遗传性癌症易感人群、小鼠癌症模型 | 癌症免疫学 | 肺癌、乳腺癌、肉瘤 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质浓度数据、基因表达数据 | 癌症患者、遗传易感人群和健康对照群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10625 | 2025-10-07 |
Modulation of blood-tumor barrier transcriptional programs improves intra-tumoral drug delivery and potentiates chemotherapy in GBM
2024-Aug-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.26.609797
PMID:39253453
|
研究论文 | 本研究通过识别血脑肿瘤屏障的12基因特征并开发BIA纳米颗粒制剂，改善了胶质母细胞瘤的化疗药物递送效率 | 首次发现CDH5作为血脑肿瘤屏障核心分子，开发具有双重功能的BIA衍生物既能破坏屏障又能增强化疗效果 | 研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证 | 改善胶质母细胞瘤化疗药物的肿瘤内递送效率 | 胶质母细胞瘤血管系统、血脑肿瘤屏障、内皮细胞单层和3D球体模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学、纳米颗粒制剂 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 胶质母细胞瘤患者标本、荷瘤小鼠模型、患者来源的胶质母细胞瘤异种移植模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10626 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis identifies distinct CD4+ T cells associated with the pathobiology of pediatric obesity-related asthma
2024-Aug-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.13.607447
PMID:39211259
|
研究论文 | 通过单细胞分析识别与儿童肥胖相关哮喘病理生物学相关的不同CD4+ T细胞亚型 | 首次在单细胞水平揭示肥胖哮喘中特定CD4+ T细胞亚群的CDC42上调、Th1炎症和类固醇耐药性特征 | 未明确说明样本量大小和研究人群的具体特征 | 探索儿童肥胖相关哮喘中CD4+ T细胞亚型的分子特征及其与疾病表型的关系 | 儿童肥胖相关哮喘患者的CD4+ T细胞 | 单细胞转录组学 | 哮喘 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10627 | 2025-10-07 |
Emerging advances in defining the molecular and therapeutic landscape of small-cell lung cancer
2024-Aug, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-024-00914-x
PMID:38965396
|
综述 | 全面概述小细胞肺癌的分子特征和新兴治疗策略的最新进展 | 首次系统总结基于四种转录因子表达状态的SCLC分子分型，并整合单细胞RNA测序揭示肿瘤异质性与治疗耐药性的关联 | 缺乏有效生物标志物用于患者选择，且面临治疗耐药性快速发展的挑战 | 改善小细胞肺癌患者预后的治疗策略开发 | 小细胞肺癌的分子特征和治疗方法 | 肿瘤学 | 小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序，基因组评估，转录组分析 | NA | 基因组数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10628 | 2025-10-07 |
Letter to editor: single-cell transcriptome analysis upon ECM-remodeling meningioma cells of published cases
2024-Apr-02, Neurosurgical review
IF:2.5Q1
DOI:10.1007/s10143-024-02375-3
PMID:38561568
|
comments | 对已发表的ECM重塑脑膜瘤细胞单细胞转录组分析研究进行细致评估 | 强调需要更全面地考虑肿瘤异质性和微环境影响，指出ECM重塑研究可能忽略其他关键肿瘤生物学方面 | 存在数据解读和验证的挑战，ECM重塑研究可能无意中忽视肿瘤生物学的其他关键方面 | 评估ECM重塑脑膜瘤细胞的单细胞转录组分析研究 | 已发表的ECM重塑脑膜瘤细胞研究 | digital pathology | meningioma | single-cell transcriptome analysis | NA | transcriptome data | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 10629 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis upon ECM-remodeling meningioma cells
2024-Mar-16, Neurosurgical review
IF:2.5Q1
DOI:10.1007/s10143-024-02349-5
PMID:38491247
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究ECM重塑脑膜瘤细胞的转录特征和生物学特性 | 首次在单细胞水平系统研究ECM重塑脑膜瘤细胞的转录特征，发现其主要分布于脑-肿瘤界面且恶性程度较低 | NA | 研究ECM重塑脑膜瘤细胞的转录组特征和生物学特性 | 脑膜瘤细胞 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10630 | 2025-10-07 |
Single-cell resolution of MET- and EMT-like programs in osteoblasts during zebrafish fin regeneration
2022-Feb-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103784
PMID:35169687
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究斑马鱼尾鳍再生过程中成骨细胞的MET和EMT样程序 | 首次在单细胞分辨率下揭示成骨祖细胞中EMT和MET相关程序的共存，并发现剪接调控因子在骨再生过程中的表达 | 研究仅限于斑马鱼模型，需要进一步验证在哺乳动物系统中的普适性 | 阐明斑马鱼鳍再生过程中成骨细胞的转录程序 | 斑马鱼尾鳍再生过程中的成骨细胞和成骨祖细胞 | 单细胞生物学 | 组织再生 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼尾鳍再生过程中的成骨细胞群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10631 | 2025-10-07 |
RNA research for drug discovery: Recent advances and critical insight
2025-May-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149342
PMID:39983851
|
综述 | 本文探讨RNA研究在药物开发领域的最新进展、历史转折点及其在新型疗法开发中的关键意义 | 系统梳理了反义寡核苷酸、mRNA疗法和RNA干扰等突破性技术，强调高通量测序和单细胞RNA测序等技术对揭示RNA生物学复杂性的贡献 | RNA稳定性、递送系统和脱靶效应等挑战仍需持续创新和伦理考量 | 评估RNA研究的现状和前景，强调其在药物发现中的变革潜力 | RNA相关技术及其在治疗应用中的相互作用 | 自然语言处理 | NA | 高通量测序, 单细胞RNA测序, 表观转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10632 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell RNA sequencing and network pharmacology to elucidate the effect of Yantiao Formula on alleviating ALI by regulating the polarization of alveolar macrophages
2025-Mar-13, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.119436
PMID:39914692
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和网络药理学方法，探讨验条方通过调节肺泡巨噬细胞极化缓解脓毒症诱导急性肺损伤的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序、网络药理学和分子对接技术系统研究验条方治疗急性肺损伤的多成分-多靶点作用机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，临床验证尚需进一步研究 | 探索验条方治疗脓毒症诱导急性肺损伤的潜在分子机制 | 验条方化学成分、脓毒症诱导急性肺损伤小鼠模型、NR8383细胞 | 生物信息学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, 网络药理学, 分子对接, 免疫组织化学, UPLC | NA | 基因表达数据, 化学组分数据 | NA | Waters | UPLC, 单细胞RNA测序 | ACQUITY UPLC I-Class | ACQUITY UPLC I-Class系统用于化学成分表征 |
| 10633 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing in autoimmune diseases: New insights and challenges
2025-Mar, Pharmacology & therapeutics
IF:12.0Q1
DOI:10.1016/j.pharmthera.2025.108807
PMID:39894174
|
综述 | 本文探讨单细胞RNA测序技术在自身免疫性疾病研究中的应用与挑战 | 系统阐述scRNA-seq如何揭示自身免疫性疾病中细胞异质性和细胞通讯网络的新机制 | 需要解决scRNA-seq技术本身的局限性才能实现进一步突破 | 研究单细胞RNA测序在自身免疫性疾病中的潜在应用价值 | 自身免疫性疾病相关的各类细胞类型 | 单细胞组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 10634 | 2025-10-07 |
IL-1β and associated molecules as prognostic biomarkers linked with immune cell infiltration in colorectal cancer: an integrated statistical and machine learning approach
2025-Feb-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01989-3
PMID:40019680
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法，识别结直肠癌中与免疫细胞浸润相关的预后生物标志物 | 开发了结合统计分析和机器学习的综合流程，首次系统鉴定IL-1β等关键基因作为结直肠癌诊断和预后的生物标志物 | 基于公开数据集的分析，需要实验验证；样本来源和数量未明确说明 | 开发结直肠癌诊断和预后生物标志物识别方法 | 结直肠癌患者基因表达数据和临床数据 | 机器学习 | 结直肠癌 | scRNA-seq, 启动子甲基化分析, 基因表达分析 | KNN, ANN, 随机森林 | 基因表达数据, 甲基化数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10635 | 2025-10-07 |
Decoding melanoma's cellular mosaic to unlock immunotherapy potential
2025-Feb-28, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2025.01.009
PMID:40023663
|
综述 | 本文探讨单细胞多组学技术如何揭示皮肤黑色素瘤的细胞异质性及其对免疫治疗耐药机制的影响 | 通过单细胞多组学技术系统性解析黑色素瘤中癌细胞与微环境细胞的复杂互作网络 | NA | 阐明黑色素瘤细胞异质性对免疫治疗应答的影响机制 | 皮肤黑色素瘤的肿瘤细胞和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序, 空间多组学 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10636 | 2025-10-07 |
SpaceBar enables clone tracing in spatial transcriptomic data
2025-Feb-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637514
PMID:39990434
|
研究论文 | 开发了一种名为SpaceBar的空间条形码技术，能够在空间转录组数据中同时进行克隆追踪和基因表达分析 | 提出结合96种合成条形码序列与成像空间转录组技术(seqFISH)的新方法，实现克隆身份识别与空间基因表达的同时分析 | 目前仅在小鼠黑色素瘤异种移植模型中验证，尚未在其他肿瘤类型或更复杂组织中测试 | 开发能够在复杂组织环境中区分克隆动态与环境驱动转录调控的分析框架 | 黑色素瘤细胞和小鼠肿瘤异种移植模型 | 空间转录组学 | 黑色素瘤 | 成像空间转录组技术(seqFISH), 细胞条形码标记 | NA | 空间转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞分析 | NA | seqFISH (顺序荧光原位杂交) 空间转录组技术 |
| 10637 | 2025-10-07 |
Spatially distinct cellular and molecular landscapes define prognosis in triple negative breast cancer
2025-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637503
PMID:39990419
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析三阴性乳腺癌不同预后患者的肿瘤异质性 | 首次利用空间转录组学深入揭示三阴性乳腺癌不同预后的细胞和分子基础 | 回顾性研究，样本量有限（32例患者） | 探索三阴性乳腺癌不同预后的空间和分子异质性机制 | 三阴性乳腺癌患者的FFPE组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，免疫荧光，细胞类型反卷积，空间熵分析，功能富集分析 | 卷积神经网络 | 空间转录组数据，图像数据 | 32例初治女性患者（17例良好预后，15例不良预后） | NanoString | 空间转录组学 | GeoMX Digital Spatial Profiler | GeoMx人类全转录组图谱面板 |
| 10638 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics of X-ray irradiated Drosophila wing discs reveals heterogeneity related to cell-cycle status and cell location
2025-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627868
PMID:39990483
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组技术分析X射线辐射对果蝇翅盘细胞的影响，揭示了与细胞周期状态和细胞位置相关的异质性 | 首次将用于研究市场集中度的赫芬达尔-赫希曼指数应用于基因表达异质性分析，并发现辐射诱导基因表达在区域间和区域内均存在显著异质性 | 研究仅限于果蝇翅盘这一相对简单的组织模型，结果可能不适用于更复杂的哺乳动物组织 | 探究X射线辐射对组织细胞异质性的影响机制 | 果蝇翅盘细胞 | 单细胞转录组学 | 辐射损伤 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10639 | 2025-10-07 |
Molecularly-guided spatial proteomics captures single-cell identity and heterogeneity of the nervous system
2025-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637505
PMID:39990460
|
研究论文 | 本研究利用空间单细胞蛋白质组学技术探索神经系统细胞身份和异质性 | 首次将免疫染色引导的激光捕获显微切割与LC-MS结合，应用于异质性中枢神经系统的空间单细胞蛋白质组学研究 | 研究主要聚焦于特定脑区域和损伤模型，尚未扩展到更广泛的神经系统疾病 | 开发和应用空间单细胞蛋白质组学方法以理解神经系统生物学和神经疾病分子机制 | 大脑皮层和黑质神经元群体、刺伤损伤相关的神经免疫变化、肠肌层神经节细胞与神经束 | 空间蛋白质组学 | 神经系统疾病 | 免疫染色引导激光捕获显微切割、液相色谱-质谱联用 | NA | 蛋白质组数据 | 多个脑区域和神经组织样本 | NA | 空间单细胞蛋白质组学、激光捕获显微切割 | LCM、LC-MS | 免疫染色引导激光捕获显微切割与液相色谱-质谱联用技术 |
| 10640 | 2025-10-07 |
A Benchmarking Study of Random Projections and Principal Components for Dimensionality Reduction Strategies in Single Cell Analysis
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.04.636499
PMID:39974925
|
研究论文 | 系统评估主成分分析和随机投影在单细胞RNA测序数据降维中的性能比较 | 首次对PCA和RP方法在单细胞分析中进行全面基准测试，包括计算效率和下游分析效果的多维度评估 | 仅评估了线性降维方法，未包含非线性降维技术的比较 | 比较不同降维策略在单细胞数据分析中的性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA, SVD, 随机SVD, 稀疏随机投影, 高斯随机投影 | 基因表达数据 | 多个公开可用的标记和未标记单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |