单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 10621 - 10640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10621 | 2024-08-05 |
Differential regulation by CD47 and thrombospondin-1 of extramedullary erythropoiesis in mouse spleen
2024-Jul-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92679
PMID:38979889
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研究论文 | 本研究探讨了CD47和血小板蛋白-1在小鼠脾脏外髓造血中的差异调节作用 | 揭示了CD47在限制外髓造血方面的作用以及血小板蛋白-1对成人小鼠脾脏外髓造血的基线作用 | 该研究主要基于小鼠模型，是否适用于其他物种尚需进一步验证 | 研究CD47和血小板蛋白-1在小鼠脾脏外髓造血中的调节机制 | 小鼠脾脏细胞，特别是缺乏CD47和血小板蛋白-1的小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组和流式细胞术分析 | NA | 细胞 | 涉及小鼠脾脏细胞的实验 |
| 10622 | 2024-08-05 |
Altered tumor microenvironment heterogeneity of penile cancer during progression from non-lymphatic to lymphatic metastasis
2024-Jul, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70025
PMID:39003681
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研究论文 | 本研究首次探讨了阴茎癌在从非淋巴转移到淋巴转移过程中肿瘤微环境异质性的变化 | 研究揭示了阴茎癌微环境中上皮细胞、成纤维细胞和内皮细胞之间的相互作用以及肿瘤进展和淋巴结转移中功能合作的重要性 | 研究样本量较小，仅涉及六名进行单细胞RNA测序的患者和七名进行整体RNA测序的患者 | 研究阴茎癌的肿瘤微环境如何随着从非淋巴转移到淋巴转移的进展而变化 | 六名阴茎癌患者的细胞，分别为四名淋巴转移患者（IV期）和两名非淋巴转移患者（I期） | 数字病理学 | 阴茎癌 | 单细胞RNA测序和整体RNA测序 | NA | 细胞 | 六名患者的46,861个细胞和七名患者的RNA样本 |
| 10623 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling highlights the importance of telocyte, kallikrein genes, and alternative splicing in mouse testes aging
2024-06-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-65710-0
PMID:38926537
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析揭示了小鼠睾丸衰老过程中包头细胞和卡利克林基因的重要性 | 首次探讨了睾丸包头细胞和卡利克林基因在小鼠睾丸衰老中的作用，及其细胞类型特异性的可变剪接动态 | 本研究仅基于小鼠模型，未来需要在其他物种中验证结果 | 深入理解睾丸衰老过程中的转录组变化 | 年轻和老年小鼠的睾丸单细胞 | 数字病理 | NA | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 43323个睾丸单细胞 |
| 10624 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptional analysis of irradiated skin reveals changes in fibroblast subpopulations and variability in caveolin expression
2024-Jun-26, Radiation oncology (London, England)
DOI:10.1186/s13014-024-02472-z
PMID:38926892
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录分析揭示了辐射皮肤中成纤维细胞亚群的变化及洞穴蛋白表达的变异性 | 本研究介绍了洞穴蛋白参与的一个新途径，可能对辐射损伤后的纤维化发展有贡献 | 当前研究的样本量有限，仅包含六名患者的皮肤样本 | 研究辐射损伤后皮肤纤维化的细胞机制 | 对六名接受乳腺重建手术的女性患者的辐射和非辐射皮肤样本进行分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 6名女性患者的皮肤样本 |
| 10625 | 2024-08-05 |
Cbl and Cbl-b ubiquitin ligases are essential for intestinal epithelial stem cell maintenance
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109912
PMID:38974465
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研究论文 | 这篇文章展示了Cbl和Cbl-b泛素连接酶对肠上皮干细胞维持的重要性 | 揭示了Cbl家族泛素连接酶在调节肠上皮干细胞和分化之间平衡的作用 | 本研究主要集中在小鼠模型上，缺乏对人类肠上皮干细胞的验证 | 探讨Cbl和Cbl-b在肠上皮干细胞维持中的功能 | Lgr5+肠干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、LacZ谱系追踪 | NA | RNA数据 | NA |
| 10626 | 2024-08-05 |
SorLA restricts TNFα release from microglia to shape a glioma-supportive brain microenvironment
2024-May, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-024-00117-6
PMID:38499808
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研究论文 | 本文探讨了SorLA在胶质瘤相关小胶质细胞和巨噬细胞功能特性中的影响 | 揭示了SorLA在调节小胶质细胞释放TNFα中的作用，其对胶质瘤微环境及肿瘤进展有重要影响 | 本研究主要依赖于已发布的scRNA-seq数据和体外模型，可能限制了在临床背景下的直接适用性 | 研究SorLA如何影响胶质瘤微环境中的小胶质细胞功能 | 胶质瘤相关小胶质细胞和巨噬细胞（GAMs） | 数字病理学 | 胶质瘤 | scRNA-seq | 小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 10627 | 2024-08-05 |
ZEB1 controls a lineage-specific transcriptional program essential for melanoma cell state transitions
2024-May, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03010-7
PMID:38519642
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研究论文 | 本研究解码了ZEB1转录因子在黑色素瘤细胞状态转变中的关键作用 | 识别并验证了关键谱系特异基因的ZEB1结合峰，阐明了其在黑色素瘤细胞身份中的重要性 | 未提及具体实验的局限性 | 探讨ZEB1在黑色素瘤细胞内肿瘤异质性中的转录调控机制 | 黑色素瘤细胞模型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | ChIP-sequencing和RNA-sequencing | NA | 单细胞空间多重分析及scRNA-Seq分析 | 人类黑色素瘤样本 |
| 10628 | 2024-08-04 |
Glutamine metabolism prognostic index predicts tumour microenvironment characteristics and therapeutic efficacy in ovarian cancer
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18198
PMID:38506093
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研究论文 | 本文探讨了谷氨酰胺代谢在卵巢癌肿瘤微环境特征和治疗效果中的预测作用 | 构建了谷氨酰胺代谢预测指数（GMPI），作为卵巢癌的独立预测因子 | 尚未全面阐明谷氨酰胺代谢在肿瘤微环境中的总体角色 | 研究谷氨酰胺代谢在卵巢癌中的作用及其预测患者预后的能力 | 患者的卵巢癌及其在肿瘤微环境中的特征 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | NA |
| 10629 | 2024-08-05 |
Combining bulk and scRNA-seq to explore the molecular mechanisms governing the distinct efferocytosis activities of a macrophage subpopulation in PDAC
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18266
PMID:38501838
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研究论文 | 本研究探讨了在胰腺导管腺癌（PDAC）中不同巨噬细胞亚群的吞噬活性所涉及的分子机制。 | 首次结合大样本和单细胞RNA测序数据，揭示了PDAC中巨噬细胞亚型在吞噬过程中的活性差异及其转录因子的作用。 | 样本量虽大，但只来自于基因表达公共数据库，缺乏临床数据的交叉验证。 | 分析巨噬细胞亚群在PDAC中的作用，以提高PDAC患者的预后。 | 涉及22,124个细胞的PDAC组织样本，分析其在吞噬过程中的活性及转录因子。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞类型数据 | 8个PDAC组织样本，分析了22,124个细胞 |
| 10630 | 2024-08-05 |
Exploring the current landscape of single-cell RNA sequencing applications in gastric cancer research
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18159
PMID:38494861
|
综述 | 本文探讨了单细胞RNA测序在胃癌研究中的应用现状 | 研究单细胞RNA测序在揭示肿瘤异质性及识别潜在治疗靶点方面的重要性 | 肿瘤异质性和技术限制仍然是该领域面临的主要障碍 | 探讨单细胞RNA测序对胃癌研究的意义及其优缺点 | 胃癌的细胞群体、稀有细胞及动态转录变化 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 10631 | 2024-08-04 |
STRN3 promotes tumour growth in hepatocellular carcinoma by inhibiting the hippo pathway
2024-03, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18147
PMID:38429901
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研究论文 | 本研究发现STRN3通过抑制Hippo通路促进肝细胞癌的肿瘤生长 | 首次揭示了STRN3通过抑制Hippo通路来促进肝细胞癌肿瘤生长的机制 | 本研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据，可能存在数据来源的限制 | 旨在探究STRN3在肝细胞癌中的功能及其对肿瘤生长的影响 | 对371名肝癌患者及其肿瘤和正常组织进行了临床相关性分析 | 数字病理学 | 肝癌 | qRT-PCR, western blotting, CCK8实验, 转移实验, 流式细胞术, 单细胞测序, 免疫组化 | NA | 细胞组织样本和临床数据 | 371名肝癌患者及其组织样本 |
| 10632 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomic analysis in clear cell renal cell carcinoma: Deciphering the role of APP within the tumour microenvironment
2024-03, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18186
PMID:38445803
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研究论文 | 本研究探讨了淀粉样前体蛋白(APP)在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤微环境中的角色 | 首次运用单细胞转录组分析揭示了APP在ccRCC的肿瘤相关巨噬细胞中的表达及其与临床结果的相关性 | 需要进一步研究来验证这些发现并探讨APP的调控机制及治疗意义 | 了解淀粉样前体蛋白(APP)在ccRCC肿瘤微环境中的潜在预后生物标志物作用 | 聚焦于肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)中APP的表达及其与ccRCC患者预后的关系 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达谱 | NA |
| 10633 | 2024-08-04 |
Progress in single-cell multimodal sequencing and multi-omics data integration
2024-Feb, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-023-01092-3
PMID:38495443
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综述 | 本文总结了单细胞多模态组学数据的实验方法和多组学数据整合的计算方法 | 提出了将多种单细胞组学技术整合以获得更全面的细胞状态 | 可能没有深入探讨每种整合技术的具体应用和局限性 | 旨在探讨单细胞多模态组学及其数据整合在理解细胞状态和基因调控中的应用 | 单细胞多模态组学技术和数据整合方法 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 组学数据 | NA |
| 10634 | 2024-08-05 |
Increased blood CSF3R+ myeloid-derived suppressor cell is a predictor for breast cancer recurrence
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/MUKD2745
PMID:39005677
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研究论文 | 本研究探讨了CSF3R+骨髓来源抑制细胞（MDSCs）在乳腺癌复发中的潜在作用 | 首次确认CSF3R+ MDSCs作为预测乳腺癌复发的生物标志物 | 该研究样本量较小，仅包含35名乳腺癌患者 | 研究MDSCs在乳腺癌复发中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 乳腺癌患者中MDSCs的丰度及基因表达特征 | 数字病理学 | 乳腺癌 | NanoString分析 | 动物模型 | 血液标本 | 35名乳腺癌患者 |
| 10635 | 2024-08-05 |
Integrated pan-cancer genomic analysis reveals the role of SLC30A5 in the proliferation, metastasis, and prognosis of hepatocellular carcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.97214
PMID:39006068
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研究论文 | 本研究探讨了SLC30A5在肝细胞癌中的表达及其预后意义。 | 发现SLC30A5在多个肿瘤类型中表达上调，并与肝细胞癌的不良预后相关联。 | 研究主要集中于肝细胞癌，其他类型癌症的相关性尚需进一步验证。 | 探讨SLC30A家族基因在多种癌症中的表达及其预后影响，特别是在肝细胞癌中的作用。 | 主要研究对象为SLC30A5及其在肝细胞癌中的作用。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠异种移植模型 | 基因表达数据 | 涉及33种癌症类型的样本，Huh7细胞系用于功能实验 |
| 10636 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis Identifies Distinct Populations of Cytotoxic CD4+ T Cells Linked to the Therapeutic Efficacy of Immune Checkpoint Inhibitors in Metastatic Renal Cell Carcinoma
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S457570
PMID:39006494
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序分析了转移性肾细胞癌患者中的细胞毒性CD4+ T细胞亚群及其与免疫检查点抑制剂疗效之间的关系 | 首次揭示了转移性肾细胞癌中细胞毒性CD4+ T细胞的不同状态及其在抗肿瘤免疫中的关键作用 | 该研究的验证主要依赖于初步的多重免疫荧光染色，进一步验证需要更多的实验支持 | 探讨细胞毒性CD4+ T细胞在转移性肾细胞癌患者接受免疫检查点抑制剂治疗时的作用 | 转移性肾细胞癌患者的CD4+ T细胞亚群 | 免疫学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | 转移性肾细胞癌患者的相关数据集 |
| 10637 | 2024-08-05 |
Transcriptomic profiling of retinal cells reveals a subpopulation of microglia/macrophages expressing Rbpms marker of retinal ganglion cells (RGCs) that confound identification of RGCs
2023-07-15, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2023.148377
PMID:37121423
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了一种表达Rbpms标记的视网膜小胶质细胞/巨噬细胞亚群，并指出其可能会干扰视网膜神经节细胞（RGCs）的识别 | 首次发现Rbpms+视网膜小胶质细胞/巨噬细胞亚群可能导致对RGC的错误识别，并提供了避免此问题的解决方案 | 研究集中在特定条件下，可能无法完全代表所有视网膜细胞类型的复杂性 | 探讨RGCs的生物学和亚型，以及神经保护和轴突再生的机制 | 视网膜小胶质细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 10638 | 2024-08-05 |
Transcriptomic profiling of retinal cells reveals a subpopulation of microglia/macrophages expressing Rbpms and Spp1 markers of retinal ganglion cells (RGCs) that confound identification of RGCs
2023-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.23.525216
PMID:36747805
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研究论文 | 本文分析了小鼠视网膜的微胶质细胞和巨噬细胞，发现其中特定亚群可能导致对视网膜神经节细胞的误识别 | 揭示了Rbpms+和Spp1+微胶质细胞/巨噬细胞在视网膜神经节细胞鉴定中的潜在混淆作用 | 仅分析了小鼠的视网膜细胞，无法推广到其他物种 | 研究视网膜神经节细胞的生物学及其亚型 | 视网膜微胶质细胞和巨噬细胞 | 数字病理 | NA | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 视网膜细胞亚群体 |
| 10639 | 2024-08-05 |
Celda: a Bayesian model to perform co-clustering of genes into modules and cells into subpopulations using single-cell RNA-seq data
2022-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqac066
PMID:36110899
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研究论文 | 本文开发了一种名为Celda的新型贝叶斯模型，用于对单细胞RNA-seq数据中的基因和细胞进行共同聚类 | Celda能够量化每个基因对每个模块的概率贡献，并在其他常用流程中遗漏的细胞亚群中取得新的发现 | 未提及 | 揭示复杂组织的分子和细胞构建块，并表征转录程序及细胞异质性 | 使用单细胞RNA-seq数据进行基因和细胞的共同聚类分析 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | 贝叶斯层次模型 | 基因表达数据 | 外周血单核细胞数据集 |
| 10640 | 2024-08-05 |
A time-resolved, multi-symbol molecular recorder via sequential genome editing
2022-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04922-8
PMID:35794474
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研究论文 | 本文描述了DNA打字机的系统，作为一种体内分子记录的通用方法 | 提出了一种新的分子记录方法，克服了现有DNA记忆设备的限制，能够捕捉事件的顺序和同时记录多个符号 | 尚未提及具体的限制因素 | 实现体内分子记录，记录复杂事件历史和短文本信息 | 使用单细胞RNA测序重建3,257个细胞的单系谱 | 数字病理学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 3,257个细胞 |