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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 10601 - 10620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10601 | 2025-10-07 |
Gbp2 driving macrophages dynamics in murine heart transplant
2025-Apr, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2024.102695
PMID:39709712
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析鉴定出Gbp2是驱动心脏移植排斥过程中巨噬细胞动态变化的关键基因 | 首次发现Gbp2在心脏移植急性排斥过程中调控巨噬细胞极化的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 鉴定心脏移植排斥过程中巨噬细胞动态变化的关键基因并评估其对巨噬细胞极化的影响 | 小鼠心脏移植模型中的巨噬细胞 | 生物信息学 | 器官移植排斥 | 单细胞测序, 伪时序分析, hdWGCNA | NA | 单细胞测序数据 | 小鼠心脏移植模型数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10602 | 2025-10-07 |
Impaired primitive erythropoiesis and defective vascular development in Trim71-KO embryos
2025-Apr, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402956
PMID:39909558
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研究论文 | 本研究揭示RNA结合蛋白Trim71通过调控中胚层先驱转录因子Eomes的表达，在胚胎原肠胚形成阶段建立器官发生正常发育框架的重要机制 | 首次发现Trim71通过NHL结构域直接抑制Eomes mRNA，建立了这两种重要调控基因之间的功能联系 | 内皮细胞条件性敲除未诱导明显缺陷，表明Trim71在内皮细胞及其前体细胞中的表达对胚胎存活并非必需 | 探究Trim71在胚胎发育过程中对基因表达的调控机制 | Trim71基因敲除小鼠胚胎 | 发育生物学 | 胚胎发育缺陷 | 单细胞RNA测序，条件性基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | E7.5阶段全局敲除胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10603 | 2025-10-07 |
A novel coarsened graph learning method for scalable single-cell data analysis
2025-Apr, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.109873
PMID:39999493
|
研究论文 | 提出一种基于特征感知图粗化的新型方法FACH，用于可扩展的单细胞数据分析 | 首次将局部敏感哈希技术整合到图粗化过程中，实现高效的单细胞数据分析 | NA | 解决单细胞数据大规模图表示的计算挑战 | 单细胞RNA测序和质谱流式细胞术数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | 图神经网络 | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 10604 | 2025-10-07 |
Enhanced single-cell RNA-seq embedding through gene expression and data-driven gene-gene interaction integration
2025-Apr, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.109880
PMID:39999494
|
研究论文 | 提出一种整合基因表达和基因间相互作用的新型单细胞RNA测序嵌入方法 | 通过构建细胞-叶图(CLG)和K近邻图(KNNG)的融合图结构，首次将数据驱动的基因间相互作用整合到单细胞嵌入中 | 未明确说明方法对特定细胞类型或组织的适用性限制 | 开发更全面的单细胞RNA测序数据分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络, 随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10605 | 2025-10-07 |
X-scPAE: An explainable deep learning model for embryonic lineage allocation prediction based on single-cell transcriptomics revealing key genes in embryonic cell development
2025-Apr, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.109787
PMID:39946788
|
研究论文 | 提出一种基于单细胞转录组数据的可解释深度学习模型X-scPAE，用于预测胚胎细胞谱系分配并识别关键基因 | 结合PCA降维、自编码器特征提取、注意力机制和反事实梯度归因算法，构建可解释的深度学习模型 | NA | 准确预测细胞谱系分配并识别谱系间基因表达差异 | 人类和小鼠的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 胚胎发育疾病 | 单细胞RNA测序 | 自编码器, 注意力机制, 逻辑回归 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10606 | 2025-10-07 |
Profiling Multiple CD8+ T-cell Functional Dimensions Enhances Breast Cancer Immune Assessment
2025-Mar-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0235
PMID:39715293
|
研究论文 | 开发基于bulk RNA测序的FuncDimen模型评估CD8+ T细胞多功能维度，提升乳腺癌免疫评估 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据开发多维度功能评估模型，克服传统CD8+ T细胞丰度评估的局限性 | 临床应用中单细胞RNA测序技术存在限制 | 提升乳腺癌抗肿瘤免疫力评估和免疫治疗反应预测 | 乳腺癌患者CD8+ T细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 免疫荧光, 成像质谱流式 | FuncDimen模型, FuncAggre评分模型 | RNA测序数据, 免疫组化数据 | 乳腺癌队列和外部数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10607 | 2025-10-07 |
Plasma Exosomes Derived from Patients with Primary Immune Thrombocytopenia Attenuate TBX21+ Regulatory T Cell-Mediated Immune Suppression via MiR-363-3p
2025-Mar-04, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02275-8
PMID:40032779
|
研究论文 | 本研究揭示原发性免疫性血小板减少症患者血浆外泌体通过miR-363-3p抑制TBX21+调节性T细胞的免疫抑制功能 | 首次发现ITP患者外泌体通过miR-363-3p-ARID3A/SPI1/TBX21轴削弱Treg功能的新机制 | 未明确外泌体miR-363-3p升高的上游调控机制 | 探究ITP患者调节性T细胞功能减弱的分子机制 | 原发性免疫性血小板减少症患者和调节性T细胞 | 免疫学 | 原发性免疫性血小板减少症 | Treg功能检测,细胞因子分析,单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据,功能实验数据 | ITP患者样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 10608 | 2024-09-13 |
From genes to geography: Mapping allergic disease landscapes with spatial transcriptomics
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.08.025
PMID:39260791
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10609 | 2025-10-07 |
Cell autonomous TLR4 signaling modulates TGF-β induced activation of human cardiac fibroblasts
2025-Feb-28, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e42452
PMID:40028530
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现TLR4是心脏成纤维细胞中主要表达的免疫传感器，并证明抑制TLR4信号可减轻TGF-β诱导的纤维化变化 | 首次揭示心脏成纤维细胞中自主性TLR4信号通路在调节TGF-β诱导纤维化过程中的关键作用 | 研究仅在体外实验条件下进行，缺乏体内验证 | 探究细胞自主性免疫信号在成人心脏成纤维细胞纤维化调节中的作用机制 | 小鼠和人类心力衰竭患者的心脏成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | FACS, 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 来自Collagen1-α1GFP小鼠和人类心力衰竭患者的心脏成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10610 | 2025-10-07 |
Phylogeny and species delimitation of ciliates in the genus Spirostomum (class Heterotrichea) using single-cell transcriptomes
2025-Feb-27, BMC ecology and evolution
IF:2.3Q3
DOI:10.1186/s12862-025-02353-3
PMID:40011795
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据对旋口虫属纤毛虫进行系统发育分析和物种界定 | 首次在旋口虫属中应用单细胞转录组数据，结合多物种溯祖模型进行物种界定，并开发了从转录组数据重建核糖体RNA基因序列的工作流程 | 样本主要来自韩国和美国，地理覆盖范围有限，可能无法完全代表该属的全球多样性 | 阐明旋口虫属纤毛虫的系统发育关系和物种边界 | 旋口虫属纤毛虫（代表6个形态种） | 系统发育基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，系统发育分析，物种界定分析 | 多物种溯祖模型，邻接网络分析 | 转录组数据，蛋白质编码基因序列 | 37个旋口虫标本（25个新生成转录组+12个来自GenBank） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10611 | 2025-10-07 |
Global landscape of hepatic organoid research: A bibliometric and visual study
2025-Feb-27, World journal of hepatology
IF:2.5Q2
DOI:10.4254/wjh.v17.i2.95624
PMID:40027550
|
文献计量分析 | 通过文献计量学方法分析全球肝类器官研究的发展格局和趋势 | 首次对肝类器官研究领域进行全面的文献计量学分析，识别关键研究趋势和学术合作机会 | 仅基于Web of Science数据库，可能未涵盖所有相关文献 | 分析肝类器官研究的全球科研产出并评估当前成就与未来趋势 | 肝类器官研究相关的科学文献 | 生物医学研究 | 肝病 | 文献计量分析，单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | 991篇文献（2010-2024年） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10612 | 2025-10-07 |
Uncovering immune cell heterogeneity in hepatocellular carcinoma by combining single-cell RNA sequencing with T-cell receptor sequencing
2025-Feb-27, World journal of hepatology
IF:2.5Q2
DOI:10.4254/wjh.v17.i2.99046
PMID:40027555
|
研究论文 | 通过结合单细胞RNA测序和T细胞受体测序技术，揭示肝细胞癌中免疫细胞的异质性 | 首次在肝细胞癌中结合单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析免疫细胞异质性，发现两个新的T细胞亚群 | 样本量有限，研究结果需要在更大队列中验证 | 研究肝细胞癌发展过程中的关键生物标志物基因和免疫细胞亚群反应 | 肝细胞癌患者肿瘤组织和癌旁正常组织中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | 生物信息学分析 | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 肝细胞癌患者的肿瘤和癌旁组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 10613 | 2025-10-07 |
The endothelial growth factor Angiopoietin-2 is an accurate prognostic biomarker in patients with acetaminophen-induced acute liver failure
2025-Feb-21, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.02.19.25322567
PMID:40034764
|
研究论文 | 本研究评估血管生成素-2作为对乙酰氨基酚诱导的急性肝衰竭预后生物标志物的价值 | 首次发现血管生成素-2在肝内皮细胞中显著升高，并证明其作为早期预后生物标志物优于MELD评分 | 样本量相对有限（总样本量123例），需要在更大规模研究中验证 | 评估血管生成素-2作为对乙酰氨基酚诱导的急性肝衰竭预后生物标志物的效能 | 对乙酰氨基酚诱导的急性肝衰竭患者 | 生物标志物研究 | 急性肝衰竭 | 单细胞RNA测序，生物标志物检测 | NA | 基因表达数据，临床数据 | 两个独立队列共123例患者（凤凰队列43例，ALFSG队列80例） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10614 | 2025-10-07 |
Powerful and accurate case-control analysis of spatial molecular data with deep learning-defined tissue microniches
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.07.637149
PMID:39975274
|
研究论文 | 介绍一种结合深度学习与统计学的空间分子数据分析方法VIMA，用于识别与疾病相关的空间结构 | 使用变分自编码器从组织斑块中提取数字“指纹”，定义具有高度相似生物学的“微生态位”，并通过严谨统计识别与病例对照状态相关的微生态位 | NA | 开发更灵活精确的空间分子数据分析方法，识别与疾病相关的关键空间结构 | 阿尔茨海默病、溃疡性结肠炎和类风湿性关节炎的空间分子数据 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病, 溃疡性结肠炎, 类风湿性关节炎 | 空间转录组学, CODEX, 免疫组织化学 | 变分自编码器(VAE) | 空间分子数据, 图像 | 三个独立数据集（140基因空间转录组数据集、54标记CODEX数据集、7标记免疫组化数据集） | NA | 空间转录组学, CODEX, 免疫组织化学 | NA | NA |
| 10615 | 2025-10-07 |
Cross-tissue multi-omics analyses reveal the gut microbiota's absence impacts organ morphology, immune homeostasis, bile acid and lipid metabolism
2025-Feb, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.272
PMID:40027481
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研究论文 | 通过跨组织多组学分析揭示肠道微生物缺失对器官形态、免疫稳态、胆汁酸和脂质代谢的影响 | 首次整合空间转录组学、单细胞RNA测序和靶向胆汁酸代谢组学系统评估无菌小鼠多器官表型 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究肠道微生物缺失对宿主多器官生理功能的系统性影响 | 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠 | 多组学整合分析 | 代谢性疾病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 靶向代谢组学 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠的比较研究 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 靶向代谢组学 | NA | NA |
| 10616 | 2025-10-07 |
Shiba: A versatile computational method for systematic identification of differential RNA splicing across platforms
2025-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.30.596331
PMID:38895326
|
研究论文 | 开发了一种名为Shiba的计算方法，用于系统识别不同RNA测序平台上的差异RNA剪接 | 整合了转录本组装、剪接事件识别、读数计数和差异剪接分析，能够捕获注释和未注释的剪接事件，解决了连接读段不平衡问题 | NA | 开发一种跨平台的差异RNA剪接识别计算方法 | RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 统计框架 | RNA测序数据 | n=1 RNA-seq数据集 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10617 | 2025-10-07 |
Single-Cell Sequencing and Transcriptome Analysis Explored Changes in Midnolin-Related Immune Microenvironment and Constructed Combined Prognostic Model for Pancreatic Cancer
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S503326
PMID:40026303
|
研究论文 | 通过单细胞测序和转录组分析探索midnolin相关免疫微环境变化并构建胰腺癌联合预后模型 | 首次将MIDN、midnolin相关基因和midnolin相关免疫浸润细胞整合构建胰腺癌联合预后模型 | NA | 评估MIDN及相关因子在胰腺癌预后中的价值并构建预后模型 | 胰腺癌患者数据及胰腺癌细胞系 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞测序,转录组分析,CIBERSORT,Cox回归,LASSO | Cox回归模型,LASSO模型 | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10618 | 2025-10-07 |
Integration of Single Cell and Bulk RNA-Sequencing Reveals Key Genes and Immune Cell Infiltration to Construct a Predictive Model and Identify Drug Targets in Endometriosis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S497643
PMID:40026309
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，揭示子宫内膜异位症的关键基因和免疫细胞浸润特征，构建预测模型并识别潜在药物靶点 | 首次整合单细胞和bulk RNA测序数据系统分析子宫内膜异位症，识别出8个关键基因构建高精度预测模型，并发现相关免疫细胞浸润变化 | 样本来源仅限于基因表达综合数据库，需要进一步实验验证 | 探索子宫内膜异位症的免疫机制和分子差异，开发疾病诊断和预测模型 | 子宫内膜异位症患者和健康对照者的增生期内膜组织 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, RT-qPCR, LASSO回归分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 来自Gene Expression Omnibus数据库的子宫内膜样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 10619 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Peripheral Immune Cell Senescence and Inflammatory Phenotypes in Patients with Premature Ovarian Failure
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S496130
PMID:40026314
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示早发性卵巢功能不全患者外周免疫细胞衰老和炎症表型 | 首次在单细胞水平系统描绘POF患者外周免疫细胞特征，发现非经典单核细胞通过CCL5介导CD8+效应T细胞趋化和卵巢损伤的新机制 | 样本量较小（3例健康对照和4例POF患者），需要在更大队列中验证发现 | 探究早发性卵巢功能不全的免疫学机制 | 早发性卵巢功能不全患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 早发性卵巢功能不全 | 单细胞RNA测序 | SCENIC分析、拟时序分析 | 单细胞转录组数据 | 3例健康对照和4例POF患者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10620 | 2025-10-07 |
HIV-SEQ REVEALS GLOBAL HOST GENE EXPRESSION DIFFERENCES BETWEEN HIV-TRANSCRIBING CELLS FROM VIREMIC AND SUPPRESSED PEOPLE WITH HIV
2024-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.17.629023
PMID:39763963
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研究论文 | 开发了HIV-seq方法用于更有效地捕获HIV转录本，并比较HIV病毒血症期和抑制期患者中HIV转录细胞的基因表达差异 | 开发了HIV-seq技术，通过添加针对HIV基因组保守区域的定制捕获序列，将HIV RNA+细胞的检测效率提高了44% | HIV转录细胞频率低且HIV转录本水平低，非多聚腺苷酸化转录本难以捕获 | 研究HIV转录细胞在病毒血症期和抗逆转录病毒治疗抑制期的基因表达差异 | HIV感染者的血液样本细胞 | 单细胞测序分析 | HIV感染 | 单细胞RNA测序，CITE-seq | NA | 单细胞RNA测序数据，表面表型数据 | 配对的HIV感染者血液样本（治疗前vs治疗后） | NA | 单细胞RNA-seq，表面表型分析 | NA | HIV-seq与CITE-seq联合使用 |