单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
10581 2024-08-04
Single-cell sequencing advances in research on mesenchymal stem/stromal cells
2024-Jul, Human cell IF:3.4Q3
综述 本文回顾了单细胞测序在间充质干细胞研究中的应用及其前景 强调了单细胞测序技术在揭示间充质干细胞异质性和分子特征中的重要性 未提及具体的局限性 审视单细胞测序在间充质干细胞研究中的应用 间充质干细胞(MSCs) 数字病理学 NA 单细胞测序 NA NA NA
10582 2024-08-04
Impact of different tissue dissociation protocols on endothelial cell recovery from developing mouse lungs
2024-Jul, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
研究论文 本研究评估了不同酶解方法对小鼠肺部内皮细胞分离的影响 首次比较了胶原酶A和Dispase在小鼠肺内皮细胞分离中的效用,并发现胶原酶A在内皮细胞回收方面优于Dispase 研究主要集中在小鼠模型,可能无法直接应用于其他物种 探索不同组织解离协议对小鼠肺内皮细胞回收的影响 幼年和成年小鼠的肺内皮细胞 数字病理学 NA 流式细胞术和单细胞RNA测序 NA 细胞 未提供确切的样本数量,涉及幼年和成年小鼠的肺组织
10583 2024-08-05
Expansion of highly interferon-responsive T cells in early-onset Alzheimer's disease
2024-07, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究探讨了早发阿尔茨海默病(EOAD)中干扰素反应性T细胞的扩展 发现早发阿尔茨海默病中抗病毒类干扰素信号关联基因高表达的T细胞显著扩展 未提及具体限制 研究早发阿尔茨海默病中的免疫反应 研究对象包括早发阿尔茨海默病患者及临床正常对照的外周血单核细胞和CD4 T细胞 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和滴度数字PCR(ddPCR) NA 基因表达 16名EOAD患者和19名CD4 T细胞样本参与者
10584 2024-08-07
Decoding the building blocks of cellular processes from single-cell transcriptomics data
2024-Jul, Nature biotechnology IF:33.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
10585 2024-08-04
Liver cancer from the perspective of single-cell sequencing: a review combined with bibliometric analysis
2024-Jun-24, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
综述 本研究通过文献计量学分析,全面概述了单细胞测序在肝癌研究中的知识结构和研究热点 这项研究是首次综合总结单细胞测序在肝癌应用的研究趋势和发展 具体的局限性未在摘要中提及 提供单细胞测序在肝癌研究领域的知识结构和研究热点的概述 与单细胞测序技术在肝癌研究中的应用相关的文献 数字病理学 肝癌 单细胞测序 NA 文献 331篇相关出版物
10586 2024-08-05
Increased Thyroid DPP4 Expression Is Associated With Inflammatory Process in Patients With Hashimoto Thyroiditis
2024-May-17, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
研究论文 本研究旨在调查Hashimoto甲状腺炎患者外周血和甲状腺组织中DPP4的表达,并探索其在病理生理过程中的作用 首次在Hashimoto甲状腺炎患者的甲状腺中发现DPP4表达显著增加,并主要局限于淋巴细胞 样本量较小,且未能探讨DPP4在其他类型甲状腺疾病中的作用 研究Hashimoto甲状腺炎患者中DPP4的表达及其在炎症过程中的角色 40名未服药的Hashimoto甲状腺炎患者和81名对照个体 数字病理学 Hashimoto甲状腺炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 血液和甲状腺组织样本 共121个样本(40名HT患者和81名对照个体)
10587 2024-08-04
Investigating the characteristics of mild intervertebral disc degeneration at various age stages using single-cell genomics
2024, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 该研究探讨了不同年龄段轻度椎间盘退变的特征和机制 首次从年龄视角研究椎间盘轻度退变的分子机制 样本量可能有限,未探索重度退变的影响 探讨年轻人与老年人椎间盘退变的潜在机制 不同年龄段的椎间盘细胞,分为正常和轻度退变组 数字病理学 NA 单细胞测序 NA 样本 四种类型的椎间盘样本
10588 2024-08-05
Ultrasound-Guided Fine Needle Biopsy of Human Axillary Lymph Nodes to Assess B Cell Responses to Vaccination
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本研究探讨了超声引导下细针活检在人类腋窝淋巴结中评估疫苗接种后B细胞反应的应用 提出了一种安全有效的活检方法,用于直接研究淋巴结中免疫细胞的动态过程和相互作用 由于关键细胞的解剖位置受到保护,直接研究这些细胞的动态过程和相互作用存在挑战 研究疫苗接种后腋窝淋巴结中的免疫应答,特别是B细胞的反应 腋窝淋巴结中的免疫细胞,重点分析B细胞群体 数字病理学 NA 流式细胞术免疫表型分析和单细胞RNA测序 NA 细胞样本 NA
10589 2024-08-05
Mitotic catastrophe heterogeneity: implications for prognosis and immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了有丝分裂灾难在肝细胞癌中的异质性及其对预后和免疫治疗的影响 通过揭示肝细胞癌中的有丝分裂灾难异质性及其与免疫逃避和疗法抵抗的关系,为临床决策提供了新的治疗策略 尚未明确有丝分裂灾难异质性与免疫逃避和治疗反应之间的机制 研究有丝分裂灾难在肝细胞癌进展中的作用以及其对免疫环境的调控 分析肝细胞癌患者的有丝分裂灾难相关基因和免疫特征 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序和空间转录组分析 NA 基因表达数据 94名肝细胞癌患者的数据
10590 2024-08-05
scOrange-a tool for hands-on training of concepts from single-cell data analytics
2019-07-15, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种基于scOrange工具的单细胞数据分析培训方法 提出了一种手动培训方式,通过探索性数据分析工具支持单细胞数据分析的教学 未提及具体的实际应用案例或评估此方法的有效性 旨在提高分子生物学家在单细胞数据分析方面的能力 分子生物学家及其在单细胞数据分析中的培训需求 数据分析 NA 数据挖掘框架 NA NA NA
10591 2024-08-05
A statistical simulator scDesign for rational scRNA-seq experimental design
2019-07-15, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了一种灵活且强大的模拟器scDesign,用于优化scRNA-seq实验设计 scDesign是第一个统计框架,定量评估差异基因表达分析中的scRNA-seq实验设计 本研究未提及具体的实验设置和外部验证 优化scRNA-seq实验设计以探索转录组信息的深度和广度 基于17种细胞类型和6种不同方案的scRNA-seq数据集 数字病理学 NA NA NA 合成的scRNA-seq数据集 17种细胞类型和6种不同方案
10592 2024-08-05
Dissecting intratumoral myeloid cell plasticity by single cell RNA-seq
2019-06, Cancer medicine IF:2.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析肿瘤微环境中髓样细胞的转录动态 首次揭示了早期非小细胞肺癌中CD14+ 单核细胞向M2巨噬细胞的分化路径及其转录重编程机制 本研究只涉及4名早期非小细胞肺癌患者,样本量有限 研究肿瘤微环境中髓样细胞的分化和转录重编程 4名早期非小细胞肺癌患者的肿瘤及其相邻正常组织 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 细胞 4名早期非小细胞肺癌患者的11,485个细胞
10593 2024-08-05
Single-Cell Profiling of Cutaneous T-Cell Lymphoma Reveals Underlying Heterogeneity Associated with Disease Progression
2019-05-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 皮肤T细胞淋巴瘤的单细胞分析揭示了与疾病进展相关的潜在异质性 首次使用单细胞RNA测序和机器学习方法定义了Sézary综合症中不同的转录组状态,并建立了能够预测早期与晚期CTCL疾病的基因签名 对疾病病理机制的理解仍不完整,这可能限制了治疗方案的开发 揭示Sézary综合症的异质性,并提供更好的转录组多样性理解 Sézary综合症中的恶性T细胞 数字病理学 皮肤T细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序 增强树分类模型 基因表达数据 NA
10594 2024-08-05
Pan-Cancer and Single-Cell Modeling of Genomic Alterations Through Gene Expression
2019, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过基因表达分析癌症中的基因组改变,提出了一种新的预测模型 提出基因聚合作为工具,以提高基因表达预测模型的准确性 未提及具体的样本规模和数据来源限制 研究基因表达与基因组变化之间的关系以及其在癌症预测中的应用 癌症类型中的单体突变和拷贝数变化 机器学习 癌症 基因表达分析 机器学习模型 基因表达数据 NA
10595 2024-08-05
A single-cell transcriptome atlas of human euploid and aneuploid blastocysts
2024-Jul, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 该文章探讨了人类正常和非正常胚泡的单细胞转录组图谱 本研究首次系统性地分析了人类非正常胚泡中转录组的改变,揭示了基因剂量效应和特定信号通路的影响 研究主要集中于初期的人类胚泡,可能无法完全推及其他发育阶段或物种 了解非正常胚泡中染色体异常如何影响细胞功能和胚胎发育 203个人类正常与非正常胚泡中的14,908个单细胞 数字病理学 NA 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 203个胚泡包含14,908个单细胞
10596 2024-08-05
Microwave ablation combined with PD-L1 blockade synergistically promotes Cxcl9-mediated antitumor immunity
2024-Jul, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 本研究探讨了微波消融与PD-L1拮抗,协同促进Cxcl9介导的抗肿瘤免疫 发表了微波消融结合抗PD-L1治疗对肿瘤免疫的改善作用的新发现 研究局限于小鼠模型,临床应用尚需进一步验证 探究微波消融与PD-L1拮抗结合对结直肠癌肝转移防治的潜力 使用经过微波消融的前临床小鼠模型进行研究 数字病理 结直肠癌 微波消融和单细胞RNA测序 NA 生物样本和肿瘤细胞 小鼠模型,样本数量未具体说明
10597 2024-08-05
Quantification and statistical modeling of droplet-based single-nucleus RNA-sequencing data
2024-Jul-01, Biostatistics (Oxford, England)
研究论文 本研究探讨了基于液滴的单核RNA测序数据的量化和统计建模 系统评估了基于液滴的单核RNA测序数据的概率分布,并发现其符合负二项分布 未能详细分析所有可能的量化映射策略 准确建模单核RNA测序数据,以改进下游分析 使用小鼠皮层和肾脏的单核RNA测序数据进行研究 数字病理 NA RNA-seq NA 基因表达数据 使用了小鼠皮层和肾脏的伪阴性对照数据
10598 2024-08-05
IRF8 configures enhancer landscape in postnatal microglia and directs microglia specific transcriptional programs
2024-Jul-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了转录因子IRF8在后天小胶质细胞发育中的作用 IRF8通过结合增强子区域调控小胶质细胞特异性的转录程序,揭示了其在小胶质细胞发育中的关键作用 研究未涉及IRF8在其他类型免疫细胞中的潜在作用 了解IRF8在后天小胶质细胞发育及特异性转录调控中的角色 后天发育的小胶质细胞 数字病理学 NA scRNA-seq和scATAC-seq 5xFAD模型 NA NA
10599 2024-08-07
A one-stop shop for 3D spatial transcriptomics
2024-Jul, Nature genetics IF:31.7Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
10600 2024-08-05
Leveraging Integrated RNA Sequencing to Decipher Adrenomedullin's Protective Mechanisms in Experimental Bronchopulmonary Dysplasia
2024-Jun-19, Genes IF:2.8Q2
研究论文 本研究旨在阐明肾上腺髓质素在实验性支气管肺发育不良中的保护机制 本研究整合了批量RNA测序和单细胞RNA测序,揭示了肾上腺髓质素缺乏与炎症、自然杀伤细胞频率增加及内皮细胞和二型肺泡细胞频率下降之间的关系 本研究仅限于小鼠模型,可能无法完全反映人类情况 阐明肾上腺髓质素对支气管肺发育不良病理机制的影响 使用LPS诱导的小鼠实验模型研究肾上腺髓质素的作用 数字病理学 肺部疾病 RNA测序 NA 基因表达数据 包含肾上腺髓质素足量(野生型或基因敲除)和肾上腺髓质素单倍缺失(haplodeficient)小鼠的肺组织样本
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