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当前共找到 32150 篇文献，本页显示第 10581 - 10600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10581 | 2025-10-07 |
Exploring cell-to-cell variability and functional insights through differentially variable gene analysis
2025-Mar-20, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00507-z
PMID:40113778
|
研究论文 | 提出了一种用于单细胞RNA测序数据的差异变异性分析统计框架spline-DV | 开发了首个专注于分析单细胞基因表达变异性的统计方法，而不仅仅是平均表达水平 | 方法主要针对两种实验条件间的比较，未涉及更复杂的实验设计 | 开发能够分析单细胞基因表达变异性的计算方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达变异性 | 生物信息学 | 肥胖、纤维化、癌症 | 单细胞RNA测序 | spline-DV统计框架 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10582 | 2025-10-07 |
RNA m7G methylation regulators and targets significantly contribute to chronic obstructive pulmonary disease
2025-Mar-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-93901-w
PMID:40113900
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研究论文 | 本研究首次通过整合生物信息学方法探讨m7G RNA甲基化调控因子在慢性阻塞性肺疾病中的作用 | 首次系统研究m7G甲基化调控因子在COPD中的联合作用，发现METTL1-CAT轴在疾病中的关键作用 | 仅通过细胞早衰模型进行初步验证，需要更多实验验证 | 探讨m7G RNA甲基化调控因子在慢性阻塞性肺疾病发病机制中的作用 | 慢性阻塞性肺疾病患者和细胞早衰模型 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 机器学习算法，单细胞测序，qRT-PCR，GSEA分析 | 机器学习算法，共识聚类 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10583 | 2025-10-07 |
Intratumoral microbiota-aided fusion radiomics model for predicting tumor response to neoadjuvant chemoimmunotherapy in triple-negative breast cancer
2025-Mar-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06369-7
PMID:40114207
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研究论文 | 开发了一种基于瘤内微生物组辅助的融合影像组学模型，用于预测三阴性乳腺癌患者对新辅助化疗免疫治疗的病理完全缓解 | 首次将瘤内微生物组特征与多时间点MRI影像组学特征融合构建预测模型 | 样本量相对有限（124例患者），需要更大规模的外部验证 | 预测三阴性乳腺癌患者对新辅助化疗免疫治疗的治疗反应 | 早期三阴性乳腺癌患者 | 数字病理 | 乳腺癌 | 16S rDNA测序, 单细胞RNA测序, 影像组学分析 | 融合影像组学模型 | 影像, 基因组数据 | 124例患者（训练集88例，验证集36例） | NA | 单细胞RNA测序, 16S rDNA测序 | NA | NA |
| 10584 | 2025-10-07 |
SENSITIVITY BASED MODEL AGNOSTIC SCALABLE EXPLANATIONS OF DEEP LEARNING
2025-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639516
PMID:40093081
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研究论文 | 提出了一种模型无关的可解释AI框架SensX，用于解释深度学习模型的预测机制 | 开发了SensX框架，在准确性和计算效率上显著优于现有最先进的可解释AI方法，并能扩展到具有超过15万个特征的视觉Transformer模型 | 未提及具体的数据集规模限制或模型类型的适用性限制 | 解决深度学习模型的黑箱问题，提供可解释的AI解决方案 | 深度神经网络和视觉Transformer模型 | 机器学习 | NA | 可解释AI，单细胞RNA测序 | 深度神经网络，视觉Transformer | 单细胞RNA-seq数据，面部图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10585 | 2025-10-07 |
Analysis of Head and Neck Cancer scRNA-seq Data Identified PRDM6 Promotes Tumor Progression by Modulating Immune Gene Expression
2025-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.04.641548
PMID:40093183
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研究论文 | 通过分析头颈癌单细胞RNA测序数据，发现PRDM6通过调控免疫基因表达促进肿瘤进展 | 首次发现PRDM6在头颈癌中通过诱导免疫应答基因表达促进肿瘤细胞增殖的新功能，并揭示HPV病毒癌蛋白与PRDM6表达的关联 | NA | 探索头颈鳞状细胞癌中免疫应答基因的调控机制及其在肿瘤进展中的作用 | 头颈鳞状细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | IRIS3 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10586 | 2025-10-07 |
Asymmetric Histone Inheritance Regulates Differential Transcription Re-initiation and Cell Fate Decisions in Mouse Olfactory Horizontal Basal Cells
2025-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.02.641101
PMID:40093102
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研究论文 | 本研究通过小鼠嗅觉上皮损伤再生模型，揭示了水平基底细胞中组蛋白不对称遗传调控转录再起始和细胞命运决定的机制 | 首次在哺乳动物成体干细胞谱系中发现组蛋白H4、H3和H3.3的不对称遗传现象，并阐明其与细胞命运决定和组织再生的关系 | 未研究H2A-H2B组蛋白的不对称遗传机制，且研究仅限于小鼠嗅觉上皮系统 | 探究哺乳动物中表观遗传继承的机制及其在细胞命运决定中的作用 | 小鼠嗅觉上皮中的水平基底细胞（HBCs） | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 配对子代细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10587 | 2025-10-07 |
MOSim: bulk and single-cell multilayer regulatory network simulator
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf110
PMID:40116657
|
研究论文 | 介绍MOSim——一个能够模拟bulk和单细胞多层调控网络数据的R包 | 开发了首个同时支持bulk和单细胞多组学数据模拟的工具，能够模拟多种调控组学层与基因表达之间的调控关系 | NA | 开发多组学数据模拟工具，用于方法测试和基准测试 | 多组学数据模拟 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, ATAC-seq, miRNA-seq, ChIP-seq, Methyl-seq, scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, bulk RNA-seq, bulk ATAC-seq | NA | NA |
| 10588 | 2025-10-07 |
AttentionGRN: a functional and directed graph transformer for gene regulatory network reconstruction from scRNA-seq data
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf118
PMID:40116659
|
研究论文 | 提出基于图变换器的AttentionGRN模型，用于从单细胞RNA测序数据重建基因调控网络 | 采用软编码增强模型表达能力，设计面向GRN的消息聚合策略，结合定向结构编码和功能基因采样 | NA | 从单细胞RNA测序数据重建细胞类型特异性基因调控网络 | 基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图变换器 | 单细胞RNA测序数据 | 88个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10589 | 2025-10-07 |
Machine Learning-Based Glycolipid Metabolism Gene Signature Predicts Prognosis and Immune Landscape in Oesophageal Squamous Cell Carcinoma
2025-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70434
PMID:40119618
|
研究论文 | 开发并验证基于糖脂代谢相关基因的食管鳞癌预后模型 | 首次建立基于机器学习的15基因糖脂代谢特征模型，揭示其与免疫浸润模式的关联 | NA | 预测食管鳞癌预后并探索糖脂代谢与肿瘤免疫的关系 | 食管鳞癌患者 | 机器学习 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的食管鳞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10590 | 2025-10-07 |
CITEgeist: Cellular Indexing of Transcriptomes and Epitopes for Guided Exploration of Intrinsic Spatial Trends
2025-Feb-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.15.638331
PMID:40027773
|
研究论文 | 开发了一种名为CITEgeist的新型空间转录组学反卷积工具，利用来自同一组织切片的抗体捕获数据作为参考 | 首次提出使用同一组织切片上的抗体捕获数据作为参考进行空间转录组学反卷积，避免了传统scRNA-seq参考的依赖 | 需要抗体捕获数据作为参考，可能受限于抗体可用性和质量 | 开发无需scRNA-seq参考的空间转录组学反卷积方法 | ER+乳腺癌肿瘤组织样本 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，抗体捕获技术 | 数学优化模型 | 空间转录组数据，蛋白质表达数据 | 临床试验中的治疗前后ER+乳腺癌肿瘤样本 | NA | 空间转录组学，单细胞多组学 | NA | NA |
| 10591 | 2025-10-07 |
Cloning and validating systems for high throughput molecular recording
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.01.015
PMID:40121084
|
研究论文 | 本文描述了构建分子记录谱系追踪系统的优化克隆和验证流程 | 利用CRISPR-Cas9条形码编辑技术在基因组整合的工程DNA盒中产生突变，通过单细胞RNA测序读取并生成高分辨率谱系树 | NA | 开发高通量分子记录技术用于细胞历史追踪 | 细胞发育、分化和肿瘤进化过程中的细胞轨迹 | 生物技术 | 肿瘤 | CRISPR-Cas9基因编辑，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10592 | 2025-10-07 |
Twin study identifies early immunological and metabolic dysregulation of CD8+ T cells in multiple sclerosis
2024-09-27, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adj8094
PMID:39331727
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析多发性硬化症患者CD8+ T细胞的免疫和代谢失调 | 首次在同卵双胞胎研究中揭示CD8+ T细胞在多发性硬化症亚临床阶段的早期免疫代谢异常 | 样本量有限，主要基于双胞胎队列研究 | 探究CD8+ T细胞在多发性硬化症发病机制中的作用 | 同卵双胞胎队列（包括健康、亚临床神经炎症和确诊多发性硬化症个体） | 单细胞组学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序，单细胞T细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据，T细胞受体序列数据 | 同卵双胞胎队列及独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 10593 | 2025-10-07 |
Targeting Fibroblast-Endothelial Interactions in LAM Pathogenesis: 3D Spheroid and Spatial Transcriptomic Insights for Therapeutic Innovation
2024-Sep-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.12.544372
PMID:37398026
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和3D球体模型探索淋巴管平滑肌瘤病中成纤维细胞-内皮细胞相互作用的机制 | 首次使用空间转录组学技术识别LAM中与肌成纤维细胞相关的激酶信号通路基因簇，并发现多激酶抑制剂索拉非尼比雷帕霉素更有效抑制细胞侵袭 | 研究样本量有限，主要基于体外模型，需要进一步临床验证 | 探索LAM疾病发病机制并寻找新的治疗靶点 | 淋巴管平滑肌瘤病肺组织、原发性LAM成纤维细胞、淋巴管内皮细胞和TSC2缺失的AML细胞 | 空间转录组学 | 肺部疾病 | 空间转录组学, 3D球体共培养, 激酶阵列分析 | 3D共培养球体模型 | 空间转录组数据, 细胞侵袭数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10594 | 2025-10-07 |
Emerging measurements for tumor-infiltrating lymphocytes in breast cancer
2024-Jun-01, Japanese journal of clinical oncology
IF:1.9Q3
DOI:10.1093/jjco/hyae033
PMID:38521965
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综述 | 本文概述了乳腺癌中肿瘤浸润淋巴细胞的评估方法及其临床意义 | 系统总结了从传统病理学方法到人工智能、单细胞分析等新兴技术在肿瘤浸润淋巴细胞评估中的应用 | 作为综述文章，未涉及原始研究数据和分析 | 探讨乳腺癌肿瘤浸润淋巴细胞的评估方法和技术进展 | 乳腺癌肿瘤微环境中的肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 免疫组织化学、流式细胞术、多组学分析、单细胞分析、空间转录组学 | 人工智能 | 组织图像、分子数据 | NA | NA | 单细胞分析、空间转录组学、多组学分析 | NA | NA |
| 10595 | 2025-10-07 |
Integrated temporal transcriptional and epigenetic single-cell analysis reveals the intrarenal immune characteristics in an early-stage model of IgA nephropathy during its acute injury
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1405748
PMID:39493754
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研究论文 | 通过整合时间序列的单细胞转录组和表观基因组分析，揭示IgA肾病早期急性损伤阶段的肾内免疫特征 | 首次在IgA肾病模型中联合应用纵向单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序，识别了具有独特表观遗传特征的巨噬细胞亚群和早期效应T细胞亚群 | 研究基于小鼠模型，结果向人类疾病的转化需要进一步验证；样本量相对有限（每组4-5只小鼠） | 阐明IgA肾病早期急性损伤阶段的免疫细胞动态变化和分子机制 | 小鼠肾脏CD45+免疫细胞和肾脏细胞 | 单细胞多组学 | IgA肾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 每组4-5只小鼠，共分析72304个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 10596 | 2025-10-07 |
Single-Cell and Population Transcriptomics Reveal Pan-epithelial Remodeling in Type 2-High Asthma
2020-07-07, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107872
PMID:32640237
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了2型细胞因子高表达型哮喘中IL-13诱导的全上皮细胞重塑机制 | 发现IL-13在所有上皮细胞类型中诱导黏液分泌程序，导致黏液和防御分泌细胞转化为具有新生黏蛋白产生和分泌能力的化生状态 | 研究主要基于体外细胞培养模型，需要在更多临床样本中验证 | 探究2型细胞因子高表达型哮喘中IL-13对气道上皮细胞的影响机制 | 人气道上皮细胞培养物和儿童哮喘患者的鼻气道上皮 | 单细胞转录组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10597 | 2025-10-07 |
Cancer‑associated fibroblasts: a pivotal regulator of tumor microenvironment in the context of radiotherapy
2025-Mar-20, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02138-7
PMID:40114180
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综述 | 本文综述了癌症相关成纤维细胞在放疗背景下对肿瘤微环境的调控作用 | 系统阐述了放疗对CAFs表型和功能的影响及其与肿瘤细胞、免疫细胞的相互作用机制 | 放疗对CAFs的影响以及受辐射CAFs对肿瘤进展和TME的作用尚未完全明确 | 探讨CAFs在放疗背景下的调控作用及其作为治疗靶点的潜力 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 肿瘤微环境研究 | 癌症 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10598 | 2025-10-07 |
Knowledge of the genetics of human pain gained over the last decade from next-generation sequencing
2025-Apr, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107667
PMID:39988004
|
综述 | 本文总结了近十年来利用二代测序技术在人类疼痛遗传学领域取得的研究进展 | 揭示了疼痛相关基因的新型突变谱、发现了关键的可变剪接事件、开发了基于NGS的疼痛预测模型，并构建了神经病理性疼痛体感系统图谱 | 面临复杂数据分析的挑战和罕见遗传变异生物学功能解读的困难 | 探索人类疼痛的遗传学基础并推动个性化疼痛管理 | 疼痛相关基因和遗传变异 | 基因组学 | 疼痛相关疾病 | 二代测序，单细胞转录组学 | 分类器 | 基因组数据，转录组数据 | NA | NA | 二代测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10599 | 2025-10-07 |
Insights into the single-cell transcriptome characteristics of porcine endometrium with embryo loss
2025-Mar-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202402212RR
PMID:40105155
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了猪胚胎丢失子宫内膜的分子特征和细胞异质性 | 首次构建了猪围植入期胚胎丢失与成功妊娠子宫内膜的单细胞转录组图谱，识别了22种细胞亚群并揭示了细胞通讯差异 | 样本数量有限，研究仅关注围植入期，未涵盖整个妊娠过程 | 探究胚胎丢失过程中子宫内膜微环境的分子机制 | 猪子宫内膜组织 | 单细胞组学 | 生殖障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 胚胎丢失和成功妊娠的子宫内膜组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10600 | 2025-10-07 |
Diversity and heterogeneity in human pancreaticobiliary maljunction revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Mar-21, Pediatric surgery international
IF:1.5Q3
DOI:10.1007/s00383-025-05997-w
PMID:40116982
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胰胆管合流异常中细胞多样性和异质性 | 首次在单细胞水平揭示PBM的细胞组成差异，发现成纤维细胞通过WNT和TWEAK信号通路驱动纤维化的新机制 | 样本量较小（仅6例患者），需更大规模研究验证 | 阐明胰胆管合流异常的病因和发病机制 | 胆管组织 | 数字病理学 | 胰胆管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例患者（3例PBM，3例非PBM） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |