单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 10601 - 10620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10601 | 2025-10-07 |
Plasma Exosomes Derived from Patients with Primary Immune Thrombocytopenia Attenuate TBX21+ Regulatory T Cell-Mediated Immune Suppression via MiR-363-3p
2025-Mar-04, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02275-8
PMID:40032779
|
研究论文 | 本研究揭示原发性免疫性血小板减少症患者血浆外泌体通过miR-363-3p抑制TBX21+调节性T细胞的免疫抑制功能 | 首次发现ITP患者外泌体通过miR-363-3p-ARID3A/SPI1/TBX21轴削弱Treg功能的新机制 | 未明确外泌体miR-363-3p升高的上游调控机制 | 探究ITP患者调节性T细胞功能减弱的分子机制 | 原发性免疫性血小板减少症患者和调节性T细胞 | 免疫学 | 原发性免疫性血小板减少症 | Treg功能检测,细胞因子分析,单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据,功能实验数据 | ITP患者样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 10602 | 2024-09-13 |
From genes to geography: Mapping allergic disease landscapes with spatial transcriptomics
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.08.025
PMID:39260791
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10603 | 2025-10-07 |
Cell autonomous TLR4 signaling modulates TGF-β induced activation of human cardiac fibroblasts
2025-Feb-28, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e42452
PMID:40028530
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现TLR4是心脏成纤维细胞中主要表达的免疫传感器，并证明抑制TLR4信号可减轻TGF-β诱导的纤维化变化 | 首次揭示心脏成纤维细胞中自主性TLR4信号通路在调节TGF-β诱导纤维化过程中的关键作用 | 研究仅在体外实验条件下进行，缺乏体内验证 | 探究细胞自主性免疫信号在成人心脏成纤维细胞纤维化调节中的作用机制 | 小鼠和人类心力衰竭患者的心脏成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | FACS, 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 来自Collagen1-α1GFP小鼠和人类心力衰竭患者的心脏成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10604 | 2025-10-07 |
Phylogeny and species delimitation of ciliates in the genus Spirostomum (class Heterotrichea) using single-cell transcriptomes
2025-Feb-27, BMC ecology and evolution
IF:2.3Q3
DOI:10.1186/s12862-025-02353-3
PMID:40011795
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据对旋口虫属纤毛虫进行系统发育分析和物种界定 | 首次在旋口虫属中应用单细胞转录组数据，结合多物种溯祖模型进行物种界定，并开发了从转录组数据重建核糖体RNA基因序列的工作流程 | 样本主要来自韩国和美国，地理覆盖范围有限，可能无法完全代表该属的全球多样性 | 阐明旋口虫属纤毛虫的系统发育关系和物种边界 | 旋口虫属纤毛虫（代表6个形态种） | 系统发育基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，系统发育分析，物种界定分析 | 多物种溯祖模型，邻接网络分析 | 转录组数据，蛋白质编码基因序列 | 37个旋口虫标本（25个新生成转录组+12个来自GenBank） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10605 | 2025-10-07 |
Global landscape of hepatic organoid research: A bibliometric and visual study
2025-Feb-27, World journal of hepatology
IF:2.5Q2
DOI:10.4254/wjh.v17.i2.95624
PMID:40027550
|
文献计量分析 | 通过文献计量学方法分析全球肝类器官研究的发展格局和趋势 | 首次对肝类器官研究领域进行全面的文献计量学分析，识别关键研究趋势和学术合作机会 | 仅基于Web of Science数据库，可能未涵盖所有相关文献 | 分析肝类器官研究的全球科研产出并评估当前成就与未来趋势 | 肝类器官研究相关的科学文献 | 生物医学研究 | 肝病 | 文献计量分析，单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | 991篇文献（2010-2024年） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10606 | 2025-10-07 |
Uncovering immune cell heterogeneity in hepatocellular carcinoma by combining single-cell RNA sequencing with T-cell receptor sequencing
2025-Feb-27, World journal of hepatology
IF:2.5Q2
DOI:10.4254/wjh.v17.i2.99046
PMID:40027555
|
研究论文 | 通过结合单细胞RNA测序和T细胞受体测序技术，揭示肝细胞癌中免疫细胞的异质性 | 首次在肝细胞癌中结合单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析免疫细胞异质性，发现两个新的T细胞亚群 | 样本量有限，研究结果需要在更大队列中验证 | 研究肝细胞癌发展过程中的关键生物标志物基因和免疫细胞亚群反应 | 肝细胞癌患者肿瘤组织和癌旁正常组织中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | 生物信息学分析 | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 肝细胞癌患者的肿瘤和癌旁组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 10607 | 2025-10-07 |
The endothelial growth factor Angiopoietin-2 is an accurate prognostic biomarker in patients with acetaminophen-induced acute liver failure
2025-Feb-21, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.02.19.25322567
PMID:40034764
|
研究论文 | 本研究评估血管生成素-2作为对乙酰氨基酚诱导的急性肝衰竭预后生物标志物的价值 | 首次发现血管生成素-2在肝内皮细胞中显著升高，并证明其作为早期预后生物标志物优于MELD评分 | 样本量相对有限（总样本量123例），需要在更大规模研究中验证 | 评估血管生成素-2作为对乙酰氨基酚诱导的急性肝衰竭预后生物标志物的效能 | 对乙酰氨基酚诱导的急性肝衰竭患者 | 生物标志物研究 | 急性肝衰竭 | 单细胞RNA测序，生物标志物检测 | NA | 基因表达数据，临床数据 | 两个独立队列共123例患者（凤凰队列43例，ALFSG队列80例） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10608 | 2025-10-07 |
Powerful and accurate case-control analysis of spatial molecular data with deep learning-defined tissue microniches
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.07.637149
PMID:39975274
|
研究论文 | 介绍一种结合深度学习与统计学的空间分子数据分析方法VIMA，用于识别与疾病相关的空间结构 | 使用变分自编码器从组织斑块中提取数字“指纹”，定义具有高度相似生物学的“微生态位”，并通过严谨统计识别与病例对照状态相关的微生态位 | NA | 开发更灵活精确的空间分子数据分析方法，识别与疾病相关的关键空间结构 | 阿尔茨海默病、溃疡性结肠炎和类风湿性关节炎的空间分子数据 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病, 溃疡性结肠炎, 类风湿性关节炎 | 空间转录组学, CODEX, 免疫组织化学 | 变分自编码器(VAE) | 空间分子数据, 图像 | 三个独立数据集（140基因空间转录组数据集、54标记CODEX数据集、7标记免疫组化数据集） | NA | 空间转录组学, CODEX, 免疫组织化学 | NA | NA |
| 10609 | 2025-10-07 |
Cross-tissue multi-omics analyses reveal the gut microbiota's absence impacts organ morphology, immune homeostasis, bile acid and lipid metabolism
2025-Feb, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.272
PMID:40027481
|
研究论文 | 通过跨组织多组学分析揭示肠道微生物缺失对器官形态、免疫稳态、胆汁酸和脂质代谢的影响 | 首次整合空间转录组学、单细胞RNA测序和靶向胆汁酸代谢组学系统评估无菌小鼠多器官表型 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究肠道微生物缺失对宿主多器官生理功能的系统性影响 | 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠 | 多组学整合分析 | 代谢性疾病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 靶向代谢组学 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠的比较研究 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 靶向代谢组学 | NA | NA |
| 10610 | 2025-10-07 |
Shiba: A versatile computational method for systematic identification of differential RNA splicing across platforms
2025-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.30.596331
PMID:38895326
|
研究论文 | 开发了一种名为Shiba的计算方法，用于系统识别不同RNA测序平台上的差异RNA剪接 | 整合了转录本组装、剪接事件识别、读数计数和差异剪接分析，能够捕获注释和未注释的剪接事件，解决了连接读段不平衡问题 | NA | 开发一种跨平台的差异RNA剪接识别计算方法 | RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 统计框架 | RNA测序数据 | n=1 RNA-seq数据集 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10611 | 2025-10-07 |
Single-Cell Sequencing and Transcriptome Analysis Explored Changes in Midnolin-Related Immune Microenvironment and Constructed Combined Prognostic Model for Pancreatic Cancer
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S503326
PMID:40026303
|
研究论文 | 通过单细胞测序和转录组分析探索midnolin相关免疫微环境变化并构建胰腺癌联合预后模型 | 首次将MIDN、midnolin相关基因和midnolin相关免疫浸润细胞整合构建胰腺癌联合预后模型 | NA | 评估MIDN及相关因子在胰腺癌预后中的价值并构建预后模型 | 胰腺癌患者数据及胰腺癌细胞系 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞测序,转录组分析,CIBERSORT,Cox回归,LASSO | Cox回归模型,LASSO模型 | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10612 | 2025-10-07 |
Integration of Single Cell and Bulk RNA-Sequencing Reveals Key Genes and Immune Cell Infiltration to Construct a Predictive Model and Identify Drug Targets in Endometriosis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S497643
PMID:40026309
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，揭示子宫内膜异位症的关键基因和免疫细胞浸润特征，构建预测模型并识别潜在药物靶点 | 首次整合单细胞和bulk RNA测序数据系统分析子宫内膜异位症，识别出8个关键基因构建高精度预测模型，并发现相关免疫细胞浸润变化 | 样本来源仅限于基因表达综合数据库，需要进一步实验验证 | 探索子宫内膜异位症的免疫机制和分子差异，开发疾病诊断和预测模型 | 子宫内膜异位症患者和健康对照者的增生期内膜组织 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, RT-qPCR, LASSO回归分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 来自Gene Expression Omnibus数据库的子宫内膜样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 10613 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Peripheral Immune Cell Senescence and Inflammatory Phenotypes in Patients with Premature Ovarian Failure
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S496130
PMID:40026314
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示早发性卵巢功能不全患者外周免疫细胞衰老和炎症表型 | 首次在单细胞水平系统描绘POF患者外周免疫细胞特征，发现非经典单核细胞通过CCL5介导CD8+效应T细胞趋化和卵巢损伤的新机制 | 样本量较小（3例健康对照和4例POF患者），需要在更大队列中验证发现 | 探究早发性卵巢功能不全的免疫学机制 | 早发性卵巢功能不全患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 早发性卵巢功能不全 | 单细胞RNA测序 | SCENIC分析、拟时序分析 | 单细胞转录组数据 | 3例健康对照和4例POF患者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10614 | 2025-10-07 |
HIV-SEQ REVEALS GLOBAL HOST GENE EXPRESSION DIFFERENCES BETWEEN HIV-TRANSCRIBING CELLS FROM VIREMIC AND SUPPRESSED PEOPLE WITH HIV
2024-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.17.629023
PMID:39763963
|
研究论文 | 开发了HIV-seq方法用于更有效地捕获HIV转录本，并比较HIV病毒血症期和抑制期患者中HIV转录细胞的基因表达差异 | 开发了HIV-seq技术，通过添加针对HIV基因组保守区域的定制捕获序列，将HIV RNA+细胞的检测效率提高了44% | HIV转录细胞频率低且HIV转录本水平低，非多聚腺苷酸化转录本难以捕获 | 研究HIV转录细胞在病毒血症期和抗逆转录病毒治疗抑制期的基因表达差异 | HIV感染者的血液样本细胞 | 单细胞测序分析 | HIV感染 | 单细胞RNA测序，CITE-seq | NA | 单细胞RNA测序数据，表面表型数据 | 配对的HIV感染者血液样本（治疗前vs治疗后） | NA | 单细胞RNA-seq，表面表型分析 | NA | HIV-seq与CITE-seq联合使用 |
| 10615 | 2025-10-07 |
Pseudo-Label Guided Structural Discriminative Subspace Learning for Unsupervised Feature Selection
2024-Dec, IEEE transactions on neural networks and learning systems
IF:10.2Q1
DOI:10.1109/TNNLS.2023.3319372
PMID:37796670
|
研究论文 | 提出一种名为伪标签引导结构判别子空间学习的无监督特征选择方法 | 将概率图构建引入特征选择学习过程作为统一框架，并提出伪标签引导学习机制结合基于图的方法和类间散布矩阵最大化思想 | 需要解决NP难问题，存在参数确定和计算复杂度挑战 | 开发更有效的无监督特征选择方法 | 九个真实世界数据集和三个单细胞RNA测序基因数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 子空间学习模型 | 基因表达数据 | 12个数据集（9个通用数据集+3个scRNA-seq数据集） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 10616 | 2025-10-07 |
Genetic variation and molecular profiling of congenital malformations of the female genital tract based on whole-genome sequencing
2024-11, World journal of pediatrics : WJP
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s12519-024-00839-6
PMID:39251565
|
研究论文 | 通过全基因组测序分析女性生殖道先天性畸形的遗传变异和分子特征 | 发现了7个新发拷贝数变异、12个罕见单核苷酸变异和10个罕见3'UTR突变，首次确定ASH1L为致病基因 | 样本量相对有限，主要基于中国人群数据 | 探索女性生殖道先天性畸形的遗传病因和分子机制 | 590名中国个体（95名患者、442名病例对照和53名家族对照） | 基因组学 | 女性生殖道先天性畸形 | 全基因组测序, 单细胞测序 | NA | 基因组数据, 单细胞表达数据 | 590名个体 | NA | 全基因组测序, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10617 | 2025-10-07 |
Joint trajectory inference for single-cell genomics using deep learning with a mixture prior
2024-Sep-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2316256121
PMID:39226366
|
研究论文 | 提出一种基于深度学习和混合先验的统计方法VITAE，用于单细胞基因组数据的轨迹推断 | 将潜在层次混合模型与变分自编码器相结合，实现同时轨迹推断和数据整合，并提供细胞投影的不确定性量化 | NA | 开发更准确可靠的单细胞轨迹推断方法 | 单细胞测序数据中的细胞发育轨迹 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器(VAE), 层次混合模型 | 单细胞基因组数据 | 三个小鼠新皮质单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学 | NA | NA |
| 10618 | 2025-10-07 |
Acyl-coenzyme a binding protein (ACBP) - a risk factor for cancer diagnosis and an inhibitor of immunosurveillance
2024-Sep-06, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02098-5
PMID:39242519
|
研究论文 | 本研究探讨了酰基辅酶A结合蛋白(ACBP/DBI)作为癌症风险因子和免疫监视抑制剂的作用 | 首次发现ACBP/DBI可作为癌症发展的风险预测因子，并证明其中和抗体能增强化疗免疫疗法的疗效 | 研究主要基于临床前模型，需要进一步的人体临床试验验证 | 探究ACBP/DBI在癌症发展和免疫监视中的作用机制 | 癌症患者、遗传性癌症易感人群、小鼠癌症模型 | 癌症免疫学 | 肺癌、乳腺癌、肉瘤 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质浓度数据、基因表达数据 | 癌症患者、遗传易感人群和健康对照群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10619 | 2025-10-07 |
Modulation of blood-tumor barrier transcriptional programs improves intra-tumoral drug delivery and potentiates chemotherapy in GBM
2024-Aug-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.26.609797
PMID:39253453
|
研究论文 | 本研究通过识别血脑肿瘤屏障的12基因特征并开发BIA纳米颗粒制剂，改善了胶质母细胞瘤的化疗药物递送效率 | 首次发现CDH5作为血脑肿瘤屏障核心分子，开发具有双重功能的BIA衍生物既能破坏屏障又能增强化疗效果 | 研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证 | 改善胶质母细胞瘤化疗药物的肿瘤内递送效率 | 胶质母细胞瘤血管系统、血脑肿瘤屏障、内皮细胞单层和3D球体模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学、纳米颗粒制剂 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 胶质母细胞瘤患者标本、荷瘤小鼠模型、患者来源的胶质母细胞瘤异种移植模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10620 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis identifies distinct CD4+ T cells associated with the pathobiology of pediatric obesity-related asthma
2024-Aug-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.13.607447
PMID:39211259
|
研究论文 | 通过单细胞分析识别与儿童肥胖相关哮喘病理生物学相关的不同CD4+ T细胞亚型 | 首次在单细胞水平揭示肥胖哮喘中特定CD4+ T细胞亚群的CDC42上调、Th1炎症和类固醇耐药性特征 | 未明确说明样本量大小和研究人群的具体特征 | 探索儿童肥胖相关哮喘中CD4+ T细胞亚型的分子特征及其与疾病表型的关系 | 儿童肥胖相关哮喘患者的CD4+ T细胞 | 单细胞转录组学 | 哮喘 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |