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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
10581 2025-10-07
Characterization of canine tumor-infiltrating leukocyte transcriptomic signatures reveals conserved expression patterns with human osteosarcoma
2025-Feb-11, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 通过单细胞RNA测序分析犬类骨肉瘤中肿瘤浸润免疫细胞的转录组特征,并与人类骨肉瘤进行比较研究 首次在犬类骨肉瘤模型中系统分析肿瘤浸润免疫细胞的转录组特征,并揭示与人类骨肉瘤的保守表达模式 使用公开可用的单细胞RNA测序数据,样本来源有限;存在物种特异性差异 研究骨肉瘤肿瘤微环境对免疫细胞转录组特征的影响,并进行跨物种比较 犬类骨肉瘤肿瘤浸润免疫细胞和循环白细胞 单细胞转录组学 骨肉瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 计算分析、差异表达分析 单细胞转录组数据 公开可用的单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
10582 2025-10-07
Neutrophil-induced pyroptosis promotes survival in patients with hepatoblastoma
2025-Feb-11, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究通过构建中性粒细胞诱导焦亡评分系统,揭示了其在肝母细胞瘤预后预测中的价值 首次构建基于ELANE、CASP1和NOD2基因的中性粒细胞诱导焦亡评分系统,并发现其与肝母细胞瘤良好预后正相关 样本量较小(仅38例患者),需要更大规模研究验证 探索中性粒细胞诱导焦亡与肝母细胞瘤预后的关系 肝母细胞瘤患者肿瘤样本 生物信息学 肝母细胞瘤 RNA测序,单细胞RNA测序,免疫组化 LASSO回归 基因表达数据,单细胞数据 38例肝母细胞瘤患者 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
10583 2025-10-07
Somatic mutations distinguish melanocyte subpopulations in human skin
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过深度表征人类皮肤中单个黑素细胞的克隆扩增,揭示了黑素细胞亚群在突变负荷、基因表达和空间分布上的差异 首次发现即使在阳光损伤皮肤中仍存在低突变负荷的黑素细胞亚群,并揭示了其在毛囊中的空间分布特征 样本量相对有限(31名供体的297个黑素细胞),空间分布推断基于基因表达谱而非直接观测 了解黑素细胞的稳态调控机制 人类皮肤黑素细胞 单细胞生物学 皮肤疾病 单细胞空间转录组学 NA 基因表达数据、突变数据、形态特征数据 31名供体的297个黑素细胞 10x Genomics 单细胞空间转录组学 10x Xenium 10x Xenium单细胞空间转录组平台
10584 2025-10-07
Identification of Wnt-5a Receptors Important in Diabetic and Non-Diabetic Corneal Epithelial Wound Healing
2025-Feb-03, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和DNA甲基化分析鉴定Wnt-5a在糖尿病和非糖尿病角膜上皮伤口愈合中的关键受体 首次在糖尿病角膜中通过单细胞RNA测序发现ROR2启动子低甲基化导致其蛋白表达增加,并证实ROR2是Wnt-5a介导伤口愈合的主要受体 研究样本来源于死后供体眼睛,可能无法完全反映活体情况;仅使用体外细胞模型验证功能 确定介导Wnt-5a刺激糖尿病角膜上皮伤口愈合的Wnt受体 人角膜缘上皮细胞(来自糖尿病和非糖尿病供体) 生物医学研究 糖尿病角膜病变 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析, qRT-PCR, western blot, 免疫染色, siRNA转染 体外细胞伤口愈合模型 基因表达数据, 甲基化数据, 蛋白质表达数据 来自糖尿病和非糖尿病供体的人角膜缘上皮细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
10585 2025-10-07
ANKRD22 participates in the proinflammatory activities of macrophages in the colon cancer tumor microenvironment
2025-Feb-01, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究探讨ANKRD22在结肠癌肿瘤微环境中巨噬细胞促炎活性中的作用 首次揭示ANKRD22在M1型肿瘤相关巨噬细胞中的表达特征及其对巨噬细胞亚型分布的调控作用 ANKRD22在结肠TAMs中的具体作用机制仍需进一步阐明 阐明ANKRD22在结肠癌肿瘤微环境中巨噬细胞功能调控中的作用 结肠癌肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞 肿瘤免疫学 结肠癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,皮下异种移植实验 NA 基因表达数据,空间转录组数据 结肠癌患者组织样本及小鼠模型 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
10586 2025-10-07
Elevated SAMD3 expression in T cells predicts improved survival in pancreatic ductal adenocarcinoma patients
2025-Feb-01, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现T细胞中SAMD3高表达与胰腺导管腺癌患者生存改善相关 首次发现SAMD3在细胞毒性CD8+ T细胞中的表达特征及其与T细胞功能和患者预后的关联 研究样本量有限,需要在更大队列中验证SAMD3的预后价值 探究SAMD3在PDAC肿瘤微环境中T细胞的功能作用及临床意义 胰腺导管腺癌患者样本和肿瘤特异性OT-I/卵清蛋白小鼠模型 单细胞转录组学 胰腺癌 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 小鼠模型 NA 单细胞转录组数据, 免疫组织化学图像 人类PDAC样本和小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
10587 2025-10-07
Pre-immunotherapy alters stereotactic ablative radiotherapy-induced systemic T cell responses in early-stage NSCLC
2025-Feb-01, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究通过单细胞测序揭示了立体定向消融放疗(SABR)联合免疫治疗对早期非小细胞肺癌患者系统性T细胞反应的影响 首次在单细胞分辨率下比较了单纯SABR与联合免疫治疗对系统性T细胞反应的差异,发现两者诱导相反的T细胞反应模式 样本量较小(仅7例患者),需要更大规模研究验证 探究SABR联合免疫治疗对早期非小细胞肺癌患者系统性T细胞反应的影响机制 早期非小细胞肺癌患者的外周血T细胞 单细胞组学 肺癌 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 流式细胞术, 批量RNA测序 NA 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据, 流式细胞数据 7例早期非小细胞肺癌患者 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, T细胞受体测序 NA NA
10588 2025-10-07
Deciphering novel mitochondrial signatures: multi-omics analysis uncovers cross-disease markers and oligodendrocyte pathways in Alzheimer's disease and glioblastoma
2025, Frontiers in aging neuroscience IF:4.1Q2
研究论文 通过多组学分析揭示阿尔茨海默病和胶质母细胞瘤中的线粒体标志物和少突胶质细胞通路 识别出四个跨疾病的线粒体标志物(EFHD1, SASH1, FAM110B, SLC25A18),并发现少突胶质细胞通过APP信号通路参与疾病进展 当前研究缺乏有效代表AD和GBM中线粒体动力学的细胞特异性标志物 识别与线粒体功能障碍相关的细胞特异性标志物,探索AD和GBM的共同分子机制 阿尔茨海默病和胶质母细胞瘤患者 生物信息学 阿尔茨海默病,胶质母细胞瘤 单细胞转录组测序,DNA甲基化分析,机器学习 10种机器学习算法 单细胞转录组数据,甲基化数据,基因表达数据 来自ROSMAP, ADNI, TCGA和CGGA队列的AD和GBM患者样本 NA 单核RNA测序,单细胞RNA测序 NA NA
10589 2025-10-07
Cytotoxic KLRG1+ IL-7R- effector CD8+ T cells distinguish kidney transplant recipients controlling cytomegalovirus reactivation
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肾移植受者控制巨细胞病毒再激活的CD8+ T细胞特征 首次发现CD28lo KLRG1hi IL-7Rlo HLA-DRhi CD8+ T细胞可作为区分CMV再激活患者的关键标志物 样本量较小(8例单细胞测序),需要在更大队列中验证 研究肾移植受者CD8+ T细胞对巨细胞病毒免疫反应的转录调控机制 肾移植受者(KTRs)的CD8+ T细胞 免疫学 巨细胞病毒感染 单细胞RNA测序,免疫表型分析 NA 单细胞转录组数据,流式细胞术数据 8例肾移植受者(单细胞测序),62例肾移植受者(验证队列) NA 单细胞RNA测序 NA NA
10590 2025-10-07
Single-cell dual-omics reveals translational and transcriptional landscapes and regulations in oocytes from ovarian endometriosis patients
2025, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞双组学测序揭示了卵巢子宫内膜异位症患者卵母细胞的翻译组和转录组特征 首次对卵巢子宫内膜异位症患者GV期卵母细胞进行单细胞转录组和翻译组联合分析,发现2480个差异表达基因 样本来源仅限于特定类型的不孕患者,未涉及其他类型的子宫内膜异位症 探究卵巢子宫内膜异位症导致卵母细胞质量下降的分子机制 卵巢子宫内膜异位症患者和因输卵管或男性因素不孕的对照者的卵母细胞 单细胞组学 子宫内膜异位症 单细胞转录组测序, 单细胞翻译组测序 NA 单细胞RNA测序数据 卵巢子宫内膜异位症患者和对照组的不孕患者卵母细胞 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞翻译组测序 NA NA
10591 2025-10-07
An integrated transcriptomic analysis unveils the regulatory roles of RNA binding proteins during human spermatogenesis
2025, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 通过整合转录组分析揭示RNA结合蛋白在人类精子发生过程中的调控作用 首次系统揭示RBP在睾丸发育和精子发生过程中的动态表达模式,并发现RPL10、RPL39和SETX作为非梗阻性无精子症的潜在诊断生物标志物 基于已发表的测序数据进行分析,缺乏实验验证 研究RNA结合蛋白在人类睾丸发育和精子发生过程中的调控机制 人类睾丸发育和精子发生过程中的各种细胞类型,非梗阻性无精子症患者 生物信息学 男性不育症 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 NA 转录组测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
10592 2025-10-07
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptome analysis in bladder cancer: Current status and future perspectives
2025 Jan-Mar, Bladder cancer (Amsterdam, Netherlands)
综述 综述膀胱癌研究中单细胞RNA测序和空间转录组技术的应用现状与未来展望 整合单细胞RNA测序与空间转录组技术解析膀胱癌异质性和肿瘤微环境 存在技术限制和临床应用可及性等挑战 探讨单细胞和空间技术在膀胱疾病研究中的应用价值 膀胱疾病相关研究文献 数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA测序, 空间转录组 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组 NA NA
10593 2025-10-07
The role of macrophages in liver metastasis: mechanisms and therapeutic prospects
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了巨噬细胞在肿瘤微环境中促进肝癌转移的机制及其治疗前景 系统阐述了巨噬细胞在肝转移微环境中的多重调控机制,特别关注了单细胞测序技术带来的新见解 NA 探讨巨噬细胞在肝转移中的作用机制及潜在治疗靶点 巨噬细胞、肿瘤微环境中的免疫细胞、肝转移肿瘤细胞 肿瘤免疫学 肝癌转移 单细胞测序 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
10594 2025-10-07
WCSGNet: a graph neural network approach using weighted cell-specific networks for cell-type annotation in scRNA-seq
2025, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 提出一种基于图神经网络的细胞类型自动注释方法WCSGNet,利用加权细胞特异性网络改进单细胞RNA测序数据分析 首次使用加权细胞特异性网络(WCSNs)来捕获单个细胞内的独特基因相互作用模式,克服了现有方法忽略细胞特异性基因关联网络的局限性 未明确说明方法在超大型数据集上的可扩展性以及在噪声数据下的鲁棒性 开发更准确的单细胞RNA测序数据细胞类型自动注释方法 单细胞RNA测序数据中的细胞类型分类 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 图神经网络(GNN) 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
10595 2025-10-07
Single-Cell Profiling Uncovers Evolutionary Divergence of Hypocretin/Orexin Neuronal Subpopulations
2024-Sep-04, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示下丘脑食欲素神经元亚群的进化分歧和功能异质性 首次在斑马鱼中鉴定出21种谷氨酸能和28种GABA能细胞类型,发现食欲素神经元存在功能异质性,并揭示跨物种保守和分歧的下丘脑细胞类型 研究主要聚焦于斑马鱼和小鼠的比较,可能不适用于所有脊椎动物物种 探究下丘脑食欲素神经元的功能异质性和进化分歧 成年雄性和雌性斑马鱼下丘脑室周区神经元 单细胞生物学 睡眠障碍 单细胞RNA测序, 高分辨率成像 NA 单细胞转录组数据, 图像数据 斑马鱼下丘脑神经元 NA 单细胞RNA测序 NA NA
10596 2025-10-07
HyperCell: Advancing Cell Type Classification with Hyperdimensional Computing
2024-Jul, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference
研究论文 提出一种基于超维度计算的新方法,用于提高单细胞RNA测序数据中的细胞类型分类准确性 首次将超维度计算应用于单细胞RNA测序数据分析,通过QuantHD方法进行高维超向量编码和迭代训练 NA 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型分类的准确性 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 超维度计算, QuantHD 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
10597 2025-10-07
Construction and validation of a novel NAD+ metabolism-related risk model for prognostic prediction in osteosarcoma
2024-05, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society IF:2.1Q2
研究论文 本研究构建并验证了一个新型NAD+代谢相关风险模型,用于骨肉瘤的预后预测 首次将NAD+代谢相关基因与肿瘤免疫微环境联系起来,构建了骨肉瘤预后风险模型,并通过体外实验验证了CBS和INPP1基因通过TGF-β1/Smad2/3通路促进骨肉瘤细胞迁移、增殖和侵袭的机制 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步临床样本验证 探讨NAD代谢相关基因与骨肉瘤肿瘤免疫微环境、免疫治疗反应及预后的关联 骨肉瘤患者数据和骨肉瘤细胞系 生物信息学 骨肉瘤 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blot, 细胞迁移侵袭实验 Cox风险比例模型, Lasso回归模型, 诺莫图 基因表达数据, 临床数据 来自TARGET和GEO数据库的骨肉瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
10598 2025-10-07
The role of epigenetic regulation in pancreatic ductal adenocarcinoma progression and drug response: an integrative genomic and pharmacological prognostic prediction model
2024, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据构建了基于表观遗传特征的胰腺导管腺癌预后预测模型 首次在单细胞分辨率下系统揭示PDAC表观遗传调控全景,并构建了优于现有模型的机器学习预后预测模型 基于公共数据库的回顾性分析,需要前瞻性临床研究验证 探索表观遗传调控在胰腺导管腺癌进展和药物反应中的作用并建立预后预测模型 胰腺导管腺癌患者 机器学习 胰腺癌 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 加权基因共表达网络分析 Lasso, 随机生存森林 基因表达数据, 临床数据 多个公共数据库的样本 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 NA NA
10599 2025-10-07
Construction of a circRNA- lincRNA-lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA regulatory network identifies genes and pathways linked to goat fertility
2023, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术构建了山羊颗粒细胞中ceRNA调控网络,揭示了与山羊繁殖力相关的关键基因和通路 首次在山羊中整合circRNA、lincRNA、lncRNA、miRNA和mRNA构建ceRNA调控网络,鉴定出18个与繁殖力相关的枢纽基因 研究依赖于公开可用的单细胞RNA测序数据,样本量相对有限,需要进一步实验验证 探究高繁殖力和低繁殖力山羊颗粒细胞的转录组差异,构建ceRNA调控网络 济宁青山羊的颗粒细胞(15只高繁殖力,15只低繁殖力) 生物信息学 繁殖障碍 单细胞RNA测序,功能富集分析,文献挖掘 ceRNA调控网络,基因调控网络 单细胞RNA测序数据 30个样本(15高繁殖力,15低繁殖力) NA 单细胞RNA测序 NA NA
10600 2025-10-07
Interactions in CSF1-Driven Tenosynovial Giant Cell Tumors
2022-11-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序探讨腱鞘巨细胞瘤中细胞间的相互作用机制 首次在单细胞水平识别TGCT中两种与正常滑膜细胞高度相似的肿瘤细胞群体,发现GFPT2可作为肿瘤细胞标志物,并证实肿瘤细胞不表达CSF1R 样本量较小(仅3例TGCT和2例GCTB样本),需要更大规模研究验证发现 研究CSF1驱动的腱鞘巨细胞瘤中细胞相互作用机制 腱鞘巨细胞瘤和骨巨细胞瘤样本 单细胞基因组学 腱鞘巨细胞瘤 单细胞RNA测序, 长读长RNA测序, 免疫荧光, 免疫组化 NA 单细胞转录组数据 18,788个单细胞(来自3例TGCT和2例GCTB样本) NA single-cell RNA-seq NA NA
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